Critères discrets pour la comparaison de filtres de détection de contours

Dans cet communication, nous proposons de nouveaux critères pour l'évaluation des détecteurs discrets de détection de contours dans les images numériques. En utilisant un modèle de contour de type échelon discret nous définissons les critères de détection, de localisation et de proximité. Ces trois critères s'expriment simplement à partir de la réponse impulsionnelle discrète des opérateurs et s'appliquent sur les détecteurs procédant par une approche dérivative. A partir de ces nouveaux critères il est possible d'évaluer les performances de l'ensemble des détecteurs discrets

Updating a reference image for detecting motion in urban scenes

We present in this paper a construction and updating method of a reference image for motion detection in an urban environment . The proposed detection algorithm exploits differences between static edges of the scene and edges extracted from each imag e of the sequence . It allows to detect moving objects contours and moving areas contours if the background is not uniform . Th e reference image, robustly controlled, contains spatio temporal information of a great number of successive images . Updated locally with a recursive filter, it allows to integrate, after a controlled time, objects that stop in the scene . This kind of updating permits to automatically adapt with unpredictible movements of deformable or rigid objects (changes in speed and direction) . I n addition, analyzing edges allows to take into account global illumination changes and heterogeneity of the scene background i n an urban environment . This approach gives good results on complex outdoor image sequences .Nous présentons dans cet article une méthode de construction et de mise à jour d'une image de référence pour la détection du mouvement dans une scène urbaine. L'algorithme de détection proposé exploite les différences entre les contours statiques contenus dans la scène et les contours extraits de chaque image de la séquence. Il permet de mettre en évidence les contours des objets mobiles et les contours des zones affectées par le mouvement dans le cas où le fond n'est pas uniforme. L'image de référence, contrôlée de manière robuste, englobe les informations spatiales et temporelles contenues dans un grand nombre d'images successives de la séquence. Actualisée localement par l'intermédiaire d'un filtre récursif, elle permet d'intégrer, après un temps contrôlé, les objets qui s'arrêtent dans la scène. Ce type de réactualisation permet de s'adapter aux mouvements imprévisibles des objets (changement de vitesse et de direction) déformables ou non. De plus, l'analyse des contours a permis de s'affranchir des variations globales de l'éclairage ainsi que de l'hétérogénéité des fonds de la scène en milieu urbain. Cette approche obtient des résultats satisfaisants sur des images de scènes d'extérieur complexes

Object recognition by intersection between adapted color histograms

Most of object recognition schemes fail in case of illumination changes between the color image acquisitions. One of the most widely used solutions to cope with this problem is to compare the images by means of the intersection between invariant color histograms. Unlike the classical invariant color histograms approach which independently analyzes each image, we consider each pair constituted by the query image and one of the target images constructed during the retrieval. In this paper, we propose a new approach based on color histograms which are adapted to each pair constituted by the query image and one of the target images. These adapted color histograms are determined so that their intersection is high only when the objects contained in the two images are similar. The adapted color histograms processing is based on an original model of illumination changes based on the rank measures of the pixels within the color component images.Dans cet article, nous abordons le problème de la reconnaissance des objets sous éclairage non contrôlé par la recherche de toutes les images d'une base qui contiennent le même objet que celui représenté dans une image requête. Nous nous intéressons aux problèmes soulevés par les modifications des images couleur consécutives à des changements d'illuminant. Les images considérées dans cet article contiennent un seul objet placé sur un fond uniforme et éclairé avec un illuminant qui diffère d'une image à l'autre. Les méthodes classiques basées sur des histogrammes invariants ne fournissent pas des résultats satisfaisants en termes de reconnaissance d'objets éclairés par différents illuminants. Nous proposons de traiter ce problème, non pas en analysant les images de la base indépendamment les unes des autres, mais en analysant tous les couples constitués de l'image requête et de chacune des images candidates. Plus précisément, nous proposons d'analyser chaque couple d'histogrammes couleur pour comparer le contenu de chaque couple d'images. Pour cela, la procédure détermine un couple d'histogrammes couleur dits « spécifiques » à chaque couple d'histogrammes couleur considéré, de telle sorte que l'intersection entre ces histogrammes couleur spécifiques soit élevée uniquement lorsque les deux objets contenus dans les deux images sont similaires. Cette procédure est basée sur une nouvelle hypothèse sur les conséquences d'un changement d'illuminant qui ne porte pas directement sur les couleurs des pixels, mais sur les mesures de rang des pixels

Reconnaissance d'objets grâce à l'analyse des composantes couleur adaptées au changement d'éclairage entre deux images

Dans le domaine de l'indexation d'images, les méthodes de reconnaissance d'objets couleur ont tendance à échouer lorsque les conditions d'éclairage lors des acquisitions diffèrent d'une image à l'autre. Dans cet article, nous proposons une nouvelle approche pour la recherche d'objets dans des bases d'images couleur qui permet de s'affranchir des variations d'éclairage. Pour cela, nous considérons qu'un changement d'illuminant ne perturbe que très légèrement l'ordre des niveaux des composantes couleur des pixels d'une même image. Pour comparer deux images, nous transformons les composantes couleur de manière spécifique à chaque couple formé par une image-modèle et une image-requête. Les composantes couleur des pixels de chaque couple d'images considéré sont transformées par une analyse spécifique des mesures de rang des pixels. Des tests effectués sur une base publique d'images montrent l'amélioration obtenue par notre méthode en terme de reconnaissance d'objets

Segmentation non supervisée d'images par analyse de la connexité Application à la détection de lésions virales sur des images de fond d'oeil

Dans cet article, nous présentons une méthode de segmentation originale basée sur l'analyse de la connexité. Par analyse d'un tableau triangulaire appelé «Pyramide des degrés de connexité normalisés», l'image est décomposée en différents ensembles constitués de pixels connexes dont les niveaux de gris sont homogènes. Cette méthode est utilisée afin de détecter des lésions rétiniennes sur des images de fond d'oeil

Validation de segmentation à partir d'une séquence d'images par la théorie de l'évidence. Application à des images IRM

Notre but est de reconstruire le rachis humain, afin de suivre l'évolution des pathologies chez les patients atteints de scoliose. Nous présentons les résultats sur la validation d'une étape de segmentation. La segmentation utilisée est de type contour actif. Pour minimiser l'incertitude et l'imprécision de l'information précédente, nous proposons une méthode de fusion de données basée sur la théorie de Dempster-Shafer. A partir d'informations issues d'une séquence d'images, nous donnons une décision de bonne ou mauvaise classifications de chaque portion de la segmentation

Hundreds of genetic barcodes of the species-rich hydroid superfamily Plumularioidea (Cnidaria, Medusozoa) provide a guide toward more reliable taxonomy

Marine hydroids are important benthic components of shallow and deep waters worldwide, but their taxonomy is controversial because diagnostic morphological characters to categorize taxa are limited. Their genetic relationships are also little investigated. We tested taxonomic hypotheses within the highly speciose superfamily Plumularioidea by integrating a classical morphological approach with DNA barcoding of the 16S and COI mitochondrial markers for 659 and 196 specimens of Plumularioidea, respectively. Adding Genbank sequences, we inferred systematic relationships among 1,114 plumularioids, corresponding to 123 nominal species and 17 novel morphospecies in five families of Plumularioidea. We found considerable inconsistencies in the systematics of nominal families, genera and species. The families Kirchenpaueriidae and Plumulariidae were polyphyletic and the Halopterididae paraphyletic. Most genera of Plumularioidea are not monophyletic. Species diversity is considerably underestimated. Within our study, at least 10% of the morphologically-distinctive morphospecies are undescribed, and about 40% of the overall species richness is represented by cryptic species. Convergent evolution and morphological plasticity therefore blur systematic relationships. Additionally, cryptic taxa occur frequently in sympatry or parapatry, complicating correspondence with type material of described species. Sometimes conspecificity of different morphotypes was found. The taxonomy of hydroids requires continued comprehensive revision.This work relied on several hydrozoan samples collected from various sites, with the aid of many people. Supplementary Table S1 refers many of the people involved in the collection and/or preservation of the samples. C.J.M. acknowledges his great buddy-divers Jaime N.-Ruiz (CIMAR, Univ. Costa Rica), Axel Calderon, Nathaniel Chu, Eleni Petrou (STRI, Smiths. Inst.), Hanae Spathias, Karen Koltes (at the Belize station, Smith. Inst.), Freya Sommer (Hopkins Marine Station), Remilson Ferreira ('Costa Norte', Sao Tome), Frederico Cardigos (DOP, Univ. Azores) and others that assisted the dives. C.J.M. also acknowledges Rita Castillo (CIMAR, Univ. Costa Rica), Plinio Gondola, Ligia Calderon, Laura Geyer, Maria Castillo (STRI, Smiths. Inst.), Gregory Ruiz (SERC, Smiths. Inst.), Paul Greenhall, William Keel (MSC, Smith. Inst.), Manuel Enes, Valentina Matos (IMAR/DOP, Univ. Azores), Filipe Porteiro, Joao Goncalves (OKEANOS/IMAR, Univ. Azores), Marina Cunha, Ascensao Ravara (CESAM, Univ. Aveiro), Shirley Pomponi (Harbor Branch, Florida Atlantic Univ.), Estrela Matilde (Fundacao Principe Trust), Monica Albuquerque, Ines Tojeira (EMEPC), Diana Carvalho (Nat. Mus. Nat. Hist., Lisbon) and many others colleagues that facilitated the morphologic classifications and deposition of the samples. Peter Schuchert (Mus. d'Hist. Nat. Geneve) kindly provided some DNA extractes. Todd Kincaid and his team of GUE divers (Project Baseline - Azores) collected valuable samples from unusual depths. Joana Boavida (CIIMAR, Univ. Algarve) facilitated some samples of the 'DeepReefs' project. Jim Drewery (Marine Scotland Science Inst.) also provided few samples. Dale Calder (Royal Ontario Museum) provided some bibliography to C.J.M. and discussed/resolved some dubios taxonomic classifications. Colleagues at the L.A.B. (NMNH, Smith. Inst.) were very supportive. The APC fees for open access publication were supported by a program of the Regional Government of the Azores ("Apoio ao funcionamento e gestao dos centros de I&D regionais: 2018 - DRCT-medida 1

Aquaporin-facilitated water uptake in barley (Hordeum vulgare L.) roots

It is not known to what degree aquaporin-facilitated water uptake differs between root developmental regions and types of root. The aim of this study was to measure aquaporin-dependent water flow in the main types of root and root developmental regions of 14- to 17-d-old barley plants and to identify candidate aquaporins which mediate this flow. Water flow at root level was related to flow at cell and plant level. Plants were grown hydroponically. Hydraulic conductivity of cells and roots was determined with a pressure probe and through exudation, respectively, and whole-plant water flow (transpiration) determined gravimetrically in response to the commonly used aquaporin inhibitor HgCl2. Expression of aquaporins was analysed by real-time PCR and in situ hybridization. Hydraulic conductivity of cortical cells in seminal roots was largest in lateral roots; it was smallest in the fully mature zone and intermediate in the not fully mature ‘transition’ zone along the main root axis. Adventitious roots displayed an even higher (3- to 4-fold) cortical cell hydraulic conductivity in the transition zone. This coincided with 3- to 4-fold higher expression of three aquaporins (HvPIP2;2, HvPIP2;5, HvTIP1:1). These were expressed (also) in cortical tissue. The largest inhibition of water flow (83–95%) in response to HgCl2 was observed in cortical cells. Water flow through roots and plants was reduced less (40–74%). It is concluded that aquaporins contribute substantially to root water uptake in 14- to 17-d-old barley plants. Most water uptake occurs through lateral roots. HvPIP2;5, HvPIP2;2, and HvTIP1;1 are prime candidates to mediate water flow in cortical tissue