Adaptation to β-myrcene catabolism in Pseudomonas sp. M1: An expression proteomics analysis

β-Myrcene, a monoterpene widely used as a fragrance and flavoring additive, also possesses analgesic, anti-mutagenic, and tyrosinase inhibitory properties. In order to get insights into the molecular mechanisms underlying the ability of Pseudomonas sp. M1 to catabolize β-myrcene, an expression proteomics approach was used in this study. Results indicate that the catabolic enzyme machinery for β-myrcene utilization (MyrB, MyrC, and MyrD and other uncharacterized proteins) is strongly induced when β-myrcene is present in the growth medium. Since an M1 mutant, lacking a functional 2-methylisocitrate dehydratase, is not able to grow in mineral medium with β-myrcene or propionic acid as the sole C-source, and also based on the expression proteomic analysis carried out in this study, it is suggested that the β-myrcene catabolic intermediate propionyl-CoA is channeled into the central metabolism via the 2-methylcitrate cycle. Results also suggest that the major alteration occurring in the central carbon metabolism of cells growing in β-myrcene-containing media is related with the redistribution of the metabolic fluxes leading to increased oxaloacetate production. Other upregulated proteins are believed to prevent protein misfolding and aggregation or to play important structural roles, contributing to the adaptive alteration of cell wall and membrane organization and integrity, which are essential features to allow the bacterium to cope with the highly lipophilic β-myrcene as C-source.- (undefined

Microbiologia para Todos: A Importância da Literacia em Microbiologia

A Comunicação e Divulgação de Ciência em Microbiologia foi o tema abordado nesta comunicação. Foram destacadas as atividades desenvolvidas pela Sociedade Portuguesa de Microbiologia (SPM), no âmbito da sua missão de promover, desenvolver e divulgar a Microbiologia, facilitando e estimulando a comunicação entre microbiólogos e entre estes e a sociedade em geral. A importância social de os cientistas e outros profissionais da Microbiologia contribuírem para o desenvolvimento de uma litera cia em Microbiologia foi enfatizada. Neste contexto, foi apresentado o Dia Internacional do Microrga nismo, desde o seu início em Portugal, em 2017, à extensão das comemorações à Europa e outros continentes. Esta atividade foi atualizada no que respeita a sua adaptação, em 2020 e 2021, à situação pandémica SARS-CoV-2 / COVID-19. Nesses anos, uma maratona de 24h de transmissão ao vivo pela internet de palestras, debates, vídeos, permitiu uma grande reunião sem fronteiras sobre os microrganismos e a microbiologia. Pelas piores razões, a referida crise de saúde pública veio colocar o conhecimento científico em microbiologia no centro das atenções em todo o mundo. Veio mostrar, com clareza, a necessidade de os governos e a sociedade em geral prestarem mais atenção à importância do conhecimento científico e às advertências e recomendações dos cientistas e especialistas para orientar a tomada de decisões adequadas, quer políticas quer individuais. Contudo há outras áreas em que os microrganismos e a microbiologia intervêm e em que as decisões individuais e políticas devem ser bem informadas! São exemplos disso as que envolvem o papel dos recursos microbiológicos para potenciar uma bioeconomia cada vez mais sustentável e passível de gerar benefícios para a sociedade, a economia e o ambiente.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Avaliação de escolas: os efeitos nos processos de mudança e melhoria da escola

A avaliação de escolas é apresentada ao nível do discurso político normativo e em alguns programas de avaliação, como é o caso em Portugal do modelo de avaliação externa das escolas (AEE), como um processo que promove a eficácia e a melhoria interna da escola. Todavia num contexto onde as politicas nem sempre criam os estímulos e as condições adequadas, a ação organizacional em torno dos processos avaliativos acaba por refletir o jogo dos atores. Perante a “natureza política” da avaliação, as escolas e os seus atores recorrem a “soluções organizacionais” que lhes permitem, em função dos interesses e dos objetivos individuais e organizativos, gerir as pressões e as expetativas do seu meio institucional. Integrada numa investigação mais ampla, em curso, com a finalidade de averiguar os efeitos do programa de AEE nas dinâmicas de autoavaliação e nos planos de ação para a melhoria da escola, na presente comunicação analisam-se as relações entre a avaliação e as mudanças ocorridas na escola. Questiona-se essencialmente: quais as mudanças ocorridas na escola na sequência dos processos avaliativos. O estudo geral no qual a comunicação se baseia insere-se numa matriz de cariz essencialmente qualitativo e opta pelo estudo de casos múltiplos, aplicado a cinco escolas. Como fonte de informação recorreu-se à observação, entrevistas, e inquérito por questionário. Nesta comunicação apresentam-se os resultados das entrevistas realizadas a diversos atores da comunidade educativa com diferentes funções nas escolas. Os resultados tendem a evidenciar que as organizações educativas, nas respostas às prescrições externas para a avaliação e melhoria da escola recorrem a estratégias e táticas plurais, de tal modo que as mudanças que ocorrem mais do que respostas à necessidade de eficácia e melhoria interna da escola, traduzem-se em processos de adaptação, que variam consoante as tensões existentes entre o contexto institucional e o ambiente competitivo onde as escolas estão inseridas

A avaliação das escolas: dos constrangimentos à melhoria da qualidade da educação

A problemática da avaliação das organizações escolares tem vindo a ocupar um lugar de destaque na agenda das políticas educativas, onde os processos de avaliação externa e de autoavaliação são apontados como instrumentos decisivos para a melhoria da qualidade do serviço educativo e para o desenvolvimento da escola. Este texto apresenta resultados parciais de uma investigação mais ampla, em curso, que se propôs averiguar de que modo o programa de Avaliação Externa das Escolas promove o desenvolvimento nas escolas de dinâmicas e práticas de autoavaliação que sustentam a elaboração de planos de ação para a melhoria e possibilitam a melhoria da escola. Trata-se de uma investigação inserida numa matriz de cariz essencialmente qualitativa e opta pelo estudo de casos múltiplos. No presente estudo restringe-se a abordagem e procura-se conhecer e refletir sobre os significados atribuídos pelos atores quanto à influência dos processos avaliativos nos processos de mudança, bem como, identificar os constrangimentos inte rnos e externos que se colocam à ocorrência de mudanças na escola na sequência dos processos avaliativos. Com estes objetivos foram realizadas um conjunto de entrevistas a diversos atores da comunidade educativa das diversas escolas em estudo. Os seus discursos tendem a evidenciar que as escolas, como organizações,possuem um papel crucial na implementação da melhoria educativa, sendo que as mudanças educativas dependem na sua implementação das condições organizacionais e da forma como os atores educativos, nos diversos contextos organizacionais, desenvolvem a capacidade interna de mudança, nem sempre coincidente com as prescrições externas para a mudança./ The thematic of evaluation of school organizations have come to occupy a prominent place in the educational policies, where the processes of self -evaluation and external evaluation are seen as crucial instruments to improving the quality of educational services and the development of school agenda. This paper presents partial results of a wider research in progress which are proposed to find out how the program and the External Evaluation of Schools in schools promotes the development of dynamic and self-evaluation practices that support the development of action plans for improvement and enable school improvement. It is inserted into an investigation of essentially qualitative nature mother and opts for a multiple case study. In the present study restricts itself to approach and endeavors to meet and reflect on the meanings attributed by actors about the influence of evaluative processes in the change process, as well as identifying the internal and external constraints to the occurrence of changes in school following the evaluation process. With these objectives a series of interviews with various stakeholders in the educational community of the various schools in the study were performed. His speeches tend to show that schools as organizations have a crucial role in the implementation of educational improvement, and educational changes depend on the implementation of the organizational conditions and how the educational actors in different organizational contexts, develop internal capacity for change, not always coincident with the external prescriptions for change

Efeitos da avaliação de escola nos processos de mudança e melhoria da escola

Numa perspetiva de confluência de eficácia e melhoria interna existem atualmente, no contexto educativo português, orientações legais para que as escolas sejam, por um lado, sujeitas a processos de avaliação externa e, por outro, induzidas a criar mecanismos de autoavaliação sobre si próprias. Embora a escola seja, pelo menos em parte, um “locus de reprodução normativa”, na prática não tem sido fácil o diálogo entre a avaliação externa e os processos de mudança e melhoria, através da autoavaliação institucional. Num contexto onde os objetivos são, por vezes, inconsistentes e não consensuais e as tecnologias pouco claras e frequentemente mal dominadas, a ação organizacional em torno dos processos avaliativos acaba por refletir o jogo dos atores. Perante a “natureza política” da avaliação, as escolas e os seus atores recorrem a “soluções organizacionais” que lhes permitem, em função dos interesses e dos objetivos individuais e organizativos, gerir as pressões e as expetativas do seu meio institucional. Integrada numa investigação mais ampla, em curso, com a finalidade de averiguar os efeitos do programa de avaliação externa das escolas (AEE) nas dinâmicas de autoavaliação e nos planos de ação para a melhoria da escola, na presente comunicação analisa-se as relações entre a avaliação e as mudanças ocorridas na escola. Questiona-se essencialmente: quais as mudanças ocorridas na escola na sequência dos processos avaliativos. O estudo geral no qual a comunicação se baseia insere-se numa matriz de cariz essencialmente qualitativo e opta pelo estudo de casos múltiplos, aplicado a cinco escolas (2 escolas secundárias e 3 agrupamentos de escola). Como fonte de informação recorreu-se à observação, entrevistas, e inquérito por questionário. Nesta comunicação apresentam-se essencialmente os resultados das trinta e sete entrevistas realizadas a atores da comunidade educativa com diferentes funções nas escolas. Os resultados preliminares tendem a evidenciar que as organizações educativas, nas respostas às prescrições externas para a avaliação da escola e para a melhoria recorrem a estratégias e táticas plurais, de tal modo que as mudanças que ocorrem nas estruturas, nos processos e nas práticas, mais do que respostas à necessidade de eficácia e melhoria interna da escola, traduzem-se em processos de adaptação, que variam consoante as tensões existentes entre o contexto institucional e o ambiente competitivo onde as escolas estão inseridas

Efeitos da avaliação de escola nos processos de mudança e melhoria da escola

No contexto educativo português existem, atualmente, orientações legais para que as escolas sejam, por um lado, sujeitas a processos de avaliação externa e, por outro, induzidas a criar mecanismos de autoavaliação. O trabalho que apresentamos integra um projeto de doutoramento, em curso, que se propôs a averiguar os efeitos do programa de avaliação externa das escolas (AEE) nas dinâmicas de autoavaliação e nos planos de ação para a melhoria da escola. Trata-se de uma investigação inserida numa matriz de cariz essencialmente qualitativo, que opta pelo estudo de casos múltiplos. No presente trabalho questiona-se essencialmente: quais as mudanças ocorridas na escola na sequência dos processos avaliativos? Metodologicamente recorreu-se à análise de conteúdo de 37 entrevistas realizadas com diferentes atores da comunidade educativa. Os resultados preliminares tendem a evidenciar que as escolas, nas respostas às prescrições externas para a avaliação e para a melhoria, recorrem a estratégias e táticas plurais. De igual modo, as mudanças que ocorrem nas estruturas, nos processos e nas práticas, mais do que respostas à necessidade de eficácia e melhoria interna da escola, traduzem-se em processos de adaptação, que variam consoante as tensões existentes entre o contexto institucional e o ambiente competitivo onde estão inseridas

Two distinct arabinofuranosidases contribute to arabino-oligosaccharide degradation in Bacillus subtilis.

Microbiology 154 (2008) 2719-2729Bacillus subtilis produces alpha-l-arabinofuranosidases (EC 3.2.1.55; AFs) capable of releasing arabinosyl oligomers and l-arabinose from plant cell walls. Here, we show by insertion-deletion mutational analysis that genes abfA and xsa(asd), herein renamed abf2, encode AFs responsible for the majority of the intracellular AF activity in B. subtilis. Both enzyme activities were shown to be cytosolic and functional studies indicated that arabino-oligomers are natural substrates for the AFs. The products of the two genes were overproduced in Escherichia coli, purified and characterized. The molecular mass of the purified AbfA and Abf2 was about 58 kDa and 57 kDa, respectively. However, native PAGE gradient gel analysis and cross-linking assays detected higher-order structures (>250 kDa), suggesting a multimeric organization of both enzymes. Kinetic experiments at 37 degrees C, with p-nitrophenyl-alpha-l-arabinofuranoside as substrate, gave an apparent K(m) of 0.498 mM and 0.421 mM, and V(max) of 317 U mg(-1) and 311 U mg(-1) for AbfA and Abf2, respectively. The two enzymes displayed maximum activity at 50 degrees C and 60 degrees C, respectively, and both proteins were most active at pH 8.0. AbfA and Abf2 both belong to family 51 of the glycoside hydrolases but have different substrate specificity. AbfA acts preferentially on (1-->5) linkages of linear alpha-1,5-l-arabinan and alpha-1,5-linked arabino-oligomers, and is much less effective on branched sugar beet arabinan and arabinoxylan and arabinogalactan. In contrast, Abf2 is most active on (1-->2) and (1-->3) linkages of branched arabinan and arabinoxylan, suggesting a concerted contribution of these enzymes to optimal utilization of arabinose-containing polysaccharides by B. subtilis.This work was partially supported by grant no. POCI/AGR/60236/2004 from the Fundacao para a Ciencia e Tecnologia (FCT) and FEDER to I. d. S.- N., and fellowship SFRH/BD/18238/2004 from the FCT to J. M. I

The cell wall and the response and tolerance to stresses of biotechnological relevance in yeasts

In industrial settings and processes, yeasts may face multiple adverse environmental conditions. These include exposure to non-optimal temperatures or pH, osmotic stress, and deleterious concentrations of diverse inhibitory compounds. These toxic chemicals may result from the desired accumulation of added-value bio-products, yeast metabolism, or be present or derive from the pre-treatment of feedstocks, as in lignocellulosic biomass hydrolysates. Adaptation and tolerance to industrially relevant stress factors involve highly complex and coordinated molecular mechanisms occurring in the yeast cell with repercussions on the performance and economy of bioprocesses, or on the microbiological stability and conservation of foods, beverages, and other goods. To sense, survive, and adapt to different stresses, yeasts rely on a network of signaling pathways to modulate the global transcriptional response and elicit coordinated changes in the cell. These pathways cooperate and tightly regulate the composition, organization and biophysical properties of the cell wall. The intricacy of the underlying regulatory networks reflects the major role of the cell wall as the first line of defense against a wide range of environmental stresses. However, the involvement of cell wall in the adaptation and tolerance of yeasts to multiple stresses of biotechnological relevance has not received the deserved attention. This article provides an overview of the molecular mechanisms involved in fine-tuning cell wall physicochemical properties during the stress response of Saccharomyces cerevisiae and their implication in stress tolerance. The available information for non-conventional yeast species is also included. These non-Saccharomyces species have recently been on the focus of very active research to better explore or control their biotechnological potential envisaging the transition to a sustainable circular bioeconomy