Bumblebee catfishes in Colombia: disentangling macro and microevolution in the genus Pseudopimelodus (Siluriformes: Pseudopimelodidae)

The Neotropical genus Pseudopimelodus (Siluriformes, Pseudopimelodidae) is the second most widely distributed genus in South America comprising four valid species that inhabit different trans- and cis-Andean rivers. Of the two species recorded in Colombia, P. schultzi is distributed in the Magdalena-Cauca and Caribbean basin and P. bufonius is distributed in the Atrato River basin and Orinoco-Amazon river basins. Several paleogeographic processes resulting from Andean orogeny in northwestern South America may promote genetic diversification in the genus Pseudopimelodus in Colombia. To test this hypothesis, we conducted phylogenetic analyses based on Bayesian Inference by using a partial sequence of the Nuclear Recombination-Activating gen (rag2) and the subunit 1 Cytochrome C Oxidase gene (COI). Furthermore, two new Pseudopimelodus species from the Magdalena-Cauca River Basin were described here based on osteological and morphometric characters: Pseudopimelodus sp. nov. 1 from Cauca River upper and middle sectors and Magdalena River upper sectors and Pseudopimelodus sp. nov. 2 from Cauca River lower sector and Magdalena River middle and lower sectors. In addition, a set of 13 microsatellites were developed by using next generation sequence technology to assess the genetic diversity and genetic structure of these two new Pseudopimelodus species. Results of Bayesian phylogenetic analyses releaved that the genus Pseudopimelodus in Colombia comprises at least five different, well-delimited evolutionary lineages, the divergence times of which agree with the geological history of northwestern South America. Moreover, microsatellite analyses showed that both new species exhibited high levels of gene flow among sample sites, and high genetic diversity compared to the mean levels of genetic diversity reported for Neotropical Siluriformes. The results obtained in this study are crucial for designing local and regional management strategies for Pseudopimelodus fisheries in Colombia.El género Neotropical Pseudopimelodus es el segundo con la más amplia distribución de la familia Pseudopimelodidae en Sur América y comprende cuatro especies válidas que habitan en diferentes ríos trans y cis-andinos. De estas cuatro especies, dos se encuentran registradas en Colombia: P. schultzi distribuida en las cuencas Magdalena-Cauca y Caribe y P. bufonius en el río Atrato y en las cuencas Amazonas y Orinoco. Diversos procesos paleogeográficos resultantes de la orogenia Andina en Suramérica noroccidental podrían promover la diversificación genética del género Pseudopimelodus en Colombia. Para contrastar esta hipótesis, en este trabajo se realizaron análisis filogenéticos basados en Inferencia Bayesiana usando secuencias parciales del gen nuclear activador de la recombinación (rag2) y de la subunidad 1 del gen de la Citocromo C Oxidasa (COI). Adicionalmente, se realizó la descripción de dos nuevas especies de Pseudopimelodus para la cuenca Magdalena-Cauca mediante el análisis de caracteres osteológicos y morfométricos: Pseudopimelodus sp. nov. 1 presente en la parte media y alta del Río Cauca y parte alta del Río Magdalena y Pseudopimelodus sp. nov. 2 que habita en la parte baja del Río Cauca y parte media y baja del Río Magdalena. Por otro lado, este estudio desarrolló un conjunto de 13 microsatélites utilizando tecnología de secuenciación de próxima generación para evaluar la diversidad y la estructura genética de estas dos nuevas especies de Pseudopimelodus. Los resultados obtenidos mediante Inferencia Bayesiana mostraron que el género Pseudopimelodus en Colombia representan al menos cinco linajes evolutivos bien delimitados, cuyos tiempos de divergencia concuerdan con la historia geológica de Suramérica noroccidental. Además, los análisis obtenidos de los microsatélites mostraron que ambas especies exhiben altos niveles de flujo genético entre los sitios muestreados y alta diversidad genética en comparación con los niveles promedios de diversidad genética reportados para Siluriformes Neotropicales. Los resultados obtenidos en el presente trabajo son de suma importancia para el diseño e implementación de estrategias regionales de manejo de las pesquerías de Pseudopimelodus en ColombiaDoctor en BiotecnologíaDoctorad

Variación genética temporal del caracol pala (strombus gigas) evidenciada por microsatélites en el atolón bolívar, archipiélago de san andrés, providencia y santa catalina

El atolón Bolívar es uno de los sitios del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina que presenta una baja recuperación en la densidad poblacional del caracol pala Strombus gigas, por lo tanto el monitoreo de la diversidad genética de la especie en este sitio constituye un punto crucial en la selección de alternativas adecuadas de manejo sostenible y actividades de conservación. Con el fin de detectar diferencias en la diversidad genética del caracol pala en este atolón, en el presente trabajo se compararon muestras recolectadas en los años 2007 y 2008 empleando seis loci microsatélites, el estadístico ФST y análisis de varianza molecular (AMOVA). Los resultados del análisis genético indicaron que todos los loci fueron polimórficos, presentaron déficit de heterocigosidad y desviación del equilibrio Hardy-Weinberg. Las muestras recolectadas en 2008 presentaron un menor número de alelos por locus y fueron genéticamente diferentes de las recolectadas en 2007 (ФST = 0,070 P= 0.000). Los resultados en conjunto sugieren una disminución significativa de la variación genética de poblaciones de Strombus gigas ocurrida en un periodo muy corto de tiempo en el atolón Bolívar lo que amerita tomar medidas urgentes que permitan la recuperación de la densidad poblacional de la especie dentro de esta área