Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry

Aim. To investigate the ability of «core» 2'-5'- and 3'-5'-oligoadenylates (OA) to interact with α-interferon – a key protein of the 2'- 5'-OAS/RNAase L system responsible for antiviral cell defense. Methods. MALDI-TOF mass spectrometry was used in the studies on protein-ligand interactions. Results. It was shown that 2'-5'-A3 and its epoxy-modified analog 2'-5'-A3-epo can bind to α-interferon in vitro. 3'-5'-tri- adenylate is also capable of binding to this protein. One to five ligand molecules can bind simultaneously to the molecule of α-interferon. At the same time, all studied oligonucleotides do not bind to insulin. Conclusions. It was established that «core» 2'-5'- and 3'-5'-triadenylates are capable of multiple interaction with α-interferon to form stable complexes. However, they do not bind to insulin which is not involved in the 2'-5'-OAS/RNAase L system.Мета. Дослідити здатність «корових» 2'-5'- і 3'-5'-олігоаденілатів взаємодіяти з α-інтерфероном – ключовим білком системи 2'-5'-ОАС/РНКаза L, відповідальної за противірусний захист клітини. Методи. Для вивчення взаємодій білок–олігонуклеотид використано метод мас-спектрометрії MALDI-TOF. Результати. Встановлено здатність 2'-5'-А3 та його епокси-модифікованого аналога 2'-5'-А3-epo зв’язуватися з α-інтерфероном in vitro. З цим білком може також взаємодіяти і 3'-5'-триаденілат. При цьому до молекули α-інтерферону одночасно може приєднуватися від однієї до п’яти молекул ліганду. У той же час з інсуліном усі досліджені олігонуклеотиди не зв’язуються. Висновки. Показано, що «корові» 2'-5'- і 3'-5'-триаденілати множинно взаємодіють з α-інтерфероном з утворенням стійких комплексів. Однак вони не зв’язуються з інсуліном, який не є компонентом системи 2'-5'-ОАС/РНКаза L.Цель. Исследовать способность «коровых» 2'-5'- и 3'-5'-олигоаденилатов взаимодействовать с α-интерфероном – ключевым белком системы 2'-5'-ОАС/РНКаза L, ответственной за противовирусную защиту клетки. Методы. Для изучения взаимодействий белок–олигонуклеотид использован метод масс-спектрометрии MALDI-TOF. Результаты. Установлена способность 2'-5'-А3 и его эпокси-модифицированного аналога 2'-5'-А3-еpo связываться с α-интерфероном in vitro. С этим белком может также взаимодействовать и 3'-5'-триаденилат. При этом к молекуле α-интерферона одновременно может присоединяться от одной до пяти молекул лиганда. В то же время с инсулином все изученные олигонуклеотиды не связываются. Выводы. Показано, что «коровые» 2'-5'- и 3'-5'-триаденилаты способны к множественному взаимодействию с α-интерфероном с образованием устойчивых комплексов. Однако они не связываются с инсулином, не являющемся компонентом системы 2'-5'-ОАС/РНКаза L

Distinct germline genetic susceptibility profiles identified for common non-Hodgkin lymphoma subtypes

Lymphoma risk is elevated for relatives with common non-Hodgkin lymphoma (NHL) subtypes, suggesting shared genetic susceptibility across subtypes. To evaluate the extent of mutual heritability among NHL subtypes and discover novel loci shared among subtypes, we analyzed data from eight genome-wide association studies within the InterLymph Consortium, including 10,629 cases and 9505 controls. We utilized Association analysis based on SubSETs (ASSET) to discover loci for subsets of NHL subtypes and evaluated shared heritability across the genome using Genome-wide Complex Trait Analysis (GCTA) and polygenic risk scores. We discovered 17 genome-wide significant loci (P < 5 × 10−8) for subsets of NHL subtypes, including a novel locus at 10q23.33 (HHEX) (P = 3.27 × 10−9). Most subset associations were driven primarily by only one subtype. Genome-wide genetic correlations between pairs of subtypes varied broadly from 0.20 to 0.86, suggesting substantial heterogeneity in the extent of shared heritability among subtypes. Polygenic risk score analyses of established loci for different lymphoid malignancies identified strong associations with some NHL subtypes (P < 5 × 10−8), but weak or null associations with others. Although our analyses suggest partially shared heritability and biological pathways, they reveal substantial heterogeneity among NHL subtypes with each having its own distinct germline genetic architecture

Studies on interaction of oligoadenylates with proteins in vitro by MALDI-TOF mass spectrometry

Aim. To investigate the ability of «core» 2'-5'- and 3'-5'-oligoadenylates (OA) to interact with α-interferon – a key protein of the 2'- 5'-OAS/RNAase L system responsible for antiviral cell defense. Methods. MALDI-TOF mass spectrometry was used in the studies on protein-ligand interactions. Results. It was shown that 2'-5'-A3 and its epoxy-modified analog 2'-5'-A3-epo can bind to α-interferon in vitro. 3'-5'-tri- adenylate is also capable of binding to this protein. One to five ligand molecules can bind simultaneously to the molecule of α-interferon. At the same time, all studied oligonucleotides do not bind to insulin. Conclusions. It was established that «core» 2'-5'- and 3'-5'-triadenylates are capable of multiple interaction with α-interferon to form stable complexes. However, they do not bind to insulin which is not involved in the 2'-5'-OAS/RNAase L system.Мета. Дослідити здатність «корових» 2'-5'- і 3'-5'-олігоаденілатів взаємодіяти з α-інтерфероном – ключовим білком системи 2'-5'-ОАС/РНКаза L, відповідальної за противірусний захист клітини. Методи. Для вивчення взаємодій білок–олігонуклеотид використано метод мас-спектрометрії MALDI-TOF. Результати. Встановлено здатність 2'-5'-А3 та його епокси-модифікованого аналога 2'-5'-А3-epo зв’язуватися з α-інтерфероном in vitro. З цим білком може також взаємодіяти і 3'-5'-триаденілат. При цьому до молекули α-інтерферону одночасно може приєднуватися від однієї до п’яти молекул ліганду. У той же час з інсуліном усі досліджені олігонуклеотиди не зв’язуються. Висновки. Показано, що «корові» 2'-5'- і 3'-5'-триаденілати множинно взаємодіють з α-інтерфероном з утворенням стійких комплексів. Однак вони не зв’язуються з інсуліном, який не є компонентом системи 2'-5'-ОАС/РНКаза L.Цель. Исследовать способность «коровых» 2'-5'- и 3'-5'-олигоаденилатов взаимодействовать с α-интерфероном – ключевым белком системы 2'-5'-ОАС/РНКаза L, ответственной за противовирусную защиту клетки. Методы. Для изучения взаимодействий белок–олигонуклеотид использован метод масс-спектрометрии MALDI-TOF. Результаты. Установлена способность 2'-5'-А3 и его эпокси-модифицированного аналога 2'-5'-А3-еpo связываться с α-интерфероном in vitro. С этим белком может также взаимодействовать и 3'-5'-триаденилат. При этом к молекуле α-интерферона одновременно может присоединяться от одной до пяти молекул лиганда. В то же время с инсулином все изученные олигонуклеотиды не связываются. Выводы. Показано, что «коровые» 2'-5'- и 3'-5'-триаденилаты способны к множественному взаимодействию с α-интерфероном с образованием устойчивых комплексов. Однако они не связываются с инсулином, не являющемся компонентом системы 2'-5'-ОАС/РНКаза L

Influence of oxynitriding on antifriction properties of Ti–6Al–4V titanium alloy

Russian Text, published in Trenie i Iznos, 2020, Vol. 41, No. 4, pp. 457–463The wear resistance of a plate–screw tribo pair used to fix bone fractures was investigated using the pin-on-plate configuration under conditions of dry friction and friction in Ringer’s solution. The nitrided and oxynitrided plates of Ti–6Al–4V titanium alloy in friction pairs with Fe–18Cr–10Ni–1Ti stainless steel were used. It was determined that under dry friction conditions, regardless of load, the nitrided Ti–6Al–4V titanium alloy provides a lower friction coefficient than the oxynitrided one; friction is implemented according to the adhesive wear mechanism. The use of Ringer’s solution during friction tests leads to an adhesive– oxidative wear mechanism that decreases the friction coefficient in friction pairs of nitrided (oxynitrided) Ti– 6Al–4V titanium alloy–Fe–18Cr–10Ni–1Ti stainless steel. In addition, the oxidative portion in the wear mechanism for an oxynitrided surface is greater, which decreases the adhesive wear in such a friction pairVytauto Didžiojo universitetasŽemės ūkio akademij

Low-stress Si3N4 waveguides on sapphire substrate: (Student paper)

In this work, we present a new platform, Si3N4-on-sapphire, in which 1.35 μm thick Si3N4 layers can be deposited in a single low pressure chemical vapor deposition (LPCVD) step with very low residual tensile stress

Modification of sintered iron properties by Y₂O₃ nanoparticles

Influence of Y₂O₃ nanoparticles on sintered iron structure and microhardness is investigated. Ferrite grain growth is shown to be slowed down by the clusters which cause altering the grain shape from needle-like to equiaxial (with lower specific surface). Yttrium oxide particles resulted microhardness increasing to 3.6 GPa at 1 % of second phase content. The fact is explained by retardation of dislocations on disperse particles by the Orowan mechanism