Rational design of an estrogen receptor mutant with altered DNA-binding specificity

Although artificial C2-H2 zinc fingers can be designed to recognize specific DNA sequences, it remains unclear to which extent nuclear receptor C4 zinc fingers can be tailored to bind novel DNA elements. Steroid receptors bind as dimers to palindromic response elements differing in the two central base pairs of repeated motifs. Predictions based on one amino acid—one base-pair relationships may not apply to estrogen receptors (ERs), which recognize the two central base pairs of estrogen response elements (EREs) via two charged amino acids, each contacting two bases on opposite DNA strands. Mutagenesis of these residues, E203 and K210 in ERα, indicated that both contribute to ERE binding. Removal of the electric charge and steric constraints associated with K210 was required for full loss of parental DNA-binding specificity and recognition of novel sequences by E203 mutants. Although some of the new binding profiles did not match predictions, the double mutation E203R-K210A generated as predicted a mutant ER that was transcriptionally active on palindromes of PuGCTCA motifs, but not on consensus EREs. This study demonstrates the feasibility of designing C4 zinc finger mutants with novel DNA-binding specificity, but also uncovers limitations of this approach

Characterization of a phage infecting Propionibacterium freudenreichii

Bacteriophage 822 was isolated from a Swiss-type cheese. Out of 30 strains ofPropionibacterium freudenieichii, only the strain TL 110 was sensitive to this phage. 822 morphology isvery similar to those of phages infecting P acnes. It has an' isometric head, a non-contractile taïl and atail plate, so it belongs to the 81 group of 8radley's classifiCation. The 822 genome consists of a Iineardouble-stranded DNA molecule 40 kb long with cohésive ends. ".Caractérisation d'un bactériophage infectant Propionibacterium freudenreichii. Lebactériophage B22 a été isolé à partir d'un fromage à pâte pressée cuite. 1/ n'infecte qu'une souche(TL 110) sur les 30 souches de Propionibacterium freudenreichii testées. Morphologiquement, B22 ressemblebeaucoup aux phages infectant P acnes. Sa tête est un icosahèdre, sa queue est non contractileet il possède une plaque basale. 1/ se trouve donc dans le groupe B1de la classification de Bradley.Son génome est constitué d'une, molécule d'ADN double brin de 40 kilobases possédant desextrémités cohésives

Characterization of a phage infecting Propionibacterium freudenreichii

Bacteriophage 822 was isolated from a Swiss-type cheese. Out of 30 strains ofPropionibacterium freudenieichii, only the strain TL 110 was sensitive to this phage. 822 morphology isvery similar to those of phages infecting P acnes. It has an' isometric head, a non-contractile taïl and atail plate, so it belongs to the 81 group of 8radley's classifiCation. The 822 genome consists of a Iineardouble-stranded DNA molecule 40 kb long with cohésive ends. ".Caractérisation d'un bactériophage infectant Propionibacterium freudenreichii. Lebactériophage B22 a été isolé à partir d'un fromage à pâte pressée cuite. 1/ n'infecte qu'une souche(TL 110) sur les 30 souches de Propionibacterium freudenreichii testées. Morphologiquement, B22 ressemblebeaucoup aux phages infectant P acnes. Sa tête est un icosahèdre, sa queue est non contractileet il possède une plaque basale. 1/ se trouve donc dans le groupe B1de la classification de Bradley.Son génome est constitué d'une, molécule d'ADN double brin de 40 kilobases possédant desextrémités cohésives

Ventilator modes and settings during non-invasive ventilation: effects on respiratory events and implications for their identification.

Compared with invasive ventilation, non-invasive ventilation (NIV) has two unique characteristics: the non-hermetic nature of the system and the fact that the ventilator-lung assembly cannot be considered as a single-compartment model because of the presence of variable resistance represented by the upper airway. When NIV is initiated, the ventilator settings are determined empirically based on a clinical evaluation and diurnal blood gas variations. However, NIV is predominantly applied during sleep. Consequently, to assess overnight patient-machine 'agreement' and efficacy of ventilation, more specific and sophisticated monitoring is needed. The effectiveness of NIV might therefore be more correctly assessed by sleep studies than by daytime assessment. The most available and simple monitoring can be done from flow and pressure curves from the mask or the ventilator circuit. Examination of these tracings can give useful information to evaluate if the settings chosen by the operator were the right ones for that patient. However, as NIV allows a large range of ventilatory parameters and settings, it is mandatory to have information about this to better understand patient-ventilator interaction. Ventilatory modality, mode of triggering, pressurisation slope, use or not of positive end expiratory pressure and type of exhalation as well as ventilator performances may all have physiological consequences. Leaks and upper airway resistance variations may, in turn, modify these patterns. This article discusses the equipment available for NIV, analyses the effect of different ventilator modes and settings and of exhalation and connecting circuits on ventilatory traces and gives the background necessary to understand their impact on nocturnal monitoring of NIV

Modes ventilatoires et réglages en ventilation non invasive: retentissement sur les évènements respiratoires et implications dans leur identification

Comparé au mode invasif, la ventilation non invasive (VNI) a deux caractéristiques : sa nature non hermétique et le fait que le couple poumon–ventilateur ne peut pas être considéré comme un modèle à un seul compartiment de par l’interposition de la voie aérienne supérieure (VAS). À l’initiation de la VNI, les réglages du ventilateur sont déterminés sur la clinique et les variations de la gazométrie diurne. Cependant la VNI s’applique principalement pendant le sommeil, et une évaluation nocturne est nécessaire pour estimer la « bonne entente » patient–ventilateur. Le monitorage le plus avéré est apporté par les courbes de débit et pression au masque. Cependant, la VNI permet une large gamme de réglages. Il est nécessaire de les connaître pour comprendre l’interaction patient–ventilateur. Le mode ventilatoire, le type de déclenchement, la pente, l’utilisation d’une pression positive expiratoire et le type d’exhalation mais aussi les performances du ventilateur peuvent avoir des retentissements. Des fuites et des variations de résistance des VAS peuvent aussi modifier ces courbes. Cet article discute du matériel disponible pour la VNI, analyse l’effet des modes ventilatoires, réglages et systèmes d’exhalation sur les tracés. Son but : donner les bases nécessaires pour comprendre leur impact sur le monitorage de la VNI.Compared with invasive ventilation, non-invasive ventilation (NIV) has two unique characteristics: its non-hermetic nature and the fact that the ventilator-lung assembly cannot be considered as a single-compartment model because of the presence of variable resistance represented by the upper airways. When NIV is initiated, the ventilator settings are determined empirically based on clinical evaluation and blood gas variations. However, NIV is predominantly applied during sleep. Consequently, to assess overnight patient-machine "agreement" and efficacy of ventilation, more specific and sophisticated monitoring is needed. The effectiveness of NIV might therefore be more correctly assessed by sleep studies than by daytime assessment. The simplest monitoring can be done from flow and pressure curves from the mask or the ventilator circuit. Examination of these tracings can give useful information to evaluate if the settings chosen by the operator were the right ones for that patient. However, as NIV allows a large range of ventilatory parameters and settings, it is mandatory to have information about this to better understand patient-ventilator interaction. Ventilatory modality, mode of triggering, pressurization slope, use or not of positive end expiratory pressure and type of exhalation as well as ventilator performances may all have physiological consequences. Leaks and upper airway resistance variations may, in turn, modify these patterns. This article discusses the equipment available for NIV, analyses the effect of different ventilator modes and settings and of exhalation and connecting circuits on ventilatory traces and gives the background necessary to understand their impact on nocturnal monitoring of NIV

Perspectives ouvertes par une approche intégrée des processus de dynamique, de fonctionnement et de diversité: le cas du Mont Ventoux

L'évolution des écosystèmes forestiers résulte de l'interaction entre processus écologiques etactes de gestion. Le contexte du changement global et particulièrement celui l'évolution du climatremet en question l'adaptation de ces écosystèmes. Le terme d'adaptation doit être ici considéré danstoute sa polysémie : adéquation du système biologique aux conditions environnementales à uninstant donné, processus évolutif et action anthropique. Face au changement, le fonctionnement desécosystèmes forestiers doit plus que jamais être considéré dans une perspective dynamique où laquestion du temps, célérité des changements et temps de réponse des forêts, est primordiale. Deplus, compte tenu des nombreuses incertitudes (concernant le changement lui-même, les réponsesbiologiques à des conditions inédites, le comportement d'un écosystème complexe ou l'impact àmoyen terme des mesures adaptatives), le principal enjeu est de guider la gestion à partir de sesimpacts probables sur les trajectoires du système, de gérer les transitions, plutôt que de chercher àfiger un idéal à moyen ou long-terme. Pour relever le défi de l'adaptation d'écosystèmes complexescomme les forêts, il faut donc comprendre les processus en jeu et les intégrer dans des modèlespermettant de réaliser une pluralité de scénarios

Apoptosis without decrease of cell DNA content

International audienc