1,346 research outputs found
Using recommendations to help novices to reuse design knowledge
This is the author's accepted manuscript. The final publication is available at Springer via http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-21530-8_35. Copyright @ Springer 2011.The use of pattern languages is not so straightforward since its users have to identify the patterns they need, browsing the language and understanding both the benefits and trade-offs of each pattern as well as the relations and interactions it has with other patterns. Novice designers might benefit from tools that assist them in this learning task. In this paper we describe a recommendation tool embedded in a visual environment for pattern-based design which aims at suggesting patterns to help novice designers to produce better designs and understand the language.Spanish Ministry of Science and Innovatio
The Economic Structure of Maritime Trade Calling at the Port of Genoa Through the Analysis of General Average Data (SixteenthâSeventeenth Centuries)
This essay will discuss the preliminary results emerging from data extrap-olated from General Average (GA) procedures in Genoa, between the last decade of the sixteenth century and the 1640s. The wealth of data provided by GA procedures compensates for some of the gaps in quanti-tative data which have held back research on the local maritime economy. Methodologically, this essay further develops the insights of Giuseppe Felloniâs work on GAâs potential for economic analysis.1 The rich docu-mentation produced during GA procedures, from the original report (testimoniale) to the final apportioning of costs (calculus), provides details for typology of vessel, provenance, route, flag and cargo. This data sheds new light on Mediterranean maritime trade during a fundamental period of structural change, characterized by the emergence of new protagonists and the creation of new equilibria
STUDIO COMPUTAZIONALE DI VIRTUAL SCREENING PER LO SVILUPPO DI NUOVI INBITORI DELLA CHINASI BTK
La BTK (Brutonâs Tyrosine Kinase) è un membro della famiglia delle tirosine chinasi TEC. La BTK è espressa in molte cellule ematopoietiche come linfociti B, nei mastociti, e nei macrofagi, ma non è espressa a livello dei linfociti T, nelle cellule natural killer (NK) e nelle cellule del plasma.
Una mutazione del gene umano che codifica per la BTK causa unâalterazione di essa, ciò provoca la mancanza di linfociti B periferici e livelli bassi di immunoglobuline che porta alla malattia ereditaria XLA (X-linked agammaglobulinemia). Nella XLA il deficit immunitario primario è specifico dei linfociti B e, data lâimportanza di essi nella riposta immunitaria cellulo-mediata, è avanzato lâinteresse da parte delle compagnie farmaceutiche nella ricerca di molecole inibitrici della BTK come possibili farmaci per la cura di patologie autoimmunitarie, come lâartrite reumatoide , il lupus erimatoso e la sclerosi multipla.
Lo scopo di questa tesi è stato quello di ricercare nuovi inibitori della chinasi BTK tramite studi di virtual screening (VS) di database commerciali.
La prima parte dello studio si è basata sullâanalisi delle strutture cristallografiche della BTK contenenti ligandi noti in letteratura. La BTK ha uno stato attivo ed uno inattivo; la definizione di questo stato è data principalmente della sequenza amminoacidica DFG (aminoacidi 539-541) che può trovarsi in posizione âinâ (verso lâinterno) ed in posizione âoutâ (verso lâesterno). Quando è in posizione âoutâ, ostacola il legame dellâATP con la proteina e ad essa si associa uno stato inattivo dellâenzima; quando invece la sequenza aminoacidica DFG si trova in posizione âinâ, lo stato risulta essere attivo.
Ai fini del mio lavoro di tesi, si sono tenute in considerazione solo tre delle nove strutture cristallografiche note, in cui i ligandi complessati interagiscono con la forma attiva dellâenzima. Una delle tre strutture (codice PDB 3K54) contiene un noto antileucemico, il Dasatinib, ed è stata quella utilizzata nei vari step receptor-based del VS poichĂŠ presenta la definizione di un loop importante per unâulteriore stabilizzazione del ligando al suo interno .
Dopo validazione, si è sottoposto il database commerciale Allvendor (contenente circa 780.000 composti) ad uno screening ligand-based col programma ROCS, utilizzando come riferimento i ligandi contenuti nelle tre strutture cristallografiche prese in analisi. Il programma, che utilizza un metodo shape-based, basato sulla sovrapposizione della forma, ha permesso di selezionare tutte quelle molecole strutturalmente simili alle tre note in bibliografia.
I risultati ottenuti dallo screening sono stati soggetti ad un ulteriore filtro da parte del programma FLAP, utilizzando stavolta un metodo receptor-based, sfruttando quindi le interazioni che le ipotetiche strutture possano avere con la zona cerniera del recettore e lâaffinitĂ di esse per il sito recettoriale.
Il filtraggio con FLAP ha ridotto il numero di molecole iniziali portandole a circa 923, esse sono state poi sottoposte al docking utilizzando il programma GOLD, tale programma analizza il complesso proteina-ligando in termini energetici. I risultati si sono in seguito visualizzati e analizzati, tenendo in considerazione solo quelle molecole che stabilivano almeno due legami ad idrogeno nella zona cerniera dellâenzima. Lâanalisi ha portato allâottenimento di 58 strutture, un numero ragionevole di composti da essere sottoposti allo studio di dinamica molecolare, essendo un calcolo molto accurato, che richiede tempi macchina lunghi, viene utilizzato in una delle ultime fasi del protocollo, in maniera da poter fornirgli un numero adeguato di molecole.
Lo studio di dinamica molecolare consente di verificare la stabilitĂ del complesso fornendogli energia. A differenza del docking, dove si considera il recettore come unâentitĂ completamente immobile, nella dinamica molecolare anche l'enzima ha un certo grado di libertĂ conformazionale, che possiamo impostare noi variando determinati parametri.
Con questa analisi è stato possibile individuare e selezionare i composti in grado di mantenere almeno due interazioni ad idrogeno fondamentali con la zona cerniera della proteina per almeno l'85% della simulazione. In questo modo, delle 58 strutture solo 5 sono state tenute in considerazione.
Tali composti saranno acquistati e saggiati allo scopo di verificarne l'attivitĂ inibitoria sulla proteina ed il loro possibile utilizzo come nuovi potenziali lead per lo sviluppo di nuovi inibitori della BTK
Chapter Genoa: Colonizing and Colonized City? The Port City as a Pole of Attraction for Foreign Merchants (16th-18th centuries)
As Michel Balard pointed out with reference to the late Middle Ages and to the relations between Genoa and overseas cities, âGenoa, a colonizer in the East, is colonized by the Orientalsâ. The aim of this work is to verify whether and to what extent this concept is applicable also to the modern age and whether it involved a wider geographic area than the one examined by this French historian. In particular we outline the features of the presence of foreign merchants in Genoa between the 16th and 18th centuries as a phenomenon complementary to the better known âdiasporaâ of Genoese businessmen
An IoT Model for Coping with Trade-offs in Designing Smart Environments
The Internet of Things (IoT) world is composed by a huge number of different so called âsmart devicesâ and every year new and different models are released on the mass market. Most of those devices are intended to be used by professional people or by companies. Thanks to the constant growth of the âsmart objectsâ, end users and people with low or no-knowledge of the IT-world get in touch with these pieces of technology. Those people are expected to use the smart devices âout of the boxâ and in a very simple and easy way so, the human-device interaction needs to be as easiest as possible. Despite of this need, end users are commonly faced with thousand of different technological standards which are hard to evaluate without a solid IT background. Thus, the comparison to understand which IoT device performs better in a particular situation become complicated. In this paper we propose a comparison of two different IoT solutions using an IoT model. The model assesses the different technical specifications of the devices and then extracts a âscoreâ for each technological aspect. The end user can use the score to better understand the points of strength and the weaknesses of the devices. Copyright Š 2018 for the individual papers by the papers' authors
October 7, 1992
This paper reports the findings of a research aimed at validating the test on narrative models; this test was developed by M. Piccinno in 2005 with the aim of identifying the narrative model through which the person relatesto himself and to others their life story.The purpose of this research is to continue in the process of validation of the constructs and test items of Piccinno, through a process of analysis focuses on three different testing procedures. The first of them, consists in the analysis factorial conducted on the results produced by the test in question on a group of 500 adolescents. The second step is to submit to the test of Cronbach theresults obtained from the factor analysis. Finally, we will proceed to calculate the indices of correlation between the scores on the test items and scores of âZimbardo Time Perspective Inventoryâ (1999).Il presente saggio riporta le conclusioni di una ricerca finalizzata allâavvio delle prove di validazione di un test sui modelli narrativi; tale test è stato elaborato da M. Piccinno nel 2005 con lo scopo di individuare la modalitĂ Â narrativa attraverso la quale il soggetto racconta a sĂŠ stesso e agli altri la propria storiadi vita. Lo scopo della presente ricerca è quello di proseguire nelle procedure di validazione dei costrutti e degli item del test di Piccinno, attraverso un percorso di analisi focalizzato su tre diverse procedure di verifica. La prima di esse consiste nellâanalisi fattoriale condotta sui risultati prodotti dal test in esame su un gruppo di 500 adolescenti. La seconda operazione consiste nel sottoporreal test di Cronbach i risultati ricavati dallâanalisi fattoriale. Infine, si procederĂ a calcolare gli indici di correlazione tra i punteggi relativi agli item del test in esame e i punteggi dello âZimbardo Time Perspective Inventoryâ (1999)
Software environments for supporting End-User Development
Our work on End-User Development primarily focuses on the needs of a specific community of users, namely professionals in diverse areas outside of computer science, such as engineers, physicians, geologists and physicist, who are not professional programmers. We refer to them as domain experts.
We developed a participatory design methodology, called SSW (Software Shaping Workshop) methodology, aimed at designing software environments that support domain experts to become co-designers of their tools. The different stakeholders can contribute their own views on the problem to design, development and maintenance of an application, using their own languages and notations.
We also proposed a model of the Interaction and Co-Evolution processes (ICE model) occurring between users and system. It extends a previous model of Human-Computer Interaction by considering an important phenomenon occurring during the use of interactive systems, called co-evolution of users and systems
SWAT: A System for Detecting Salient Wikipedia Entities in Texts
We study the problem of entity salience by proposing the design and
implementation of SWAT, a system that identifies the salient Wikipedia entities
occurring in an input document. SWAT consists of several modules that are able
to detect and classify on-the-fly Wikipedia entities as salient or not, based
on a large number of syntactic, semantic and latent features properly extracted
via a supervised process which has been trained over millions of examples drawn
from the New York Times corpus. The validation process is performed through a
large experimental assessment, eventually showing that SWAT improves known
solutions over all publicly available datasets. We release SWAT via an API that
we describe and comment in the paper in order to ease its use in other
software
- âŚ