Role of the interactions bacteria - bacterivorous nematodes on the availability of N and P within rhizosphere of rice on Ferralsols in Madagascar : mechanisms and control drivers

Les objectifs de cette thèse étaient (i) d'étudier les mécanismes par lesquels les nématodes bactérivores régulent les flux de nutriments (N et P) dans la rhizosphère du riz pluvial dans un sol ferrallitique de Madagascar, (ii) d'étudier les effets des interactions bactéries – bactérivores sur les fonctions de la plante (croissance et nutrition), et (iii) d'évaluer les principaux facteurs contrôlant la boucle microbienne des sols dans une optique d'intensification. Notre modèle biologique comprenait Acrobeloides sp. (Cephalobidae) et Oryza sativa (Poaceae).Deux voies ont été proposées pour expliquer les effets positifs des bactérivores sur la disponibilité des nutriments et les fonctions de la plante: voie de minéralisation et voie d'exploration. Afin d'identifier l'implication de chaque voie dans les flux de P inorganique à l'interface sol-plante nous avons utilisé le radio-isotope 32P comme traceur. Lorsque le pH du sol est corrigé par l'ajout de dolomie, la présence des nématodes bactérivores améliore la minéralisation nette de P, la production de biomasse et la nutrition de la plante sans modifier la ramification du système racinaire, contrairement à ce qui a été observé par certains auteurs en présence de protistes. En effet, en présence de nématodes et de dolomie, la L-value dans les parties aériennes de la plante augmente de 49%, la biomasse totale de la plante augmente de 22%, et la quantité de P total dans les tissus de la plante augmente de 9%. Ainsi, Acrobeloides sp. stimule le prélèvement de P par la plante via la voie nutritionnelle ou voie de minéralisation.Les effets de Acrobeloides sp. sur les fonctions de la plante sont variables (positives, neutres, négatives), en fonction des pratiques agricoles et des caractéristiques abiotiques du sol. Tout d'abord, ces effets peuvent dépendre de la variété de riz puisque l'attractivité des nématodes Acrobeloides sp. par la rhizosphère du riz varie en fonction des variétés de riz pluvial, plus précisément en fonction de la composition et de la quantité d'exsudats racinaires libérés par la plante. Ensuite, l'activité mutualiste des nématodes est influencée (maximisée) par la présence d'arbres (agroforesterie) dans la parcelle de riz pluvial. En plus des plantes, les paramètres édaphiques étaient des facteurs clés. L'activité mutualiste des nématodes est fortement limitée par le pouvoir fixateur des Ferralsols. Ainsi, l'ajout de dolomie limite la capacité de sorption de P du sol et améliore l'activité mutualiste des nématodes bactérivores. Enfin, l'activité mutualiste des nématodes sur la croissance et la nutrition du riz pluvial est favorisée par les valeurs élevées de pH et de teneur en Mg dans le sol. Pour conclure nous avons trouvé qu'il est possible d'intensifier l'activité mutualiste des nématodes bactérivores dans un sol tropical pauvre à travers des pratiques agricoles spécifiques (gestion des sols, agroforesterie).Using Acrobeloides sp. (Cephalobidae) and Oryza sativa (Poaceae), we aimed at (i) studying the effects of bacterivorous nematodes on plant functions growing in a nutrient-poor soil in Madagascar, (ii) testing the mechanisms involved in the mutualistic activity of the bacterivorous nematodes in a strong P-depleted Ferralsol from the highlands of Madagascar, and (iii) identifying the agronomic and edaphic factors that can drive the soil microbial loop.Two pathways have been proposed to explain the positive effects of bacterial-feeders on nutrients availability and plant functions: mineralization pathway and exploration pathway. In order to test the involvement of each pathway in the mutualistic activity of bacterivorous nematodes, we assessed the effect of nematodes inoculation on inorganic P flows from soil to plant using the 32P labelling technique. When the soil pH was corrected with dolomite lime, we showed that the presence of Acrobeloides sp. improved net P mineralization and plant (Oryza sativa) functions (growth and nutrition) but did not alter lateral root growth as protists do. Indeed, in the presence of nematodes and dolomite, the shoot L-value increased by 49%, the plant total biomass increased by 22% and the plant total P amount increased by 9%. Thus, Acrobeloides sp. increased plant P uptake through the "nutritional" or "mineralization" pathway.The effects of Acrobeloides sp. on Oryza sativa functions were variable (positive, neutral or negative) according to agricultural practices and soil abiotic variables. First, these effects may depend on the rice cultivar used in the experiment. Indeed, the nematodes attractancy to root-adhering soils varied according to upland rice cultivar, probably according to the amount and composition of root exudates. The mutualistic activity of nematodes is also influenced (maximized) by the presence of trees (agroforestry) in the rice field. Besides plants, the abiotic soil parameters were key drivers. The mutualistic activity of nematodes was strongly limited by the ability of Ferralsols to precipitate and chemisorb phosphates. The addition of dolomite lime limited phosphates sorption on soil and enhanced the mutualistic activity of the nematodes. Also, the high values of soil pH and Mg content tended to increase the mutualistic activity of the bacterivorous nematodes on rice growth and nutrition. To conclude, we found that it is possible to drive the mutualistic activity of bacterivorous nematodes in poor tropical soils through specific soil and agricultural practices

DÉFORESTATION ET GOUVERNANCE ENVIRONNEMENTALE : ANALYSE DE LA MISE EN ŒUVRE DES POLITIQUES DE CONSERVATION DES FORÊTS A MADAGASCAR - CAS DE L’AIRE PROTÉGÉE MAROMIZAHA

Les premières lois forestières malgaches datent de l’époque monarchique, et ont été stimulées par une vision conversationniste. Tenant compte du droit coutumier des populations riveraines qui ont longtemps considéré la forêt comme un moyen de subsistance, ces règles formelles du gouvernement sont souvent réadaptées en fonction du contexte au niveau local. Cette recherche a eu pour objectif principal de comprendre comment l’Etat malgache s’est occupé de la déforestation (1) au niveau national par l’intermédiaire des législations, puis (2) dans un cas concret qui est l’aire protégée Maromizaha. Ainsi, l’analyse s’est basée essentiellement sur les processus de gouvernance et de réappropriation des lois au niveau local. Est-ce que les politiques puis les structures mises en place et les mécanismes locaux contribuent à l’amélioration du processus de conservation des forêts et donc à la réduction de la déforestation ? Tel est l’objet principal de la recherche. Nous avons alors procédé à une revue de la littérature scientifique sur les concepts fondamentaux autour desquels s’articule notre sujet, puis effectué une périodisation de l’évolution de la politique de conservation des forêts, pour enfin mener des entretiens auprès des principaux acteurs locaux à Maromizaha et confronter le théorique aux réalités locales. Les difficultés de mise en œuvre des politiques forestières à Maromizaha s’inscrivent dans des dynamiques conflictuelles qui opposent les besoins de survies des locaux matérialisés par des activités économiques à courts termes et une vision conversationniste sur le long terme de l’Etat.Master de spécialisation en développement, environnement et sociétés, Université catholique de Louvain, 201

Rôle des interactions bactéries-nématodes bactérivores sur la disponibilité du N et P au sein de la rhizosphère du riz sur sol ferrallitique à Madagascar : mécanismes et facteurs de contrôle

Using Acrobeloides sp. (Cephalobidae) and Oryza sativa (Poaceae), we aimed at (i) studying the effects of bacterivorous nematodes on plant functions growing in a nutrient-poor soil in Madagascar, (ii) testing the mechanisms involved in the mutualistic activity of the bacterivorous nematodes in a strong P-depleted Ferralsol from the highlands of Madagascar, and (iii) identifying the agronomic and edaphic factors that can drive the soil microbial loop.Two pathways have been proposed to explain the positive effects of bacterial-feeders on nutrients availability and plant functions: mineralization pathway and exploration pathway. In order to test the involvement of each pathway in the mutualistic activity of bacterivorous nematodes, we assessed the effect of nematodes inoculation on inorganic P flows from soil to plant using the 32P labelling technique. When the soil pH was corrected with dolomite lime, we showed that the presence of Acrobeloides sp. improved net P mineralization and plant (Oryza sativa) functions (growth and nutrition) but did not alter lateral root growth as protists do. Indeed, in the presence of nematodes and dolomite, the shoot L-value increased by 49%, the plant total biomass increased by 22% and the plant total P amount increased by 9%. Thus, Acrobeloides sp. increased plant P uptake through the "nutritional" or "mineralization" pathway.The effects of Acrobeloides sp. on Oryza sativa functions were variable (positive, neutral or negative) according to agricultural practices and soil abiotic variables. First, these effects may depend on the rice cultivar used in the experiment. Indeed, the nematodes attractancy to root-adhering soils varied according to upland rice cultivar, probably according to the amount and composition of root exudates. The mutualistic activity of nematodes is also influenced (maximized) by the presence of trees (agroforestry) in the rice field. Besides plants, the abiotic soil parameters were key drivers. The mutualistic activity of nematodes was strongly limited by the ability of Ferralsols to precipitate and chemisorb phosphates. The addition of dolomite lime limited phosphates sorption on soil and enhanced the mutualistic activity of the nematodes. Also, the high values of soil pH and Mg content tended to increase the mutualistic activity of the bacterivorous nematodes on rice growth and nutrition. To conclude, we found that it is possible to drive the mutualistic activity of bacterivorous nematodes in poor tropical soils through specific soil and agricultural practices.Les objectifs de cette thèse étaient (i) d'étudier les mécanismes par lesquels les nématodes bactérivores régulent les flux de nutriments (N et P) dans la rhizosphère du riz pluvial dans un sol ferrallitique de Madagascar, (ii) d'étudier les effets des interactions bactéries – bactérivores sur les fonctions de la plante (croissance et nutrition), et (iii) d'évaluer les principaux facteurs contrôlant la boucle microbienne des sols dans une optique d'intensification. Notre modèle biologique comprenait Acrobeloides sp. (Cephalobidae) et Oryza sativa (Poaceae).Deux voies ont été proposées pour expliquer les effets positifs des bactérivores sur la disponibilité des nutriments et les fonctions de la plante: voie de minéralisation et voie d'exploration. Afin d'identifier l'implication de chaque voie dans les flux de P inorganique à l'interface sol-plante nous avons utilisé le radio-isotope 32P comme traceur. Lorsque le pH du sol est corrigé par l'ajout de dolomie, la présence des nématodes bactérivores améliore la minéralisation nette de P, la production de biomasse et la nutrition de la plante sans modifier la ramification du système racinaire, contrairement à ce qui a été observé par certains auteurs en présence de protistes. En effet, en présence de nématodes et de dolomie, la L-value dans les parties aériennes de la plante augmente de 49%, la biomasse totale de la plante augmente de 22%, et la quantité de P total dans les tissus de la plante augmente de 9%. Ainsi, Acrobeloides sp. stimule le prélèvement de P par la plante via la voie nutritionnelle ou voie de minéralisation.Les effets de Acrobeloides sp. sur les fonctions de la plante sont variables (positives, neutres, négatives), en fonction des pratiques agricoles et des caractéristiques abiotiques du sol. Tout d'abord, ces effets peuvent dépendre de la variété de riz puisque l'attractivité des nématodes Acrobeloides sp. par la rhizosphère du riz varie en fonction des variétés de riz pluvial, plus précisément en fonction de la composition et de la quantité d'exsudats racinaires libérés par la plante. Ensuite, l'activité mutualiste des nématodes est influencée (maximisée) par la présence d'arbres (agroforesterie) dans la parcelle de riz pluvial. En plus des plantes, les paramètres édaphiques étaient des facteurs clés. L'activité mutualiste des nématodes est fortement limitée par le pouvoir fixateur des Ferralsols. Ainsi, l'ajout de dolomie limite la capacité de sorption de P du sol et améliore l'activité mutualiste des nématodes bactérivores. Enfin, l'activité mutualiste des nématodes sur la croissance et la nutrition du riz pluvial est favorisée par les valeurs élevées de pH et de teneur en Mg dans le sol. Pour conclure nous avons trouvé qu'il est possible d'intensifier l'activité mutualiste des nématodes bactérivores dans un sol tropical pauvre à travers des pratiques agricoles spécifiques (gestion des sols, agroforesterie)

Do trophic relationships in soil enhance organic P cycling and plant P nutrition? Phytate mineralization as a case study

Phosphorus (P) strongly limits plant productivity as plants can only absorb free inorganic orthophosphate (Pi) at very low concentrations in soil solution. However, soil contains high levels of poorly available P, especially phytate, considered as the most abundant plant-unavailable organic P source. Here, we investigated a new strategy based on rhizosphere trophic relationships to mobilize P from phytate. We hypothesized that the interactions between plant (Pinus pinaster), phytase-producing bacteria (Bacillus subtilis), mycorrhizal fungi (Hebeloma cylindrosporum), representing the more widespread strategy to improve plant P acquisition, and bacterial grazer nematodes (Rhabditis sp.) may improve plant P acquisition from phytate and thus P cycling from soil organic P. We grew seedlings jn microcosms containing soil with Pi or phytate, with or without the above-mentioned organisms for 2.5 months. With Pi, no significant differences were observed among inoculation or mycorrhizal treatments. In contrast, with phytate, nematode grazing was required for non-mycorrhizal plants to acquire P into their shoots. In mycorrhizal plants, bacteria alone improved net P accumulation and nematode grazing enhanced this positive effect. Soil microbial P contents and in situ probing of bacterial phytase gene expression are currently under study to understand better the mechanisms underlying the strong positive effects of nematode grazing on plant P nutrition. Our first results indicate that the use of trophic relationships should be considered as a sustainable strategy for plant P nutrition to enhance organic P cycling and P availability in the rhizosphere

Richness of rhizosphere organisms affects plant P nutrition according to P source and mobility

Plants evolve complex interactions with diverse soil mutualist organisms to enhance P mobilization from the soil. These strategies are particularly important when P is poorly available. It is still unclear how the soil P source (e.g., mineral P versus recalcitrant organic P) and its mobility in the soil (high or low) affect soil mutualist biological (ectomycorrhizal fungi, bacteria and bacterial-feeding nematodes) richness-plant P acquisition relationships. Using a set of six microcosm experiments conducted in growth chamber across contrasting P situations, we tested the hypothesis that the relationship between the increasing addition of soil mutualist organisms in the rhizosphere of the plant and plant P acquisition depends on P source and mobility. The highest correlation (R-2 = 0.70) between plant P acquisition with soil rhizosphere biological richness was found in a high P-sorbing soil amended with an organic P source. In the five other situations, the relationships became significant either in soil conditions, with or without mineral P addition, or when the P source was supplied as organic P in the absence of soil, although with a low correlation coefficient (0.09 < R-2 < 0.15). We thus encourage the systematic and careful consideration of the form and mobility of P in the experimental trials that aim to assess the role of biological complexity on plant P nutrition

Les relations trophiques microfaune bactéries rhizosphériques mycorhizes: quel rôle dans le recyclage des nutriments (N et P)?

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