Aplicação da metodologia de homozigose do haplótipo estendido (EHH) para genes relacionados com crescimento e deposição de gordura em bovinos da raça Nelore.

O rebanho bovino brasileiro destinado à produção de carne vem sendo selecionado há décadas, por programas de melhoramento genético, para diversas características de crescimento e, mais recentemente, de deposição de gordura. A seleção artificial resulta em alterações no genoma, que podem ser detectadas, por exemplo, por diferenças nos padrões de homozigose dos indivíduos de uma população, permitindo a identificação de regiões do genoma que controlam características sob seleção. Com o objetivo de avaliar a presença de assinaturas de seleção do genoma de bovinos Nelore que continham genes candidatos relacionados com crescimento e deposição de gordura, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs), formados os blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos) e realizada a detecção de possíveis evidências de seleção nas regiões específicas de quatro genes candidatos - somatostatina (SST), receptor da leptina (LEPR), gene da proteina de ligação de ácido graxo 4 (FABP4) e gene do hormônio do crescimento (GH1) - bem como o padrão de frequência e homozigose dos haplótipos. Foram encontradas evidências de seleção nos quatro genes, sugerindo que estão relacionados com crescimento (SST e GH1), metabolismo e deposição de gordura (LEPR e FABP4) na raça Nelore

Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore.

A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001).SBMA 2012

Environmental and anthropogenic driven transitions in the demersal ecosystem of Cantabrian Sea

In the framework of global human-induced change, marine communities’ often respond to changing conditions abruptly reorganizing into new equilibria. These shifts are difficult to predict and often imply irreversible adjustments due to hysteresis. Unraveling the role of the forces leading regime shifts is a major challenge. We explored the temporal evolution of 63 fish species representing the Cantabrian bentho-demersal community in response to environmental changes and fishing pressure in the period 1983–2018, using survey data. Via multivariate analysis and non-additive modeling of a community index and the system's main stressors, two decadal-scale regimes were revealed, suggesting a non-linear response of the community to its environment. The Integrated Resilience Assessment framework elucidated the response mechanism to the candidate stressors and allowed quantifying resilience dynamics. The decline in fishing pressure in the 1990s was associated with a gradual transition of the system, while further decline during the 2000s eroded the resilience of the system towards changes in its stressors, leading to a discontinuous response expressed as an abrupt, possibly irreversible shift in the 2010s. Given the teleconnected character of marine ecosystems, this regional study endorses the scientific effort for actions facing the dynamic impacts of climate change on exploited marine ecosystems.En prensa2,27

Short communication: Genetic parameters for post-weaning visual scores and reproductive traits in Suffolk sheep

          The aim of this study was to estimate the coefficients of heritability and genetic correlations among visual scores (conformation, CPW; precocity, PPW; musculature, MPW) and reproductive traits: age at first lambing (AFL) and scrotal circumference (SC) evaluated at 180 days of age in Suffolk lambs. In the statistical model only the additive genetic effect was considered as random effect. The heritability estimates by univariate analyses for CPW, PPW, MPW, AFL and SC were 0.08, 0.12, 0.09, 0.20 and 0.22, respectively. The genetic correlations among AFL and CPW, PPW, MPW were -0.26, 0.19, and 0.08, respectively. The genetic correlation among SC and CPW, PPW, MPW were, respectively, 0.54, 0.88 and 0.86, and between AFL and SC was 0.26. The direct selection for conformation, precocity and musculature at 180 days of age and age at first lambing will provide slow genetic progress due to low heritability estimates. It is possible to obtain genetic gain in sexual precocity through selection on scrotal circumference in Suffolk rams. The favorable genetic correlation among visual scores and SC and between CPW and AFL, indicated the possibility to gain in genetic progress for reproductive traits through indirect selection of the visual scores in Suffolk sheep

Identificação de genes candidatos posicionais para eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore.

A Eficiência alimentar é uma característica produtiva importante por estar ligada à produtividade do rebanho. O Consumo Alimentar Residual (CAR) é um parâmetro de eficiência não correlacionado com taxa de crescimento e peso metabólico, sendo utilizado em programas de melhoramento. O objetivo deste estudo foi identificar genes candidatos posicionais para CAR em animais da raça Nelore. Para isso, 273 animais foram genotipados através do Illumina BovineHD BeadChip (770 k). Após a estimação dos valores BLUP (Best Linear Unbiased Prediction), a análise de associação foi realizada através do programa PLINK. Através do software Gbrowse e do programa DAVID foram visualizados genes presentes em regiões associadas com CAR e suas respectivas rotas metabólicas. Resultados preliminares permitiram identificar dois genes candidatos em regiões associadas com CAR: o gene UBEF2(ubiquitin-conjugating enzyme E2F, putative) e o gene KSR2(Kinase suppressor of ras 2). A identificação de genes associados à eficiência alimentar pode contribuir para a melhor compreensão dos mecanismos que determinam esses fenótipos

Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore.

A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001)

La problemática de la alimentación : el diseño didáctico y el cambio de teorías

El conocimiento sobre la alimentación posee un perfil conceptual y axiológico de múltiples enfoques para promover procesos adecuados de enseñanza. En este trabajo se presenta una innovación educativa, enmarcada en un estudio amplio sobre cambio representacional. Para movilizar las teorías implícitas sobre esta noción se construyó y evaluó el diseño de una secuencia instruccional, con enfoques de alfabetización ciudadana (CTS). El ajuste conceptual en esta noción necesitó de escenarios de activación cognitiva, que alternaron niveles de abstracción, complejidad conceptual y contextualización cultural. El anclaje representacional de la noción, se asocia a las prácticas y tradición de cocinas, necesitando para el cambio, de un mayor perspectivismo conceptual y modelos de actuación social, que contrasten actitudes y valores culturales