Extension of charge-state-distribution calculations for ion-solid collisions towards low velocities and many-electron ions

Knowledge of the detailed evolution of the whole charge-state distribution of projectile ions colliding with targets is required in several fields of research such as material science and atomic and nuclear physics but also in accelerator physics, and in particular in regard to the several foreseen large-scale facilities. However, there is a lack of data for collisions in the nonperturbative energy domain and that involve many-electron projectiles. Starting from the etacha model we developed [Rozet, Nucl. Instrum. Methods Phys. Res., Sect. B 107, 67 (1996)10.1016/0168-583X(95)00800-4], we present an extension of its validity domain towards lower velocities and larger distortions. Moreover, the system of rate equations is able to take into account ions with up to 60 orbital states of electrons. The computed data from the different new versions of the etacha code are compared to some test collision systems. The improvements made are clearly illustrated by 28.9MeVu-1Pb56+ ions, and laser-generated carbon ion beams of 0.045 to 0.5MeVu-1, passing through carbon or aluminum targets, respectively. Hence, those new developments can efficiently sustain the experimental programs that are currently in progress on the "next-generation" accelerators or laser facilities.Fil: Lamour, E.. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Universite de Paris; FranciaFil: Fainstein, Pablo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Centro Atómico Bariloche; ArgentinaFil: Galassi, Mariel Elisa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Física de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Instituto de Física de Rosario; ArgentinaFil: Prigent, C.. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Universite de Paris; FranciaFil: Ramirez, C. A.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Física de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Instituto de Física de Rosario; ArgentinaFil: Rivarola, Roberto Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Física de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Instituto de Física de Rosario; ArgentinaFil: Rozet, J. P.. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Universite de Paris; FranciaFil: Trassinelli, M.. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Universite de Paris; FranciaFil: Vernhet, D.. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Universite de Paris; Franci

A

Abstract:  In the dairy activity, the production of cheese and ricotta discards approximately 55% of the milk used, wasting 6 million L / Day of whey. Currently, they are used as raw material for new products such as dairy-based drinks, grated cheeses and spreads. These advances led to the need to regulate the packaged food´s labeling, incorporating to the ch. V of the Argentine Food Code (CAA) (year 2005), to protect and guide the consumer. The products "dairy drinks" and "fermented dairy drinks" were incorporated in the ch. VIII of the CAA (year 2018). The aim of this research was to determine the compliance rate of the CAA regulations for the labeling of dairy substitutes (SL) commercialized at hypermarkets in Córdoba City in 2020; and evaluate the influence of dairy food labeling on consumers purchasing choices. A descriptive, observational and cross-sectional study was carried out on 39 SL labels, compared through a check-list, and by 176 structured surveys. Differences in compliance and influence were evaluated by inferential statistics using the proportions homogeneity test, with a significance level of 0.05. To analyze compliance and non-compliance according to the type of product, the chi-square test was used, for the same level of significance. It was obtained that 85% of the SL showed some non-compliance, mainly in the exhibition and distribution of the mandatory information (33%) and in the optional labeling (8%), prevailing in the drinkable SL. No significant influences of the label were found in the respondents´ purchase choice (only in 7% was it determined by reading and information on it), it was estimated, by a 95% confidence interval, that the proportion of the sample group who were influenced in its choice, and it is among [0.03; 0.11]. The label is the main mean of communication between the consumer and the manufacturer, and therefore the regulation´s compliance is highly relevant since it provides all the information that the consumer needs to make a decision on their purchase.Resumen:  En la actividad láctea, la elaboración de queso y ricota desecha aproximadamente 55% de la leche utilizada, desaprovechando 6 millones de L/Día de suero. Actualmente, se utilizan como materia prima de nuevos productos como bebidas con base láctea, quesos rallados y untables. Estos avances llevaron a la necesidad de regular la rotulación de alimentos envasados, incorporando el cap. V al Código Alimentario Argentino (CAA) (año 2005), para proteger y orientar al consumidor. Se incorporaron los productos “bebidas lácteas” y “bebidas lácteas fermentadas” en el cap. VIII del CAA (año 2018). Esta investigación tuvo como objetivo determinar el grado de cumplimiento de las disposiciones del CAA para el rotulado de sucedáneos lácteos (SL) comercializados en hipermercados de la ciudad de Córdoba en el año 2020; y evaluar la influencia del rotulado de los alimentos lácteos en la elección de compra por parte de los consumidores. Se realizó un estudio descriptivo, observacional y transversal, sobre 39 rótulos de SL, comparados a través de un check-list, y por 176 encuestas estructuradas. Las diferencias en cumplimiento y la influencia se evaluaron mediante estadística inferencial utilizando prueba de homogeneidad de proporciones, con un nivel de significancia de 0.05. Para analizar el cumplimiento e incumplimiento según tipo de producto, se utilizó el test chi cuadrado, para el mismo nivel de significación. Se obtuvo que el 85% de los SL presentan algún incumplimiento principalmente en la presentación y distribución de la información obligatoria (33%) y en el rotulado facultativo (8%), prevaleciendo en los SL bebibles. No se encontró influencias significativas del rótulo en la elección de compra de los encuestados (solo en el 7% estuvo determinada por la lectura e información del mismo), se estimó por intervalo de confianza del 95% la proporción poblacional de los encuestados que se ven influenciados, siendo el mismo [0,03; 0,11]. El rótulo es el principal medio de comunicación entre el consumidor y el elaborador, y por ello el cumplimiento de las disposiciones para el mismo cobra gran relevancia ya que en él se brinda toda la información que el consumidor necesita para tomar una decisión en su compra.

Criptorquidia, fisiología, patología asociada, clasificación, examen fisico y controversias sobre el tratamiento

El testículo no descendido o criptórquido es aquel que no se localiza en la región inferior del escroto o que luego de descender con maniobras manuales al escroto no permanece en esta localización. La importancia de la ubicación normal del testículo es reconocida desde hace siglos, en la Edad Media para confirmar que el papa elegido era un hombre completo, se evaluaba si tenia los testículos ubicados normalmente: “testículos habet, et bene pendentes”1 . Es la anomalía congénita mas frecuente en el varón y un reconocido factor de riesgo asociado a infertilidad y cáncer testicular en la adultez. La mayoría de las veces la etiología es desconocida. Probablemente en estos casos, su origen sea multifactorial, pudiendo tener un rol agentes ambientales que interactuarían con factores genéticos propios provocando la disrupción del proceso de descenso normal del testículo. Desde hace décadas existen dos modalidades terapéuticas, el tratamiento hormonal y/o la orquidopexia. Los primeros reportes sobre estos tratamientos son de aproximadamente el año19302,3. Desde entonces, han sido publicados más de 3300 artículos. Sin embargo, a pesar de la profusa literatura al respecto, aún existen controversias sobre la conducta terapéutica más adecuada. Esto se debe en parte a la falta de estudios bien diseñados a largo plazo que permitan obtener conclusiones estadísticamente valederas. Actualmente, el tratamiento óptimo para la criptorquidia es un tema importante de debate en los foros internacionales. El objetivo de esta revisión es actualizar la fisiopatología y la etiopatogenia, y discutir las evidencias a favor o en contra de las modalidades terapéuticas actuales.Fil: Vaiani, Elisa. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Barrenechea, M. E.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Rivarola, Marco Aurelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Belgorosky, Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentin

Criptorquidia, fisiología, patología asociada, clasificación, examen fisico y controversias sobre el tratamiento

El testículo no descendido o criptórquido es aquel que no se localiza en la región inferior del escroto o que luego de descender con maniobras manuales al escroto no permanece en esta localización. La importancia de la ubicación normal del testículo es reconocida desde hace siglos, en la Edad Media para confirmar que el papa elegido era un hombre completo, se evaluaba si tenia los testículos ubicados normalmente: “testículos habet, et bene pendentes”1 . Es la anomalía congénita mas frecuente en el varón y un reconocido factor de riesgo asociado a infertilidad y cáncer testicular en la adultez. La mayoría de las veces la etiología es desconocida. Probablemente en estos casos, su origen sea multifactorial, pudiendo tener un rol agentes ambientales que interactuarían con factores genéticos propios provocando la disrupción del proceso de descenso normal del testículo. Desde hace décadas existen dos modalidades terapéuticas, el tratamiento hormonal y/o la orquidopexia. Los primeros reportes sobre estos tratamientos son de aproximadamente el año19302,3. Desde entonces, han sido publicados más de 3300 artículos. Sin embargo, a pesar de la profusa literatura al respecto, aún existen controversias sobre la conducta terapéutica más adecuada. Esto se debe en parte a la falta de estudios bien diseñados a largo plazo que permitan obtener conclusiones estadísticamente valederas. Actualmente, el tratamiento óptimo para la criptorquidia es un tema importante de debate en los foros internacionales. El objetivo de esta revisión es actualizar la fisiopatología y la etiopatogenia, y discutir las evidencias a favor o en contra de las modalidades terapéuticas actuales.Fil: Vaiani, Elisa. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Barrenechea, M. E.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Rivarola, Marco Aurelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Belgorosky, Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentin

Genomic characterization and seroprevalence studies on alphaviruses in Uruguay

Alphaviruses (Togaviridae) are arboviruses frequently associated with emerging infectious diseases. In this study, we aimed to investigate the presence of alphaviruses in Uruguay by detecting the viral genome in mosquitoes and neutralizing antibodies in equines. A total of 3,575 mosquitoes were analyzed for alphavirus genome detection. Serologic studies were performed on 425 horse sera by plaque reduction neutralization test (PRNT80) against Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV) subtype IAB, Pixuna virus (PIXV), Rio Negro virus (RNV), western equine encephalitis virus (WEEV), and Madariaga virus (MADV). Mosquitoes belonging to six genera were captured and 82.9% were identified as Culex pipiens. Two Cx. pipiens pools collected in Fray Bentos and Las Toscas localities were alphavirus positive, and phylogenetic analyses showed that the sequences grouped into two different clusters: the lineage I of eastern equine encephalitis virus and RNV (VEEV complex), respectively. Plaque reduction neutralization test assays showed antibodies against strains of the VEEV complex, MADV, and WEEV. Rio Negro virus was the most geographically widespread virus, showing higher seroprevalences (up to 20%). Seroprevalences against VEEV IAB ranged between 4.6% and 13%; antibodies against PIXV, WEEV, and MADV were less frequent (3–4%). In conclusion, RNV exhibited the highest seroprevalence in horses, a wide geographical distribution, and viral genome was detected in Cx. pipiens mosquitoes. Madariaga virus had a low seroprevalence in equines, but an epizootic lineage typical of North America was detected in Cx. pipiens mosquitoes. Taken together, our results show that alphaviruses are present in Uruguay with variable occurrence and geographical distribution being a potential threat for human and equine health

Functional Characterization of Two Mutations Located in the Ligand Binding Domain in the SF1

Purpose: Since SF1 gene mutations located in the ligand binding domain are associated with a wide phenotypic spectrum in 46,XY subjects, the functional and structural characterization of these variations is of great interest. The aim of this study is to evaluate the clinical phenotype, hormonal pattern and molecular studies (genetic, functional data and protein structural analysis) in two non-related 46,XY disorder of sex development (DSD) index patients. Methods: Clinical characteristics, genomic DNA sequencing analysis, protein prediction software study and protein structure analysis, and functional characterization of the mutations was carried out. Results: Both index DSD patients showed a similar phenotype, however several affected members of Family 1 showed variable phenotypes. While in Family 1 a previously reported heterozygous missense point mutation (p.Arg313His) was found, in Family 2 a novel heterozygous missense point mutation (p.Ser303Arg) was detected. Both mutations were predicted to be as “probably damaging”. The transcriptional activity of SF1 mutants p.Arg313His and p.Ser303Arg, studied using two different promoters in two cell lines, exhibited significant reductions of transactivation activity. Structural analysis showed differences between both mutants, such as changes in the flexibility of the receptor backbone and in the tertiary structure around the ligand and in the AF-2 domain. Conclusions: One of these ligand binding domain mutations in SF1 showed phenotypic heterogeneity among family members, while both variations showed similarities in prepubertal phenotype, as well as in damage prediction and experimental decreases in transcriptional activity, but marked differences in structural consequence predictions. Finally the present study reinforces the concept of the wide variability in the clinical phenotype in affected 46,XY DSD patients.Fil: Perez Garrido, Natalia Isabel. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Saraco, Nora Isabel. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Marino, R.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Ramirez, P.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Ciaccio, Marta Graciela Cristina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Costanzo, M.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Guercio, Gabriela Viviana. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Warman, M.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Minini, L.. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Portillo Ledesma, S.. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Rivarola, Marco Aurelio. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; ArgentinaFil: Coitiño, E. L.. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Belgorosky, Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentin

Optimizing DDRADseq in non-model species: A Case Study in Eucalyptus dunnii Maiden

Restriction site-associated DNA sequencing (RADseq) and its derived protocols, such as double digest RADseq (ddRADseq), offer a flexible and highly cost-effective strategy for efficient plant genome sampling. This has become one of the most popular genotyping approaches for breeding, conservation, and evolution studies in model and non-model plant species. However, universal protocols do not always adapt well to non-model species. Herein, this study reports the development of an optimized and detailed ddRADseq protocol in Eucalyptus dunnii, a non-model species, which combines different aspects of published methodologies. The initial protocol was established using only two samples by selecting the best combination of enzymes and through optimal size selection and simplifying lab procedures. Both single nucleotide polymorphisms (SNPs) and simple sequence repeats (SSRs) were determined with high accuracy after applying stringent bioinformatics settings and quality filters, with and without a reference genome. To scale it up to 24 samples, we added barcoded adapters. We also applied automatic size selection, and therefore obtained an optimal number of loci, the expected SNP locus density, and genome-wide distribution. Reliability and cross-sequencing platform compatibility were verified through dissimilarity coefficients of 0.05 between replicates. To our knowledge, this optimized ddRADseq protocol will allow users to go from the DNA sample to genotyping data in a highly accessible and reproducible way.Instituto de BiotecnologíaFil: Aguirre, Natalia Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Filippi, Carla Valeria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Zaina, Giusi. University of Udine. Department of Agricultural, Food, Environmental and Animal Sciences; ItaliaFil: Rivas, Juan Gabriel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Acuña, Cintia Vanesa. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Villalba, Pamela Victoria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Garcia, Martin Nahuel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Gonzalez, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rivarola, Maximo Lisandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Martinez, Maria Carolina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Puebla, Andrea Fabiana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Morgante, Michele. University of Udine. Department of Agricultural, Food, Environmental and Animal Sciences; ItaliaFil: Hopp, Horacio Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Marcucci Poltri, Susana Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Abiotic Stress‐Related Expressed Sequence Tags from the Diploid Strawberry Fragaria vesca

Strawberry ( spp.) is a eudicotyledonous plant that belongs to the Rosaceae family, which includes other agronomically important plants such as raspberry ( L.) and several tree-fruit species. Despite the vital role played by cultivated strawberry in agriculture, few stress-related gene expression characterizations of this crop are available. To increase the diversity of available transcriptome sequence, we produced 41,430 L. expressed sequence tags (ESTs) from plants growing under water-, temperature-, and osmotic-stress conditions as well as a combination of heat and osmotic stresses that is often found in irrigated fields. Clustering and assembling of the ESTs resulted in a total of 11,836 contigs and singletons that were annotated using Gene Ontology (GO) terms. Furthermore, over 1200 sequences with no match to available Rosaceae ESTs were found, including six that were assigned the “response to stress” GO category. Analysis of EST frequency provided an estimate of steady state transcript levels, with 91 sequences exhibiting at least a 20-fold difference between treatments. This EST collection represents a useful resource to advance our understanding of the abiotic stress-response mechanisms in strawberry. The sequence information may be translated to valuable tree crops in the Rosaceae family, where whole-plant treatments are not as simple or practical

Pathological and Incidental Findings on Brain MRI in a Single-Center Study of 229 Consecutive Girls with Early or Precocious Puberty

Central precocious puberty may result from organic brain lesions, but is most frequently of idiopathic origin. Clinical or biochemical factors which could predict a pathological brain MRI in girls with CPP have been searched for. With the recent decline in age at pubertal onset among US and European girls, it has been suggested that only girls with CPP below 6 years of age should have brain MRI performed

High-dimensional analysis of 16 SARS-CoV-2 vaccine combinations reveals lymphocyte signatures correlating with immunogenicity

The range of vaccines developed against severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS‑CoV‑2) provides a unique opportunity to study immunization across different platforms. In a single-center cohort, we analyzed the humoral and cellular immune compartments following five coronavirus disease 2019 (COVID-19) vaccines spanning three technologies (adenoviral, mRNA and inactivated virus) administered in 16 combinations. For adenoviral and inactivated-virus vaccines, heterologous combinations were generally more immunogenic compared to homologous regimens. The mRNA vaccine as the second dose resulted in the strongest antibody response and induced the highest frequency of spike-binding memory B cells irrespective of the priming vaccine. Priming with the inactivated-virus vaccine increased the SARS-CoV-2-specific T cell response, whereas boosting did not. Distinct immune signatures were elicited by the different vaccine combinations, demonstrating that the immune response is shaped by the type of vaccines applied and the order in which they are delivered. These data provide a framework for improving future vaccine strategies against pathogens and cancer