Expression profiling of rainbow trout testis development identifies evolutionary conserved genes involved in spermatogenesis.

Chantier qualité GAInternational audienceBACKGROUND: Spermatogenesis is a late developmental process that involves a coordinated expression program in germ cells and a permanent communication between the testicular somatic cells and the germ-line. Current knowledge regarding molecular factors driving male germ cell proliferation and differentiation in vertebrates is still limited and mainly based on existing data from rodents and human. Fish with a marked reproductive cycle and a germ cell development in synchronous cysts have proven to be choice models to study precise stages of the spermatogenetic development and the germ cell-somatic cell communication network. In this study we used 9K cDNA microarrays to investigate the expression profiles underlying testis maturation during the male reproductive cycle of the trout, Oncorhynchus mykiss. RESULTS: Using total testis samples at various developmental stages and isolated spermatogonia, spermatocytes and spermatids, 3379 differentially expressed trout cDNAs were identified and their gene activation or repression patterns throughout the reproductive cycle were reported. We also performed a tissue-profiling analysis and highlighted many genes for which expression signals were restricted to the testes or gonads from both sexes. The search for orthologous genes in genome-sequenced fish species and the use of their mammalian orthologs allowed us to provide accurate annotations for trout cDNAs. The analysis of the GeneOntology terms therefore validated and broadened our interpretation of expression clusters by highlighting enriched functions that are consistent with known sequential events during male gametogenesis. Furthermore, we compared expression profiles of trout and mouse orthologs and identified a complement of genes for which expression during spermatogenesis was maintained throughout evolution. CONCLUSION: A comprehensive study of gene expression and associated functions during testis maturation and germ cell differentiation in the rainbow trout is presented. The study identifies new pathways involved during spermatogonia self-renewal or rapid proliferation, meiosis and gamete differentiation, in fish and potentially in all vertebrates. It also provides the necessary basis to further investigate the hormonal and molecular networks that trigger puberty and annual testicular recrudescence in seasonally breeding species

Quantification des performances mécaniques en fatigue d'un Loess d'Alsace traité aux liants hydrauliques (rapport final)

Dans le cadre des études de projet concernant la rocade Sud de Strasbourg, la DREAL Alsace, le cimentier HAURI et l'IFSTTAR ont établi une collaboration scientifique concernant la possibilité d'utilisation dans les infrastructures routières de matériaux présents dans l'emprise du projet. Les matériaux concernés sont des loess ; il s'agit d'un limon éolien qui recouvre en partie la plaine d'Alsace et dont l'une des particularités est de présenter une certaine homogénéité au niveau géotechnique. L'objet de la collaboration scientifique est de mesurer les performances mécaniques de ce matériau traité avec des liants hydrauliques de l'entreprise HAURI. Ces performances seront mesurées pour commencer conformément aux documents en vigueur pour valider leur utilisation dans la partie Terrassement de l'ouvrage. Une étude en fatigue mécanique sera ensuite conduite afin de déterminer les paramètres permettant d'introduire ces matériaux dans le dimensionnement mécanique de la chaussée

Amount, composition and sources of macrolitter from a highly frequented roadway

3ème rencontre du GDR Polymères et Océans, BREST, FRANCE, 27-/06/2022 - 29/06/2022De nombreuses recherches mentionnent la nécessité d'identifier les sources continentales de macrodéchets mais paradoxalement, relativement peu de données de terrain sur la composition et les sources de macrodéchets sont disponibles dans la littérature. Décrire et quantifier ces sources est nécessaire à une meilleure estimation des flux dans les milieux et une meilleure définition des stratégies d'atténuation. Si les bords de routes sont perçus comme des zones particulièrement polluées par les macrodéchets, « objectiver » cette pollution demeure important dans une approche systémique. Cette étude, menée dans le cadre du projet Plasti-nium, visait à étudier l'abondance et la composition des macrodéchets issus du trafic routier sur une portion de 800 m du périphérique nantais (90 000 véh/j). Les macrodéchets jusqu'à 1 cm, ont été collectés pendant une année, puis triés et classés selon les classifications OSPAR/TSG-ML. En un an, 88,5 kg de déchets ont été collectés. Au total, 36 439 articles ont été caractérisés, dont 84% en nombre étaient des plastiques. Ce sont surtout des fragments, des mégots et filtres de cigarettes, ainsi que des morceaux de polystyrène liés au chargement des véhicules. L'accumulation de déchets est fortement corrélée au trafic routier. En différenciant les déchets jetés volontairement des déchets perdus accidentellement, cette étude illustre la contribution majeure des chargements non couverts et non sécurisés. Ces données originales permettent d'apporter un autre regard sur les déchets le long des bords de route et, serviront à terme dans l'évaluation des pertes liées au trafic routier aux flux de plastiques vers l'environnement

Macrodéchets et déchets plastiques issus du trafic routier

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Macrolitter dataset from a highly frequented roadway in Nantes, France

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Amount, composition and sources of macrolitter from a highly frequented roadway

3ème rencontre du GDR Polymères et Océans, BREST, FRANCE, 27-/06/2022 - 29/06/2022De nombreuses recherches mentionnent la nécessité d'identifier les sources continentales de macrodéchets mais paradoxalement, relativement peu de données de terrain sur la composition et les sources de macrodéchets sont disponibles dans la littérature. Décrire et quantifier ces sources est nécessaire à une meilleure estimation des flux dans les milieux et une meilleure définition des stratégies d'atténuation. Si les bords de routes sont perçus comme des zones particulièrement polluées par les macrodéchets, « objectiver » cette pollution demeure important dans une approche systémique. Cette étude, menée dans le cadre du projet Plasti-nium, visait à étudier l'abondance et la composition des macrodéchets issus du trafic routier sur une portion de 800 m du périphérique nantais (90 000 véh/j). Les macrodéchets jusqu'à 1 cm, ont été collectés pendant une année, puis triés et classés selon les classifications OSPAR/TSG-ML. En un an, 88,5 kg de déchets ont été collectés. Au total, 36 439 articles ont été caractérisés, dont 84% en nombre étaient des plastiques. Ce sont surtout des fragments, des mégots et filtres de cigarettes, ainsi que des morceaux de polystyrène liés au chargement des véhicules. L'accumulation de déchets est fortement corrélée au trafic routier. En différenciant les déchets jetés volontairement des déchets perdus accidentellement, cette étude illustre la contribution majeure des chargements non couverts et non sécurisés. Ces données originales permettent d'apporter un autre regard sur les déchets le long des bords de route et, serviront à terme dans l'évaluation des pertes liées au trafic routier aux flux de plastiques vers l'environnement

Dynamique de transfert des macroplastiques en estuaire de Loire : trajectoires et facteurs d'influence

The quantification of macroplastics fluxes transferred by rivers generates increasing researches but a better assessment of these fluxes requires a precise understanding of macroplastics transfer dynamic within estuaries, environments at the land-ocean interface. Following the strategy deployed in the Seine estuary during the Macro-Plast project, this study aims to characterize macroplastics trajectories in the Loire estuary. Plastic bottles with different buoyancy were therefore equipped with GPS-trackers and released at different locations of the estuary between January 2020 and July 2021, during variable conditions of water flow and tidal ranges. 35 trajectories of maximum two months were monitored. Trajectories demonstrated a high spatiotemporal variability with total distances travelled by the tracked bottles ranging from 100 m to 103.6 km. The distances travelled by the tracked bottles were however lower in the Loire estuary that in the Seine one. Indeed, the specific geomorphology of the Loire estuary (riverbanks with gentle slope, submersible areas, reedbeds) lead to a fast stranding and hard remobilization of macroplastics. Bottles buoyancy plays a key role in macroplastics transfer dynamic but their trajectories animated by back and forth movements and stranding/remobilization processes highlighted that they are also influenced by other environmental factors including tides. This complex transfer dynamic and the fact that like in the Seine estuary, no bottle reached the ocean environment, raises questions on the real fluxes transferred from continental environments to oceans estimated with statistical methods.La quantification des flux de macroplastiques transférés par les fleuves fait l'objet de plus en plus d'études scientifiques mais une meilleure appréciation de ces flux nécessite une compréhension fine de la dynamique de transfert de ces déchets en milieu estuarien, interface entre le milieu continental et le milieu océanique. A l'image de ce qui a été réalisé sur la Seine dans le cadre du projet Macro-Plast, cette étude cherche à caractériser la trajectoire des déchets plastiques en estuaire de Loire. Dans ce but, des bouteilles plastiques de flottabilités différentes ont été équipées de balises GPS et lâchées à différents niveaux de l'estuaire entre janvier 2020 et juillet 2021. 35 trajectoires d'un maximum de deux mois ont été enregistrées. Celles-ci présentent une forte variabilité spatiotemporelle avec des distances totales parcourues comprises entre 100 m et 103,6 km. Les distances parcourues en estuaire de Loire sont toutefois plus faibles que celles mesurées en Seine. En effet, la morphologie particulière de l'estuaire de Loire (berges à pentes faibles, zones submersibles, roselières) donne lieu à des échouages rapides et une remobilisation difficile des macroplastiques. La flottabilité joue un rôle important dans la dynamique de transfert des macroplastiques mais leurs trajectoires animées par des allers-retours et des phénomènes d'échouage/remobilisation démontrent qu'elles sont également influencées par d'autres facteurs environnementaux dont la marée. Cette dynamique complexe et le fait que comme en estuaire de Seine, aucune bouteille n'a atteint le milieu océanique, questionne l'évaluation des flux réels de macroplastiques transférés des milieux continentaux vers les océans par des méthodes simplement statistiques

Macrodéchets et déchets plastiques issus du trafic routier

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Dynamique de transfert des macroplastiques en estuaire de Loire : trajectoires et facteurs d'influence

The quantification of macroplastics fluxes transferred by rivers generates increasing researches but a better assessment of these fluxes requires a precise understanding of macroplastics transfer dynamic within estuaries, environments at the land-ocean interface. Following the strategy deployed in the Seine estuary during the Macro-Plast project, this study aims to characterize macroplastics trajectories in the Loire estuary. Plastic bottles with different buoyancy were therefore equipped with GPS-trackers and released at different locations of the estuary between January 2020 and July 2021, during variable conditions of water flow and tidal ranges. 35 trajectories of maximum two months were monitored. Trajectories demonstrated a high spatiotemporal variability with total distances travelled by the tracked bottles ranging from 100 m to 103.6 km. The distances travelled by the tracked bottles were however lower in the Loire estuary that in the Seine one. Indeed, the specific geomorphology of the Loire estuary (riverbanks with gentle slope, submersible areas, reedbeds) lead to a fast stranding and hard remobilization of macroplastics. Bottles buoyancy plays a key role in macroplastics transfer dynamic but their trajectories animated by back and forth movements and stranding/remobilization processes highlighted that they are also influenced by other environmental factors including tides. This complex transfer dynamic and the fact that like in the Seine estuary, no bottle reached the ocean environment, raises questions on the real fluxes transferred from continental environments to oceans estimated with statistical methods.La quantification des flux de macroplastiques transférés par les fleuves fait l'objet de plus en plus d'études scientifiques mais une meilleure appréciation de ces flux nécessite une compréhension fine de la dynamique de transfert de ces déchets en milieu estuarien, interface entre le milieu continental et le milieu océanique. A l'image de ce qui a été réalisé sur la Seine dans le cadre du projet Macro-Plast, cette étude cherche à caractériser la trajectoire des déchets plastiques en estuaire de Loire. Dans ce but, des bouteilles plastiques de flottabilités différentes ont été équipées de balises GPS et lâchées à différents niveaux de l'estuaire entre janvier 2020 et juillet 2021. 35 trajectoires d'un maximum de deux mois ont été enregistrées. Celles-ci présentent une forte variabilité spatiotemporelle avec des distances totales parcourues comprises entre 100 m et 103,6 km. Les distances parcourues en estuaire de Loire sont toutefois plus faibles que celles mesurées en Seine. En effet, la morphologie particulière de l'estuaire de Loire (berges à pentes faibles, zones submersibles, roselières) donne lieu à des échouages rapides et une remobilisation difficile des macroplastiques. La flottabilité joue un rôle important dans la dynamique de transfert des macroplastiques mais leurs trajectoires animées par des allers-retours et des phénomènes d'échouage/remobilisation démontrent qu'elles sont également influencées par d'autres facteurs environnementaux dont la marée. Cette dynamique complexe et le fait que comme en estuaire de Seine, aucune bouteille n'a atteint le milieu océanique, questionne l'évaluation des flux réels de macroplastiques transférés des milieux continentaux vers les océans par des méthodes simplement statistiques

Dynamique de transfert des macrodéchets plastiques dans les estuaires macrotidaux : similarités et spécificités de l'estuaire de la Loire

3ème rencontre du GDR Polymères et Océans, BREST, FRANCE, 27-/06/2022 - 29/06/2022Les fleuves sont considérés comme des voies de transfert importantes où les macrodéchets plastiques seraient linéairement et continuellement transférés vers l'océan. Récemment, certaines études démontrent pourtant que les macrodéchets peuvent s'accumuler dans les systèmes fluviaux durant des années, voire plusieurs décennies. Tout l'enjeu est de savoir quel rôle jouent les estuaires, interfaces entre les fleuves et les océans, dans la dynamique de transfert des macrodéchets plastiques. L'objectif de cette étude est donc de caractériser cette dynamique dans l'estuaire macrotidal de la Loire et d'identifier les similarités et spécificités de cet estuaire vis-à-vis de celui de la Seine, étudié selon la même méthodologie. Ainsi, 35 bouteilles équipées de balises GPS et avec des flottabilités différentes ont été lâchées en amont et en aval de l'agglomération nantaise durant des conditions de débit et de marée différentes. Les résultats démontrent qu'un grand nombre de facteurs anime le transfert des macrodéchets menant à des trajectoires chaotiques avec une forte variabilité spatiotemporelle (distances totales parcourues comprises entre 100 m et 103,6 km). Comme observé en estuaire de Seine, tous les macrodéchets tendent à s'accumuler sur les berges, confirmant que les estuaires macrotidaux constituent des puits, au moins temporaires, plutôt que des sources de macrodéchets plastiques. Les processus de remobilisation apparaissent toutefois différents entre ces deux estuaires soulignant l'influence importante de la géomorphologie des berges dans ces processus. Les tendances observées à l'échelle des deux estuaires permettent une certaine montée en généralité et serviront à une meilleure évaluation des flux réellement transférés vers les océans