Melhoramento genético da cana-de-açúcar.

bitstream/item/142119/1/Doc-200.pd

Escaneamento genômico para tolerância à seca em sorgo.

O sorgo é adaptado a ambientes extremos onde estresses abióticos como a seca limitam a produção de grãos e de biomassa, como nas vastas regiões do Cerrado brasileiro. Por ser usado como alimento básico em regiões do mundo onde a produção de alimentos é ainda um desafio, o aumento da tolerância à seca em sorgo é importante para a segurança alimentar global, particularmente em um cenário de mudanças climáticas. Além disso, como o genoma do sorgo é menor e menos duplicado, em comparação com gramíneas como o milho e a cana-de-açúcar, o sorgo pode ser utilizado para elucidar os determinantes genéticos da tolerância à seca em outras espécies. Neste trabalho, o mapeamento associativo em escala genômica foi utilizado para a identificação de regiões genômicas associadas com características relacionadas com a tolerância à seca em dois ambientes, em Janaúba (MG) e em Teresina (PI). Um total de 265.587 marcadores SNP foram testados para associações com diferentes características em um painel de sorgo com 243 acessos. As estimativas de herdabilidade foram moderadas a altas e a redução máxima na produção de grãos causada pelo estresse de seca foi de 57% em Teresina. Os testes de associação com um modelo incorporando simultaneamente estrutura populacional e a matriz de relacionamento revelaram vários SNPs associados com diferentes característas, alguns dos quais foram estáveis entre ambientes.bitstream/item/160901/1/bol-152.pd

A mixed model QTL analysis for sugarcane multiple-harvest-location trial data

Sugarcane-breeding programs take at least 12 years to develop new commercial cultivars. Molecular markers offer a possibility to study the genetic architecture of quantitative traits in sugarcane, and they may be used in marker-assisted selection to speed up artificial selection. Although the performance of sugarcane progenies in breeding programs are commonly evaluated across a range of locations and harvest years, many of the QTL detection methods ignore two- and three-way interactions between QTL, harvest, and location. In this work, a strategy for QTL detection in multi-harvest-location trial data, based on interval mapping and mixed models, is proposed and applied to map QTL effects on a segregating progeny from a biparental cross of pre-commercial Brazilian cultivars, evaluated at two locations and three consecutive harvest years for cane yield (tonnes per hectare), sugar yield (tonnes per hectare), fiber percent, and sucrose content. In the mixed model, we have included appropriate (co)variance structures for modeling heterogeneity and correlation of genetic effects and non-genetic residual effects. Forty-six QTLs were found: 13 QTLs for cane yield, 14 for sugar yield, 11 for fiber percent, and 8 for sucrose content. In addition, QTL by harvest, QTL by location, and QTL by harvest by location interaction effects were significant for all evaluated traits (30 QTLs showed some interaction, and 16 none). Our results contribute to a better understanding of the genetic architecture of complex traits related to biomass production and sucrose content in sugarcane