IgG autoantibody to brain beta tubulin III associated with cytokine cluster-II discriminate cerebral malaria in central India

We investigated the significance of these self-reactive antibodies in clinically well-defined groups of P. falciparum infected patients manifesting mild malaria (MM), severe non-cerebral malaria (SM), or cerebral malaria (CM) and in control subjects from Gondia, a malaria epidemic site in central India using quantitative immunoprinting and multivariate statistical analyses. A two-fold complete-linkage hierarchical clustering allows classifying the different patient groups and to distinguish the CM from the others on the basis of their profile of IgG reactivity to brain proteins defined by PANAMA Blot. We identified beta tubulin III (TBB3) as a novel discriminant brain antigen in the prevalence of CM. In addition, circulating IgG from CM patients highly react with recombinant TBB3. Overall, correspondence analyses based on singular value decomposition show a strong correlation between IgG anti-TBB3 and elevated concentration of cluster-II cytokine (IFNγ, IL1β, TNFα, TGFβ) previously demonstrated to be a predictor of CM in the same populatio

La pomme de terre. Production, amélioration, ennemis et maladies, utilisations

National audienc

Evaluation et homologation de variétés issues des vergers à graines de l'Etat - programme 2017. Rapport final

This report describes the work done in 2017 by Irstea, INRA, ONF and CNPF in the frame of a joint research programme dedicated to seed orchard testing. Two species or groups of species were involved: Douglas-fir and larch. With regard to Douglas-fir, the common network of comparative trials has recently been completed. Actions now aim to improve our knowledge on the performance of the 8 French seed orchards considering adaptive traits, vigor and stem form. In 2017, first results were obtained for three additional traits: growth in diameter, branch angle and branch density. For larch, the 'calling card' of the hybrid variety Rêve-vert enlarged with new results for important wood traits. In addition, other studies were continued: artificial inoculation of larch canker to assess clone vulnerability, identification of hybrid materials using near infrared spectrometry (NIRS).Ce rapport présente les actions entreprises en 2017 par Irstea, l'INRA, l'ONF et le CNPF dans le cadre de l'évaluation des variétés issues des vergers à graines de l'Etat. Elles concernent le Douglas et les mélèzes. Pour le Douglas, le réseau national d'évaluation des vergers à graines de l'Etat se trouve à présent dans sa configuration définitive. Les principales actions visent à comparer les performances des variétés pour des caractères adaptatifs, la croissance et la forme de l'arbre. En 2017, de premiers résultats ont été obtenus pour trois nouveaux caractères : la croissance en diamètre, la densité de branches et leur angle d'insertion. Pour le mélèze, la connaissance des performances de la variété hybride Rêve-vert a progressé grâce à la caractérisation de caractères déterminant la qualité du bois (densité et duraminisation). D'autre part, plusieurs études se sont poursuivies : estimation de la vulnérabilité au chancre des clones des vergers de mélèze d'Europe, identification des hybrides par spectrométrie infrarouge

Analogues structuraux de la serotonine comme marqueurs d'affinite des recepteurs serotoninergiques

International audienceDerivatives of serotonine and bufotenine are synthesized as potential electrophilic or photoactivable labels for the serotoninergic sites. The most promising compound is the azidoethyl-3 indole derivative 13 which presents a high affinity for the site; the corresponding binding appears specific and irreversible after photoactivation

Evaluation et homologation de variétés issues des vergers à graines de l'Etat - Programme 2016

This report shows the work done in 2016 by Irstea, INRA, ONF and CNPF in the frame of a joint research programme dedicated to improved variety testing. Three species or groups of species are involved: Douglas-fir, larches and ash. With regard to Douglas-fir, the actions aim to enlarge the common network of comparative trials and compare the performance of the 8 French varieties for survival, health, growth, branching, cold hardiness and drought resistance. For larch, the results mainly concern the performance of hybrid varieties at the adult stage (12 to 20 years after planting). The studied traits include survival, resistance to heat and drought, growth in height and diameter, stem straightness, and resistance to larch canker. The work dedicated to ash mainly concerns resistance to Hymenoscyphus fraxineus.Ce rapport présente les actions entreprises en 2016 par Irstea, l'INRA, l'ONF et le CNPF dans le cadre de l'évaluation des variétés issues des vergers à graines de l'Etat. Elles concernent 3 essences : Douglas, mélèzes et frêne commun. Pour le Douglas, les principales actions visent, d'une part, à compléter le réseau de plantations comparatives et, d'autre part, à comparer les performances des 8 variétés françaises pour la survie, l'état sanitaire, la croissance en hauteur et en diamètre, la forme, l'acclimatation au froid et la résistance à des stress hydriques. Pour le mélèze, de nouveaux résultats permettent de comparer des variétés hybrides et des espèces parentes, françaises et étrangères, au stade adulte (12 à 20 ans après la plantation). Les caractères étudiés incluent la survie, la résistance à la canicule, la croissance en hauteur et diamètre, la rectitude du tronc et la résistance au chancre. Les travaux relatifs au frêne concernent essentiellement la vulnérabilité à la chalarose

Evaluation et homologation de variétés issues des vergers à graines de l'Etat - programme 2013

This report shows the work done in 2013 by Irstea, INRA, ONF and CNPF in the framework of a research programme dedicated to improved varieties testing. Six species are concerned: Douglas-fir, larch, black pine, Scots pine, wild cherry and ash. A large part of the report deals with results obtained in Douglas-fir, in a recently established network of comparative trials that aims to compare the 8 French seed orchards, and in indoor drought experiments.Ce rapport présente les actions entreprises de mars 2013 à mars 2014 par Irstea, l'INRA, l'ONF et le CNPF dans le cadre de l'évaluation des variétés issues des vergers à graines de l'Etat. Elles concernent 6 espèces : Douglas, mélèzes, pins Laricio, pin sylvestre, merisier et frêne. Une large part du rapport est consacrée aux résultats obtenus sur Douglas, au champ dans un réseau d'évaluation récemment installé pour évaluer les 8 variétés françaises de Douglas, et en conditions contrôlées sous serre

Evaluation et homologation de variétés issues des vergers à graines de l'Etat - programme 2015. Rapport final

This report shows the work done in 2015 by Irstea, INRA, ONF and CNPF in the frame of a joint research programme dedicated to improved variety testing. Four species or groups of species are involved: Douglas-fir, larches, Norway spruce and ash. With regard to Douglas-fir, the actions aim to enlarge the common network of comparative trials and compare the performance of French varieties for survival, health, growth, branching, cold hardiness and drought resistance. For larch, the results mainly concern i) performance of hybrids versus non-hybrid progenies, ii) the variation of hybrid percentage over time, from the seed lot to the thinned stand and iii) the origin of the clones that compose the two French seed orchards of Sudeten larch. At last, across site analyses give information about the worth of a seed orchard of Norway spruce (Rachovo provenance).Ce rapport présente les actions entreprises en 2015 par Irstea, l'INRA, l'ONF et le CNPF dans le cadre de l'évaluation des variétés issues des vergers à graines de l'Etat. Elles concernent 4 espèces : Douglas, mélèzes, épicéa commun et frêne. Pour le Douglas, les principales actions visent, d'une part, à compléter le réseau de plantations comparatives et, d'autre part, à comparer les performances des variétés pour la survie, l'état sanitaire, la croissance en hauteur et en diamètre, la forme, l'acclimatation au froid et la résistance à des stress hydriques. Les résultats liés aux mélèzes concernent principalement i) la comparaison de descendances hybrides et d'espèces parentales, ii) l'évolution du taux d'hybrides entre les lots de graines, la pépinière et le jeune peuplement et iii) la détermination de l'origine des clones composant les vergers français de mélèze d'europe 'Sudètes'. Enfin, une analyse multisite a permis d'évaluer les produits du verger d'épicéa Rachovo pour des caractères d'adaptation, de vigueur et de branchaison

Evaluation et homologation de variétés issues des vergers à graines de l'Etat - programme 2014. Rapport final

This report shows the work done in 2014 by Irstea, INRA, ONF and CNPF in the framework of a research programme dedicated to improved varieties testing. It includes six species: Douglas-fir, larch, Norway spruce, black pine, wild cherry and ash. With regard to Douglas-fir, the results concern i) survival, health and height growth of French varieties (measurements done in 8 trials included in a recent network of comparative trials that aims to compare the eight French seed orchards), ii) actions undertaken to broaden this network, iii) cold hardiness, iv) resistance to drought (cavitation) and v) lateness of flushing of progenies produced by the clones of a French seed orchard (Californie). Results related to larch mainly concern the modulus of elasticity of hybrid and non-hybrid progenies produced in five European hybridisation orchards.Ce rapport présente les actions entreprises en 2014 par Irstea, l'INRA, l'ONF et le CNPF dans le cadre de l'évaluation des variétés issues des vergers à graines de l'Etat. Elles concernent 6 espèces : Douglas, mélèzes, épicéa commun, pins laricio, merisier et frêne. Pour ce qui concerne le Douglas, les résultats concernent i) la survie, l’état sanitaire et la croissance en hauteur des 8 variétés françaises (mesures effectuées dans 8 dispositifs du réseau d’évaluation national) ii) les actions entreprises pour étendre ce réseau, iii) l’acclimatation au froid, iv) la résistance à la sécheresse (résistance à la cavitation) et v) la tardiveté de débourrement des descendances du verger « Californie » utilisable en zone méditerranéenne. Les actions liées aux mélèzes concernent principalement des mesures de module d’élasticité sur des descendances hybrides et non hybrides de 5 vergers d’hybridation européens

Experimental assessment of the accuracy of genomic selection in sugarcane

The authors wish to thank T. Dumont, C. Lallemand, I. Promi, R. Tibere, M. Carbel, J. M. Coupan, O. Calvados and N. Lubin for field work, M. Hoarau for lab work. This study was funded by the eRcane company, by CIRAD (Centre de Cooperation Internationale en Recherche Agronomique pour le Developpement) ATP-SEPANG project grant, by the Conseil Regional de la Reunion, by the European Union (European regional development fund-ERDF), by ANR (Agence Nationale de la Recherche) Delicas project grant ANR-08-GENM-001, ANR Grass biofuel project grant ANR-07-GPLA-018-005 and by the ANRT (Association Nationale de la Recherche et de la Technologie) through the CIFRE Ph.D grant No600/2012 of M. Gouy.International audienceSugarcane cultivars are interspecific hybrids with an aneuploid, highly heterozygous polyploid genome. The complexity of the sugarcane genome is the main obstacle to the use of marker-assisted selection in sugarcane breeding. Given the promising results of recent studies of plant genomic selection, we explored the feasibility of genomic selection in this complex polyploid crop. Genetic values were predicted in two independent panels, each composed of 167 accessions representing sugarcane genetic diversity worldwide. Accessions were genotyped with 1,499 DArT markers. One panel was phenotyped in Reunion Island and the other in Guadeloupe. Ten traits concerning sugar and bagasse contents, digestibility and composition of the bagasse, plant morphology, and disease resistance were used. We used four statistical predictive models: bayesian LASSO, ridge regression, reproducing kernel Hilbert space, and partial least square regression. The accuracy of the predictions was assessed through the correlation between observed and predicted genetic values by cross validation within each panel and between the two panels. We observed equivalent accuracy among the four predictive models for a given trait, and marked differences were observed among traits. Depending on the trait concerned, within-panel cross validation yielded median correlations ranging from 0.29 to 0.62 in the Reunion Island panel and from 0.11 to 0.5 in the Guadeloupe panel. Cross validation between panels yielded correlations ranging from 0.13 for smut resistance to 0.55 for brix. This level of correlations is promising for future implementations. Our results provide the first validation of genomic selection in sugarcane