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Oxidative protein labeling in mass-spectrometry-based proteomics
Oxidation of proteins and peptides is a common phenomenon, and can be employed as a labeling technique for mass-spectrometry-based proteomics. Nonspecific oxidative labeling methods can modify almost any amino acid residue in a protein or only surface-exposed regions. Specific agents may label reactive functional groups in amino acids, primarily cysteine, methionine, tyrosine, and tryptophan. Nonspecific radical intermediates (reactive oxygen, nitrogen, or halogen species) can be produced by chemical, photochemical, electrochemical, or enzymatic methods. More targeted oxidation can be achieved by chemical reagents but also by direct electrochemical oxidation, which opens the way to instrumental labeling methods. Oxidative labeling of amino acids in the context of liquid chromatography(LC)–mass spectrometry (MS) based proteomics allows for differential LC separation, improved MS ionization, and label-specific fragmentation and detection. Oxidation of proteins can create new reactive groups which are useful for secondary, more conventional derivatization reactions with, e.g., fluorescent labels. This review summarizes reactions of oxidizing agents with peptides and proteins, the corresponding methodologies and instrumentation, and the major, innovative applications of oxidative protein labeling described in selected literature from the last decade
DNA glycosylases involved in base excision repair may be associated with cancer risk in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers
Efficient Metabolic Exchange and Electron Transfer within a Syntrophic Trichloroethene-Degrading Coculture of Dehalococcoides mccartyi 195 and Syntrophomonas wolfei
Associação entre os modos de enfrentamento e as variáveis sociodemográficas de pessoas em hemodiálise crônica
Este é um estudo seccional que objetiva verificar a associação entre os modos de enfrentamento das pessoas em hemodiálise crônica e as variáveis sociodemográficas. Foram utilizados um instrumento semiestruturado e o Inventário de Estratégias de Enfrentamento de Folkman e Lazarus. A amostra constituiu-se por 107 adultos, predominantemente do sexo masculino (62,4%), em hemodiálise ambulatorial há mais de seis meses. Os modos de enfrentamento mais referidos foram relacionados ao fator reavaliação positiva (enfrentamento focado na emoção); sendo que os escores médios mais elevados foram para as mulheres em todos os fatores e para as pessoas que expuseram ter companheiro, morar com familiares e ter apoio no tratamento; e foram comuns os maiores escores para os fatores confronto, autocontrole e suporte social. O conhecimento dos modos de enfrentamento prepara o enfermeiro para reforçar ou buscar, junto às pessoas em hemodiálise, a escolha de modos de enfrentamento positivos e propor ações que permitam o desenvolvimento dos mecanismos adaptativos do paciente