Caractérisation de la diversité des microorganismes symbiotiques de Pterocarpus officinalis dans des forêts marécageuses de Guadeloupe et Martinique

We have isolated 17 strains of rhizobiums from nodules collected on roots of Pterocarpus officinalis in different sites of swamp forest in Guadeloupe and Martinique. The genotypic diversity of these strains were characterized by PCR-RFLP analysis of the IGS (intergenic spacer) region between 16S and 23S rRNA genes, by using two 4-base restriction endonucleases Hae III and Msp I. Results of IGS PCR-RFLP analysis showed that restriction patterns were similar for DNA extract from root nodules and cultures of rhizobium strains. The diversity of these strains varied from one site to another. They were grouped into 5 ribotypes by IGS PCR-RFLP analysis. Results of IGS sequence analysis showed that the 5 ribotypes are very close to the genus Bradyrhizobium. The symbiotic properties of the 5 ribotypes were evaluated on Acacia seyal, a plant test that is able to form nodules with several Bradyrhizobium species. One month and nineteen days after inoculation, the green colour of the leaves and the best growth of inoculated seedlings contrasting with the yellow colour of the leaves and the lowest growth of uninoculated seedlings, were the parameters indicating the level of nitrogen-fixing activity of the three Bradyrhizobium strains. Concurrently, the vesicular and arbuscular mycorrhizal status of P. officinalis was established. The two types of symbiotic microorganisms could contribute to mobilize available phosphorus and nitrogen for improving the growth of P. officinalis in degraded swamp forestsNous avons isolé 17 souches de rhizobiums à partir de nodules récoltés sur des racines de Pterocarpus officinalis dans différents sites de forêt marécageuse en Guadeloupe et Martinique. La diversité de ces souches a été caractérisée par PCR-RFLP de l'intergène IGS situé entre les gènes nucléaires codant pour les ARNr 16S et 23S en utilisant deux enzymes de restriction Hae III et Msp I. Des profils RFLP obtenus par digestion de l'IGS d'extraits d'ADN de nodules ou de cultures bactériennes sont comparables. L'analyse de ces profils RFLP a révélé une hétérogénéité génétique des souches qui varie suivant les sites. Les 17 souches de P. officinalis ont été groupées en 5 ribotypes par comparaison de leur profil RFLP. L'analyse phylogénétique de l'IGS a montré que ces ribotypes sont très proches du genre Bradyrhizobium. Les propriétés symbiotiques d'un représentant de chaque groupe de souches ont été testées sur Acacia seyal, espèce qui nodule avec un grand nombre d'espèces de Bradyrhizobium. Un mois et dix neuf jours après inoculation, l'observation de la vigueur et de la couleur verte des parties aériennes des plantes inoculées, comparativement aux plantes témoins peu vigoureuses et de couleur jaune, ont été des paramètres indiquant le caractère fixateur de trois souches de Bradyrhizobium. Parallélement, la présence de champignons mycorhiziens à vésicules et à arbuscules a été révélée sur des racines de P. officinalis. Ces deux types de symbiose pourraient agir en synergie sur la mobilisation du phosphore et de l'azote pour améliorer la croissance de P. officinalis dans des forêts marécageuses dégradées

Phytogéographie tropicale : réalités et perspectives

Les modifications de la flore et de la structure forestière le long d'un gradient altitudinal, sont décrites pour le versant au vent des montagnes de Guadeloupe. Trois étages forestiers sont définis. Au-dessus de 400 ou 500 m d'altitude, la densité des peuplements augmente, la surface terrière diminue, la dominance des espèces abondantes s'accentue. L'analyse des distributions de fréquence de la densité permet l'interprétation suivante : en altitude, les conditions environnementales limitent la croissance des arbres ; la faiblesse des surfaces terrières explique qu'en sous-bois, l'éclairement permette l'établissement et le recrutement lents d'espèces peu tolérantes ; la régénération progresse sous les semenciers (imprégnation du site, auto-remplacement des espèces) ; à l'échelon local, cette flore dominée par des taxons peu tolérants, tend à se simplifier et à se perpétuer. (Résumé d'auteur

Caractérisation de la diversité des microorganismes symbiotiques de pterocarpus officinalis dans des forêts marécageuses de Guadeloupe et Martinique

We have isolated 17 strains of rhizobiums from nodules collected on roots of Pterocarpus officinalis in different sites of swamp forest in Guadeloupe and Martinique. The genotypic diversity of these strains were characterized by PCR-RFLP analysis of the IGS (inter-genic spacer) region between 16S and 23S rRNA genes, by using two 4-base restriction endonucleases Hae III and Msp I. Results of IGS PCR-RFLP analysis showed that restriction patterns were similar for DNA extract from root nodules and cultures of rhizobium strains. The diversity of these strains varied from one site to another. They were grouped into 5 ribotypes by IGS PCR-RFLP analysis. Results of IGS sequence analysis showed that the 5 ribotypes are very close to the genus Bradyrhizobium. The symbiotic properties of the 5 ribotypes were evaluated on Acacia seyal , a plant test that is able to form nodules with several Bradyrhizobium species. One month and nineteen days after inoculation, the green colour of the leaves and the best growth of inoculated seedlings contrasting with the yellow colour of the leaves and the lowest growth of uninoculated seedlings, were the parameters indicating the level of nitrogen-fixing activity of the three Bradyrhizobium strains. Concurrently, the vesicular and arbuscular mycorrhizal status of P. officinalis was established. The two types of symbiotic microorganisms could contribute to mobilize available phosphorus and nitrogen for improving the growth of P. officinalis in degraded swamp forests.Nous avons isolé 17 souches de rhizobiums à partir de nodules récoltés sur des racines de Pterocarpus officinalis dans différents sites de forêt marécageuse en Guadeloupe et Martinique. La diversité de ces souches a été caractérisée par PCR-RFLP de l’intergène IGS situé entre les gènes nucléaires codant pour les ARNr 16S et 23S en utilisant deux enzymes de restriction Hae III et Msp I. Des profils RFLP obtenus par digestion de l’IGS d’extraits d’ADN de nodules ou de cultures bactériennes sont comparables. L’analyse de ces profils RFLP a révélé une hétérogénéité génétique des souches qui varie suivant les sites. Les 17 souches de P. officinalis ont été groupées en 5 ribotypes par comparaison de leur profil RFLP. L’analyse phylogénétique de l’IGS a montré que ces ribotypes sont très proches du genre Bradyrhizobium. Les propriétés symbiotiques d’un représentant de chaque groupe de souches ont été testées sur Acacia seyal , espèce qui nodule avec un grand nombre d’espèces de Bradyrhizobium. Un mois et dix neuf jours après inoculation, l’observation de la vigueur et de la couleur verte des parties aériennes des plantes inoculées, comparativement aux plantes témoins peu vigoureuses et de couleur jaune, ont été des paramètres indiquant le caractère fixateur de trois souches de Bradyrhizobium. Parallèlement, la présence de champignons mycorhiziens à vésicules et à arbuscules a été révélée sur des racines de P. officinalis. Ces deux types de symbiose pourraient agir en synergie sur la mobilisation du phosphore et de l’azote pour améliorer la croissance de P. officinalis dans des forêts marécageuses dégradées.Bâ Amadou M., Samba R., Sylla S. N., Le Roux C., Neyra M., Rousteau A., Imbert D., Toribio A. Caractérisation de la diversité des microorganismes symbiotiques de pterocarpus officinalis dans des forêts marécageuses de Guadeloupe et Martinique . In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), tome 59, n°1-2, 2004. pp. 163-170

Risk factors for West Nile virus seropositivity of equids in Guadeloupe

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