Cellular self-organization on micro-structured surfaces

Micro-patterned surfaces are frequently used in high-throughput single-cell studies, as they allow one to image isolated cells in defined geometries. Commonly, cells are seeded in excess onto the entire chip, and non-adherent cells are removed from the unpatterned sectors by rinsing. Here, we report on the phenomenon of cellular self-organization, which allows for autonomous positioning of cells on micro-patterned surfaces over time. We prepared substrates with a regular lattice of protein-coated adhesion sites surrounded by PLL-g-PEG passivated areas, and studied the time course of cell ordering. After seeding, cells randomly migrate over the passivated surface until they find and permanently attach to adhesion sites. Efficient cellular self-organization was observed for three commonly used cell lines (HuH7, A549, and MDA-MB-436), with occupancy levels typically reaching 40-60% after 3-5 h. The time required for sorting was found to increase with increasing distance between adhesion sites, and is well described by the time-to-capture in a random-search model. Our approach thus paves the way for automated filling of cell arrays, enabling high-throughput single-cell analysis of cell samples without losses

„Nuit, correspondance, sentiment”: Topic Modeling auf einem Korpus von französischen Romanen 1750-1800

Wie lassen sich romanistische Korpora hinsichtlich ihrer literarischen Themen mit digitalen Methoden explorativ erforschen? Im Kontext des Verbundprojekts „Mining and Modeling Text” wurde Topic Modeling mit MALLET (McCallum 2002) auf ein Korpus von 80 französischen Romanen aus der Zeit von 1750 bis 1800 (Röttgermann et al. 2020) angewandt. Ziel des Topic Modeling-Ansatzes ist es dabei, Aussagen über die Themen von Werken zu treffen, die in Form von RDF-Tripeln in ein auf Wikibase basierendes Wissensnetzwerk einfließen. Die über­geordnete, interdisziplinäre und neuartige Idee ist es dabei, datenbasierte Literatur­­geschichtsschreibung zu betreiben. Neben der Informationsextraktion aus Primärtexten speist sich das Wissensnetzwerk auch aus bereits digitalisierten biblio­graphischen Daten (Martin, Mylne & Frautschi 1977; Lüschow 2019). Im Zusammenspiel dieser beiden Informationsflüsse lässt sich über ein gemeinsames kontrolliertes Vokabular ein aufschlussreicher Datenabgleich vollziehen: Welche Themen der Werke wurden durch die Bibliograph:innen identifiziert und welche Topics treten durch den Topic Modeling-Algorithmus zutage? Zwei Fallstudien zu Choderlos de Laclos und Xavier de Maistre exemplifizieren die Vorgehensweise und das Potential dieses Ansatzes.How can Romance corpora be digitally researched exploratively with regard to their literary topics? In the context of the project “Mining and Modeling Text”, topic modeling with MALLET (McCallum 2002) was applied to a corpus of 80 French novels 1750-1800 (Röttgermann et al. 2020). The aim of the topic modeling approach is to generate statements about the topics of the novels, which then are imported into a knowledge graph based on Wikibase. The overriding, interdisciplinary and novel idea is to practice data-based literary historiography. In addition to information extraction on primary texts, the knowledge network is also fed from digitized bibliographic data (Martin, Mylne & Frautschi 1977; Lüschow 2019). In the interplay of these two data types, a comparison can be carried out: Which “topics” of the novels were identified by the bibliographers and which topics are revealed by the algorithm? Two case studies on Choderlos de Laclos and Xavier de Maistre exemplify this

Einfluss von intraperitoneal appliziertem Lokalanästhetikum auf den postoperativen Analgetikabedarf und die Schmerzintensität nach laparoskopischer Chirurgie

Ziel der Studie war die Untersuchung des Einflusses von intraperitoneal appliziertem Lokalanäshetikum auf den postoperativen Schmerzmittelbedarf nach laparoskopischer Leistenherniotomie (TAPP) und Fundoplikatio. 120 Patienten wurden in 3 Gruppen eingeteilt. In Gruppe 1 wurde eine Placebolösung, in Gruppe 2 0,5% Lidocain präoperativ, in Gruppe 3 postoperativ intraperitoneal verabreicht. Der postoperative Analgetikabedarf und die Schmerzintensität (mittels Visueller Analogskala) wurden untersucht. Die Dauer des Pneumoperitoneums und die Schmerzintensität waren nach laparoskopischer Fundoplikatio signifikant höher als nach TAPP. Nur durch die präemptive Gabe von Lokalanästhetika konnte der abdominelle und der Schulterschmerz sowie der Analgetikabedarf nach Fundoplikatio signifikant gesenkt werden

Topic Model October 2023 (200 texts, 40 topics)

<p>Topic Model of the MiMoText roman18 corpus (Oct 2023)</p&gt