410 research outputs found

    Avalia??o de RNAs n?o codificadores longos espec?ficos de Schistosoma mansoni, como candidatos a biomarcadores da esquistossomose murina.

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    Programa de P?s-Gradua??o em Biotecnologia. N?cleo de Pesquisas em Ci?ncias Biol?gicas, Pr?-Reitoria de Pesquisa de P?s Gradua??o, Universidade Federal de Ouro Preto.RNAs n?o codificantes longos (lncRNAs) possuem um importante papel na regula??o transcricional e p?s-transcricional. S?o classificados como transcritos maiores que 200 nucleot?deos, que n?o apresentam potencial de codificar prote?nas, sendo observados tanto no n?cleo como no citoplasma. Estudos recentes v?m demonstrado que, dependendo de sua localiza??o e de suas intera??es espec?ficas com DNA, RNA e prote?nas, os lncRNAs podem modular a fun??o da cromatina, alterar a estabilidade e a tradu??o de mRNAs citoplasm?ticos e interferir nas vias de sinaliza??o. Muitas dessas fun??es, em ?ltima an?lise, afetam a express?o g?nica em diversos contextos biol?gicos e muito provavelmente est?o relacionados aos mecanismos referentes ? intera??o parasito-hospedeiro. Por outro lado, os padr?es de express?o est?gio-espec?fico sugerem que os lncRNAs s?o biomarcadores em potencial para a detec??o da esquistosomose, uma parasitose debilitante e de grande impacto socioecon?mico no mundo, causada por platelmintos do g?nero Schistosoma. Acredita-se que a complexidade dos programas de diferencia??o e desenvolvimento observado entre os diferentes est?gios evolutivos e ambientes onde o parasita vive seja dependente da regula??o da express?o g?nica, e neste cen?rio os lncRNAs seriam mol?culas chave. As hip?teses desse trabalho s?o que o S. mansoni expressa um conjunto de lncRNAs de forma diferencial atrav?s da reprograma??o de sua express?o g?nica em determinados est?gios evolutivos, e que esses lncRNAs s?o importantes na intera??o parasito-hospedeiro. Recentemente, nosso grupo de pesquisa identificou um conjunto de 170 novos lncRNAs em S. mansoni e deste conjunto, quinze mostraram express?o diferencial quando comparado os est?gios larvais e adultos do verme, bem como entre machos e f?meas. Continuando essa linha de investiga??o, o objetivo desse trabalho foi avaliar a express?o de 47 lncRNAs nos est?gios de cerc?rias, esquistoss?mulos com 3,5h de cultivo in vitro, vermes adultos e ovos, bem como em amostras de f?gado e sangue de camundongos BALB/c infectados e n?o infectados com S. mansoni. Do conjunto de 47 lncRNAs avaliados, 29 foram considerados como expressos em vermes adultos, utilizando a t?cnica de qRT-PCR. A seguir, este conjunto se mostrou diferencialmente expresso entre os est?gios evolutivos avaliados. Posteriormente foram realizados testes qualitativos e quantitivos utilizando f?gado e sangue de camundongos infectados e n?o infectados, apresentando detec??o de lncRNAs espec?ficos de S. mansoni no hospedeiro mam?fero. Em conjunto, podemos concluir que os lncRNAs s?o diferencialmente express?es em S. mansoni e com potencial de biomarcador.Long non-coding RNAs (lncRNAs) play an important role in transcriptional and posttranscriptional regulation. They are classified as transcripts larger than 200 nucleotides, which have no potential to encode proteins, being observed both in the nucleus and in the cytoplasm of cells. Recent studies have shown that depending on their location and their specific interactions with DNA, RNA and proteins, lncRNAs can modulate chromatin function, alter the stability and translation of cytoplasmic mRNAs and interfere in the signaling pathways. Many of these functions, ultimately, affect gene expression in various biological contexts and are most likely related to mechanisms related to host-parasite interaction. On the other hand, stage-specific expression patterns suggest that lncRNAs are potential biomarkers for the detection of schistosomiasis, a debilitating parasitosis, of great socioeconomic impact in the world, caused by Schistosoma genus. It is believed that the complexity of the differentiation and development programs observed between the different evolutionary stages and environments where the parasite lives is dependent on the regulation of gene expression, and in this scenario the lncRNAs would be key molecules. The hypotheses of this work are that S. mansoni expresses a set of lncRNAs in a differential way through the reprogramming of its gene expression in certain evolutionary stages, and that these lncRNAs are important in the parasite-host interaction. Recently, our research group identified a set of 170 new lncRNAs in S. mansoni and of this set, fifteen showed differential expression when comparing the larval and adult stages of the worm, as well as between males and females. Continuing this line of investigation, the hypothesis of this work was to evaluate the expression of 47 lncRNAs in the stages of cercariae, schistosomules with 3.5 h of in vitro culture, adult worms and eggs, as well as in liver and blood samples from BALB / c mice, infected and not infected with S. mansoni. Of the set of 47 lncRNAs evaluated, 29 were considered to be expressed in adult worms, using the qRT-PCR technique. Next, this set was shown to be differentially expressed between the evolutionary stages evaluated. Subsequently, qualitative and quantitative tests were performed using liver and blood of infected and uninfected mice, showing detection of specific S. mansoni lncRNAs in the mammalian host. Together, we can conclude that lncRNAs are differentially expressed in S. mansoni stages and have a potential for being biomarkers

    PROCESSO DE REGULARIZA??O FUNDI?RIA NA COMUNIDADE PADRE Z? : DESAFIOS ENCONTRADOS E CAMINHOS PARA A OTIMIZA??O DOS SERVI?OS

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    O presente trabalho discorreu sobre o processo de Regulariza??o Fundi?ria, realizado pela Secretaria de Habita??o Social do Munic?pio de Jo?o Pessoa, na comunidade do Padre Z?. Trabalho este realizado pelas equipes da Diretoria de Regulariza??o Fundi?ria. O objetivo Geral foi identificar quais as principais dificuldades encontradas pela equipe, para realizar suas atividades, tais como cadastramento dos moradores, dentro da comunidade. Acerca do tema foram identificados, atrav?s da realiza??o de pesquisa, com utiliza??o de question?rio, junto aos funcion?rios, problemas relativos ? falta de seguran?a para as equipes realizarem suas atividades dentro da comunidade; falta de coopera??o e hostilidade dos moradores para com os trabalhadores da DRF; aus?ncia de um conhecimento pr?vio das ?reas onde o trabalho ? realizado e defici?ncia na qualidade do material que identifica as equipes. Essa problem?tica foi objeto de estudo da pesquisa, pois entende-se que, pelo fato de envolver clientes externos e dificultar a fluidez do trabalho, esses fatores tamb?m provocaram gargalos e por isso a resolu??o ? de fundamental import?ncia para a fluidez das atividades. A pesquisa foi de grande relev?ncia visto que, a partir da identifica??o desses problemas, p?de ser criado um modelo de atua??o que facilite, no futuro, o desenvolvimento das atividades similares, no ?mbito de outras comunidades assistida pelo DRF. Foram apresentadas como sugest?es de melhorias, a realiza??o de parcerias com outras Secretarias, atrav?s da realiza??o de interc?mbios de profissionais de ?reas afins para efetuar os trabalhos dentro da comunidade; a utiliza??o de t?cnica de melhoria no processo de trabalho, atrav?s da aplica??o da ferramenta de Qualidade Total, tais como Diagrama de Ishikawa, o Modelo 5W2H e Avalia??o por Desempenho 360?. Por tudo isso, pode-se afirmar que o trabalho realizado pelos funcion?rios da DRF, para regularizar os t?tulos dos im?veis dessa por??o da popula??o, considerada mais carente, ? de extrema import?ncia, pois proporciona cidadania e seguran?a jur?dica em termos de propriedade dos seus im?veis, p?de-se constatar tamb?m que apesar dos problemas enfrentados, as equipes da DRF, realizam seu trabalho com satisfa??o, executam suas atividades de forma integrada e est?o satisfeitos com os resultados que seu trabalho traz para a comunidade

    Deletion of BmoR affects the expression of genes related to thiol/disulfide balance in Bacteroides fragilis

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    Bacteroides fragilis, an opportunistic pathogen and commensal bacterium in the gut, is one the most aerotolerant species among strict anaerobes. However, the mechanisms that control gene regulation in response to oxidative stress are not completely understood. In this study, we show that the MarR type regulator, BmoR, regulates the expression of genes involved in the homeostasis of intracellular redox state. Transcriptome analysis showed that absence of BmoR leads to altered expression in total of 167 genes. Sixteen of these genes had a 2-fold or greater change in their expression. Most of these genes are related to LPS biosynthesis and carbohydrates metabolism, but there was a signifcant increase in the expression of genes related to the redox balance inside the cell. A pyridine nucleotide-disulfde oxidoreductase located directly upstream of bmoR was shown to be repressed by direct binding of BmoR to the promoter region. The expression of two other genes, coding for a thiosulphate:quinoneoxidoreductase and a thioredoxin, are indirectly afected by bmoR mutation during oxygen exposure. Phenotypic assays showed that BmoR is important to maintain the thiol/disulfde balance in the cell, confrming its relevance to B. fragilis response to oxidative stress

    A tetravalent dengue nanoparticle stimulates antibody production in mice

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    <p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Dengue is a major public health problem worldwide, especially in the tropical and subtropical regions of the world. Infection with a single <it>Dengue virus </it>(DENV) serotype causes a mild, self-limiting febrile illness called dengue fever. However, a subset of patients experiencing secondary infection with a different serotype progresses to the severe form of the disease, dengue hemorrhagic fever/dengue shock syndrome. Currently, there are no licensed vaccines or antiviral drugs to prevent or treat dengue infections. Biodegradable nanoparticles coated with proteins represent a promising method for in vivo delivery of vaccines.</p> <p>Findings</p> <p>Here, we used a murine model to evaluate the IgG production after administration of inactivated DENV corresponding to all four serotypes adsorbed to bovine serum albumin nanoparticles. This formulation induced a production of anti-DENV IgG antibodies (p < 0.001). However, plaque reduction neutralization assays with the four DENV serotypes revealed that these antibodies have no neutralizing activity in the dilutions tested.</p> <p>Conclusions</p> <p>Our results show that while the nanoparticle system induces humoral responses against DENV, further investigation with different DENV antigens will be required to improve immunogenicity, epitope specicity, and functional activity to make this platform a viable option for DENV vaccines.</p

    PHENOLIC OXYDATION, TYPE OF EXPLANT AND NUTRITIVE MEDIA IN Peltophorum dubium (SPRENG.) TAUB.'S IN VITRO ESTABLISHMENT

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    A canaf\uedstula, Peltophorum dubium (Spreng.) Taub. \ue9 uma esp\ue9cie florestal nativa e com ampla dispers\ue3o geogr\ue1fica, desempenhando um papel pioneiro nas \ue1reas abertas, em capoeiras e matas degradadas. Apresenta um r\ue1pido crescimento e se adapta facilmente, sendo muito recomendada para reflorestamento homog\ueaneo. A madeira \ue9 utilizada em constru\ue7\uf5es civis, ind\ufastria de m\uf3veis, constru\ue7\ue3o naval e militar. A micropropaga\ue7\ue3o \ue9 uma t\ue9cnica utilizada com bastante sucesso, apresentando, entre outras vantagens, um r\ue1pido aumento no n\ufamero de plantas geneticamente id\ueanticas partindo de plantas selecionadas. Os objetivos do trabalho s\ue3o avaliar a influ\ueancia da luz no controle da oxida\ue7\ue3o fen\uf3lica dos explantes de canaf\uedstula (Peltophorum dubium (Spreng.), determinar o meio nutritivo e o tipo de explante mais adequado para o estabelecimento in vitro de canaf\uedstula (Peltophorum dubium (Spreng.). Foram realizados dois experimentos. No primeiro, \ue1pices caulinares foram cultivados em meio base MS a 25 \ub1 3\ub0C, por 7 dias no escuro e, posteriormente, sob fotoper\uedodo de 16 horas de luz e intensidade luminosa de 20 \u3bcmol.m2.s-1, fornecida por l\ue2mpada fluorescente branca durante 21 dias ou permaneceram na c\ue2mara de crescimento com exposi\ue7\ue3o \ue0 luz durante todo o experimento. Foi empregado o delineamento inteiramente casualizado com cinco repeti\ue7\uf5es contendo quatro unidades experimentais (UE). A oxida\ue7\ue3o fen\uf3lica foi observada ap\uf3s 21 dias de cultivo. N\ue3o ocorreu oxida\ue7\ue3o fen\uf3lica em nenhum dos tratamentos analisados. No segundo experimento, \ue1pices caulinares e segmentos nodais foram cultivados em meio base MS e meio WPM. Os explantes foram mantidos em sala de crescimento com fotoper\uedodo de 16 horas de luz e intensidade luminosa de 20 \u3bcmol.m2.s-1, fornecidas por l\ue2mpada fluorescente branca fria e temperatura de 25 \ub1 3\ub0C. A UE foi composta por um frasco de vidro de 150 mL contendo 30 mL de meio nutritivo e um explante. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, em esquema fatorial 2 x 2 (meio nutritivo e tipo de explante) com cinco repeti\ue7\uf5es por tratamento, cada repeti\ue7\ue3o consistindo de quatro UE. Aos 49 dias de cultivo avaliaram-se as seguintes vari\ue1veis: sobreviv\ueancia, estabelecimento, presen\ue7a de raiz, presen\ue7a de calos, n\ufamero de n\uf3s, n\ufamero de folhas e altura da parte a\ue9rea (mm). Os dados de presen\ue7a de raiz, presen\ue7a de calo, sobreviv\ueancia e estabelecimento foram analisados pelo teste qui-quadrado. As demais vari\ue1veis foram submetidas \ue0 an\ue1lise de vari\ue2ncia. Neste experimento, o meio base MS \ue9 mais eficiente que o WPM no estabelecimento in vitro de canaf\uedstula (Peltophorum dubium (Spreng.). N\ue3o existem diferen\ue7as entre a utiliza\ue7\ue3o dos explantes \ue1pice caulinar e segmento nodal.Peltophorum dubium (Spreng.) Taub. is a heliopylous, a native forest species with wide geografic dispersion, occuping a pioneer role in open areas, hencoops and degradated woods. Showing a fast growth, it adapts easily and it is highly recommended for homogeneous reforest. The timber is used in industrial furniture, civilian, naval and military constructions. The micropropagation is a technique used succesfully, allowing a fast increase of the number of plants genetically identical considering the superior types. The work's objectives are: to evaluate the effect of the light on phenolic oxydation and to determinate the most appropriate nutritive medium and type of explant for in vitro establishment of Peltophorum dubium. Two experiments were accomplished. In the first one, apical segments were cultivated in MS base medium at 25\ub13\ub0C, during seven days in the dark; after that, they remained in the presence of light (photoperiod of 16h) for 14 days. In the other treatment, the explants stayed under light during the whole experiment (21 days). Completely random design with five replicates and four experimental units (EU) were used. Phenolic oxydation did not occur in any of the analyzed treatments. In the second assay, apical segments and nodal segments were cultivated in MS base medium and WPM medium. The explants stayed in the growth room during 16h of photoperiod and luminous intensity of 20 \u3bcmol.m2.s-1, supplied with cool white fluorescent lamps, at 25\ub13\ub0C. The EU was composed by one 150mL flask with 30mL of nutritive medium and one explant. Completely random design with factorial outline 2 x 2 (nutritive medium and type of explant) and five replicates by treatment, each replicate with four EU, were used. After 49 days, the following elements were evaluated: survival, establishment, root presence, calli presence, numbers of nodes, number of leaves and shoot height (mm). The data of survival, establishment, root presence and calli presence were analyzed for qui-quadrado test. The other variables were submitted to variance analysis. In this experiment, MS base medium is more efficient than WPM medium in the in vitro establishment of Peltophorum dubium. There are no statistical differences among apical segment and nodal segment
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