Técnicas moleculares de diagnóstico virológico: amplificación de ácidos nucleicos

8 p.Los métodos basados en la detección de genomas virales son comúnmente llamados métodos moleculares. La moderna tecnología desarrollada para la detección de genomas virales ha recibido un gran impulso en los últimos años. Aunque el progreso en las diferentes ciencias parece ser lento, en el caso de la biología molecular ha sucedido lo contrario. Así, dicha disciplina ha sido afortunada con grandes cambios en un tiempo relativamente corto: a mediados de los años 70 se produjeron grandes descubrimientos como la identificación de enzimas de restricción, el desarrollo de vectores de clonación y la introducción de técnicas nuevas de hibridación de ácidos nucleicos (Southern blot). Un segundo salto tecnológico ocurrió en 1985, con la introducción de la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Se explican los distintos tipos de PCR, técnicas moleculares aplicadas a la cuantificación viral, técnicas moleculares aplicadas al tamizaje de virus en bancos de sangre.Fil: Gallego, Sandra Verónica. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Virología "Dr. José María Vanella"; Argentina.Fil: Ré, Viviana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Virología "Dr. José María Vanella"; Argentina

Estudo da prevalência para vírus da encefalite St. Louis relacionado com a idade em uma população de Córdoba, Argentina

A serological screening was performed in 615 individuals aged 0-87 years, living in the city of Cordoba, Argentina to study the relationship between antibody prevalence for the SLE virus and age. A 13.98% prevalence of neutralizing antibodies was obtained and its relation to age was significantly high (p = 0.045). The highest seroprevalence was noted on individuals over 60 years old (>;20%), whereas no subject under 10 was seropositive for this virus. Our results confirm that the agent is endemic in this area and neurological pathology studies should be performed on those individuals aged 60 since they represent the most susceptible group to SLE virus.Com a finalidade de estudar a relação entre prevalência de anticorpo para o vírus da encefalite St. Louis (ESL) e a idade, foram analisados 615 soros de indivíduos entre 0-87 anos de idade, morando na cidade de Córdoba, Argentina. Detectou-se uma prevalência de anticorpos neutralizantes de 13,98% e observou-se uma relação com a idade estatisticamente significante (p = 0,045). A soroprevalência mais alta foi encontrada em indivíduos de mais de 60 anos (>; 20%), enquanto nenhum com menos de 10 anos foi soropositivo para este vírus. Nossos resultados confirmam que o agente é endêmico nesta área. Por esse motivo os autores sugerem que deveríam se realizar estudos de patologias neurológicas nesses indivíduos de 60 anos de idade dado que eles representam o grupo mais suscetível ao vírus ESL

Hepatitis E virus infection in the United States: Seroprevalence, risk factors and the influence of immunological assays

In the United States (U.S.), a hepatitis E virus (HEV) seroprevalence between 6 and 21% has been described, with a decreasing trend. We aimed to investigate HEV infection in the U.S. population from 2009 to 2016, and examine the differences in seroprevalence using different assays. We used data from the National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES-CDC) to estimate HEV seroprevalence and analyze demographic variables related to the infection. Additionally, we compared 4 serological tests used. The estimated HEV seroprevalence between 2009?2016 was 6.1% (95% CI: 5.6%-7.0%) for IgG and 1.02% (0.8%-1.2%) for IgM. Higher HEV IgG prevalences were found in older people, females, non-Hispanic Asians and those born outside of the U.S. The in-house immunoassay and the Wantai HEV-IgG ELISA presented the highest sensitivity values in the tested population. The highest specificity values corresponded to the DSI-EIA-ANTI-HEV-IgG assay. The kappa statistical values showed concordances no greater than 0.64 between the assays. HEV prevalence in our study was similar to previously reported, and a decline in the prevalence was observed through the NHANES assessments (from 1988 to 2016). The sensitivity and specificity of the assays varied widely, making comparisons difficult and highlighting the need to develop a gold standard assay.Fil: Pisano, María Belén. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Campbell, Christopher. University of Minnesota; Estados UnidosFil: Anugwom, Chimaobi. University of Minnesota; Estados UnidosFil: Ré, Viviana Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; ArgentinaFil: Debes, José D.. University of Minnesota; Estados Unido

Foodborne transmission of hepatitis A and hepatitis E viruses: A literature review

Foodborne viruses have been recognized as a growing concern to the food industry and a serious public health problem. Hepatitis A virus (HAV) is responsible for the majority of viral outbreaks of food origin worldwide, while hepatitis E virus (HEV) has also been gaining prominence as a foodborne viral agent in the last years, due to its zoonotic transmission through the consumption of uncooked or undercooked infected meat or derivatives. However, there is a lack of scientific reports that gather all the updated information about HAV and HEV as foodborne viruses. A search of all scientific articles about HAV and HEV in food until March 2020 was carried out, using the keywords “HAV”, “HEV”, “foodborne”, “outbreak” and “detection in food”. Foodborne outbreaks due to HAV have been reported since 1956, mainly in the USA, and in Europe in recent years, where the number of outbreaks has been increasing throughout time, and nowadays it has become the continent with the highest foodborne HAV outbreak report. Investigation and detection of HAV in food is more recent, and the first detections were performed in the 1990s decade, most of them carried out on seafood, first, and frozen food, later. On the other hand, HEV has been mainly looked for and detected in food derived from reservoir animals, such as meat, sausages and pate of pigs and wild boars. For this virus, only isolated cases and small outbreaks of foodborne transmission have been recorded, most of them in industrialized countries, due to HEV genotype 3 or 4. Virus detection in food matrices requires special processing of the food matrix, followed by RNA detection by molecular techniques. For HAV, a real-time PCR has been agreed as the standard method for virus detection in food; in the case of HEV, a consensus assay for its detection in food has not been reached yet. Our investigation shows that there is still little data about HAV and HEV prevalence and frequency of contamination in food, prevalent viral strains, and sources of contamination, mainly in developing countries, where there is no research and legislation in this regard. Studies on these issues are needed to get a better understanding of foodborne viruses, their maintenance and their potential to cause diseases.Fil: Di Cola Bucciarelli, Guadalupe. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Fantilli, Anabella Clara. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Pisano, María Belén. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Ré, Viviana Elizabeth. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentin

Hepatitis C (HCV) crónica en Córdoba: impacto de la coinfección HIV / HCV, predicción del grado de fibrosis/cirrosis por un método no invasivo

Hasta el momento no existen datos epidemiológico – moleculares publicados acerca de la coinfección HCV/HIV y su impacto en la región central de Argentina. Este proyecto tiene como objetivos estudiar la prevalencia de infección activa y la distribución de genotipos de HCV en individuos infectados con HIV y evaluar su impacto en la terapia antiretroviral (HAART). Y por otra parte, implementar un método no invasivo, simple y de mayor adhesión, basado en análisis bioquímicos, para predecir grados de fibrosis y cirrosis en individuos infectados con HCV. Dicho método podrá ser transferido a otros laboratorios públicos y privados en un futuro cercano. Se estudiarán (bajo consentimiento informado) muestras de suero de individuos coinfectados HIV/HCV y monoinfectados con HCV. Se realizará el screening de anticuerpos contra HCV (anti-HCV), la confirmación de la infección (RNA HCV) y el diagnóstico suplementario (genotipificación, carga viral y biopsia). Además, se realizarán análisis bioquímicos y se completarán fichas clínico-epidemiológicos. Este proyecto intenta aportar información de la situación de HCV a los programas sanitarios para reforzar el sistema de vigilancia, mejorar el diagnóstico clínico e impulsar a programas de control, prevención y tratamiento para atenuar la diseminación de HCV en nuestro medio.Fil: Re, Viviana Elizabeth. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Elbarcha, Osvaldo César.Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; Argentin

Hepatitis C (HCV) crónica en Córdoba: impacto de la coinfección HIV / HCV, predicción del grado de fibrosis/cirrosis por un método no invasivo

Hasta el momento no existen datos epidemiológico – moleculares publicados acerca de la coinfección HCV/HIV y su impacto en la región central de Argentina. Este proyecto tiene como objetivos estudiar la prevalencia de infección activa y la distribución de genotipos de HCV en individuos infectados con HIV y evaluar su impacto en la terapia antiretroviral (HAART). Y por otra parte, implementar un método no invasivo, simple y de mayor adhesión, basado en análisis bioquímicos, para predecir grados de fibrosis y cirrosis en individuos infectados con HCV. Dicho método podrá ser transferido a otros laboratorios públicos y privados en un futuro cercano. Se estudiarán (bajo consentimiento informado) muestras de suero de individuos coinfectados HIV/HCV y monoinfectados con HCV. Se realizará el screening de anticuerpos contra HCV (anti-HCV), la confirmación de la infección (RNA HCV) y el diagnóstico suplementario (genotipificación, carga viral y biopsia). Además, se realizarán análisis bioquímicos y se completarán fichas clínico-epidemiológicos. Este proyecto intenta aportar información de la situación de HCV a los programas sanitarios para reforzar el sistema de vigilancia, mejorar el diagnóstico clínico e impulsar a programas de control, prevención y tratamiento para atenuar la diseminación de HCV en nuestro medio.Fil: Re, Viviana Elizabeth. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Elbarcha, Osvaldo César.Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; Argentin

Environmental hepatitis E virus detection supported by serological evidence in the northwest of Argentina

Hepatitis E virus (HEV) is an emergent cause of acute hepatitis worldwide. Water contamination is a possible source of viral infection. In South America, particularly in Argentina, little is known about environmental HEV circulation, including recreational water. The aim of this work was to provide evidence of current environmental and human circulation of HEV in northern Argentina. Methods: Molecular detection of HEV in water samples from the Arias-Arenales River in the city of Salta by nested polymerase chain reaction (ORF2 region) and anti-HEV immunoglobulin G (IgG) and IgM detection in the general population by enzyme-linked immunosorbent assay was carried out. Results: HEV RNA was detected in 1.6% (3/189) of the environmental samples. All sequences belonged to HEV genotype 3 and were very similar to those previously detected in the country. The prevalence of IgG anti-HEV was 9% (13/143) and three samples were positive for specific IgM. Circulation of HEV in the northwest of Argentina was demonstrated for the first time, showing viral presence in environmental samples and infections in people who attended health care centres for routine control. These findings show that recreational waters are a possible source of virus and highlight the need to carry out HEV detection when a case of hepatitis occurs.Fil: Pisano, María Belén. Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Lugo, Belen Catalina. Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Poma, Hugo Ramiro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones para la Industria Química. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones para la Industria Química; Argentina. Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología; Argentina. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Cristobal, Hector Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones para la Industria Química. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones para la Industria Química; ArgentinaFil: Raskovsky, Viviana. Hospital Señor del Milagro; ArgentinaFil: Martinez Wassaf, Maribel Graciela. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Rajal, Verónica Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones para la Industria Química. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones para la Industria Química; ArgentinaFil: Ré, Viviana Elizabeth. Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentin

New pieces in the transmission cycle of the hepatitis E virus in South America: First viral detection in wild boars from Argentina

The hepatitis E virus (HEV) causes hepatitis worldwide. In Europe, wild boars are known to be viral reservoirs and sources of infection. In South America, there is a lack of information about HEV in these animals. A total of 102 wild boar serum samples from Argentina (2014?2017) were studied for serologicalnd molecular HEV detection. We obtained a seroprevalence of 19.6%, similar to that recently described in Uruguay (the only antecedent in South America). HEV ribonucleic acid (RNA) was amplified in two anti-HEV-positive samples.Conclusions: This is the first report of HEV circulation in wild boars from Argentina, adding evidence to the findings obtained in Uruguay indicating that wild boars could be viral reservoirs in South AmericaFil: Pisano, María Belén. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Winter, Marina. Universidad Nacional de Rio Negro. Centro de Investigaciones y Transferencia de Rio Negro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia de Rio Negro; ArgentinaFil: Raimondo, Natalia. Lace Laboratorios. Área Virología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Martínez Wassaf, Maribel G.. Lace Laboratorios, Área Virología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Abate, Sergio Damian. Universidad Nacional de Rio Negro. Centro de Investigaciones y Transferencia de Rio Negro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia de Rio Negro; ArgentinaFil: Ré, Viviana Elizabeth. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Validation of a point-of-care rapid diagnostic test for hepatitis C for use in resource-limited settings

Treatment of HCV with direct-acting antivirals has enabled the discussion of HCV eradicationworldwide. Envisioning this aim requires implementation of mass screening in resource-limited areas, usuallyconstrained by testing costs. We validated a low-cost, rapid diagnosis test (RDT) for HCV in three different continents in 141individuals. The HCV RDT showed 100% specificity and sensitivity across different samples regardless of genotypeor viral load (in samples with such information, 90%). The HCV test validated in this study can allow for HCV screening in areas of need when properly used.Fil: Leathers, James S.. Vanderbilt University; Estados UnidosFil: Pisano, María Belén. Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Ré, Viviana Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Cordoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología; ArgentinaFil: van Oord, Gertine. Erasmus Medical Center; Países BajosFil: Sultan, Amir. Addis Ababa University; EtiopíaFil: Boonstra, Andre. Erasmus Medical Center; Países BajosFil: Debes, Jose D.. Universidad de Minnesota; Estados Unido

Evaluation of rapid diagnostic tests for assessment of hepatitis B in resource-limited settings

Chronic Hepatitis B (HBV) is the most important cause of liver disease worldwide. There is a need for low-cost tests to aid in diagnosis and management of HBV infection in resource-limited settings. We evaluated the utility of several rapid diagnostic tests (RDT) in three different continents (Europe, South America, Africa). The HBsAg RDT showed optimal sensitivity and specificity. The anti-HBeAb RDT showed acceptable sensitivity and excellent specificity. Our results suggest that these RDTs could be used for screening and management of HBV.Fil: Leathers, James S.. Uc Davis School Of Medicine; Estados UnidosFil: Pisano, María Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; ArgentinaFil: Ré, Viviana Elizabeth. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Van Oord, Gertine. Erasmus MC. Department of Gastroenterology and Hepatology; Países BajosFil: Sultan, Amir. Addis Ababa University; EtiopíaFil: Boonstra, Andre. Erasmus MC. Department of Gastroenterology and Hepatology; Países BajosFil: Debes, Jose D.. University of Minnesota; Estados Unidos. Erasmus MC. Department of Gastroenterology and Hepatology; Países Bajo