NIPK, a protein pseudokinase that interacts with the C subunit of the transcription factor NF-Y, is involved in rhizobial infection and nodule organogenesis

Heterotrimeric Nuclear Factor Y (NF-Y) transcription factors are key regulators of the symbiotic program that controls rhizobial infection and nodule organogenesis. Using a yeast two-hybrid screening, we identified a putative protein kinase of Phaseolus vulgaris that interacts with the C subunit of the NF-Y complex. Physical interaction between NF-YC1 Interacting Protein Kinase (NIPK) and NF-YC1 occurs in the cytoplasm and the plasma membrane. Only one of the three canonical amino acids predicted to be required for catalytic activity is conserved in NIPK and its putative homologs from lycophytes to angiosperms, indicating that NIPK is an evolutionary conserved pseudokinase. Post-transcriptional silencing on NIPK affected infection and nodule organogenesis, suggesting NIPK is a positive regulator of the NF-Y transcriptional complex. In addition, NIPK is required for activation of cell cycle genes and early symbiotic genes in response to rhizobia, including NF-YA1 and NF-YC1. However, strain preference in co-inoculation experiments was not affected by NIPK silencing, suggesting that some functions of the NF-Y complex are independent of NIPK. Our work adds a new component associated with the NF-Y transcriptional regulators in the context of nitrogen-fixing symbiosis.Fil: Clua, Joaquin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Rípodas, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Roda, Carla Lucía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Battaglia, Marina Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Zanetti, María Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Blanco, Flavio Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; Argentin

Compatibility between legumes and rhizobia for the establishment of a successful nitrogen-fixing symbiosis

The root nodule symbiosis established between legumes and rhizobia is an exquisite biological interaction responsible for fixing a significant amount of nitrogen in terrestrial ecosystems. The success of this interaction depends on the recognition of the right partner by the plant within the richest microbial ecosystems on Earth, the soil. Recent metagenomic studies of the soil biome have revealed its complexity, which includes microorganisms that affect plant fitness and growth in a beneficial, harmful, or neutral manner. In this complex scenario, understanding the molecular mechanisms by which legumes recognize and discriminate rhizobia from pathogens, but also between distinct rhizobia species and strains that differ in their symbiotic performance, is a considerable challenge. In this work, we will review how plants are able to recognize and select symbiotic partners from a vast diversity of surrounding bacteria. We will also analyze recent advances that contribute to understand changes in plant gene expression associated with the outcome of the symbiotic interaction. These aspects of nitrogen-fixing symbiosis should contribute to translate the knowledge generated in basic laboratory research into biotechnological advances to improve the efficiency of the nitrogen-fixing symbiosis in agronomic systems.Instituto de Biotecnologia y Biologia Molecula

Transcriptomic analysis of Mesoamerican and Andean Phaseolus vulgaris accessions revealed mRNAs and lncRNAs associated with strain selectivity during symbiosis

Legume plants establish a nitrogen-fxing symbiosis with soil bacteria known as rhizobia. Compatibility between legumes and rhizobia is determined at species-specifc level, but variations in the outcome of the symbiotic process are also infuenced by the capacity of the plant to discriminate and select specifc strains that are better partners. We compared the transcriptional response of two genetically diverse accessions of Phaseolus vulgaris from Mesoamerica and South Andes to Rhizobium etli strains that exhibit variable degrees of symbiotic afnities. Our results indicate that the plant genotype is the major determinant of the transcriptional reprogramming occurring in roots at early stages of the symbiotic interaction. Diferentially expressed genes (DEGs) regulated in the Mesoamerican and the Andean accessions in response to specifc strains are diferent, but they belong to the same functional categories. The common and strain-specifc transcriptional responses to rhizobia involve distinct transcription factors  and cis-elements present in the promoters of DEGs in each accession, showing that diversifcation and domestication of common bean at diferent geographic regions infuenced the evolution of symbiosis diferently in each genetic pool. Quantitative PCR analysis validated our transcriptional datasets, which constitute a valuable source of coding and non-coding candidate genes to further unravel the molecular determinants governing the mechanisms by which plants select bacterial strains that produce a better symbiotic outcome.Fil: Clúa, Joaquín. l'Université de Lausanne; Suiza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Rivero, Claudio Hernán. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Roda, Carla Lucía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Giorgis, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Donna, Soledad Antonela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Zanetti, María Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Blanco, Flavio Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; Argentin

Informe ampliado: efectos socioeconómicos y culturales de la pandemia COVID-19 y del aislamiento social, preventivo y obligatorio en los Pueblos Indígenas en Argentina -Segunda etapa, junio 2020-

A partir de la pandemia generada por el COVID-19, con el consiguiente Aislamiento Social Preventivo y Obligatorio (ASPO) dispuesto a partir del 20/03/2020 y demás acciones implementadas desde el Estado nacional argentino, un conjunto de equipos, instituciones, investigadores, becaries y tesistas de diferentes ámbitos del país, nos agrupamos con el objetivo de elaborar un informe acerca de las consecuencias e impactos socioeconómicos y culturales que atraviesan los pueblos indígenas con los que trabajamos en las regiones Metropolitana, Pampeana, Noroeste, Noreste, Cuyo y Patagonia. En una primera instancia, más de 30 autores, participaron en la elaboración de un informe (1er etapa) presentado el 15 de abril de 20201 . En esta segunda etapa, con más de 100 integrantes de diferentes ámbitos académicos del país, se amplió lo abordado a partir de la actualización y profundización de las problemáticas y situaciones que experimentan un conjunto de diversas comunidades y pueblos originarios –qom, mbya, moqoit, mapuche, guaraní, tupí guaraní, avá guaraní, kolla, diaguita, diaguita-calchaquí, wichí, huarpe, quechua, aymara, nivaclé, tonokote, omaguaca, tastil, günün a küna, comechingón, comechingón-camiare, ocloya, iogys, chané, tapiete, chorote, chulupi, sanavirón, ranquel, wehnayek, atacama, lule, quilmes, mapuche-pehuenches, tehuelches, mapuche-tehuelches, selk‘nam, haush y selk‘nam-haush-.Valdata, Marcela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Humanidades y Artes. Centro de Estudios Aplicados a Problemáticas Socioculturales. Rosario; Argentin