A characterization of the multivariate excess wealth ordering

In this paper, some new properties of the upper-corrected orthant of a random vector are proved. The univariate rightspread or excess wealth function, introduced by Fernández-Ponce et al. (1996), is extended to multivariate random vectors, and some properties of this multivariate function are studied. Later, this function was used to define the excess wealth ordering by Shaked and Shanthikumar (1998) and Fernández-Ponce et al. (1998). The multivariate excess wealth function enable us to define a new stochastic comparison which is weaker than the multivariate dispersion orderings. Also, some properties relating the multivariate excess wealth order with stochastic dependence are described

A new approach to multivariate lifetime distributions base don the excess-wealth concept an application in tumor Growth

Las distribuciones de visa son de gran importancia en la teoría de modelización estocástica, teoría de la renovación, fiabilidad y análisis de supervivencia. El envejecimiento de un sistema físico o biológico se conoce como el fenóm ... eno por el cual un sistema más antiguo tiene un menor tiempo de vida, en algún sentido estocástico, que un sistema más nuevo. Muchos de los criterios de envejecimiento (por ejemplo, las nociones IFR, DMRL y NBUE) se han desarrollado en la literatura durante muchos años y han sido también propuestas y estudiadas. Cabe mencionar que muchos de estos métodos se incluyen en el marco del ordenamiento estocástico.Esta Tesis Doctoral está centrada fundamentalmente en dos objetivos: Estudiar nuevas nociones de envejecimiento multivariante y caracterizar dichas nociones por medio de una función de dispersión multivariante, generalizando así los resultados ya estudiados en el caso univariante por Fernández-once et al. (1996) and Fernández-Ponce et al. (1998). Para el estudio de estos objetivos, dos conceptos fundamentales son tomados como punto de partida, también conocido como construcción estándar, fue definido por primera vez por O´brien (1975), y ha sido ampliamente utilizado en teoría de simulación así como en la teoría de ordenaciones estocásticas. El segundo concepto fue dado por Fernández-Ponce y el Suárez-Lloréns (2003). Estos autores proporcionaron el concepto de cuadrante superior corregido asociado con la construcción estándar y obtuvieron el importante resultado de que la probabilidad acumulada en esta región no depende de la distribución considerada. Estos conceptos, junto con el trabajo de Fernández-Ponce et al. (1998), donde las nociones de envejecimiento univariante son caracterizan por la función de exceso de riqueza (excess-wealth), es la base para el desarrollo de esta investigación. Obviamente, numerosos resultados significativos en fiabilidad y en el área de ordenaciones estocásticas son considerados con el fin de alcanzar nuestro propósito.Este trabajo está estructurado en cuatro capítulos. El Capítulo 1 es introductorio y presenta el estado del arte en las nociones de envejecimiento univariante y multivariado. En particular, se resumen diferentes trabajos donde propiedades de envejecimiento son caracterizadas usando ordenaciones estocásticas. La función cuantil y sus generalizaciones multivariante, así como la función "excess-wealth" univariante son también estudiadas en este capítulo.El Capítulo 2 tiene por objeto dar un concepto multivariante de la función "excess-wealth" basada conjuntamente en el trabajo por Fernández-Ponce et al. (1998) y Fernández-Ponce y el Suárez-Lloréns (20039. Se inicia mediante la introducción de nociones preliminares que serán utilizados a lo largo de la memoria. A continuación, y dada la importancia en este trabajo del cuadrante corregido superior, centramos nuestra atención en proporcionar nuevos resultados sobre este concepto. Las relaciones entre el cuadrante superior corregido con el soporte de un vector aleatorio y el cuadrante superior derecho en un punto, son establecidas. Por último, en las dos últimas secciones del capítulo, la función "excess-wealth" multivariante y el orden "excess-wealth" multivariante son estudiados. Esta función es definida en términos del cuadrante superior corregido y se demuestra que conserva las mismas propiedades que verifica la versión univariante.En el Capítulo 3, son definidas nuevas propiedades de envejecimiento multivariante. A partir de nuevas generalizaciones de la función vida residual media y la función intensidad de fallo, se presentan versiones multivariante de las nociones IFR, DMRL y NBUE, junto con la cadena de implicaciones entre ellas. Siguiendo el desarrollo en Fernández-Ponce et al. (1998), estas nuevas propiedades son caracterizadas en términos de la función "excess-wealth" multivariante. Por último, y basados en estas nociones multivariado de envejecimiento, se definen nuevas ordenaciones estocásticas que permiten comparar el envejecimiento de dos vectores aleatorios. Finalmente, en el Capítulo 4, una aplicación de una propiedad del envejecimiento bivariante es estudiada en el campo de la oncología. La edad de los pacientes y el tamaño del tumor en la detección espontánea del tumor, desempeñan un papel importante en la prevención de la cáncer. Como bien es conocido, existe un creciente interés en la detección temprana de enfermedades crónicas, con la esperanza de que el diagnóstico precoz, combinado con la terapia adecuad, da lugar a un mayor número de curas caso como mayor supervivencia de los pacientes. El proceso de desarrollo del tumor puede ser explicado en términos de edad de los pacientes al inicio del tumor (tiempo desde el nacimiento del paciente hasta que la célula primera célula cancerígena aparece) y el tiempo de estancia en la etapa preclínica, (tiempo desde que la primera célula cancerígena aparece hasta que el tumor es detectado). Un modelo exponencial no determinista que relaciona el tiempo de estancia en la etapa preclínica con el tamaño del tumor en el momento de la detección es planteado y estudiado en este capítulo. En el proceso de estimar los parámetros de este modelo, es considerada una restricción que representa una propiedad inherente de envejecimiento multivariante de las distribuciones de vida consideradas. El modelo propuesto es ilustrado en dos bases de datos reales

Nueva metodología docente y evaluadora de la competencia “manejo del programa estadístico spss” en la asignatura estadística en el grado de ciencias ambientales

La asignatura Estadística en el Grado de Ciencias Ambientales impartida en Universidad Pablo de Olavide, correspondiente al módulo de Técnicas Instrumentales, se caracteriza por un enfoque práctico de la misma. La competencia “manejo de programas estadísticos” forma parte de las competencias específicas a desarrollar tanto en la titulación como en el módulo donde se incluye la asignatura. La estadística juega un importante papel dentro de las ciencias experimentales y tanto el conocimiento como el buen manejo de un software informático para realizar diferentes análisis estadísticos es fundamental para posteriores experimentos reales en un futuro académico y profesional. Este proyecto está motivado por la necesidad de crear una metodología docente que asegure la adquisición de dicha competencia. El objetivo principal es asegurar que el alumno adquiera la competencia “manejo de un programa estadístico” (concretamente SPSS) para ser capaz de realizar e interpretar diferentes análisis estadísticos dentro del campo de las ciencias ambientales. Para cumplir el objetivo propuesto se realizaron acciones que modificaban tanto el sistema de docencia como el sistema de evaluación. Entre ellas cabe destacar el desarrollo de todas las EPD en aulas de informática utilizando el programa SPSS para resolver los problemas, así como un incremento del peso de la nota obtenida en la prueba realizada con SPSS en el sistema de evaluación. Los resultados académicos al final del curso 2013-14 evidencian una mayor adquisición por parte de los alumnos de la competencia evaluada en el proyecto

Stochastic comparisons for time transformed exponential models

Different sufficient conditions for stochastic comparisons between random vectors have been described in the literature. In particular, conditions for the comparison of random vectors having the same copula, i.e., the same dependence structure, may be found in Müller and Scarsini (2001). Here we provide conditions for the comparison, in the usual stochastic order sense and in other weaker stochastic orders, of two time transformed exponential bivariate lifetimes having different copulas. Some examples of applications are provided too.Multivariate stochastic orders Positive dependence orders Bivariate lifetimes Survival copulas Archimedean copulas TTE models

Classification of protein motifs based on subcellular localization uncovers evolutionary relationships at both sequence and functional levels

This article is published under license to BioMed Central Ltd. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License.[Background]: Most proteins have evolved in specific cellular compartments that limit their functions and potential interactions. On the other hand, motifs define amino acid arrangements conserved between protein family members and represent powerful tools for assigning function to protein sequences. The ideal motif would identify all members of a protein family but in practice many motifs identify both family members and unrelated proteins, referred to as True Positive (TP) and False Positive (FP) sequences, respectively. [Results]: To address the relationship between protein motifs, protein function and cellular localization, we systematically assigned subcellular localization data to motif sequences from the comprehensive PROSITE sequence motif database. Using this data we analyzed relationships between localization and function. We find that TPs and FPs have a strong tendency to localize in different compartments. When multiple localizations are considered, TPs are usually distributed between related cellular compartments. We also identified cases where FPs are concentrated in particular subcellular regions, indicating possible functional or evolutionary relationships with TP sequences of the same motif. [Conclusions]: Our findings suggest that the systematic examination of subcellular localization has the potential to uncover evolutionary and functional relationships between motif-containing sequences. We believe that this type of analysis complements existing motif annotations and could aid in their interpretation. Our results shed light on the evolution of cellular organelles and potentially establish the basis for new subcellular localization and function prediction algorithms.We acknowledge institutional support from the Junta de Andalucía to the CABD, and to the Unit of Information Resources for Research at the “Consejo Superior de Investigaciones Científicas” (CSIC) for the article-processing charge contribution.Peer Reviewe

An Application of Stochastic Dominances in Sports Analytics

Los órdenes estocásticos o las dominancias estocásticas tal como se conocen en Economía se han estudiado y aplicado ampliamente en diversidad de campos científicos, desde la Biología hasta la Ingeniería de Sistemas. Sin embargo, hasta donde llega nuestro conocimiento hay una laguna de aplicación dentro del ámbito de las Ciencias del Deporte. En este trabajo, pretendemos una primera aproximación a una posible aplicación de los órdenes estocásticos a un conjunto de datos de partidos de fútbol de LaLiga (España). Nuestro objetivo simplemente es mostrar como se puede ampliar una comparativa más allá de una simple comparación de métricas globales o totales. En particular, nos detendremos en los órdenes de dominancia estocástica de primer y segundo orden por ser los más intuitivos y de más sencilla interpretación y por ser los más usados en Economía.Stochastic orders or stochastic dominance as they are known in economics, have been widely studied and applied in a variety of scientific fields, from biology to Systems Engineering. However, to the best of our knowledge, there is an application gap in the field of Sports Analytics or Sports Sciences. In this paper, we attempt a first approach to a possible application of stochastic orders to a dataset of LaLiga (Spain) football matches. Our aim is simply to show how a comparison can be extended beyond a simple metric comparison. In particular, we will focus on the first and second dominance stochastic orders as they are the most intuitive and simple to interpret and are also the most widely used in economics

Flood risk assessment by multivariate risk measures

International audienc

Serial co-expression analysis of host factors from SARS-CoV viruses highly converges with former high-throughput screenings and proposes key regulators and co-option of cellular pathways

Versión postprint publicada en Briefings in Bioinformatics, próximamente disponible en: http://hdl.handle.net/10261/228222The current genomics era is bringing an unprecedented growth in the amount of gene expression data, only comparable to the exponential growth of sequences in databases during the last decades. This data now allows the design of secondary analyses that take advantage of this information to create new knowledge through specific computational approaches. One of these feasible analyses is the evaluation of the expression level for a gene through a series of different conditions or cell types. Based on this idea, we have developed ASACO, Automatic and Serial Analysis of CO-expression, which performs expression profiles for a given gene along hundreds of normalized and heterogeneous transcriptomics experiments and discover other genes that show either a similar or an inverse behavior. It might help to discover co-regulated genes, and even common transcriptional regulators in any biological model, including human diseases or microbial infections. The present SARS-CoV-2 pandemic is an opportunity to test this novel approach due to the wealth of data that is being generated, which could be used for validating results. In addition, new cell mechanisms identified could become new therapeutic targets. Thus, we have identified 35 host factors in the literature putatively involved in the infectious cycle of SARS-CoV and/or SARS-CoV-2 and searched for genes tightly co-expressed with them. We have found around 1900 co-expressed genes whose assigned functions are strongly related to viral cycles. Moreover, this set of genes heavily overlap with those identified by former laboratory high-throughput screenings (with p-value near 0). Some of these genes aim to cellular structures such as the stress granules, which could be essential for the virus replication and thereby could constitute potential targets in the current fight against the virus. Additionally, our results reveal a series of common transcription regulators, involved in immune and inflammatory responses, that might be key virus targets to induce the coordinated expression of SARS-CoV-2 host factors. All of this proves that ASACO can discover gene co-regulation networks with potential for proposing new genes, pathways and regulators participating in particular biological systems.N

β-Cryptoxanthin is more bioavailable in humans from fermented orange juice than from orange juice

24 Páginas.-- 3 Tablas.-- 1 FiguraCarotenoids, especially β-cryptoxanthin, exert multiple biological activities in the organism. Various processing techniques can improve carotenoid bioavailability in relation to the food matrix. The study objective was to compare the bioavailability of carotenoids from orange juice (OJ) with that from a beverage obtained by alcoholic fermentation of orange juice (FOB). Seven volunteers were recruited for a randomized, controlled, and crossover study. Post-intake plasma carotenoid concentrations were measured by HPLC in the subjects at 0–8 h after their consumption of OJ or FOB. β-Cryptoxanthin and lutein absorption was significantly higher from FOB than from OJ, but no significant difference in zeaxanthin absorption was found. The mean baseline-corrected area under the concentration curve (AUC0-8 h) for β-cryptoxanthin, lutein and zeaxanthin was 24.6-, 1.3- and 4.65-fold larger, respectively, after FOB versus OJ consumption. This fermented orange beverage could be an abundant source of bioavailable carotenoids, and its regular consumption may exert healthy effects.The authors thank the Spanish Government (projects AGL2010-14850/ALI and AGL2014-53195R) and Junta de Andalucía (projects P09-AGR4814M and P08-AGR-03477, and group PAI BIO311) for financial support. DHM is member of CaRed Network funded by MINECO (BIO2015-71703-REDT) and participates in EUROCAROTEN COST Action (CA15136). They are also grateful to Grupo Hespérides Biotech S.L. for supplying the fermented orange beverage.Peer reviewe