Immune checkpoints pathways in head and neck squamous cell carcinoma

Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is a heterogeneous group of tumors usually diagnosed at an advanced stage and characterized by a poor prognosis. The main risk factors associated with its development include tobacco and alcohol consumption and Human Papillomavirus (HPV) infections. The immune system has a significant role in the oncogenesis and evolution of this cancer type. Notably, the immunosuppressive tumor microenvironment triggers immune escape through several mechanisms. The improved understanding of the antitumor immune response in solid tumors and the role of the immune checkpoint molecules and other immune regulators have led to the development of novel therapeutic strategies that revolutionized the clinical management of HNSCC. However, the limited overall response rate to immunotherapy urges identifying predictive biomarkers of response and resistance to treatment. Here, we review the role of the immune system and immune checkpoint pathways in HNSCC, the most relevant clinical findings linked to immunotherapeutic strategies and predictive biomarkers of response and future treatment perspectives.Fil: Veigas, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Mahmoud, Yamil Damián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Merlo, Joaquín Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Rinflerch, Adriana Raquel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; ArgentinaFil: Rabinovich, Gabriel Adrián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; ArgentinaFil: Girotti, María Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentin

Toxigenic Capacity and Trichothecene Production by <i>Fusarium graminearum</i> Isolates from Argentina and Their Relationship with Aggressiveness and Fungal Expansion in the Wheat Spike

At least 20 epidemics of Fusarium head blight (FHB) of wheat have been registered in the last 50 years in Argentina, with variable intensity. Damage induced by the disease is further aggravated by the presence of mycotoxins in affected grains that may cause health problems to humans and animals. The trichothecene chemotype was analyzed for 112 isolates of Fusarium graminearum from Argentina by polymerase chain reaction and two field trials were conducted to study the aggressiveness of a subsample of 14 representative isolates and to analyze deoxynivalenol (DON) production in planta and in vitro. All isolates belonged to the 15-acetyl-DON chemotype. Significant differences were observed in both the symptom severity induced in wheat spikes and the in vivoDON pro-duction, and a close correlation was found between these two variables. However, in vitro toxigenic potential was not correlated with the capacity of F. graminearum isolates to produce DON under natural conditions. The progress of infectionin the rachis of inoculated wheat spikes was analyzed and the pathogen presence verified in both symptomatic and symptomless spikes. Even isolates with a limited capacity to induce symptoms were able to colonize the vascular tissue and to produce considerable amounts of DON in planta.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Control of intestinal inflammation by glycosylation-dependent lectin-driven immunoregulatory circuits

Diverse immunoregulatory circuits operate to preserve intestinal homeostasis and prevent inflammation. Galectin-1 (Gal1), a β-galactoside-binding protein, promotes homeostasis by reprogramming innate and adaptive immunity. Here, we identify a glycosylation-dependent "on-off"circuit driven by Gal1 and its glycosylated ligands that controls intestinal immunopathology by targeting activated CD8+ T cells and shaping the cytokine profile. In patients with inflammatory bowel disease (IBD), augmented Gal1 was associated with dysregulated expression of core 2 β6-N-acetylglucosaminyltransferase 1 (C2GNT1) and α(2,6)-sialyltransferase 1 (ST6GAL1), glycosyltransferases responsible for creating or masking Gal1 ligands. Mice lacking Gal1 exhibited exacerbated colitis and augmented mucosal CD8+ T cell activation in response to 2,4,6-trinitrobenzenesulfonic acid; this phenotype was partially ameliorated by treatment with recombinant Gal1. While C2gnt1-/- mice exhibited aggravated colitis, St6gal1-/- mice showed attenuated inflammation. These effects were associated with intrinsic T cell glycosylation. Thus, Gal1 and its glycosylated ligands act to preserve intestinal homeostasis by recalibrating T cell immunity.Fil: Morosi, Luciano Gastón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Cutine, Anabela María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Cagnoni, Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Manselle Cocco, Montana Nicolle. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Croci Russo, Diego Omar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Merlo, Joaquín Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Morales, Rosa María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: May, María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Farmacológicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones Farmacológicas; ArgentinaFil: Pérez Sáez, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Girotti, Maria Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Mendez Huergo, Santiago Patricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Pucci, Betiana. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Gastroenterología "Dr. Carlos B. Udaondo"; ArgentinaFil: Gil, Aníbal H.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Gastroenterología "Dr. Carlos B. Udaondo"; ArgentinaFil: Huernos, Sergio P.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Gastroenterología "Dr. Carlos B. Udaondo"; ArgentinaFil: Docena, Guillermo H.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Estudios Inmunológicos y Fisiopatológicos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Estudios Inmunológicos y Fisiopatológicos; ArgentinaFil: Sambuelli, Alicia. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Gastroenterología "Dr. Carlos B. Udaondo"; ArgentinaFil: Toscano, Marta Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Rabinovich, Gabriel Adrián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; ArgentinaFil: Mariño, Karina Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentin

Does the Wolf (<i>Canis lupus</i>) Exhibit Human Habituation Behaviours after Rehabilitation and Release into the Wild? A Case Report from Central Italy

The knowledge of how wolves’ movement patterns and habitat selection are affected by habituation to persons after a period of veterinary isolation, treatment and non-agonistic experience with humans is scarce. Unnatural behaviours could be transferred by imitation to members of the pack and to subsequent generations, increasing direct interaction risks. We used GPS data from a rescued radio-collared female wolf after an 11-day rehabilitation to estimate home range, movement patterns, circadian rhythms, and habitat selection, searching for signals of eventual behavioural distortions. In the period 1 August–26 November 2013, 870 valid locations were acquired. The wolf moved within a minimum convex polygon (95%) of 6541.1 ha (79% wooded), avoiding anthropized areas. Nocturnal and diurnal displacements were significantly different (p p < 0.01) in the summer (2239.0 ± 329.0 m) than in the autumn (595.9 ± 110.3 m), when the hunting season was running. As for a wild wolf, clear complementarity concerning human activities was recorded and no habituation signals were detected, but this is only a first case study that aims to be a stimulus for further research and a call for widespread data sharing

Toxigenic Capacity and Trichothecene Production by Fusarium graminearum Isolates from Argentina and Their Relationship with Aggressiveness and Fungal Expansion in the Wheat Spike

At least 20 epidemics of Fusarium head blight (FHB) of wheat have been registered in the last 50 years in Argentina, with variable intensity. Damage induced by the disease is further aggravated by the presence of mycotoxins in affected grains that may cause health problems to humans and animals. The trichothecene chemotype was analyzed for 112 isolates of Fusarium graminearum from Argentina by polymerase chain reaction and two field trials were conducted to study the aggressiveness of a subsample of 14 representative isolates and to analyze deoxynivalenol (DON) production in planta and in vitro. All isolates belonged to the 15-acetyl-DON chemotype. Significant differences were observed in both the symptom severity induced in wheat spikes and the in vivoDON pro-duction, and a close correlation was found between these two variables. However, in vitro toxigenic potential was not correlated with the capacity of F. graminearum isolates to produce DON under natural conditions. The progress of infectionin the rachis of inoculated wheat spikes was analyzed and the pathogen presence verified in both symptomatic and symptomless spikes. Even isolates with a limited capacity to induce symptoms were able to colonize the vascular tissue and to produce considerable amounts of DON in plantFil: Malbrán, Ismael. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología; ArgentinaFil: Mourelos, Cecilia Alejandra. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología; ArgentinaFil: Girotti, Juan Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner". Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata ; ArgentinaFil: Balatti, Pedro Alberto. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología; ArgentinaFil: Lori, Gladys. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología; Argentin

Building a predictive model based on glycogene expression profiles of melanoma patients from TCGA-SKCM project

We aim to study glycoimmune pathways involved in resistance to immune checkpoint blockade (ICB) therapies for melanoma to establish a signature for patient classification.Fil: Merlo, Joaquín Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Mahmoud, Yamil Damián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Veigas, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Rabinovich, Gabriel Adrián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Mariño, Karina Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Girotti, Maria Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaReunión Anual de Sociedades de Biociencia 2020Buenos AiresArgentinaSociedad Argentina de Investigación Clínica SAICSociedad Argentina de Inmunología SAISociedad Argentina de Fisiología SAFI

An Updated List of Rock Partridge (Alectoris graeca) Haplotypes from the Apennines—Central Italy

We report an updated and expanded list of Rock Partridge (Alectoris graeca) haplotypes found in wild animals throughout the Apennines of central Italy. Samples were collected and identified during a monitoring program of autochthonous Galliformes and from a private collection. The haplotypes were identified on a longer fragment of the mitochondrial control region (D-loop) based on previously reported haplotypes. This novel evidence, based on a wider sampling area and a higher number of analyzed specimens, will be of relevance in both conservation projects and gamebird breeding for restock, as imposed by the Italian Action Plan. Studying longer fragments can also be useful for phylogeographic analysis. Dataset: Molecular data on the NCBI web site (GenBank) are available at the link https://www.ncbi.nlm.nih.gov. Registration codes are ON086324, ON086325, ON086326, ON086327, ON086328, ON086329, ON086317, ON086318, ON086319, ON086320, ON086322, ON086323. Dataset License: CC09n

Unveiling the immune infiltrate modulation in cancer and response to immunotherapy by MIXTURE—an enhanced deconvolution method

The accurate quantification of tumor-infiltrating immune cells turns crucial to uncover their role in tumor immune escape, to determine patient prognosis and to predict response to immune checkpoint blockade. Current state-of-the-art methods that quantify immune cells from tumor biopsies using gene expression data apply computational deconvolution methods that present multicollinearity and estimation errors resulting in the overestimation or underestimation of the diversity of infiltrating immune cells and their quantity. To overcome such limitations, we developed MIXTURE, a new ν-support vector regression-based noise constrained recursive feature selection algorithm based on validated immune cell molecular signatures. MIXTURE provides increased robustness to cell type identification and proportion estimation, outperforms the current methods, and is available to the wider scientific community. We applied MIXTURE to transcriptomic data from tumor biopsies and found relevant novel associations between the components of the immune infiltrate and molecular subtypes, tumor driver biomarkers, tumor mutational burden, microsatellite instability, intratumor heterogeneity, cytolytic score, programmed cell death ligand 1 expression, patients´ survival and response to anti-cytotoxic T-lymphocyte-associated antigen 4 and anti-programmed cell death protein 1 immunotherapy.Fil: Fernandez, Elmer Andres. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Inmunología y Enfermedades Infecciosas. Universidad Católica de Córdoba. Centro de Investigación y Desarrollo en Inmunología y Enfermedades Infecciosas; ArgentinaFil: Mahmoud, Yamil Damián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Veigas, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Rocha, Darío Gastón. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; ArgentinaFil: Miranda, Matías. Universidad Católica de Córdoba; ArgentinaFil: Merlo, Joaquín Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Balzarini, Mónica. Universidad Nacional de Córdoba; ArgentinaFil: Lujan, Hugo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Inmunología y Enfermedades Infecciosas. Universidad Católica de Córdoba. Centro de Investigación y Desarrollo en Inmunología y Enfermedades Infecciosas; ArgentinaFil: Rabinovich, Gabriel Adrián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Girotti, Maria Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentin