14 research outputs found

    Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

    Full text link
    The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

    IMPACT-Global Hip Fracture Audit: Nosocomial infection, risk prediction and prognostication, minimum reporting standards and global collaborative audit. Lessons from an international multicentre study of 7,090 patients conducted in 14 nations during the COVID-19 pandemic

    Get PDF

    Actualidad y prospectiva de la investigación científica en el Centro Universitario Amecameca de la Universidad Autónoma del Estado de México

    Get PDF
    Con responsabilidad, se organizó un programa cuya finalidad fuera publicitar con transparencia dichos avances, a través de un esfuerzo de rendición de cuentas a la comunidad inmediata, la universitaria, y a la comunidad abierta, la sociedad que la principal referencia para tal efecto. El programa se concretiza a través del presente libro, conformado con una inspiración de investigación multidisciplinaria; sin embargo, para llegar a tal fin, el reto es realizar el proceso de búsqueda y generación de conocimiento transitando hacia la colaboración de los cuerpos académicos, que puedan construir nuevos conocimientos fortalecidos por la convergencia de diferentes campos del saber. En consecuencia, la primera etapa de esta estrategia es la publicidad de los trabajos investigativos ejercidos, para hacer un balance al día, pero también proyectar el futuro de cada campo y área del conocimiento. La organización explicativa está organizada por tres bloques representativos del quehacer en la generación de conocimiento del Centro Universitario, un primer bloque centra el interés en las humanidades, educación y sustentabilidad; el segundo bloque lo integra la reflexión científica sobre la construcción democrática, derechos humanos y equidad de género; en el tercer segmento se destina a la seguridad alimentaria, salud pública y sistemas agropecuarios. La actualidad de la investigación eleva la producción lograda y lo que en el momento se encuentra en construcción y los alcances que produce para la docencia, la investigación misma, y para la sociedad en general. La prospectiva es un área que todos los capítulos desarrollan con el propósito de delinear los alcances innovadores por andar en teoría, metodología e incluso en los saberes mismo

    El alfa-herpes virus bovino 5 induce la producción de especies reactivas de oxígeno en estadíos tempranos de la infección de células neuronales humanas

    No full text
    Los alfa-herpesvirus bovinos (BoHV) 1 y 5 son virus neurotrópicos. Mientras que el BoHV-5 es el agente causal de meningoencefalitis no supurativa en terneros, el BoHV-1 solo ocasionalmente causa encefalitis.Fil: Rosales Hurtado, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Perez, Sandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Maldonado, Eduardo. Medical University of South Carolina; Estados UnidosXIII Congreso Argentino de VirologíaCiudad Autónoma de Buenos AiresArgentinaAsociación Argentina de MicrobiologíaSociedad Argentina de Virologí

    Efecto de la presencia de un inhibidor de la producción de especies reactivas de oxígeno en células neurales SH-SY5Y infectadas con alfaherpesvirus bovinos

    No full text
    Los alfaherpesvirus bovinos tipo 1 y 5 (BoAHV-1 y BoAHV-5) son virus estrechamente relacionados. Aunque ambas especies virales son neurotrópicas, BoAHV-5 es el agente causal de meningoencefalitis necrotizante no supurativa en terneros mientras que BoAHV-1 solo ocasionalmente causa encefalitis. Actualmente no están establecidos qué mecanismos del hospedador y/o virus determinan las diferencias en neuropatogenicidad entre ambos virus. El oxígeno es fundamental para el correcto funcionamiento del cerebro, está involucrado en la transducción de señales, transcripción de genes y otras actividades celulares, aunque también posee un efecto adverso debido a su estado de reducción metabólica que deriva en la formación de especies reactivas de oxígeno (ROS). El objetivo de este estudio fue evaluar si existen diferencias en la producción de ROS en células neurales SH-SY5Y infectadas con diferentes cepas de BoAHV. Para ello se utilizaron células neurales no diferenciadas y diferenciadas con ácido retinoico (RA) [10 µM] por 5 días y pre-tratadas por 1 h con N-Acetil-L-Cisteína (NAC), un tiol que se utiliza como antioxidante [5 mM]. Las infecciones se realizaron a una MOI=1 por 1 a 4 y 24 h en placas de 96 pocillos. La producción de ROS se cuantificó mediante el uso de la sonda CellRox y la lectura se realizó en lector de microplaca. Se observó una diferencia significativa en la producción de ROS entre BoAHV-1 y 5 (p0,05), incluso, a las 24 hpi la producción de ROS entre ambas especies virales se mantiene en los mismos niveles que el control negativo, tanto en células diferenciadas como sin diferenciar. Si bien estos resultados sugieren que la producción de ROS entre las infecciones con BoAHV-1 y BoAHV-5 no varía en estas células neurales, tal producción sigue siendo mayor en células infectadas que en células sin infectar pre-tratadas con NAC.Fil: Brunner, María Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Rosales Hurtado, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Verna, Andrea Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; ArgentinaFil: Perez, Sandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaII Congreso de Microbiología VeterinariaTandilArgentinaUniversidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias VeterinariasAsociación Argentina de Microbiologí

    Expresión de interferón lambda 3 en tejido nervioso durante la latencia y reactivación de terneros infectados con alfaherpesvirus bovinos tipos 1 y 5

    No full text
    Los alfaherpesvirus bovinos (BoHV) tipo 1 y 5 son virus neurotrópicos. El BoHV-5 ocasiona meningoencefalitis en terneros y el BoHV-1 solo ocasionalmente causa encefalitis. El ciclo de infección de los alfaherpesvirus se caracteriza por etapas de infección aguda, latencia y reactivación, siendo el ganglio trigémino (GT) el principal sitio de latencia. La reactivación del virus latente conduce a la transmisión y diseminación del mismo. El interferón (IFN) lambda (λ) fue recientemente identificado. Al igual que el IFN tipo I, IFNλ induce un estado antiviral, aunque no existe información respecto a su rol en la infección por BoHV. Estudios preliminares demostraron niveles elevados de expresión de IFNλ3 en corteza cerebral y GT de terneros en la etapa aguda de infección con BoHV-5 y BoHV-1, respectivamente, en concordancia con los sitios de mayor replicación de cada virus. El objetivo de este estudio fue determinar y comparar los niveles de expresión del IFNλ3 en sistema nervioso central (SNC) y GT de terneros experimentalmente infectados con BoHV-1 o BoHV-5 durante la latencia y reactivación. Para este estudio se inocularon terneros intranasalmente con 10^3 DICC50/ml de la cepa Cooper de BoHV-1 (n=4) o de la cepa 97/613 de BoHV-5 (n=4) para inducir una infección latente, realizándose la eutanasia de 2 terneros de cada grupo durante esta etapa a los 24 días post-infección (dpi). A los animales restantes se les inició un tratamiento con dexametasona (DEX) a los 21 dpi para inducir la reactivación. La eutanasia se realizó a los 25 dpi, 48 horas luego de la última dosis de DEX. Se contó con dos animales controles sin infectar, uno de los cuales también recibió tratamiento con DEX y se realizó la eutanasia a los 24 y 25 dpi, de acuerdo a los grupos infectados. Se obtuvieron muestras de corteza cerebral olfatoria, frontal y posterior, médula oblonga y GT y se analizó la expresión de IFNλ3 mediante RT-qPCR. Durante la latencia, la expresión de IFNλ3 incrementó (p≤0,05) en todas las áreas de SNC evaluadas y GT con respecto a los tejidos control. Esto fue particularmente evidente en GT infectado con BoHV-1 y corteza anterior y médula cervical de animales infectados con BoHV-5. Por el contrario, la reactivación de ambos virus inhibió la expresión de IFNλ3 (p≤0,05), excepto en GT donde IFNλ3 solo fue detectable en los terneros infectados y no en los terneros control. Al igual que en la infección aguda, la expresión de IFNλ3 coincide con los sitios preferenciales de replicación de cada virus y es probable que refleje la respuesta innata del hospedador que restringiría la replicación viral inicial hasta el establecimiento de latencia. La reactivación del virus contrarrestaría esta respuesta en SNC, propiciando su excreción y diseminación. La detección de los niveles de expresión de los IFNλ1 y 2 será necesaria para obtener un análisis global de la respuesta mediada por IFNλ en el tejido nervioso bovino.Fil: Marin, Maia Solange. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rosales Hurtado, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Burucúa, Mercedes María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Perez, Sandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaXV Congreso Argentino de Microbiología; V Congreso Argentino de Microbiología de Alimentos; V Congreso Latinoamericano de Microbiología de Medicamentos y Cosméticos y XIV Congreso Argentino de Microbiología GeneralCiudad Autónoma de Buenos AiresArgentinaAsociación Argentina de Microbiologí

    Implicancia del factor de necrosis tumoral alfa (TNFα) en la respuesta inflamatoria desencadenada por alfaherpesvirus en el sistema Nervioso de terneros infectados experimentalmente

    No full text
    Los herpesvirus bovinos tipo 1 (BoHV-1) y 5 (BoHV-5) son dos alfa-herpesvirus estrechamente relacionados. El BoHV-5 es el principal agente causal de encefalitis viral en terneros, mientras que el BoHV-1 solo la produce ocasionalmente. TNFα es un factor crítico en la respuesta pro-inflamatoria contra distintos patógenos. Sin embargo, su rol en la neuropatogenia de BoHV no ha sido estudiado. El objetivo de este trabajo fue determinar las variaciones en la expresión de TNFα en el sistema nervioso de terneros infectados experimentalmente con BoHV-1 o 5 durante la infección aguda [6 días post-infección (dpi)], latencia (24 dpi) y reactivación (mediante inmunosupresión con dexametasona, 25 dpi). Se utilizaron 2 animales infectados con BoHV-1 o 5 durante cada etapa del ciclo infeccioso y 2 como control. A partir de corteza olfatoria, frontal y posterior, médula cervical y ganglio trigémino (GT) se determinó la expresión génica de TNFα mediante RT-qPCR, utilizando el gen GAPDH como control. El ARNm de TNFα fue detectado en la mayoría de las muestras evaluadas. La infección aguda con BoHV-1 indujo un incremento de 3,6 veces (p<0,05) en la expresión de TNFα tanto en corteza frontal como posterior. Durante la latencia de este virus, sólo se observó una modulación en la médula cervical (0,6 veces, p<0,05), mientras que la reactivación de BoHV-1 indujo una disminución en la expresión génica de esta citoquina en la corteza olfatoria (0,4 veces) con respecto a los animales control y una sobreexpresión en corteza posterior (60,4 veces). Con respecto a BoHV-5, tanto la infección aguda como la reactivación de este virus modularon positivamente la expresión de TNF en sistema nervioso central y GT. Este incremento durante el pico de infección aguda se observó en la corteza frontal (3 veces) y particularmente en GT (129 veces), mientras que la reactivación de BoHV-5 indujo su expresión en corteza posterior (49,1 veces) y también en GT, sitio en el cual la transcripción de TNF fue detectada solo en terneros infectados y no en terneros control. Los hallazgos descriptos en este trabajo demuestran una modulación diferencial de la expresión de TNFα durante las infecciones con dos alfaherpesvirus bovinos relacionados. La inducción de esta citoquina en presencia de virus activo, particularmente de BoHV-5, podría relacionarse con la mayor respuesta inflamatoria y lesiones inducidas por este virus durante la respuesta inmune desencadenada en sistema nervioso. Trabajos previos han demostrado un aumento exacerbado en la expresión de receptores innatos (TLRs), así como de moléculas inmunomoduladoras y otras citoquinas (BMAP28 e IFNβ) durante la infección por BoHV-5, posiblemente reflejando la respuesta innata en tejido nervioso para contener la infección, asociada a la eliminación viral temprana. La comprensión del proceso inflamatorio en las infecciones hespesvirales sería útil para generar herramientas que mejoren las estrategias preventivas y terapéuticas.Fil: Burucúa, Mercedes María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; ArgentinaFil: Rosales Hurtado, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Perez, Sandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Odeón, Anselmo Carlos. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Marin, Maia Solange. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaXV Congreso Argentino de Microbiología; V Congreso Argentino de Microbiología de Alimentos; V Congreso Latinoamericano de Microbiología de Medicamentos y Cosméticos y XIV Congreso Argentino de Microbiología GeneralCiudad de Buenos AiresArgentinaAsociación Argentina de Microbiologí

    Infection by bovine alphaherpesvirus types 1 and 5 induces IFN-λ3 expression in neuronal-type cells and bovine neural tissues

    No full text
    Type III interferons (IFNs) are components of the innate immunity, with IFN lambda- (λ)3 having the most potent bioactivity in humans. IFN-λ has a predominant role in epithelial cells. However, antiviral function in certain infections of the central nervous system has also been demonstrated. IFN-λ3 expression in neural tissues of cattle has not been investigated. Thus, the aim of this study was to analyze whether an antiviral IFN-λ3 response is mounted after infection with bovine alphaherpesviruses (BoHV-1 and BoHV-5) in vitro, in neuronal-type cells, and in neural tissues from experimentally-infected calves. This study demonstrated that there is a strong IFN-λ3 response early after BoHV-1infection of undifferentiated neuroblastoma cells. During acute BoHV-1 and BoHV-5 infection of calves, low levels of IFN-λ3 expression were detected in the brain, which would favor virus spread within this tissue. Striking differences in the transcriptional levels of IFN-λ3 were observed in trigeminal ganglion, particularly in BoHV-1-acutely- and latently-infected calves. During reactivation, IFN-λ3 expression was down-regulated, which may be a requirement for virus replication and spread. Overall, different patterns of IFN-λ3 expression were detected during BoHV-1 and BoHV-5 infection, particularly during latency.Fil: Rosales Hurtado, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Nieto Farías, María Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Burucúa, Mercedes María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; ArgentinaFil: Marin, Maia Solange. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; ArgentinaFil: Perez, Sandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentin

    Differential expression of cyclins mRNA in neural tissues of BoHV-1- and BoHV-5- infected cattle

    No full text
    Bovine alphaherpesvirus types 1 (BoHV-1) and 5 (BoHV-5) are closely related alphaherpesviruses. BoHV-5 causes non-suppurative meningoencephalitis in calves. BoHV-1 is associated with several syndromes and, occasionally, can cause encephalitis. Although both viruses are neurotropic and they share similar biological properties, it is unknown why these alphaherpesviruses differ in their ability to cause neurological disease. Neural tissue samples were collected from BoHV-1- and BoHV-5-intranasally inoculated calves during acute infection, latency and reactivation and the levels of cyclins mRNA expression were analyzed by qRT-PCR. Striking differences in the levels of cyclins mRNA were particularly detected in trigeminal ganglion (TG). The expression levels of cyclins in TG during BoHV-5 latency suggest that these viruses utilize different strategies to persist in the host. It is apparent that a relationship between virus loads and cyclin mRNA levels can be established only during acute infection and other factors might be involved in the regulation of cell cycle components during BoHV latency and reactivation. Bovine alphaherpesviruses neuropathogenicity might be influenced by the differential control of cell cycle components by these herpesviruses. This is the first report on BoHV-5 modulation of cyclins expression in neural tissues from its natural host.Fil: Marin, Maia Solange. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Burucúa, Mercedes María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Rensetti, Daniel Ernesto. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; ArgentinaFil: Rosales Hurtado, Juan José. Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica. Fondo para la Investigación Científica y Tecnológica; ArgentinaFil: Odeón, Anselmo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Pérez, Sandra. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentin

    Dominance of Three Sublineages of the SARS-CoV-2 Delta Variant in Mexico

    No full text
    In this study, we analyzed the sequences of SARS-CoV-2 isolates of the Delta variant in Mexico, which has completely replaced other previously circulating variants in the country due to its transmission advantage. Among all the Delta sublineages that were detected, 81.5 % were classified as AY.20, AY.26, and AY.100. According to publicly available data, these only reached a world prevalence of less than 1%, suggesting a possible Mexican origin. The signature mutations of these sublineages are described herein, and phylogenetic analyses and haplotype networks are used to track their spread across the country. Other frequently detected sublineages include AY.3, AY.62, AY.103, and AY.113. Over time, the main sublineages showed different geographical distributions, with AY.20 predominant in Central Mexico, AY.26 in the North, and AY.100 in the Northwest and South/Southeast. This work describes the circulation, from May to November 2021, of the primary sublineages of the Delta variant associated with the third wave of the COVID-19 pandemic in Mexico and highlights the importance of SARS-CoV-2 genomic surveillance for the timely identification of emerging variants that may impact public health
    corecore