NI LabVIEW based camera system used for gait detection

L

Development of Gait Recognition in NI LabVIEW

Nowadays, one of the most significantly improving area in security is the world of biometric identifiers. Within the biometric identifiers, the research group is working with the gait recognition speciality. The research group realized a complex gait recognition system in NI LabVIEW, that can detect more reference points simultaneously with a universal camera and is capable of suiting predetermined curves on the detected points. Moreover, the program can compare the functions suited on the reference curve and the actual curve and evaluate if the two gait images are the same or not. In the program there is a saving and a reloading function which contributes to the production of the reference gait image. The foot analysis program before the gait recognition is designed to improve accuracy. The self-developed gait recognition system was tested on more persons and the False Acceptance Rate (FAR) was zero

Analysis of gait recognition system developed in NI LabVIEW

L

Analysis of gait recognition system developed in NI LabVIEW

L

Gazdanövénykört és betegségtüneteket meghatározó vírusgének analízise, különös tekintettel a cucumovírusokra = Analysis of the genetic determinants of cucumoviral host range and symptomatology

Növényi vírosok esetében a gazdanövénykört és a kialakuló vírustüneteket számos vírusgén befolyásolja. Gazdaságilag az egyik legjelentősebb vírusnemzetség esetén, a cucumovírusoknál különböző vírusgének patológiai jelentőségét vizsgáltuk. A szisztemikus terjedésben szerept játszó köpenyfehérje vizsgálata során az uborka mozaik vírus (cucumber mosac virus, CMV) köpenyfehérjéjének a virion felszínén lokalizálódó öt hurok régióját paradicsom magtalanság vírus (tomato aspermy virus, TAV) megfelelő régióira cserélve, majd pontmutánsokat készítve azonosítottuk, hogy a cucumovírusok szisztemikus mozgásában a 'B-'C hurok három aminosavának van kulcsszerepe. A CMV-Ns izolátuma hiperszenzitív reakciót (HR) indukál Nicotiana tabacum cv. Xanthi-nc és Nicotiana glutinosa növényeken. A HR kiváltásának genetikai determinánsaként az 1a fehérje 461 aminosavát azonosítottuk, majd az elicitor funkciót molekuláris modellezéssel tervezett mutáns vírusok felhasználásával vizsgáltuk. A jósolt részleges fehérjeszerkezet felhasználásával elemeztük a fertőzési kísérletek eredményeit. A földimogyoró satnyulás vírus (peanut stunt virus, PSV) akác izolátumának (PSV-Rp) teljes nukleinsav sorrendjét meghatároztuk. A PSV izolátumok homológia viszonyai és a rekombinációs vizsgálatok indokolták egy új, IV. PSV alcsoport kialakítása. | In the case of plant viruses symptoms and host range differences are affected by several different viral factors. We have analysed such viral determinants in the case of cucumoviruses inducing considerable harm to agriculture worldwide. To characterise the long-distance movement determinant of cucumoviral coat proteins (cp), 5 mutants were engineered into the Cucumber mosaic virus (CMV) cp bearing the corresponding Tomato aspermy virus (TAV) loops exposed on the surface of the virion. Three amino acids of the 'B-'C loop of the CP were identified as critical determinants for long-distance movement of cucumoviruses. The Ns-strain of CMV induces a hypersensitive response (HR) on Nicotiana tabacum cv. Xanthi-nc and on Nicotiana glutinosa. The genetic determinant of the HR induction was localised to amino acid 461 of the 1a protein and the elicitor function was characterized with a series of mutants based on molecular modeling. We analysed the results in terms of a predicted partial protein structure. The complete nucleotide sequence of Peanut stunt virus Robinia strain (PSV-Rp) was determined and compared to other PSV strains. Recombination breakpoint analysis revealed two recombination points on the RNA3. Based on our results we proposed to establish a forth PSV subgroup, and our work revealed that homologous recombination occurred in PSV evolution

Növényi víruskórókozók szisztemikus mozgásának vizsgálata korszerű védekezési stratégia kialakításához = Investigation of the systemic movement of cucumoviruses in order to develop new defence strategies

A cucumovírus nemzetségbe tartozó uborka mozaik vírus az egyik legszélesebb gazdanövénykörrel rendelkező növényi vírusoknak. Genomja három RNS-en elosztva, összesen öt fehérjét kódol. Ezek közül korábban a vírus hosszútávú mozgásában a köpenyfehérjének tulajdonítottak kulcsszerepet. OTKA pályázatunk keretében bizonyítottuk. hogy a köpenyfehérje bétaB-bétaC hurok régiójának van központ szerepe a vírus hosszútávú mozgásában uborka növényen, valamint nem egy-egy aminosav megléte vagy hiánya a meghatározó, hanem a víruspartikulum felületének töltéseloszlása fontos. Különböző cucumovírus-növény rendszereken sikerült bizonyítanunk, hogy az RNS 2- kódolódó fehérjéknek is szerepe van a vírus szisztemizálódásában. Földimogyoró satnyulás vírus izolátumok vizsgálatával bizonyítottuk a rekombináns vírus nagymértékű elterjedését hazánkban, valamint az RNS 2-n kódolódó fehérjék szerepét a vírus hosszútávú mozgásában. A különböző, babon lokális illetve szisztemikus tüneteket indukáló CMV izolátumok esetén a szisztematikus fertőzésért felelős részt sikerült a 2a fehérje egyetlen aminosavára lokalizálnunk (631Y) amiben nagy valószínűséggel a fehérje foszforilációja játszik szerepet. A CMV 2a fehérje alanin scanning mutánsai segítségével hat mutánst azonosítottunk melyek Nicotiana clevelandii növényen a vad típusú vírustól eltérően viselkedtek. Ezek közül négy a géncsendesítés szupresszálásában nem volt hatékony, míg kettő a vírus növényen belüli terjedésében bizonyult sérültnek. | Cucumber mosaic virus (CMV) belonging to the genus Cucumovirus has an extremely wild host range. Its genome consists of three genomic RNA and codes for five proteins. Previously the coat protein of cucumoviruses was described as a key factor in long-distance movement. In our present project we have proved, that the betaB-betaC loop region of the coat protein has the central role in long distance movement on cucumber. We have showed that not the presence of specific amino acids is required, but the general electrostatic potential pattern of the particle surface is important. We have also proved the importance of the viral proteins coded by the RNA2 in the long distance movement on different virus-host systems. In the case of peanut stunt virus we have demonstrated the dominance of the recombinant strains in Hungary, and the role of the proteins encoded by RNA 2 in viral long distance movement. Using different CMV isolates we have proved the role of a single amino acid (631Y) of the 2a protein in the systemic movement of the virus on bean and the role of protein phosphorylation could have a function in this case. Using alanin scanning mutatnts of the 2b protein, we have identified six mutants with different pathological characteristics. Four of them were defective in the suppression of gene silencing, while two was defective in viral movement

EGYEDI SEJTEK ADHÉZIÓS VIZSGÁLATA SZÁMÍTÓGÉP-VEZÉRELT MIKROPIPETTÁVAL

Az egyedi sejtek válogatása és manipulálása komoly kihívást jelent az ép sejteket igényelő vizsgálatokban, mint pl. a DNS vagy RNS szekvenálás esetén. A számítógép-vezérelt mikropipetta rendszer [1] azonban lehetővé teszi, hogy az előzetesen szoftveresen vagy manuálisan detektált, Petri csészében lévő sejteket egyenként tudjuk manipulálni és válogatni. Kísérleteinkhez neuroektodermális egér progenitor, és human vérből izolált monocita sejteket használtunk [2]. 15-20 mp/sejt válogatási sebességgel 0,4–0,7 μl térfogatú, egyedi sejteket tartalmazó cseppeket tudtunk automatikusan izolálni PCR csövekben. A mikroliter alatti mérettartomány elérése fontos paraméter a további vizsgálatok szempontjából, ugyanis ezek költséges reagenseket igényelnek. A sejtadhézió alapvető jelenség a többsejtű élőlények számára. Azonban az egyedi sejtek direkt adhéziós erejének meghatározására alkalmas technikák (pl. AFM) rendkívül alacsony áteresztőképességűek, kísérletenként ~10 sejt mérhető le velük. A számítógép-vezérelt mikropipettával egyedi humán fehérvérsejtek és specifikus makromolekulák kölcsönhatását tanulmányoztuk [3]. A leukociták adhéziója a specifikus makromolekulákhoz fontos feladat az immunválasz elindításában. Azt tapasztaltuk, hogy a primer monociták kevésbé adherensek a fibrinogén felületen, mint az in vitro differenciáltatott származékai: a makrofágok és dendritikus sejtek, az utóbbiak mutatták a legmagasabb adhéziós erőt. Az eredményeket mikrofluidikai áramlási csatornával is alátámasztottuk. Ezzel a módszerrel több száz sejt vizsgálható egyenként, viszonylag rövid idő alatt (~30 perc)