Avaliação ambiental de práticas de manejo sítio específico aplicadas à produção de grãos na região de Rio Verde (GO).

Denomina-se Agricultura de Precisão (AP) o conjunto de ações de gestão de sistemas de produção agropecuária que consideram a variabilidade espacial local dos campos de produção e realizam o manejo de insumos e recursos de forma sítio-específica. A AP surgiu em resposta a um mercado crescentemente competitivo, que demanda maior volume de produção, a preços baixos e com promoção da sustentabilidade. Com o objetivo de verificar o potencial da AP para atendimento desse último objetivo, procedeu-se à avaliação da produção de grãos em sistema plantio direto em estabelecimentos rurais dedicados ou não à aplicação de técnicas de AP, na região de Rio Verde (GO). Para tanto, empregou-se o Sistema de Avaliação Ponderada de Impacto Ambiental de Atividades do Novo Rural (APOIA-NovoRural), que consiste de um conjunto de 62 indicadores, integrados em cinco dimensões de sustentabilidade: (i) Ecologia da Paisagem, (ii) Qualidade dos Compartimentos Ambientais (Atmosfera, Água e Solo), (iii) Valores Socioculturais, (iv) Valores Econômicos, e (v) Gestão e Administração. Os resultados apontaram importantes contribuições dos estabelecimentos estudados para o desenvolvimento local sustentável, dadas as medidas de manejo, organização produtiva e gestão ambiental observadas. O contraste mais evidente entre os estabelecimentos que aplicam ou não as práticas de AP foi referente ao manejo do solo, sendo que a AP permitiu a correção da acidez potencial, promovendo elevação da saturação em bases e possibilitando níveis mais elevados de produtividade. Os resultados atestam o valor da AP para promoção do desempenho ambiental de estabelecimentos rurais, com especial referência para a qualidade do solo

Certificação participativa e gestão ambiental da produção integrada de morango.

No Brasil, a produção de morangos é de cerca de 100 mil toneladas, em uma área cultivada de 3.500 hectares. Minas Gerais é o maior produtor nacional, seguido por São Paulo e Rio Grande do Sul, sendo caracterizada pelo emprego de alta tecnologia e exigência em mão-deobra, principalmente na época da colheita, que é longa e gera em torno de quatro empregos diretos por hectare (NAPOLEÃO, 2007). Além da questão simplesmente produtiva, a sociedade começa a diferenciar e valorizar produtores que manejam responsavelmente o ambiente e os recursos naturais, como forma de compensação e incentivo pela conservação. Iniciativas de certificação permitem essa compensação do produtor, ao registrar e avaliar a eficácia de investimentos e dedicação a adequadas práticas de manejo. A certificação de qualidade, que busca diferenciar capacidades institucionais padronizadas, auditadas por agentes de terceira parte, é frequentemente de difícil alcance para iniciativas locais e de pequenos produtores familiares (característica de muitos produtores de morango), podendo ser alternativamente concebidos sistemas de certificação participativa e inclusiva para preparação de produtores interessados em ingressar no programa PIF (CAMPANHOLA et al., 2006). Neste contexto, a Embrapa Meio Ambiente desenvolveu o Sistema de Avaliação Ponderada de Impacto Ambiental de Atividades do Novo Rural (APOIA-NovoRural), um instrumento de gestão ambiental participativo da atividade produtiva, aplicável no âmbito do estabelecimento rural (RODRIGUES; CAMPANHOLA, 2003) e com caráter territorial quando estes são avaliados coletivamente (RODRIGUES et al., 2007b). Nos últimos quatro anos, o sistema vem sendo validado em centenas de estabelecimentos rurais, envolvendo uma variedade de atividades produtivas, tais como: Unidades familiares, Atividades extrativas e Carcinicultura (PB), Estabelecimentos dedicados à Horticultura Orgânica e Convencional, ao Agroturismo, Pesque-pagues e Agricultura Ecológica nas regiões Sudeste e Sul; bem como em estabelecimentos dedicados à Estrutiocultura, Agricultura de Precisão, Produção de Oleaginosas para geração de Biocombustível e Produção Integrada de Frutas em todas as regiões do Brasil (RODRIGUES et al., 2007a, 2007b; RODRIGUES et al., 2006). A estratégia de divulgação inclui a apresentação em cursos de capacitação em produção integrada de frutas como o promovido recentemente para pêssego e ameixa (BUSCHINELLI et al., 2007). O objetivo deste trabalho é apresentar uma estratégia de gestão ambiental participativa e voluntária dirigida aos produtores rurais, de forma a auxiliar a eco-certificação de suas atividades produtivas, tendo como exemplo, a preparação de produtores para ingresso na produção integrada de morango (PIMo)

A functional biological network centered on XRCC3: a new possible marker of chemoradiotherapy resistance in rectal cancer patients

Preoperative chemoradiotherapy is widely used to improve local control of disease, sphincter preservation and to improve survival in patients with locally advanced rectal cancer. Patients enrolled in the present study underwent preoperative chemoradiotherapy, followed by surgical excision. Response to chemoradiotherapy was evaluated according to Mandard's Tumor Regression Grade (TRG). TRG 3, 4 and 5 were considered as partial or no response while TRG 1 and 2 as complete response. From pretherapeutic biopsies of 84 locally advanced rectal carcinomas available for the analysis, only 42 of them showed 70% cancer cellularity at least. By determining gene expression profiles, responders and non-responders showed significantly different expression levels for 19 genes (P < 0.001). We fitted a logistic model selected with a stepwise procedure optimizing the Akaike Information Criterion (AIC) and then validated by means of leave one out cross validation (LOOCV, accuracy = 95%). Four genes were retained in the achieved model: ZNF160, XRCC3, HFM1 and ASXL2. Real time PCR confirmed that XRCC3 is overexpressed in responders group and HFM1 and ASXL2 showed a positive trend. In vitro test on colon cancer resistant/susceptible to chemoradioterapy cells, finally prove that XRCC3 deregulation is extensively involved in the chemoresistance mechanisms. Protein-protein interactions (PPI) analysis involving the predictive classifier revealed a network of 45 interacting nodes (proteins) with TRAF6 gene playing a keystone role in the network. The present study confirmed the possibility that gene expression profiling combined with integrative computational biology is useful to predict complete responses to preoperative chemoradiotherapy in patients with advanced rectal cance

Fração mineralizável de nitrogênio em solo tratado sucessivamente com lodo de esgoto.

A taxa de mineralização de nitrogênio oriundo de lodo de esgoto é utilizada para calcular a dose adequada de resíduo a ser aplicada ao solo. A Resolução CONAMA optou por utilizar porcentagens fixas de N mineralizável, dependendo do tipo de lodo de esgoto. Entretanto, a maioria das informações sobre a porcentagem de N mineralizável foi obtida a partir de solos que nunca receberam o resíduo anteriormente. O presente estudo avaliou a mineralização de N de solos que receberam por 5 anos doses diferentes de lodo de esgoto. Os resultados mostraram que a FMN e o modelo de cinética de primeira ordem não foram adequados para a avaliação de solos que já haviam recebido o resíduo anteriormente

Sequencing identifies a distinct signature of circulating microRNAs in early radiographic knee osteoarthritis

OBJECTIVE: MicroRNAs act locally and systemically to impact osteoarthritis (OA) pathophysiology, but comprehensive profiling of the circulating miRNome in early vs late stages of OA has yet to be conducted. Sequencing has emerged as the preferred method for microRNA profiling since it offers high sensitivity and specificity. Our objective is to sequence the miRNome in plasma from 91 patients with early [Kellgren-Lawrence (KL) grade 0 or 1 (n = 41)] or late [KL grade 3 or 4 (n = 50)] symptomatic radiographic knee OA to identify unique microRNA signatures in each disease state. DESIGN: MicroRNA libraries were prepared using the QIAseq miRNA Library Kit and sequenced on the Illumina NextSeq 550.Counts were produced for microRNAs captured in miRBase and for novel microRNAs. Statistical, bioinformatics, and computational biology approaches were used to refine and interpret the final list of microRNAs. RESULTS: From 215 differentially expressed microRNAs (FDR \u3c 0.01), 97 microRNAs showed an increase or decrease in expression in ≥85% of samples in the early OA group as compared to the median expression in the late OA group. Increasing this threshold to ≥95%, seven microRNAs were identified: hsa-miR-335-3p, hsa-miR-199a-5p, hsa-miR-671-3p, hsa-miR-1260b, hsa-miR-191-3p, hsa-miR-335-5p, and hsa-miR-543. Four novel microRNAs were present in ≥50% of early OA samples and had 27 predicted gene targets in common with the prioritized set of predicted gene targets from the 97 microRNAs, suggesting common underlying mechanisms. CONCLUSION: Applying sequencing to well-characterized patient cohorts produced unbiased profiling of the circulating miRNome and identified a unique panel of 11 microRNAs in early radiographic knee OA

Avaliação de impacto socioambiental da cadeia produtiva da soja - uma análise na região de Londrina/PR.

O trabalho relata a avaliação socioambiental na cadeia produtiva da soja para geração de biodiesel, na região de Londrina/PR. Foi realizado levantamento bibliográfico uma oficina de trabalho com a aplicação de uma ferramenta de avaliação de impacto socioambiental, o Eco-cert.Rural (Sistema Base de Eco-certificação de Atividades Rurais). A oficina ocorreu em 17 de abril de 2008, na Embrapa Soja, reunindo 17 atores sociais envolvidos com a cadeia produtiva da soja, na região de Londrina/PR. A avaliação explicitou as principais tendências de desempenho dos indicadores de impacto socioambiental, segundo o conhecimento e experiência dos atores sociais envolvidos na época da avaliação. Houve alteração no objeto de avaliação do trabalho de cadeia produtiva da soja para geração de biodiesel para cadeia de produção da soja com práticas intensivas de plantio direto. Isto porque, os especialistas foram unânimes em afirmar que o processo produtivo agrícola de soja, na região de Londrina/PR, não se alterou em função do uso desta matéria-prima na produção de biodiesel. Constatou-se inicialmente que na região de Londrina/PR a produção de soja em sistema de plantio direto intensivo traz efeitos negativos sobre o Desempenho Ecológico, que são comuns em atividades agrícolas devido à dependência da agricultura de fontes e meios de produção externos. Ainda assim, há efeito positivo para o critério Recuperação Ambiental, dentro desta dimensão. O Desempenho Socioambiental beneficiado por essa cadeia produtiva com impactos positivos para a maioria dos critérios indicadores, destacando-se a capacitação dos produtores, a geração e diversidade de fontes de renda e o valor das propriedades

Avaliação socioambiental da diversificação produtiva e adoção de boas práticas de produção leiteira em pequena propriedade familiar em Piracanjuba (GO).

O presente trabalho refere-se a uma Avaliação Socioambiental realizada pela Embrapa Meio Ambiente em parceria com a Cooperativa Agropecuária Mista de Piracanjuba (COAPIL),como parte de um projeto de Gestão Ambiental da Produção Leiteira na Região Centro-Sul desenvolvido pela Universidade Católica de Goiás (UCG). Esta avaliação resultou da aplicação do Sistema Base de Avaliação e Eco-Certificação de Atividades Rurais (Eco-cert.Rural) na diversificação produtiva e na adoção de boas práticas de produção em uma pequena propriedade familiar no município de Piracanjuba/GO. Para tanto, foi realizada no dia 21 de Fevereiro de 2008, uma entrevista/vistoria com o acompanhamento do proprietário para a avaliação dos indicadores de desempenho socioambiental das atividades praticada na propriedade. O Sistema Eco-cert.Rural consiste de um conjunto de planilhas eletrônicas (plataforma MS-Excel) construídas para a avaliação do desempenho ecológico e socioambiental de uma dada atividade rural, considerando seus impactos ecológicos, econômicos e sociais. O sistema compõe-se de duas dimensões (Ecológica e Socioambiental)considerando sete aspectos essenciais de avaliação: i. Uso de Insumos e Recursos, ii. Qualidade Ambiental, iii. Respeito ao Consumidor, iv. Emprego, v. Renda, vi. Saúde e vii. Gestão e Administração, que são expressos por vinte e quatro indicadores e cento e vinte cinco componentes. O resultado final desta avaliação consiste no Índice de Desempenho da Atividade, que foi de 1,41 (de uma escala que varia de ?15 a +15) no estabelecimento estudado mostrando uma tendência positiva no manejo praticado no estabelecimento

The IMEx coronavirus interactome: an evolving map of Coronaviridae-host molecular interactions

The current coronavirus disease of 2019 (COVID-19) pandemic, caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV)-2, has spurred a wave of research of nearly unprecedented scale. Among the different strategies that are being used to understand the disease and develop effective treatments, the study of physical molecular interactions can provide fine-grained resolution of the mechanisms behind the virus biology and the human organism response. We present a curated dataset of physical molecular interactions focused on proteins from SARS-CoV-2, SARS-CoV-1 and other members of the Coronaviridae family that has been manually extracted by International Molecular Exchange (IMEx) Consortium curators. Currently, the dataset comprises over 4400 binarized interactions extracted from 151 publications. The dataset can be accessed in the standard formats recommended by the Proteomics Standards Initiative (HUPO-PSI) at the IntAct database website (https://www.ebi.ac.uk/intact) and will be continuously updated as research on COVID-19 progresses

Capturing variation impact on molecular interactions in the IMEx Consortium mutations data set

The current wealth of genomic variation data identified at nucleotide level presents the challenge of understanding by which mechanisms amino acid variation affects cellular processes. These effects may manifest as distinct phenotypic differences between individuals or result in the development of disease. Physical interactions between molecules are the linking steps underlying most, if not all, cellular processes. Understanding the effects that sequence variation has on a molecule's interactions is a key step towards connecting mechanistic characterization of nonsynonymous variation to phenotype. We present an open access resource created over 14 years by IMEx database curators, featuring 28,000 annotations describing the effect of small sequence changes on physical protein interactions. We describe how this resource was built, the formats in which the data is provided and offer a descriptive analysis of the data set. The data set is publicly available through the IntAct website and is enhanced with every monthly release

Increased Risk of Breast Cancer Associated with CC Genotype of Has-miR-146a Rs2910164 Polymorphism in Europeans

Background: Emerging evidence suggests that microRNAs play a critical role in the pathogenesis of breast cancer. Several molecular epidemiological studies were conducted in recent years to evaluate the association between has-miR-146a rs2910164 polymorphism and breast cancer risk in diverse populations. However, the results remain conflicting rather than conclusive. Methodology/Principal findings: We performed a meta-analysis of 6 case-control studies that included 4238 breast-cancer cases and 4469 case-free controls. We assessed the strength of the association, using odds ratios (ORs) with 95 % confidence intervals (CIs). Overall, this meta-analysis showed that the rs2910164 polymorphism was not associated with a significantly increased risk of breast cancer in all genetic models (for GC vs GG: OR = 1.00, 95 % CI = 0.9021.09, Pheterpgeneity = 0.364; for CC vs GG: OR=1.16, 95 % CI=0.9821.36, P heterpgeneity =0.757; for GC+CC vs GG: OR=1.02, 95 % CI=0.9321.12, Pheterpgeneity = 0.562; for CC vs GC+GG: OR = 1.10, 95 % CI = 0.9621.26, Pheterpgeneity = 0.441). However, in the stratified analysis by ethnicity, we found the rs2910164 polymorphism was associated with increased breast cancer risk among Europeans in homozygote comparison (CC vs. GG: OR = 1.29, 95%CI = 1.0221.63, Pheterpgeneity = 0.950, P = 0.032) and recessive model (CC vs. GC+GG: OR = 1.31, 95%CI = 1.0521.65, P heterpgeneity = 0.839, P = 0.019). No publication bias was found in the present study