53 research outputs found
Conventional versus molecular tests (Multiplex PCR and PCR mecA gene) for detection of methicillin resistant Staphylococcus aureus
Terapia Empírica Inapropriada no Tratamento de Infecções de Corrente Sanguínea na Era da Multirresistência Antimicrobiana
Background and objectives: Bloodstream infection (BSI) by multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa is a severe infection. This study aimed to evaluate and identify the predictors of mortality in patients who had bloodstream infection by carbapenem-resistant P. aeruginosa. Methods: This is a retrospective cohort study, approved by Committee of Ethics in Research with Human Participants, which included 87 consecutive patients hospitalized in a referral hospital in Brazil. Clinical and demographic information about each patient were obtained from hospital records. The Student’s T-test was used to compare continuous variables and x2 or Fisher’s exact tests to compare categorical variables. To determine independent risk factors for 30-day mortality, a multiple logistic regression model was used. A survival curve was constructed using the Kaplan–Meier method. Results: Among the patients, 87.3% use antibiotics previously, 60.9% received inadequate empirical treatment, and the 30-day mortality rate was 57.5%. Inappropriate antibiotic empirical therapy was independently associated with a 30-days death and mortality rate. Conclusion: These findings can show some insights about the relationship between higher mortality and inappropriate empirical therapy for patients with BSI by P. aeruginosa. There is a need for better diagnostic tests and infection control programs should focus on de-escalation the antibiotic inappropriate therapy, mainly in BSI caused by carbapenem-resistant P. aeruginosa.Justificación y objetivos: La infección del torrente sanguíneo por Pseudomonas aeruginosa multirresistente es grave. Este estudio tuvo como objetivo evaluar e identificar predictores de mortalidad en pacientes ingresados en una Unidad de Cuidados Intensivos que presentaban infección del torrente sanguíneo por P. aeruginosa resistente a carbapenémicos. Métodos: Se trata de un estudio de cohorte retrospectivo, aprobado por el Comité de Ética en Investigación con Participantes Humanos, que incluyó 87 pacientes consecutivos ingresados en un hospital de referencia en Brasil. La información clínica y demográfica de cada paciente se obtuvo mediante el análisis de las historias clínicas de los pacientes. Se utilizó la prueba t de Student para comparar variables continuas y x2 o prueba exacta de Fisher para comparar variables categóricas. Para determinar los factores de riesgo independientes para la mortalidad a los 30 días, se utilizó un modelo de regresión logística múltiple. Se construyó una curva de supervivencia utilizando el método de Kaplan-Meier. Resultados: Del total de pacientes, el 87,3% utilizaba antibióticos previamente, el 60,9% recibió tratamiento empírico inadecuado y la tasa de mortalidad a los 30 días fue del 57,5%. La terapia empírica inadecuada fue un factor de riesgo independiente de mortalidad. Conclusión: Estos hallazgos revelan algunos conocimientos sobre la relación entre el aumento de la mortalidad y la terapia empírica inadecuada para los pacientes con infección del torrente sanguíneo por P. aeruginosa. Además, destacan la necesidad de mejores pruebas de diagnóstico y los programas de control de infecciones deben centrarse en reducir la terapia con antibióticos inapropiados, particularmente en infección del torrente sanguíneo causados por P. aeruginosa resistente a carbapenémicos.Justificativa e objetivos: Infecção da corrente sanguínea (ICS) por Pseudomonas aeruginosa multirresistente é grave. Este estudo teve como objetivo avaliar e identificar os preditores de mortalidade em pacientes admitidos em uma Unidade de Terapia Intensiva que apresentaram infecção da corrente sanguínea por P. aeruginosa resistente aos carbapenêmicos. Métodos: Trata-se de um estudo de coorte retrospectivo, aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa com Seres Humanos, que incluiu 87 pacientes consecutivos internados em um hospital de referência no Brasil. As informações clínicas e demográficas de cada paciente foram obtidas através de análise dos prontuários dos pacientes. O teste T de Student foi usado para comparar variáveis contínuas e o teste x2 ou exato de Fisher para comparar variáveis categóricas. Para determinar fatores de risco independentes para mortalidade em 30 dias, foi utilizado um modelo de regressão logística múltipla. Uma curva de sobrevida foi construída pelo método de Kaplan-Meier. Resultados: Do total de pacientes, 87,3% faziam uso prévio de antibióticos, 60,9% receberam tratamento empírico inadequado e a mortalidade em 30 dias foi de 57,5%. A terapia empírica inadequada foi fator de risco independente para mortalidade. Conclusão: Esses achados revelam alguns insights sobre a relação entre maior mortalidade e terapia empírica inadequada para pacientes com ICS por P. aeruginosa. Além disso, destacam a necessidade de melhores testes diagnósticos e os programas de controle de infecção devem se concentrar na redução da terapia inadequada com antibióticos, principalmente na ICS causada por P. aeruginosa resistente a carbapenêmicos
Disseminação de microrganismos multirresistentes: uma ameça global e um problema de saúde crítico
Multidrug-resistant organisms are usually associated with greater number of clinical manifestations and severe infections than those caused by susceptible pathogens. The high prevalence of antimicrobial resistance is a global concern, mainly in Latin America, where resistance levels are higher for important pathogens such as Gram-negative non-fermentative bacteria and Enterobacteriacae family, compared with those seen in US hospitals and Europe. The use of antimicrobial agents for the treatment of these infections is advantageous for the multidrug-resistant pathogens and contributes to the maintenance of the genetic determinants of resistance. Countries like Brazil, characterized by the allocation of limited financial resources for the health department, have in the infection prevention and control practices an economical necessity, because of the increased costs that nosocomial infection demand in addition to the reduction of rates morbidity and mortality
Exploring the staphylococcus aureus in patients infected of the tertiary-care university hospital: results of the retrospective cohort study
Objective: To establish a baseline of knowledge regarding about inappropriate therapy, virulence and resistance in a cohort of patients infected with S. aureus. Methods: Retrospective cohort study in tertiary-care university hospital was employed to evaluate the risk factors and the impact of inappropriate therapy among patients with Staphylococcus aureus infections, resistance and virulence. To assess the presence of the genes was performed PCR. Results: Patients with MRSA were older and hospitalized 17 days longer than those with MSSA infection, which were in ICU with a bloodstream infection. 50.0% received inadequate antibiotic therapy and we found virulence factors associated with MRSA (mecA, LukS, fnbB and clfA genes). Conclusion: These data show that surveillance studies related to Staphylococcus aureus infections remain essential to identify resistance and inform policy on resistance
Biofilm formation of Brazilian meticillin-resistant Staphylococcus aureus strains: prevalence of biofilm determinants and clonal profiles
Biofilms plays an important role in medical-device-related infections. This study aimed to determine the factors that influence adherence and biofilm production, as well as the relationship between strong biofilm production and genetic determinants in clinical isolates of meticillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). Fifteen strains carrying different chromosomal cassettes recovered from hospitalized patients were selected; five SCCmecII, five SCCmecIII and five SCCmecIV. The SCCmec type, agr group and the presence of the virulence genes (bbp, clfA, icaA, icaD, fnbB, bap, sasC and IS256) were assessed by PCR. PFGE and multilocus sequence typing (MLST) techniques were also performed. The initial adhesion and biofilm formation were examined by quantitative assays. The surface tension and hydrophobicity of the strains were measured by the contact angle technique to evaluate the association between these parameters and adhesion ability. SCCmecIII and IV strains were less hydrophilic, with a high value for the electron acceptor parameter and higher adhesion in comparison with SCCmecII strains. Only SCCmecIII strains could be characterized as strong biofilm producers. The PFGE showed five major pulsotypes (AE); however, biofilm production was related to the dissemination of one specific PFGE clone (C) belonging to MLST ST239 (Brazilian epidemic clonal complex). The genes agrI, fnbB and IS256 in SCCmecIII strains were considered as genetic determinants associated with strong biofilm-formation by an ica-independent biofilm pathway. This study contributes to the understanding of biofilm production as an aggravating factor potentially involved in the persistence and severity of infections caused by multidrug-resistant MRSA belonging to this genotype.We thank FAPEMIG (Fundação de Amparo à Pesquisa de Minas Gerais, proceeding APQ 01398-11) and CAPES (Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, PDSE proceeding 8952/11-6) for the financial support and scholarships. We also thank Dr Teruyo Ito, Juntendo University, Japan, and Dr Elsa Masae Mamizuka, Universidade de São Paulo, Brazil, for kindly providing the control strains used in this study.info:eu-repo/semantics/publishedVersio
Nosocomial infections in a pediatric intensive care unit of a developing country: NHSN surveillance
Avaliação de presença de Enterococos resistentes a Vancomicina no Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia.
Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação)Foi realizado um estudo de incidência, no período de Abril - Setembro de 1996, em pacientes infectados e/ou colonizados por VRE (Vancomycin-Resistant Enterococcus), utilizando-se dois sistemas de vigilância: (A) Pacientes em uso de vancomicina internados na enfermaria de Clínica Médica e, (B) Laboratorial de microbiologia do Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia
Hospital infections in elderly patients: classic and molecular epidemiological aspects associated with Staphylococcus aureus and Enterococcus spp
Three one-week survey was conducted to determine the prevalence rate of nosocomial infections in elderly patients (65 years of age or older). We examined nosocomial and community infections rates and their relationship with intrinsic and extrinsic risk factors in a Brazilian University Hospital. Additionally, a colonization survey was carried out from their nares, oropharynx and intestine the presence of Staphylococcus aureus and Enterococcus spp.
Finally, a laboratory surveillance was conducted during the period to detected nosocomial bacteremias by this organisms considering adults patients and elderly patients. Isolates were identified to species levei by classical methods and antimicrobial susceptibility by using gel diffusion and diluition methods. mecA gene and van genes were investigate in MRSA isolates (“Methicillin- resistant Staphylococcus aureus”) and Enterococcus spp., respectively, by polymerase chain reaction. The pulsed-fíeld gel electrophoresis (PFGE) pattems to eleven Enterococcus isolates recovered in different clinics/services was performed. The overall prevalence of elderly patients with nosocomial and community infections were 16,1% and 25,6%, respectively without dififerences when compared with adults patients. On the other hand, when the elderly group was considered almost all risk factors (use of antibiotics, invasive devices, surgery and time o f hospitalization) were found to be significantly associated with hospital infection. The colonization rate for Staphylococcus aureus was high (55,6% in nostril and 38,9% in intestine), with 39% o f the isolates oxacillin resistant. Risk factors to nosocomial bacteremias by MRSA included: more than one diagnostic, surgery, time o f hospitalization, use o f antibiotics and devices invasives, but was not related with advanced age (60 years of age or older). We describe the first isolate of vancomycin-resistant Enterococcus faecalis (vanA) in a surgical patient, poly-traumatic, vancomycin and 3thcephalosporins treated. The strain was clonally related as shown by PFGE to another isolate who was not the same ward and was treated of different time.Tese (Doutorado)Foi analisada uma coorte de 155 pacientes idosos (> 65 anos), selecionados através de estudos de prevalência repetidos em Janeiro/1999, Fevereiro/2000 e Outubro/2000. Foram avaliadas as taxas de infecções hospitalares e comunitárias, principais síndromes infecciosas e os fatores de risco intrínsecos e extrínsecos relacionados, em pacientes adultos e idosos.
Adicionalmente, foram realizadas coletas de materiais clínicos provenientes da narina, boca e cavidade anal para a pesquisa de Staphylococcus aureus e Enterococcus spp. Foi realizada uma vigilância no laboratório de Microbiologia do Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia (HC-UFU), de bacteremias hospitalares por esses microrganismos em pacientes adultos, incluindo os idosos; os isolados foram identificados em nível de gênero e espécies por testes tradicionais e a resistência “/« vitro" aos antimicrobianos foi determinada através dos testes de difusão e diluição em gel. Foi detectada ainda a presença do gene mecA. e genes van em amostras de MRSA (“Methicillin-resistant Staphylococcus aureus") e enterococos, respectivamente, através da técnica multiplex PCR. Os graus de similaridade genética entre amostras de Enterococcus selecionadas, considerando-se as clínicas/serviços mais representativas foram analisadas através do PFGE (“Pulsed-field Gel Electrophoresis”).
As taxas de infecções hospitalares e comunitárias foram 16,1% e 25,6%, respectivamente, sem diferenças estatísticas entre adultos e idosos. Quando a análise estatística incluiu apenas os idosos, praticamente todos os fatores de risco considerados foram associados com infecção hospitalar, com destaque para: tempo de hospitalização longo, em uso de antibiótico e de mais de dois procedimentos invasivos sobressaindo cateter intravascular e cirurgia. Os pacientes idosos apresentaram uma alta taxa de colonização por Staphylococcus aureus (55,6% na narina e 38,9% no intestino), com 39,0% de resistência à oxacilina. A análise univariada dos fatores de risco para bacteremias hospitalares por MRSA indicou significância para osseguintes: presença de mais de um diagnóstico, paciente cirúrgico, tempo de internação, uso de antibióticos e procedimentos invasivos como sonda vesical e dreno, sem no entanto relação de risco com os pacientes com mais de 60 anos. É descrito o primeiro isolado de Enterococcus faecalis (vanA) em uma paciente com episódio de infecção cirúrgica, politraumatizada, em uso de vancomicina e cefalosporina de 3a geração. Esta amostra apresentou um perfil de similaridade de aproximadamente 80,0% com um segundo isolado, sem no entanto, qualquer relação epidemiológica quanto ao tempo e clínica de internação. As demais amostras apresentaram perfis de similaridade clonal variando de 36,0% a 91,0%
Memorial para promoção a Classe de Professor Titular de Rosineide Marques Ribas
What is the first idea that comes to mind if someone asks you to describe a researcher? I bet your initial description is that of a man or woman wearing glasses, a white apron and hands in gloves while holding a test tube amid various expensive equipment. However, I say from experience, that a researcher is much more than that. To become a researcher, the person goes through a long period of study: undergraduate, master's, doctorate, post-doctorate. All of these qualifications take on average, 12 years. Above all, it is important to mention that the scientific career is not separated from teaching. Both always go together. With that thought, I write this memorial. This document is a narrative of the years that I have dedicated myself to education (particularly in the teaching of microbiology) at the Federal University of Uberlândia (UFU). The document was written based on UFU’s RESOLUTION CONDIR 2017-03 and aims to obtain a promotion in my teaching career to become a tenured professor in this Institution. This narrative is based on scientific aspects; however, I also consider it to be affective because it includes friends and dear colleagues, inside and outside UFU, who certainly were part of this arduous trajectory, in a country with great difficulties. This memorial was written at a time of uncertainty of a country suffering from a new disease (COVID-19), however, it was written with maturity and presents a trajectory that includes everything from graduation until now. It describes the opportunities that the University provided me, the friends and colleagues that I made throughout this journey, the difficulties I encountered and how I was able to contribute in some way with the graduation of students, management, research and field work. And, finally, it points to the perspectives from this new stage, that I intend to carry out.Qual é a primeira idéia que vem à cabeça se alguém lhe pedir a descrição de um pesquisador? Aposto que sua descrição inicial é de um homem ou mulher de óculos, usando um avental branco, as mãos com luvas segurando um tubo de ensaio em meio a vários equipamentos caros. Entretanto, digo por experiência, que um pesquisador é muito mais que isso. Para se tornar um pesquisador, a pessoa passa por um longo período de formação: graduação, mestrado, doutorado, pós-doutorado, entre outros. Todas essas formações levam, em média, 12 anos. Acima de tudo, é importante mencionar que a carreira científica não se desvincula da docência. Ambas caminham sempre juntas. Com esse pensamento, escrevo esse memorial. O presente documento é uma narrativa dos anos que tenho me dedicado à educação (particularmente no ensino de microbiologia) na Universidade Federal de Uberlândia (UFU). O documento foi escrito com base na RESOLUÇÃO CONDIR 2017-03 da UFU e tem como objetivo a obtenção de promoção na carreira docente para professora titular nesta Instituição. Essa narrativa é baseada em aspectos científicos, entretanto, a considero também, afetiva, porque inclui amigos e bons colegas também de profissão, dentro e fora da UFU, que com certeza fizeram parte dessa trajetória, árdua, em um país com grandes dificuldades. Esse memorial foi redigido em um momento de incertezas de um país sofrendo com uma nova doença (COVID-19), entretanto, foi redigido com maturidade e apresenta uma trajetória que inclui desde a graduação até aqui. Descreve as oportunidades que a Universidade me proporcionou, as dificulades encontradas no caminho e como pude contribuir de alguma forma com a formação discente, gestão, pesquisa e extensão. E, por fim, aponta para as perspectivas, a partir dessa nova etapa, que pretendo realizar
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