Comparative transcriptomics in human and mouse

Cross-species comparisons of genomes, transcriptomes and gene regulation are now feasible at unprecedented resolution and throughput, enabling the comparison of human and mouse biology at the molecular level. Insights have been gained into the degree of conservation between human and mouse at the level of not only gene expression but also epigenetics and inter-individual variation. However, a number of limitations exist, including incomplete transcriptome characterization and difficulties in identifying orthologous phenotypes and cell types, which are beginning to be addressed by emerging technologies. Ultimately, these comparisons will help to identify the conditions under which the mouse is a suitable model of human physiology and disease, and optimize the use of animal models

Genome of Rhodnius prolixus, an insect vector of Chagas disease, reveals unique adaptations to hematophagy and parasite infection (vol 112, pg 14936, 2015)

Univ Fed Rio de Janeiro, Inst Quim, Dept Bioquim, BR-21941909 Rio De Janeiro, BrazilInst Nacl Ciencia & Tecnol Entomol Mol, BR-21941591 Rio De Janeiro, BrazilUniv Fed Rio de Janeiro, Inst Bioquim Med Leopoldo Meis, Programa Biol Mol & Biotecnol, BR-21941591 Rio De Janeiro, BrazilSimon Fraser Univ, Biol Sci, Burnaby, BC V5A 1S6, CanadaUniv Nacl La Plata, Ctr Reg Estudios Genom, RA-1900 La Plata, ArgentinaUniv Nacl Noroeste Buenos Aires, Ctr Bioinvest, RA-2700 Pergamino, ArgentinaFundacao Oswaldo Cruz, Inst Oswaldo Cruz, BR-21040900 Rio De Janeiro, BrazilWashington Univ, Sch Med, McDonnell Genome Inst, St Louis, MO 63108 USAUniv Fed Rio de Janeiro, Inst Biol, Dept Genet, BR-21941590 Rio De Janeiro, BrazilUniv Republica, Fac Ciencias, Secc Genet Evolut, Montevideo 11400, UruguayEuropean Bioinformat Inst, European Mol Biol Lab, Welcome Trust Genome Campus, Cambridge CB10 1SD, EnglandNIAID, Sect Vector Biol, NIH, Rockville, MD 20852 USAUniv Geneva, Sch Med, Dept Genet Med & Dev, CH-1211 Geneva, SwitzerlandSwiss Inst Bioinformat, CH-1211 Geneva, SwitzerlandMIT, Comp Sci & Artificial Intelligence Lab, Cambridge, MA 02139 USAMIT & Harvard, Broad Inst, Cambridge, MA 02142 USAFundacao Oswaldo Cruz, Inst Leonidas & Maria Deane, Grp Pesquisa Ecol Doencas Transmissiveis Amazonia, BR-69057070 Amazonas, BrazilUniv Fed Uberlandia, Fac Computacao, Inst Genet & Bioquim, Lab Bioinformat & Anal Mol, BR-38700002 Uberlandia, MG, BrazilUniv Fed Rio de Janeiro, Inst Ciencias Biomed, BR-21941591 Rio De Janeiro, BrazilUniv Fed Minas Gerais, Inst Ciencias Biol, Dept Parasitol, BR-31270901 Belo Horizonte, MG, BrazilNIH, Natl Lib Med, Natl Ctr Biotechnol Informat, Rockville, MD 20894 USAUniv Nacl La Plata, CONICET, Fac Ciencias Med, Inst Invest Bioquim La Plata, RA-1900 La Plata, ArgentinaUniv Estadual Paulista, Dept Biol, BR-15054000 Sao Paulo, BrazilUniv Estadual Norte Fluminense, Ctr Biociencias & Biotecnol, Lab Quim & Funcao Proteinas & Peptideos, BR-28013602 Rio De Janeiro, BrazilJohns Hopkins Univ, Bloomberg Sch Publ Hlth, Dept Mol Microbiol & Immunol, Baltimore, MD 21205 USAUniv Notre Dame, Dept Comp Sci & Engn, Notre Dame, IN 46556 USAUniv Fed Rural Rio de Janeiro, Inst Ciencias Biol & Saude, Dept Biol Anim, BR-23897000 Rio De Janeiro, BrazilFdn Oswaldo Cruz Rio de Janeiro, Escola Nacl Saude Publ, BR-21040360 Rio De Janeiro, BrazilUniv Fed Rio de Janeiro, Nucleo Pesquisas Ecol Macae, BR-27910970 Rio De Janeiro, BrazilUniv Notre Dame, Dept Biol Sci, Notre Dame, IN 46556 USAFundacao Oswaldo Cruz, Ctr Pesquisas Rene Rachou, BR-30190002 Belo Horizonte, MG, BrazilBarcelona Inst Sci & Technol, Ctr Genom Regulat, Barcelona 08003, Catalonia, SpainUniv Pompeu Fabra, Barcelona 08003, Catalonia, SpainCNRS, Inst Rech Dev, Lab Evolut Genome & Speciat, UPR9034 UR 072, F-91198 Gif Sur Yvette, FranceUniv Paris 11, F-91400 Orsay, FranceFrench Natl Inst Agr Res, Inst Ecol & Environm Sci Paris, F-78000 Versailles, FranceUniv Toronto, Dept Biol, Mississauga, ON L5L 1C6, CanadaCtr Dis Control & Prevent, Entomol Branch, Div Parasit Dis & Malaria, Atlanta, GA 30329 USAUniv Tours, CNRS, Inst Rech Biol Insecte, UMR7261, F-37200 Tours, FranceUniv Fed Rio de Janeiro, Fac Farm, Dept Biotecnol Farmaceut, BR-21941902 Rio De Janeiro, BrazilInst Politecn Nacl Zacatenco, Ctr Invest & Estudios Avanzados, Dept Physiol Biophys & Neurosci, Mexico City 03760, DF, MexicoUniv Fed Minas Gerais, Inst Ciencias Biol, Dept Fisiol & Biofis, BR-31270901 Belo Horizonte, MG, BrazilFlorida Int Univ, Dept Biol Sci, Miami, FL 33199 USAUniv Fed Espirito Santo, Nucleo Doencas Infecciosas, BR-29043900 Espirito Santo, BrazilUniv Illinois, Dept Entomol, Urbana, IL 61801 USAInst Fed Educ Ciencia & Tecnol Rio de Janeiro, BR-20270021 Rio De Janeiro, BrazilUniv Santiago de Compostela, Inst Invest Sanit, Ctr Resesarch Mol Med & Chron Dis, Dept Physiol,Sch Med, Santiago De Compostela 15782, SpainVirginia Polytech Inst & State Univ, Dept Biochem, Blacksburg, VA 24061 USAUniv Cambridge, Dept Vet Med, Cambridge CB3 0ES, EnglandUniv Manitoba, Dept Biol Sci, Winnipeg, MB R3T 2N2, CanadaUniv Estadual Paulista, Dept Biol, BR-15054000 Sao Paulo, Brazi

Genome of Rhodnius prolixus, an insect vector of Chagas disease, reveals unique adaptations to hematophagy and parasite infection

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Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Simon Fraser University. Biological Sciences. Burnaby, BC, Canada.Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genomicos. La Plata, Argentina / Universidad Nacional del Noroeste de Buenos Aires. Centro de Bioinvestigaciones. Pergamino, Argentina.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Washington University School of Medicine. McDonnell Genome Institute. St. Louis, MO, USA.Washington University School of Medicine. McDonnell Genome Institute. St. Louis, MO, USA.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidad de la República. Facultad de Ciencias. Sección Genética Evolutiva. Montevideo, Uruguay.European Bioinformatics Institute. European Molecular Biology Laboratory. Welcome Trust Genome Campus. Hinxton, Cambridge, United Kingdom.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Química. Departamento de Bioquímica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.University of Notre Dame. Department of Biological Sciences. Notre Dame, IN.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Estadual Paulista. Departamento de Biologia. São Paulo, SP, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.The Barcelona Institute of Science and Technology. Centre for Genomic Regulation. Barcelona, Spain / Universitat Pompeu Fabra. Barcelona, Spain.Institut de Recherche pour le Development. Centre National de la Recherche Scientifique. Laboratoire d`Evolution, Génome et Spéciation. Gif sur Yvette, France / Université Paris-Sud, Orsay, France.European Bioinformatics Institute. European Molecular Biology Laboratory. Welcome Trust Genome Campus. Hinxton, Cambridge, United Kingdom.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Université François Rabelais. Centre National de la Recherche Sicentifique. Institut de Recherche sur la Biologie de l`Insect. Tours, France.Université Paris-Sud, Orsay, France.Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata (INIBIOLP, CONICET). La Plata, Argentina.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.University of Toronto. Department of Biology. Mississauga, ON, Canada.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genomicos. La Plata, Argentina.Centers for Disease Control and Prevention. Entomology Branch. Division of Parasitic Diseases and Malaria. Atlanta, GA, USA.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro. Centro de Biociências e Biotecnologia. Laboratório de Química e Função de Proteínas e Peptídeos. Campos de Goytacazes, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil /Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Farmácia. Departamento de Biotecnologia Farmacêutica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Centers for Disease Control and Prevention. Entomology Branch. Division of Parasitic Diseases and Malaria. Atlanta, GA, USA.The Barcelona Institute of Science and Technology. Centre for Genomic Regulation. Barcelona, Spain / Universitat Pompeu Fabra. Barcelona, Spain.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.European Bioinformatics Institute. European Molecular Biology Laboratory. Welcome Trust Genome Campus. Hinxton, Cambridge, United Kingdom.Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genomicos. La Plata, Argentina.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Química. Departamento de Bioquímica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Politécnico Nacional. Centro de Investigación y de Estudios Avanzados. oDepartment of Physiology, Biophysics and Neuroscience. Mexico City, Mexico.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Fisiologia e BIoquímica. Belo Horizonte, MG, Brasil.Florida International University. Department of Biological Sciences. Miami, FL, USA.Florida International University. Department of Biological Sciences. Miami, FL, USA.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Departamento de Biologia Animal. Seropédica, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.University of Toronto. Department of Biology. Mississauga, ON, Canada.Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genomicos. La Plata, Argentina.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genomicos. La Plata, Argentina.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata (INIBIOLP, CONICET). La Plata, Argentina.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais.Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Parasitologia. Belo Horizonte, MG, Brasil.The John Hopkins University. Bloomberg School of Public Health. Deparment of Molecular Microbiology and Immunology. Baltimore, MD, USA.Instituto Federal de Educação Ciência e Tecnologia do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Espirito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.University of Illinois at Urbana–Champaign. Department of Entomology. Urbana, IL, USA.Instituto Federal de Educação Ciência e Tecnologia do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.The Barcelona Institute of Science and Technology. Centre for Genomic Regulation. Barcelona, Spain / Universitat Pompeu Fabra. Barcelona, Spain.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil./ Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal de Uberlândia. Faculdade de Computação. Instituto de Genética e Bioquímica. Laboratório de Bioinformática e Análises Moleculares. Uberlândia, MG, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, BrasilUniversidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, BrasilUniversity of Santiago de Compostela. Instituto de Investigaciones Sanitarias. School of Medicine– Center for Resesarch in Molecular Medicine and Chronic Diseases. Department of Physiology. Santiago de Compostela, Spain.Virginia Polytechnic Institute. Department of Biochemistry. Blacksburg, VA, USA.University of Cambridge. Deparment of Veterinary Medicine. Cambridge, United Kingdom.Simon Fraser University. Biological Sciences. Burnaby, BC, Canada.National Institutes of Health. National Institute of Allergy and Infectious Diseases. Section of Vector Biology. Rockville, MD, USA.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro. Centro de Biociências e Biotecnologia. Laboratório de Química e Função de Proteínas e Peptídeos. Campos de Goytacazes, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, BrasilEuropean Bioinformatics Institute. European Molecular Biology Laboratory. Welcome Trust Genome Campus. Hinxton, Cambridge, United Kingdom.Washington University School of Medicine. McDonnell Genome Institute. St. Louis, MO, USA.Washington University School of Medicine. McDonnell Genome Institute. St. Louis, MO, USA.University of Manitoba.Department of Biological Sciences. Winnipeg, MB, Canada.Centers for Disease Control and Prevention. Entomology Branch. Division of Parasitic Diseases and Malaria. Atlanta, GA, USA.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil..Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.University of Geneva Medical School. Department of Genetic Medicine and Development. Geneva 1211, Switzerland / Swiss Institute of Bioinformatics. Geneva 1211, Switzerland / Massachusetts Institute of Technology. Computer Science and Artificial Intelligence Laboratory. Cambridge, MA, USA / The Broad Institute of MIT and Harvard. Cambridge, MA, USA.Washington University School of Medicine. McDonnell Genome Institute. St. Louis, MO, USA.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Grupo de Pesquisa em Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. AM, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal de Uberlândia. Faculdade de Computação. Instituto de Genética e Bioquímica. Laboratório de Bioinformática e Análises Moleculares. Uberlândia, MG, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Biomédicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Parasitologia. Belo Horizonte, MG, Brasil.National Institutes of Health. National Center for Biotechnology Information. Rockville, MD, USA.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Química. Departamento de Bioquímica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata (INIBIOLP, CONICET). La Plata, Argentina.Universidade Estadual Paulista. Departamento de Biologia. São Paulo, SP, Brasil.European Bioinformatics Institute. European Molecular Biology Laboratory. Welcome Trust Genome Campus. Hinxton, Cambridge, United Kingdom.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro. Centro de Biociências e Biotecnologia. Laboratório de Química e Função de Proteínas e Peptídeos. Campos de Goytacazes, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.The John Hopkins University. Bloomberg School of Public Health. Deparment of Molecular Microbiology and Immunology. Baltimore, MD, USA.University of Notre Dame. Department of Computer Science and Engineering. Notre Dame, IN.Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genomicos. La Plata, Argentina.Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Departamento de Biologia Animal. Seropédica, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sérgio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Núcleo de Pesquisas Ecológicas de Macaé. Macaé, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Biomédicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Washington University School of Medicine. McDonnell Genome Institute. St. Louis, MO, USA.Washington University School of Medicine. McDonnell Genome Institute. St. Louis, MO, USA.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Molecular e Biotecnologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Rhodnius prolixus not only has served as a model organism for the study of insect physiology, but also is a major vector of Chagas disease, an illness that affects approximately seven million people worldwide. We sequenced the genome of R. prolixus, generated assembled sequences covering 95% of the genome (∼702 Mb), including 15,456 putative protein-coding genes, and completed comprehensive genomic analyses of this obligate blood-feeding insect. Although immunedeficiency (IMD)-mediated immune responses were observed, R. prolixus putatively lacks key components of the IMD pathway, suggesting a reorganization of the canonical immune signaling network. Although both Toll and IMD effectors controlled intestinal microbiota, neither affected Trypanosoma cruzi, the causal agent of Chagas disease, implying the existence of evasion or tolerance mechanisms. R. prolixus has experienced an extensive loss of selenoprotein genes, with its repertoire reduced to only two proteins, one of which is a selenocysteine-based glutathione peroxidase, the first found in insects. The genome contained actively transcribed, horizontally transferred genes from Wolbachia sp., which showed evidence of codon use evolution toward the insect use pattern. Comparative protein analyses revealed many lineage-specific expansions and putative gene absences in R. prolixus, including tandem expansions of genes related to chemoreception, feeding, and digestion that possibly contributed to the evolution of a blood-feeding lifestyle. The genome assembly and these associated analyses provide critical information on the physiology and evolution of this important vector species and should be instrumental for the development of innovative disease control methods

Genome of Rhodnius prolixus, an insect vector of Chagas disease, reveals unique adaptations to hematophagy and parasite infection

Rhodnius prolixus not only has served as a model organism for the study of insect physiology, but also is a major vector of Chagas disease, an illness that affects approximately seven million people worldwide. We sequenced the genome of R. prolixus, generated assembled sequences covering 95% of the genome (similar to 702 Mb), including 15,456 putative protein-coding genes, and completed comprehensive genomic analyses of this obligate blood-feeding insect. Although immune-deficiency (IMD)-mediated immune responses were observed, R. prolixus putatively lacks key components of the IMD pathway, suggesting a reorganization of the canonical immune signaling network. Although both Toll and IMD effectors controlled intestinal microbiota, neither affected Trypanosoma cruzi, the causal agent of Chagas disease, implying the existence of evasion or tolerance mechanisms. R. prolixus has experienced an extensive loss of selenoprotein genes, with its repertoire reduced to only two proteins, one of which is a selenocysteine-based glutathione peroxidase, the first found in insects. The genome contained actively transcribed, horizontally transferred genes from Wolbachia sp., which showed evidence of codon use evolution toward the insect use pattern. Comparative protein analyses revealed many lineage-specific expansions and putative gene absences in R. prolixus, including tandem expansions of genes related to chemoreception, feeding, and digestion that possibly contributed to the evolution of a blood-feeding lifestyle. The genome assembly and these associated analyses provide critical information on the physiology and evolution of this important vector species and should be instrumental for the development of innovative disease control methods.National Institutes of Health GrantNational Institutes of Health National Institute of Allergy and Infectious Diseases GrantConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG)Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas de ArgentinaAgencia Nacional de Promocion de Ciencia y TecnologiaFundacion Bunge y BornCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Univ Fed Rio de Janeiro, Inst Quim, Dept Bioquim, BR-21941909 Rio De Janeiro, BrazilInst Nacl Ciencia & Tecnol Entomol Mol, BR-21941591 Rio De Janeiro, BrazilUniv Fed Rio de Janeiro, Inst Bioquim Med Leopoldo Meis, Programa Biol Mol & Biotecnol, BR-21941591 Rio De Janeiro, BrazilSimon Fraser Univ, Biol Sci, Burnaby, BC V5A 1S6, CanadaUniv Nacl La Plata, Ctr Reg Estudios Genom, RA-1900 La Plata, ArgentinaUniv Nacl Noroeste Buenos Aires, Ctr Bioinvest, RA-2700 Pergamino, ArgentinaFundacao Oswaldo Cruz, Inst Oswaldo Cruz, BR-21040900 Rio De Janeiro, BrazilWashington Univ, Sch Med, McDonnell Genome Inst, St Louis, MO 63108 USAUniv Fed Rio de Janeiro, Dept Genet, Inst Biol, BR-21941590 Rio De Janeiro, BrazilUniv Republica, Secc Genet Evolutiva, Fac Ciencias, Montevideo 11400, UruguayWelcome Trust Genome Campus, European Mol Biol Lab, European Bioinformat Inst, Hinxton, Cambs CB10 1SD, EnglandNIAID, Sect Vector Biol, NIH, Rockville, MD 20852 USAUniv Geneva, Sch Med, Dept Genet Med & Dev, CH-1211 Geneva, SwitzerlandSwiss Inst Bioinformat, CH-1211 Geneva, SwitzerlandMIT, Comp Sci & Artificial Intelligence Lab, Cambridge, MA 02139 USABroad Inst MIT & Harvard, Cambridge, MA 02142 USAFundacao Oswaldo Cruz, Grp Pesquisa Ecol Doencas Transmissiveis Amazonia, Inst Leonidas & Maria Deane, BR-69057070 Amazonas, BrazilUniv Fed Uberlandia, Lab Bioinformat & Analises Mol, Inst Genet & Bioquim, Fac Comp, BR-38700002 Minas Gerais, BrazilUniv Fed Rio de Janeiro, Inst Ciencias Biomed, BR-21941591 Rio De Janeiro, BrazilUniv Fed Minas Gerais, Dept Parasitol, Inst Ciencias Biol, BR-31270901 Minas Gerais, BrazilNatl Lib Med, Natl Ctr Biotechnol Informat, NIH, Rockville, MD 20894 USAUniv Nacl La Plata, Inst Invest Bioquim La Plata, Fac Ciencias Med, CONICET, RA-1900 La Plata, Buenos Aires, ArgentinaUniv Estadual Paulista, Dept Biol, BR-15054000 Sao Paulo, BrazilUniv Estadual Norte Fluminense, Ctr Biociencias & Biotecnol, Lab Quim & Funcao Proteinas Peptideos, BR-28013602 Rio De Janeiro, BrazilJohns Hopkins Univ, Dept Mol Microbiol & Immunol, Bloomberg Sch Publ Hlth, Baltimore, MD 21205 USAUniv Notre Dame, Dept Comp Sci & Engn, Notre Dame, IN 46556 USAUniv Fed Rio de Janeiro, Dept Biol Anim, Inst Ciencias Biol & Saude, BR-23897000 Rio De Janeiro, BrazilFundacao Oswaldo Cruz, Escola Nacl Saude Publ, BR-21040360 Rio De Janeiro, BrazilUniv Fed Rio de Janeiro, Nucl Pesquisas Ecol Macae, BR-27910970 Rio De Janeiro, BrazilUniv Notre Dame, Dept Biol Sci, Notre Dame, IN 46556 USAFundacao Oswaldo Cruz, Ctr Pesquisas Rene Rachou, BR-30190002 Minas Gerais, BrazilBarcelona Inst Sci & Technol, Ctr Genom Regulat, Barcelona 08003, Catalonia, SpainUniv Pompeu Fabra, Barcelona 08003, Catalonia, SpainCNRS, Lab Evolut Genome & Speciat, Inst Rech Dev, UPR9034,UR 072, F-91198 Gif Sur Yvette, FranceUniv Paris 11, F-91400 Orsay, FranceFrench Natl Inst Agr Res, Inst Ecol & Environm Sci Paris, F-78000 Versailles, FranceCtr Dis Control & Prevent, Entomol Branch, Div Parasit Dis & Malaria, Atlanta, GA 30329 USAUniv Tours, Inst Rech Biol Insecte, UMR7261, Ctr Natl Rech Scientif, F-37200 Tours, FranceUniv Fed Rio de Janeiro, Fac Farm, Dept Biotecnol Farma, BR-21941902 Rio De Janeiro, BrazilInst Politecn Nacl, Ctr Invest & Estudios Avanzados, Dept Physiol Biophys & Neurosci, Mexico City 03760, DF, MexicoUniv Fed Minas Gerais, Dept Fisiol & Biofis, Inst Ciencias Biol, BR-31270901 Minas Gerais, BrazilFlorida Int Univ, Dept Biol Sci, Miami, FL 11200 USAUniv Fed Espirito Santo, Nucl Doencas Infecciosas, BR-29043900 Espirito Santo, BrazilUniv Illinois, Dept Entomol, Urbana, IL 61801 USAInst Fed Edu Ciencia & Tecnol Rio De Janeriro, BR-20270021 Rio De Janeiro, BrazilUniv Santiago Compostela, Inst Invest Sanitarias, Dept Physiol, Sch Med,Ctr Res Mol Med & Chron Dis, Santiago De Compostela 15782, SpainVirginia Polytech Inst & State Univ, Dept Biochem, Blacksburg, VA 24061 USAUniv Cambridge, Dept Vet Med, Cambridge CB3 0ES, EnglandUniv Manitoba, Dept Biol Sci, Winnipeg, MB R3T 2N2, CanadaUniv Estadual Paulista, Dept Biol, BR-15054000 Sao Paulo, BrazilNational Institutes of Health Grant: NHGRI-HG003079National Institutes of Health National Institute of Allergy and Infectious Diseases Grant: HHSN272200900039C: PIOF-GA-2011-30331