MODELS FOR IDENTIFYING FACTS ABOUT THE PHARMACEUTICAL MARKET COMPETETIVE ENVIRONMENT

The open data-driven model for identifying facts about the pharmaceutical market is suggested. The model is based on the patent analytics tools used for the patent land-scapes building

Decision making tool for determining the points of innovation and technological development of the region

A research purpose is to modify the model of a patent landscape on an algorithm for the complex construction of the technological landscape, taking into account the ecological and economic features of the region. Technological landscape as a management tool for determining the points of innovation and technological development involves three basic stages. The first stage is to analyze the ecological and resource conditions in the region. The second is to build the model of the well-known patent landscape. In the third stage, identification of the chosen direction, affect investment and development opportunities are presented to support the innovation and technological development of the region. Technological landscape opportunities in the direction of iron metallurgy are constructed for the Sverdlovsk region. The methodology of building technological landscapes over time may be useful in the construction and analysis of the technological trend of the studied direction. © 2019 IOP Publishing Ltd

Structure of the Diphtheria Toxin at Acidic pH: Implications for the Conformational Switching of the Translocation Domain

This article is an open access article distributed under the terms and conditions of the Creative Commons Attribution (CC BY) license.Diphtheria toxin, an exotoxin secreted by Corynebacterium that causes disease in humans by inhibiting protein synthesis, enters the cell via receptor-mediated endocytosis. The subsequent endosomal acidification triggers a series of conformational changes, resulting in the refolding and membrane insertion of the translocation (T-)domain and ultimately leading to the translocation of the catalytic domain into the cytoplasm. Here, we use X-ray crystallography along with circular dichroism and fluorescence spectroscopy to gain insight into the mechanism of the early stages of pH-dependent conformational transition. For the first time, we present the high-resolution structure of the diphtheria toxin at a mildly acidic pH (5–6) and compare it to the structure at neutral pH (7). We demonstrate that neither catalytic nor receptor-binding domains change their structure upon this acidification, while the T-domain undergoes a conformational change that results in the unfolding of the TH2–3 helices. Surprisingly, the TH1 helix maintains its conformation in the crystal of the full-length toxin even at pH 5. This contrasts with the evidence from the new and previously published data, obtained by spectroscopic measurements and molecular dynamics computer simulations, which indicate the refolding of TH1 upon the acidification of the isolated T-domain. The overall results imply that the membrane interactions of the T-domain are critical in ensuring the proper conformational changes required for the preparation of the diphtheria toxin for the cellular entry.National Institute of General Medical Sciences (P30 GM110761)Department of Energy, Office of Science, Office of Basic Energy Sciences, under contract no. DE-AC02-06CH1135

The possibility of the categorical method application in pharmaceutical organizations product portfolios analysis

In accordance with the present article the possibilities of the practical application of the entrepreneurs categorization and ranking methods performed in the field of the pharmaceuticals are presented. The mentioned methods are aimed at the descriptive market modelling, therein the model obtained is based unto the formal indicia of the drugs included in the uniform therapeutic profile of the entrepreneurs’ product portfolios. The method proposed is characterized with the high level of the representativeness, since the raw data utilized are fully open sourced and reliable, allow the target product of the each organization identification, and the data sources are the corresponding federal government agencies. As a result of the categorization analysis performed, the generalized understanding of the entrepreneurs’ R&D competences in the field of the Russian antidiabetic drugs market is obtained.В соответствии с настоящей статьей представлены возможности практического использования методов категоризации и ранжирования конкурирующих организаций применительно к области фармацевтики. Указанные методы нацелены на получение описательной модели рынка, основанной на формальных характеристиках лекарственных препаратов, входящих в однородный терапевтический профиль продуктовых портфелей этих организаций. Предложенный метод характеризуется высоким уровнем репрезентативности, так как используемые в нем исходные данные являются полностью открытыми и достоверными, идентифицируют целевые продукты организации, а источником этих данных являются патентные и регистрационные документы, представляемые соответствующими федеральными органами исполнительной власти. В результате категориального анализа исследуемых организаций было получено обобщенное представление об имеющихся у организаций компетенциях в области разработки и вывода на российский рынок лекарственных препаратов, применяемых при диабете

Identification of tumor-associated antigens in human thyroid papillar carcinoma

In this study two cDNA expressing libraries generated from thyroid papillar carcinomas were screened using SEREX approach. Thirty positive cDNA clones representing seventeen different genes were identified from both libraries. It is important to note, that three of them were isolated previously by other laboratories in SEREX screens of various types of human cancer. These include transcription factor NZF, a-catenin and BAG RP11 — a protein with unknown function. Moreover, we identified a whole panel of novel potential tumor-associated antigens, which would be further investigated. We are particularly interested in more detailed analysis of cathepsin H and transducer of ErbB2 (TOB2), which are differentially expressed in various types of human cancer. We will analyse the frequency of autoantibodies against identified antigens in sera of patients with various malignancies and healthy donors by heterologous screening. It is expected that among the clones isolated in this study, there might be novel cancer-associated markers.З двох зразків тканини папіломи щитовидної залози людини отримано дві кДНК експресуючі бібліотеки. Імуноскринуванням бібліотек методом SEREX ідентифіковано 30 пози­тивних клонів, які відповідали 17 різним генам. Потрібно відмітити, що три гени – транскрипційний фактор NZF, α-катенін і білок ВАС RP11 з поки невідомою функцією – раніше виявлено в інших лабораторіях методом SEREX, де скрикували бібліотеки з різних типів пухлин людини. Серед решти ідентифікованих генів найцікавішими є катепсин Н (cathepsin Н) и ТОВ2 (transducer of ErbB2), підвищену екс­пресію яких було знайдено в багатьох злоякісних пухлинах людини. Подальші дослідження буде направлено на виявлення частоти зустрічальності антитіл проти даних антигенів у сироватках крові хворих на рак різної етіології та здорових донорів. Серед визначених у нашій лабораторії нових SEREX позитивних клонів є потенційні маркери злоякісних новоутво­рень щитовидної залози людини.кДНК экспрессирующие библиотеки получены из двух образцов ткани злокачественной папилломы щитовидной железы человека. Иммуноскрининг библиотек методом SEREX дал воз­можность идентифицировать 30 положительных клонов, представляющих собой продукты 17 различных генов. Следует отметить, что три гена — транскрипционный фактор NZF, а-катенин и белок с неизвестной функцией ВАС RP11 – выявлены ранее в других лабораториях SEREX скринингом библиотек из различных типов опухолей человека. Среди ос­тальных идентифицированных генов наибольший интерес представляют катепсин Н (cathepsin Н) и ТОВ2 (transducer of ErbB2), повышенная экспресия которых выявлена во многих злокачественных опухолях человека. Дальнейшие исследования будут направлены на установление частоты встречаемости антител против данных антигенов в сыворотках крови боль­ных раком различной этиологии и здоровых доноров. Среди выявленных нами новых SEREX положительных клонов могут быть потенциальные маркеры злокачественных новообразова­ний щитовидной железы человека