Identificação de genes diferencialmente expressos em soja em resposta à Phakopsora pachyrhizi pela metodologia ACP.

A ferrugem asiática da soja (FAS), causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi, é uma doença foliar destrutiva em quase todos os países produtores de soja. Ferramentas biotecnológicas podem auxiliar no entendimento dos mecanismos de resposta de defesa a este fungo em nível molecular e consequentemente no controle da doença. Para identificar genes envolvidos em resposta à infecção com FAS, RNA de folhas infectadas e não infectadas de genótipos de soja resistente (PI561356) e suscetível (BRS 184), foram analisadas pela metodologia ACP (Annealing Control Primer). Quarenta ACPs foram utilizados para identificar e sequenciar 59 genes diferencialmente expressos (DEGs) e 44 destes genes mostraram homologia com proteínas conhecidas e foram identificados como envolvidos principalmente em fotossíntese, síntese e degradação de proteínas. A maioria dos DEGs que foi induzida nas plantas resistentes estava envolvida na categoria funcional de defesa, energia, atividade antioxidante e transporte celular. Quatro genes com diferentes padrões de expressão foram selecionados e caracterizados por meio de análises de RT-qPCR para obter um perfil de expressão específico nos genótipos de soja resistente (PI561356), tolerante (BRS 231) e suscetível (BRS 184). Análises de RT-qPCR revelaram que as respostas iniciais são mais intensas nas plantas resistentes. Adicionalmente, foi possível identificar o gene tiazol como candidato para estudos mais detalhados de seu envolvimento com a resistência a FAS

Refractory Angina Cell Therapy (ReACT) Involving Autologous Bone Marrow Cells in Patients Without Left Ventricular Dysfunction: A Possible Role for Monocytes

Autologous bone marrow mononuclear cell (BMMC) transplantation has emerged as a potential therapeutic option for refractory angina patients. Previous studies have shown conflicting myocardium reperfusion results. the present study evaluated safety and efficacy of CellPraxis Refractory Angina Cell Therapy Protocol (ReACT). in which a specific BMMC formulation was administered as the sole therapy for these patients. the phase I/IIa noncontrolled, open label. clinical trial, involved eight patients with refractory angina and viable ischemic myocardium, without left ventricular dysfunction and who were not suitable for conventional myocardial revascularization. ReACT is a surgical procedure involving a single series of multiple injections (40-90 injections, 0.2 ml each) into ischemic areas of the left ventricle. Primary endpoints were Canadian Cardiovascular Society Angina Classification (CCSAC) improvement at 18 months follow-up and myocardium ischemic area reduction (assessed by scintigraphic analysis) at 12 months follow-up, in correlation with a specific BMMC formulation. Almost all patients presented progressive improvement in angina classification beginning 3 months (p = 0.008) postprocedure which was sustained at 18 months follow-up (p = 0.004), as well as objective myocardium ischemic area reduction at 12 months (decrease of 84.4%, p < 0.004). A positive correlation was found between monocyte concentration and CCSAC improvement (r = -0.759, p < 0.05). Improvement in CCSAC, followed by correlated reduction in scintigraphic myocardium ischemic area, strongly suggests neoangiogenesis as the main stem cell action mechanism. the significant correlation between number of monocytes and improvement strongly supports a cell-related effect of ReACT. ReACT appeared safe and effective.Cryopraxis Crobiologia Ltda.Cellpraxis BiogenhariaUniversidade Federal de São Paulo, Paulista Sch Med, Dept Surg, Div Cardiovasc Surg, São Paulo, BrazilCryopraxis Criobiol Ltda, Rio de Janeiro, BrazilCellpraxis Bioengn, Rio de Janeiro, BrazilUniversidade Federal de São Paulo, Paulista Sch Med, Div Hematol, São Paulo, BrazilUniv São Paulo, Coll Med, Inst Heart, São Paulo, BrazilUniv S Florida, Coll Med, Dept Neurosurg & Brain Repair, Ctr Excellence Aging & Brain Repair, Tampa, FL USAUniv S Florida, Off Res & Innovat, Tampa, FL USAUniversidade Federal de São Paulo, Paulista Sch Med, Dept Surg, Div Cardiovasc Surg, São Paulo, BrazilUniversidade Federal de São Paulo, Paulista Sch Med, Div Hematol, São Paulo, BrazilWeb of Scienc

Quality of life after on-pump and off-pump coronary artery bypass grafting surgery

FUNDAMENTO: Técnicas de cirurgia de revascularização miocárdica (RM) sem o uso de circulação extracorpórea (CEC) possibilitou resultados operatórios com menor dano sistêmico, menor ocorrência de complicações clínicas, menor permanência na sala de terapia intensiva e também no tempo de internação, gerando expectativas de melhor qualidade de vida (QV) dos pacientes. OBJETIVO: Avaliar a QV em pacientes submetidos à cirurgia de revascularização com e sem CEC. MÉTODOS: Em pacientes com doença multiarterial coronariana (DAC) estável e função ventricular preservada, aplicou-se o Short-Form Health Survey (SF-36) Questionnaire antes da cirurgia e depois de 6 e 12 meses. RESULTADOS: Entre janeiro de 2002 e dezembro de 2006, foram randomizados 202 pacientes para cirurgia de RM. As características demográficas clínicas laboratoriais e angiográficas foram semelhantes nos dois grupos. Desses pacientes, 105 foram operados sem CEC e 97 com CEC. Na evolução, 22 pacientes sofreram infarto, 29 relataram angina, um reoperou, 3 tiveram AVC e nenhum morreu. A avaliação da QV mostrou similaridade nos dois grupos em relação ao componente físico e mental. Todavia, encontrou-se significativa melhora da capacidade funcional e percepção do aspecto físico nos pacientes do sexo masculino. Além disso, um expressivo número de pacientes dos dois grupos retornou ao trabalho. CONCLUSÃO: Em todos os pacientes estudados, observaram-se melhora progressiva da qualidade de vida e retorno precoce ao trabalho, independentemente da técnica cirúrgica empregada. Exceto pela melhor percepção da capacidade funcional e do aspecto físico experimentado pelos homens, não houve diferença estatística nos resultados dos demais domínios alcançados pelos dois grupos estudados.BACKGROUND: Coronary artery bypass grafting techniques without using cardiopulmonary bypass (off-pump CABG) result in less systemic damage, less clinical complications, less time spent in the intensive care unit, and shorter hospital stays, thereby raising the perspective of improved quality of life (QOL) for patients. OBJECTIVE: To assess quality of life in patients who underwent on-pump and off-pump CABG. METHODS: The Short-Form Health Survey (SF-36) Questionnaire was administered to patients with stable multivessel coronary artery disease (CAD) and preserved ventricular function before and at six and 12 months after surgery. RESULTS: Between January 2002 and December 2006, a total of 202 patients were randomized to either on-pump or off-pump CABG. Demographic, clinical, laboratory, and angiographic characteristics were similar in both groups. One hundred and five patients underwent off-pump CABG and 97 underwent on-pump CABG. In the postoperative course, 22 patients had myocardial infarction, 29 reported angina, one was reoperated, and three experienced stroke. No patient died. Quality of life, as measured by the SF-36 questionnaire, was shown to be similar in both groups regarding physical and mental components. However, male patients showed a significant improvement in physical functioning and role limitations due to physical problems. Also, a large number of patients in both groups returned to work. CONCLUSION: Progressive enhancement in quality of life and early return to work were observed for all patients, regardless of the surgical technique used. Save for a greater improvement in physical functioning and role limitations due to physical problems experienced by male patients, no statistically significant differences were found in the other domains between groups

Enhanced Graph Rewriting Systems for Complex Software Domain

International audienceMethodologies for correct by construction reconfigurations can efficiently solve consistency issues in dynamic software architecture. Graph-based models are appropriate for designing such architectures and methods. At the same time, they may be unfit to characterize a system from a non functional perspective. This stems from efficiency and applicability limitations in handling time-varying characteristics and their related dependencies. In order to lift these restrictions, an extension to graph rewriting systems is proposed herein. The suitability of this approach, as well as the restraints of currently available ones, are illustrated, analysed and experimentally evaluated with reference to a concrete example. This investigation demonstrates that the conceived solution can: (i) express any kind of algebraic dependencies between evolving requirements and properties; (ii) significantly ameliorate the efficiency and scalability of system modifications with respect to classic methodologies; (iii) provide an efficient access to attribute values; (iv) be fruitfully exploited in software management systems; (v) guarantee theoretical properties of a grammar, like its termination

Soja resistente à ferrugem: participação de compostos voláteis nas respostas de defesa?

A ferrugem asiática da soja (FAS), causada por Phakopsora pachyrhizi, é uma grande ameaça à sojicultura brasileira. A avaliação das atividades de enzimas marcadoras de indução de resistência pode auxiliar na elucidação de mecanismos envolvidos em respostas de defesa das plantas. Proteína total e atividades de enzimas marcadoras da indução de resistência foram determinadas em extratos de folhas de plantas dos genótipos PI561356 (resistente, PI) e Embrapa 48 (susceptível, E48), inoculadas ou não com P. pachyrhizi. Respostas muito discrepantes entre os dois genótipos e entre os tempos de coleta (12, 72 e 168 h após inoculação) foram observadas, em especial para lipoxigenases e B-1, 3-glucanases. Diferentemente de E48, plantas de PI responderam tardiamente à inoculação pelo fungo com a redução da concentração da proteína total e de atividades enzimáticas. Os dados indicam que as vias que envolvem ação dessas duas enzimas devem participar ativamente da defesa das plantas de soja de E48, mas não de PI. Uma hipótese para explicar a resistência de PI é que voláteis produzidos por plantas inoculadas atuam como moduladores da resposta de defesa

Enzimas marcadoras de indução de resistência diferencialmente reguladas em soja resistente e suscetível à ferrugem-asiática-da-soja.

O objetivo deste trabalho foi avaliar, por meio de enzimas marcadoras, a indução de resistência à ferrugem-asiática-da-soja em genótipos de soja contrastantes quanto à suscetibilidade a Phakopsora pachyrhizi. Aproteína total e as atividades de cinco enzimas marcadoras da indução de resistência (lipoxigenases, peroxidases, fenilalanina amônia-liase, quitinases e ?-1, 3-glucanases) foram avaliadas em extratos de folhas de plantas de soja dos genótipos Embrapa 48 (suscetível) e PI 561356 (resistente), submetidas à inoculação ou não com o patógeno. Foram observadas respostas de defesa discrepantes entre os dois genótipos e entre os tempos de coleta (12, 72 e 168 horas após inoculação). A resposta de indução dessas enzimas assemelha-se à defesa bifásica, para Embrapa 48, e é consistente com o observado para outros patossistemas. No entanto, o genótipo PI 561356 respondeu com diminuição da concentração de proteína total e das atividades enzimáticas, o que indica redução do metabolismo geral das plantas infectadas. Há um importante mecanismo de resistência do genótipo PI 561356, ainda não relatado, embasado em vias que envolvem essas enzimas marcadoras e em mecanismos que utilizam menor concentração de proteínas, como os de via metabólica de resposta em cascata. Differentially regulated induced resistance marker enzymes in soybean genotypes resistant and susceptible to Asian soybean rust. The objective of this work was to evaluate induced resistance to Asian soybean rust by means of enzyme activities in soybean genotypes contrasting as to their susceptibility to Phakopsora pachyrhizi. Total protein and the activities of five induced resistance marker enzymes (lipoxygenases, peroxidases, phenylalanine ammonia-lyase, chitinases and ?-1, 3-glucanases) were evaluated in leaf extracts of soybean plants of the genotypes Embrapa 48 (susceptible) and PI 561356 (resistant), inoculated or not with the pathogen. Discrepant defense responses were obtained between the two genotypes and among the leaf harvest times (12, 72, and 168 hours after inoculation). The induction response of these enzymes resembles the biphasic defense in Embrapa 48 and is consistent with that observed in other pathological systems. However, the genotype PI 561356 responded with a decrease in total protein concentration and in enzymatic activities, indicating a general reduction in the metabolism of the infected plants. There is an important mechanism of resistance for the genotype PI 561356, not yet reported, which is grounded on the metabolic ways involving these induced resistance marker enzymes and on the mechanisms that use lower concentrations of total protein, such as the ones with metabolic pathways in response cascade

Metacaspase-binding peptide inhibits heat shock-induced death in Leishmania (L.) amazonensis

Leishmania (Leishmania) amazonensis is an important agent of cutaneous leishmaniasis in Brazil. This parasite faces cell death in some situations during transmission to the vertebrate host, and this process seems to be dependent on the activity of metacaspase (MCA), an enzyme bearing trypsin-like activity present in protozoans, plants and fungi. In fact, the association between MCA expression and cell death induced by different stimuli has been demonstrated for several Leishmania species. Regulators and natural substrates of MCA are poorly known. To fulfill this gap, we have employed phage display over recombinant L. (L.) amazonensis MCA to identify peptides that could interact with the enzyme and modulate its activity. Four peptides were selected for their capacity to specifically bind to MCA and interfere with its activity. One of these peptides, similar to ecotin-like ISP3 of L. (L.) major, decreases trypsin-like activity of promastigotes under heat shock, and significantly decreases parasite heat shock-induced death. These findings indicate that peptide ligands identified by phage display affect trypsin-like activity and parasite death, and that an endogenous peptidase inhibitor is a possible natural regulator of the enzyme.FAPESPUniv Sao Paulo, Inst Biomed Sci, Dept Parasitol, 1374,Prof Lineu Prestes,room 20, BR-05508000 Sao Paulo, BrazilUniv Fed Sao Paulo, Dept Biophys, Sao Paulo, BrazilUniv Fed Sao Paulo, Dept Biophys, Sao Paulo, BrazilFAPESP: 2011/12634-9Web of Scienc

Estimativa da pegada hídrica cinza de fertilizante nitrogenado no polo de produção de grãos, Paragominas - Pará, Amazônia.

Estimativas apontam que até o ano de 2050 o planeta irá presenciar uma crise em quantidade e qualidade hídrica, decorrente principalmente do crescimento populacional nos grandes centros urbanos e do incremento econômico. No Brasil segundo dados da Organização das Nações Unidas (ONU), em 2030 a população nacional chegará a 232 milhões de habitantes, indicando comprometimentos em qualidade e disponibilidade de água às populações. Na Amazônia, a partir de 2004 houve uma mudança no perfil agrícola com a expansão da fronteira, principalmente nos estados de Mato Grosso, Maranhão e Pará. Na microrregião nordeste paraense, onde está inserido o município de Paragominas, a agricultura é a atividade mais expressiva, onde a soja (Glycine max) e o milho (Zea may) são as principais culturas. No ano 2000 a área plantada era de 24.440 hectares, em 2012 passou para 104.924 hectares cultivados com soja e milho. Todavia, o desafio na Amazônia é produzir apontando indicadores de sustentabilidade (econômicos, sociais e ambientais). Assim, objetivou-se neste trabalho estimar a pegada hídrica cinza de composto nitrogenado utilizado na adubação de culturas, para subsidiar ações de planejamento agrícola. No cálculo foram consideradas dosagens recomendadas nas literaturas técnicas e os parâmetros da legislação naciona