Genetic diversity in a world germplasm collection of tall fescue

Festuca arundinacea Schreb., commonly known as tall fescue, is a major forage crop in temperate regions. Recently, a molecular analysis of different accessions of a world germplasm collection of tall fescue has demonstrated that it contains different species from the genus Festuca and allowed their rapid classification into the three major morphotypes (Continental, Mediterranean and Rhizomatous). In this study, we explored the genetic diversity of 161 accessions of Festuca species from 29 countries, including 28 accessions of INTA (Argentina), by analyzing 15 polymorphic SSR markers by capillary electrophoresis. These molecular markers allowed us to detect a total of 214 alleles. The number of alleles per locus varied between 5 and 24, and the values of polymorphic information content ranged from 0.627 to 0.840. In addition, the accessions analyzed by flow cytometry showed different ploidy levels (diploid, tetraploid, hexaploid and octaploid), placing in evidence that the world germplasm collection consisted of multiple species, as previously suggested. Interestingly, almost all accessions of INTA germplasm collection were true hexaploid tall fescue, belonging to two eco-geographic races (Continental and Mediterranean). Finally, the data presented revealed an ample genetic diversity of tall fescue showing the importance of preserving the INTA collection for future breeding programsFil: Cuyeu, Alba Romina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética "Ewald A. Favret"; ArgentinaFil: Rosso, Beatriz Susana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino; ArgentinaFil: Pagano, Elba Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética "Ewald A. Favret"; ArgentinaFil: Soto, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética "Ewald A. Favret"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fox, Ana Romina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética "Ewald A. Favret"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Ayub, Nicolás Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética "Ewald A. Favret"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Genetic diversity in a world germplasm collection of tall fescue

Festuca arundinacea Schreb., commonly known as tall fescue, is a major forage crop in temperate regions. Recently, a molecular analysis of different accessions of a world germplasm collection of tall fescue has demonstrated that it contains different species from the genus Festuca and allowed their rapid classification into the three major morphotypes (Continental, Mediterranean and Rhizomatous). In this study, we explored the genetic diversity of 161 accessions of Festuca species from 29 countries, including 28 accessions of INTA (Argentina), by analyzing 15 polymorphic SSR markers by capillary electrophoresis. These molecular markers allowed us to detect a total of 214 alleles. The number of alleles per locus varied between 5 and 24, and the values of polymorphic information content ranged from 0.627 to 0.840. In addition, the accessions analyzed by flow cytometry showed different ploidy levels (diploid, tetraploid, hexaploid and octaploid), placing in evidence that the world germplasm collection consisted of multiple species, as previously suggested. Interestingly, almost all accessions of INTA germplasm collection were true hexaploid tall fescue, belonging to two eco-geographic races (Continental and Mediterranean). Finally, the data presented revealed an ample genetic diversity of tall fescue showing the importance of preserving the INTA collection for future breeding programs.Fil: Cuyeu, Romina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias. Centro de Investigación de Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; ArgentinaFil: Rosso, Beatriz Elena. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Norte. Estación Experimental Agropecuaria Pergamino; ArgentinaFil: Pagano, Elba Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias. Centro de Investigación de Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; ArgentinaFil: Soto, Gabriela Cynthia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias. Centro de Investigación de Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fox, Ana Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; ArgentinaFil: Ayub, Nicolas Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias. Centro de Investigación de Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

The genetic diversity of wild rescuegrass is associated with precipitation levels

The genus Bromus belongs to the family Poaceae, contains 3 over 160 annual and perennial species of grasses [...]Fil: Cuyeu, Romina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias. Centro de Investigación de Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; ArgentinaFil: Pagano, Elba Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias. Centro de Investigación de Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; ArgentinaFil: Rosso, Beatriz Elena. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; ArgentinaFil: Soto, Gabriela Cynthia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; ArgentinaFil: Ayub, Nicolas Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias. Centro de Investigación de Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; Argentin

Aplicación de marcadores moleculares a estudios de variabilidad genética en poáceas forrajeras templadas

En la Argentina, alrededor de 22 especies Poáceas son utilizadas, en diferentes sistemas de producción de la región templada, para la alimentación del ganado en forma directa o diferida como heno. Se adaptan a crecer solas o en mezclas con otras especies Poáceas o Fabáceas y en diferentes condiciones de suelo destacándose su aporte para mejorar la estructura, mantener la fertilidad y controlar la erosión de los suelos. La festuca alta (Festuca arundinacea Schreb) y la cebadilla criolla (Bromus catharticus VahIJ están entre las forrajeras templadas mas importantes y utilizadas en Argentina. El objetivo de este trabajo fue caracterizar, mediante marcadores moleculares SSR, la variabilidad genética de las colecciones de festuca alta y cebadilla criolla del Banco de Activo de Germoplasma de la EEA INTA Pergamino, y comparar la estructura genética de las accesiones de ambas especies. Para ello, se analizaron 161 accesiones de festuca alta y 68 accesiones de cebadilla criolla, trabajadas en bulk. El sistema de PCR usado se basó en marcadores SSR marcados con fluorescencia y la detección de los fragmentos amplificados se realizó en el Analizador Genético ABI 3130. En festuca alta, a partir de una evaluación de 45 SSR, se seleccionaron 15 SSR por criterio de calidad de amplificación y de detección de polimorfismo. En cebadilla criolla, luego de una evaluación de 134 SSR de otras poáceas, se transfirieron 26 SSR, seleccionándose 17 SSR por criterio de calidad de amplificación y de detección de polimorfismo. Los datos generados por los marcadores moleculares se codificaron en forma binaria: presencia/ ausencia de banda y ¡as distancias genéticas fueron estimadas a partir del coeficiente de similitud Dice (festuca) o Jaccard (cebadilla). Los agrupamientos se determinaron por el método de promedio aritmético de grupos de pares no ponderados (UPGMA) y las relaciones genéticas entre las accesiones se visualizaron mediante dendogramas. En festuca alta la caracterización de las 161 accesiones mostró una distancia genética que varió entre 0,22 y 0,76, confirmando la existencia de elevada variabilidad genética entre las mismas. Además, la caracterización individual de 22 accesiones representativas de los agrupamientos observados mostró que el 71% de la variabilidad molecular se encuentra dentro de las accesiones y el 29% entre las mismas. A pesar de ello, la caracterización de esas mismas accesiones en bulk proveyó una adecuada caracterización de las mismas. En cebadilla criolla, la caracterización de las 68 accesiones mostró una distancia genética que varió entre 0,10 y 0,60 confirmando la existencia de una moderada variabilidad genética entre las mismas. Cabe destacar que dicha variabilidad está relacionada al origen geográfico de las accesiones verificándose una interesante diferenciación de aquellas provenientes del Oeste de la región muestreada. Por otra parte la comparación, para un subconjunto de las accesiones, de las relaciones genéticas obtenidas mediante RAPD y SSR mostró agrupamientos similares aunque la capacidad discriminatoria de los SSR fue superior. Se verificó para ambas especies la ausencia de accesiones duplicadas.Fil: Cuyeu, Alba Romina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas.En la Argentina, alrededor de 22 especies Poáceas son utilizadas, en diferentes sistemas de producción de la región templada, para la alimentación del ganado en forma directa o diferida como heno. Se adaptan a crecer solas o en mezclas con otras especies Poáceas o Fabáceas y en diferentes condiciones de suelo destacándose su aporte para mejorar la estructura, mantener la fertilidad y controlar la erosión de los suelos. La festuca alta (Festuca arundinacea Schreb) y la cebadilla criolla (Bromus catharticus VahIJ están entre las forrajeras templadas mas importantes y utilizadas en Argentina. El objetivo de este trabajo fue caracterizar, mediante marcadores moleculares SSR, la variabilidad genética de las colecciones de festuca alta y cebadilla criolla del Banco de Activo de Germoplasma de la EEA INTA Pergamino, y comparar la estructura genética de las accesiones de ambas especies. Para ello, se analizaron 161 accesiones de festuca alta y 68 accesiones de cebadilla criolla, trabajadas en bulk. El sistema de PCR usado se basó en marcadores SSR marcados con fluorescencia y la detección de los fragmentos amplificados se realizó en el Analizador Genético ABI 3130. En festuca alta, a partir de una evaluación de 45 SSR, se seleccionaron 15 SSR por criterio de calidad de amplificación y de detección de polimorfismo. En cebadilla criolla, luego de una evaluación de 134 SSR de otras poáceas, se transfirieron 26 SSR, seleccionándose 17 SSR por criterio de calidad de amplificación y de detección de polimorfismo. Los datos generados por los marcadores moleculares se codificaron en forma binaria: presencia/ ausencia de banda y ¡as distancias genéticas fueron estimadas a partir del coeficiente de similitud Dice (festuca) o Jaccard (cebadilla). Los agrupamientos se determinaron por el método de promedio aritmético de grupos de pares no ponderados (UPGMA) y las relaciones genéticas entre las accesiones se visualizaron mediante dendogramas. En festuca alta la caracterización de las 161 accesiones mostró una distancia genética que varió entre 0,22 y 0,76, confirmando la existencia de elevada variabilidad genética entre las mismas. Además, la caracterización individual de 22 accesiones representativas de los agrupamientos observados mostró que el 71% de la variabilidad molecular se encuentra dentro de las accesiones y el 29% entre las mismas. A pesar de ello, la caracterización de esas mismas accesiones en bulk proveyó una adecuada caracterización de las mismas. En cebadilla criolla, la caracterización de las 68 accesiones mostró una distancia genética que varió entre 0,10 y 0,60 confirmando la existencia de una moderada variabilidad genética entre las mismas. Cabe destacar que dicha variabilidad está relacionada al origen geográfico de las accesiones verificándose una interesante diferenciación de aquellas provenientes del Oeste de la región muestreada. Por otra parte la comparación, para un subconjunto de las accesiones, de las relaciones genéticas obtenidas mediante RAPD y SSR mostró agrupamientos similares aunque la capacidad discriminatoria de los SSR fue superior. Se verificó para ambas especies la ausencia de accesiones duplicadas

Genetic diversity in a world germplasm collection of tall fescue

Festuca arundinacea Schreb., commonly known as tall fescue, is a major forage crop in temperate regions. Recently, a molecular analysis of different accessions of a world germplasm collection of tall fescue has demonstrated that it contains different species from the genus Festuca and allowed their rapid classification into the three major morphotypes (Continental, Mediterranean and Rhizomatous). In this study, we explored the genetic diversity of 161 accessions of Festuca species from 29 countries, including 28 accessions of INTA (Argentina), by analyzing 15 polymorphic SSR markers by capillary electrophoresis. These molecular markers allowed us to detect a total of 214 alleles. The number of alleles per locus varied between 5 and 24, and the values of polymorphic information content ranged from 0.627 to 0.840. In addition, the accessions analyzed by flow cytometry showed different ploidy levels (diploid, tetraploid, hexaploid and octaploid), placing in evidence that the world germplasm collection consisted of multiple species, as previously suggested. Interestingly, almost all accessions of INTA germplasm collection were true hexaploid tall fescue, belonging to two eco-geographic races (Continental and Mediterranean). Finally, the data presented revealed an ample genetic diversity of tall fescue showing the importance of preserving the INTA collection for future breeding programs

Temporal host–symbiont dynamics in community contexts: Impact of host fitness and vertical transmission efficiency on symbiosis prevalence

<p>Symbiotic associations are pivotal in plant ecology and evolution, with outcomes depending on partners' traits and environmental context. Here, we compiled a dataset from a three-year study focusing on an annual plant species that forms symbiosis with a vertically transmitted fungal endophyte. The study was conducted in stands situated in two different vegetation communities: HMM, characterized by productivity and low-stress conditions, and HP, exhibiting less productivity and high-stress conditions.</p&gt

Temporal host–symbiont dynamics in community contexts: Impact of host fitness and vertical transmission efficiency on symbiosis prevalence

<p>Symbiotic associations are pivotal in plant ecology and evolution, with outcomes depending on partners' traits and environmental context. Here, we compiled a dataset regarding a three-year study focusing on an annual plant species that forms symbiosis with a vertically transmitted fungal endophyte. The study was conducted in stands situated in two different vegetation communities: HMM, characterized by productivity and low-stress conditions, and HP, exhibiting less productivity and high-stress conditions.</p&gt