18 research outputs found
Botulismo no Brasil, 2000-2008: epidemiologia, achados clÃnicos e diagnóstico laboratorial
Botulism is a rare and potentially lethal illness caused by Clostridium botulinum neurotoxin. We describe the findings of a laboratorial investigation of 117 suspected cases of botulism reported to the surveillance system in Brazil from January 2000 to October 2008. Data on the number and type of samples analyzed, type of toxins identified, reporting of the number of botulism cases and transmission sources are discussed. A total of 193 clinical samples and 81 food samples were analyzed for detection and identification of the botulism neurotoxin. Among the clinical samples, 22 (11.4%) presented the toxin (nine type A, five type AB and eight with an unidentified type); in food samples, eight (9.9%) were positive for the toxin (five type A, one type AB and two with an unidentified type). Of the 38 cases of suspected botulism in Brazil, 27 were confirmed by a mouse bioassay. Laboratorial botulism diagnosis is an important procedure to elucidate cases, especially food-borne botulism, to confirm clinical diagnosis and to identify toxins in food, helping sanitary control measures.Botulismo é uma doença rara e potencialmente letal, resultante da ação de uma neurotoxina produzida pelo Clostridium botulinum. No presente estudo, estão descritos os resultados da investigação laboratorial de 117 casos suspeitos de botulismo notificados ao sistema de vigilância, ocorridos no Brasil no perÃodo de janeiro de 2000 a outubro de 2008. Os dados obtidos sobre as fontes de transmissão, os tipos de toxina identificados e de amostras analisadas serão discutidos. Foram analisadas 193 amostras clÃnicas e 81 amostras de alimentos para detecção e identificação de neurotoxina botulÃnica. Entre as amostras clÃnicas, 22 (11,4%) amostras apresentaram resultado positivo para toxina (nove do tipo A, cinco do tipo AB e em oito o tipo não foi identificado) e entre as amostras de alimentos, oito (9,9%) foram positivas (cinco do tipo A, uma do tipo AB e em duas o tipo não foi identificado). Dos 38 casos considerados positivos para botulismo, 27 foram confirmados pelo bioensaio em camundongo. O diagnóstico laboratorial de botulismo é importante para elucidação dos casos, principalmente de botulismo alimentar, para confirmação dos diagnósticos clÃnicos e identificação das toxinas nos alimentos, provendo subsÃdios para as medidas de controle sanitári
Genotipagem de multilocus de Cryptosporidium hominis associado a surto diarréico em creche de São Paulo
A number of species of Cryptosporidium are associated with diarrhea worldwide. Little data exists regarding the genotypes and species of Cryptosporidium associated with cases of infections in Brazil. PURPOSE: In the present study, we ascertained by molecular methods the species and the genotype of Cryptosporidium sp from a diarrhea outbreak diagnosed in a day care at the Hospital ClÃnicas, São Paulo University Medical School. MATERIALS AND METHODS: Specific identification and typing of the isolates associated with the outbreak was done by DNA sequencing analysis of fragments amplified by polymerase chain reaction (PCR) from 3 different Cryptosporidium loci: the SSUrRNA coding region, the Cryptosporidium oocyst wall protein (COWP) gene, and the microsatellite locus 1 (ML1), a tandem GAG-trinucleotide repeat containing substitutions that differentiate the genotypes of Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis. RESULTS: A total of 29 positive samples from the outbreak were studied by the molecular methods described. Our study revealed the presence of a single genotype of Cryptosporidium hominis in all samples. CONCLUSION: The molecular analysis reinforced the hypothesis that the transmission of Cryptosporidium hominis during the period the samples were collected occurred in an outbreak pattern, possibly by person-to-person contact through the fecal-oral route. As far as we know, this is the first time that molecular tools have been used to identify the species and the genotype of isolates showing the presence of the ML1 genotype in samples from Brazilian patients.Mundialmente, diferentes espécies de Cryptosporidium estão relacionadas com doenças diarréicas. No Brasil há poucos dados sobre os genótipos das espécies de Cryptosporidium associadas a infecções. OBJETIVO: No presente estudo, caracterizamos, por métodos moleculares, a espécie e o genótipo de Cryptosporidium sp diagnosticado em surto diarréico ocorrido na creche do Hospital das ClÃnicas, São Paulo, Brasil. MATERIAL E MÉTODOS: Identificação especÃfica e tipagem dos isolados associados ao surto foram feitos a partir do seqüenciamento de fragmentos de DNA amplificados por PCR dos seguintes loci: a região que codifica o SSUrRNA, o gene que codifica uma proteÃna do envoltório dos oocistos de Cryptosporidium (COWP), e o locus de microsatélite ML1, representado por seqüências repetitiva de três nucleotÃdeos GAG contendo substituições que diferem entre os genótipos de Cryptosporidium parvum e Cryptosporidium hominis. RESULTADOS: Um total de 29 amostras positivas para Cryptosporidium associadas ao surto diarréico foi analisado com base nos métodos moleculares acima descritos. O estudo revelou a presença do genótipo ML1 de Cryptosporidium hominis. DISCUSSÃO: A análise molecular reforçou a hipótese de que a transmissão de Cryptosporidium hominis durante o surto diarréico ocorreu de pessoa a pessoa através da rota fecal oral. Esta é a primeira vez que ferramentas moleculares são utilizadas para identificação de espécies e genótipos de isolados acusando a presença do genótipo ML1 em pacientes brasileiros
Multilocus genotyping of Cryptosporidium hominis associated with diarrhea outbreak in a day care unit in São Paulo
Frequência e manifestações clÃnicas da sÃndrome pós-poliomielite em um centro terciário brasileiro
OBJECTIVE: To determine the frequency and clinical manifestations of patients with post-poliomyelitis syndrome (PPS) in a Brazilian division of neuromuscular disorders. METHODS: A total of 167 patients with prior history of paralytic poliomyelitis was investigated for PPS, based on international diagnostic criteria. Other variables analyzed were: gender, race, age at poliomyelitis infection, age at PPS onset, and PPS symptoms. RESULTS: One hundred and twenty-nine patients presented PPS, corresponding to 77.2% of the studied population. 62.8% were women and 37.2% were men. Mean age of patients with PPS at onset of PPS symptoms was 39.9±9.69 years. Their main clinical manifestations were: new weakness in the previously affected limbs (69%) and in the apparently not affected limbs (31%); joint pain (79.8%); fatigue (77.5%); muscle pain (76%); and cold intolerance (69.8%). CONCLUSIONS: Most patients of our sample presented PPS. In Brazil, PPS frequency and clinical features are quite similar to those of other countries.OBJETIVO: Determinar a frequência e as manifestações clÃnicas de pacientes com sÃndrome pós-poliomielite (SPP) em um setor terciário de doenças neuromusculares brasileiro. MÉTODOS: Um total de 167 pacientes com história prévia de poliomielite paralÃtica foi estudado para diagnóstico de SPP, de acordo com critérios diagnósticos internacionais. Além da SPP, as variáveis analisadas foram: gênero, raça, idade à época da poliomielite aguda e idade no inÃcio dos sintomas da SPP. RESULTADOS: Cento e vinte e nove pacientes apresentaram SPP, correspondendo a 77,2% da população estudada. Mulheres constituÃram 62,8% dos pacientes e os homens, 37,2%. A média de idade dos pacientes com SPP à época do inÃcio dos sintomas foi de 39,9±9,69 anos. Suas principais manifestações clÃnicas foram: manifestações novas de fraqueza em membros previamente afetados (69%) e em membros aparentemente não afetados (31%); dores articulares (79,8%); fadiga (77,5%); dor muscular (76%) e intolerância ao frio (69,8%). CONCLUSÕES: A maioria dos pacientes da presente casuÃstica apresentou SPP. No Brasil, a frequência e as caracterÃsticas clÃnicas da SPP são similares à s observadas em outros paÃses.Federal University of São Paulo Division of Neuromuscular Disorders Department of Neurology and NeurosurgeryCentro Universitário Adventista de São Paulo Neurologic Rehabilitation Service of the PoliclÃnicaUNIFESP, Division of Neuromuscular Disorders Department of Neurology and NeurosurgerySciEL
Diphyllobothriasis, Brazil
Cases of human diphyllobothriasis have been reported worldwide. Only 1 case in Brazil was diagnosed by our institution from January 1998 to December 2003. By comparison, 18 cases were diagnosed from March 2004 to January 2005. All patients who became infected ate raw fish in sushi or sashimi
Tendência temporal da mortalidade por doenças infecciosas intestinais em crianças menores de cinco anos de idade, no estado de São Paulo, 2000-2012
Resumo OBJETIVO: analisar a tendência temporal da mortalidade por doenças infecciosas intestinais (DII) em crianças menores de cinco anos de idade no estado de São Paulo e suas Redes Regionais de Atenção à Saúde (RRAS), no perÃodo 2000-2012. MÉTODOS: estudo de série temporal sobre os óbitos com causa básica, antecedente ou contribuinte de morte por DII, obtidos a partir do Sistema de Informações sobre Mortalidade (SIM). RESULTADOS: ocorreram 2.886 óbitos por DII no estado; a taxa de mortalidade por DII apresentou diminuição de 10,5% ao ano (intervalo de confiança de 95% 4,8; 15,8%); em 13 das 17 RRAS ocorreu diminuição significativa da taxa de mortalidade, com decréscimo anual variável entre 16,6 e 8,3% ao ano. CONCLUSÃO: a taxa de mortalidade por DII apresentou decréscimo significativo na maioria das RRAS, com diferentes velocidades, possÃvel reflexo das desigualdades das condições socioeconômicas e de organização das redes de atenção à saúde
Multilocus genotyping of Cryptosporidium hominis associated with diarrhea outbreak in a day care unit in São Paulo
A number of species of Cryptosporidium are associated with diarrhea worldwide. Little data exists regarding the genotypes and species of Cryptosporidium associated with cases of infections in Brazil. PURPOSE: In the present study, we ascertained by molecular methods the species and the genotype of Cryptosporidium sp from a diarrhea outbreak diagnosed in a day care at the Hospital ClÃnicas, São Paulo University Medical School. MATERIALS AND METHODS: Specific identification and typing of the isolates associated with the outbreak was done by DNA sequencing analysis of fragments amplified by polymerase chain reaction (PCR) from 3 different Cryptosporidium loci: the SSUrRNA coding region, the Cryptosporidium oocyst wall protein (COWP) gene, and the microsatellite locus 1 (ML1), a tandem GAG-trinucleotide repeat containing substitutions that differentiate the genotypes of Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis. RESULTS: A total of 29 positive samples from the outbreak were studied by the molecular methods described. Our study revealed the presence of a single genotype of Cryptosporidium hominis in all samples. CONCLUSION: The molecular analysis reinforced the hypothesis that the transmission of Cryptosporidium hominis during the period the samples were collected occurred in an outbreak pattern, possibly by person-to-person contact through the fecal-oral route. As far as we know, this is the first time that molecular tools have been used to identify the species and the genotype of isolates showing the presence of the ML1 genotype in samples from Brazilian patients
Molecular analysis of clonally related Salmonella Typhi recovered from epidemiologically unrelated cases of typhoid fever, Brazil
Background: The primary method of molecular subtyping for the identification and investigation of outbreaks has been pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). In some cases, this technique has not been able to show discrimination between the unrelated strains that can be achieved by whole genome sequencing (WGS). Methods: The aim of this study was to determine the strengths and drawbacks of WGS using different analytic approaches compared to traditional typing method, PFGE, for retrospectively typing clusters cases of 28 S. Typhi. Results: We evaluated three analytical approaches on the WGS data set (Nucleotide Difference (ND), (SNPs) and Whole genome multi locus sequence typing (wgMLST) that identically classified the clusters-related strains into two clusters, cluster A (with strains from 2017), and Cluster B (with strains from 2007). Conclusions: In this study WGS based typing, was able to compete with PFGE for differentiation of the clusters of S. Typhi strains. Keywords: Salmonella Typhi, Whole genome sequencing, Phylogenetic, Antimicrobial resistanc
Botulism in Brazil, 2000-2008: epidemiology, clinical findings and laboratorial diagnosis Botulismo no Brasil, 2000-2008: epidemiologia, achados clÃnicos e diagnóstico laboratorial
Botulism is a rare and potentially lethal illness caused by Clostridium botulinum neurotoxin. We describe the findings of a laboratorial investigation of 117 suspected cases of botulism reported to the surveillance system in Brazil from January 2000 to October 2008. Data on the number and type of samples analyzed, type of toxins identified, reporting of the number of botulism cases and transmission sources are discussed. A total of 193 clinical samples and 81 food samples were analyzed for detection and identification of the botulism neurotoxin. Among the clinical samples, 22 (11.4%) presented the toxin (nine type A, five type AB and eight with an unidentified type); in food samples, eight (9.9%) were positive for the toxin (five type A, one type AB and two with an unidentified type). Of the 38 cases of suspected botulism in Brazil, 27 were confirmed by a mouse bioassay. Laboratorial botulism diagnosis is an important procedure to elucidate cases, especially food-borne botulism, to confirm clinical diagnosis and to identify toxins in food, helping sanitary control measures.<br>Botulismo é uma doença rara e potencialmente letal, resultante da ação de uma neurotoxina produzida pelo Clostridium botulinum. No presente estudo, estão descritos os resultados da investigação laboratorial de 117 casos suspeitos de botulismo notificados ao sistema de vigilância, ocorridos no Brasil no perÃodo de janeiro de 2000 a outubro de 2008. Os dados obtidos sobre as fontes de transmissão, os tipos de toxina identificados e de amostras analisadas serão discutidos. Foram analisadas 193 amostras clÃnicas e 81 amostras de alimentos para detecção e identificação de neurotoxina botulÃnica. Entre as amostras clÃnicas, 22 (11,4%) amostras apresentaram resultado positivo para toxina (nove do tipo A, cinco do tipo AB e em oito o tipo não foi identificado) e entre as amostras de alimentos, oito (9,9%) foram positivas (cinco do tipo A, uma do tipo AB e em duas o tipo não foi identificado). Dos 38 casos considerados positivos para botulismo, 27 foram confirmados pelo bioensaio em camundongo. O diagnóstico laboratorial de botulismo é importante para elucidação dos casos, principalmente de botulismo alimentar, para confirmação dos diagnósticos clÃnicos e identificação das toxinas nos alimentos, provendo subsÃdios para as medidas de controle sanitári