How Ebola Impacts Genetics of Western Lowland Gorilla Populations

12 pagesInternational audienceBackground: Emerging infectious diseases in wildlife are major threats for both human health and biodiversity conservation. Infectious diseases can have serious consequences for the genetic diversity of populations, which could enhance the species' extinction probability. The Ebola epizootic in western and central Africa induced more than 90% mortality in Western lowland gorilla population. Although mortality rates are very high, the impacts of Ebola on genetic diversity of Western lowland gorilla have never been assessed. Methodology/Principal Findings: We carried out long term studies of three populations of Western lowland gorilla in the Republic of the Congo (Odzala-Kokoua National Park, Lossi gorilla sanctuary both affected by Ebola and Lossi's periphery not affected). Using 17 microsatellite loci, we compared genetic diversity and structure of the populations and estimate their effective size before and after Ebola outbreaks. Despite the effective size decline in both populations, we did not detect loss in genetic diversity after the epizootic. We revealed temporal changes in allele frequencies in the smallest population. Conclusions/Significance: Immigration and short time elapsed since outbreaks could explain the conservation of genetic diversity after the demographic crash. Temporal changes in allele frequencies could not be explained by genetic drift or random sampling. Immigration from genetically differentiated populations and a non random mortality induced by Ebola, i.e., selective pressure and cost of sociality, are alternative hypotheses. Understanding the influence of Ebola on gorilla genetic dynamics is of paramount importance for human health, primate evolution and conservation biology

Long-term trends in survival of a declining population: the case of the little owl (Athene noctua) in the Netherlands

The little owl (Athene noctua) has declined significantly in many parts of Europe, including the Netherlands. To understand the demographic mechanisms underlying their decline, we analysed all available Dutch little owl ringing data. The data set spanned 35 years, and included more than 24,000 ringed owls, allowing detailed estimation of survival rates through multi-state capture–recapture modelling taking dispersal into account. We investigated geographical and temporal variation in age-specific survival rates and linked annual survival estimates to population growth rate in corresponding years, as well as to environmental covariates. The best model for estimating survival assumed time effects on both juvenile and adult survival rates, with average annual survival estimated at 0.258 (SE = 0.047) and 0.753 (SE = 0.019), respectively. Juvenile survival rates decreased with time whereas adult survival rates fluctuated regularly among years, low survival occurring about every 4 years. Years when the population declined were associated with low juvenile survival. More than 60% of the variation in juvenile survival was explained by the increase in road traffic intensity or in average temperature in spring, but these correlations rather reflect a gradual decrease in juvenile survival coinciding with long-term global change than direct causal effects. Surprisingly, vole dynamics did not explain the cyclic dynamics of adult survival rate. Instead, dry and cold years led to low adult survival rates. Low juvenile survival rates, that limit recruitment of first-year breeders, and the regular occurrence of years with poor adult survival, were the most important determinants of the population decline of the little owl

Long-term trends in survival of a declining population: the case of the little owl (Athene noctua) in the Netherlands

The little owl (Athene noctua) has declined significantly in many parts of Europe, including the Netherlands. To understand the demographic mechanisms underlying their decline, we analysed all available Dutch little owl ringing data. The data set spanned 35 years, and included more than 24,000 ringed owls, allowing detailed estimation of survival rates through multi-state capture–recapture modelling taking dispersal into account. We investigated geographical and temporal variation in age-specific survival rates and linked annual survival estimates to population growth rate in corresponding years, as well as to environmental covariates. The best model for estimating survival assumed time effects on both juvenile and adult survival rates, with average annual survival estimated at 0.258 (SE = 0.047) and 0.753 (SE = 0.019), respectively. Juvenile survival rates decreased with time whereas adult survival rates fluctuated regularly among years, low survival occurring about every 4 years. Years when the population declined were associated with low juvenile survival. More than 60% of the variation in juvenile survival was explained by the increase in road traffic intensity or in average temperature in spring, but these correlations rather reflect a gradual decrease in juvenile survival coinciding with long-term global change than direct causal effects. Surprisingly, vole dynamics did not explain the cyclic dynamics of adult survival rate. Instead, dry and cold years led to low adult survival rates. Low juvenile survival rates, that limit recruitment of first-year breeders, and the regular occurrence of years with poor adult survival, were the most important determinants of the population decline of the little owl

Observer le comportement animal au temps de l’Antiquité – induction des protocoles au regard des pratiques actuelles en éthologie.

International audienceLes historiens de la pensée interprètent souvent les discours antiques, y compris dans le domaine naturaliste, comme déterminés par des postures idéologiques. En réaction contre ce parti pris intellectuel, nous pensons utile de faire le pari de l’expérience et d’envisager l’histoire naturelle antique comme une tradition majoritairement fondée sur des données d’expérience et une observation cumulée. Pour mettre à l’épreuve cette approche, qui suppose une autre genèse des savoirs naturalistes, nous examinerons le dossier des descriptions de comportements proposées par Aristote principalement dans les livres 8 et 9 de l’Histoire des Animaux. Notre objectif est donc d’aborder les textes antiques, par un travail conjoint impliquant la philologie, l’histoire, la biologie et l’éco-éthologie contemporaine en faisant l’hypothèse, a priori, d’une objectivité des observateurs lors de leur description des comportements. Aristote circonscrit les comportements des animaux aux fonctions d’accouplement et de soins aux petits et à la recherche de nourriture, toutes forces vitales qui contribuent à la persistance des populations —les principaux éléments influant sur ces comportements étant les changements de saison et les variations de températures, par ailleurs deux facteurs dépendants (HA 596a20-23). Observateur et médiateur de récits et de données qu’il généralise, Aristote propose des descriptions particulièrement détaillées de comportements et de leurs contextes. Nous centrerons notre étude sur le thème des soins aux petits qui fournit un riche éventail de textes sur des espèces variées (oiseaux, mammifères, poissons) de milieux terrestres ou aquatiques. Notre démarche consistera dans un premier temps, à confronter les descriptions des textes d’Aristote pour quelques espèces cibles avec les connaissances actuelles concernant les comportements de ces espèces. Il s’agira d’apprécier dans quelle mesure l’analyse des comportements animaux pendant l’antiquité s’accorde ou non avec celle issue de nos observations contemporaines. Cela nous permettra également de discuter de l’existence éventuelle des biais d’observations liés à l’une ou l’autre époque. Comme les textes antiques nous donnent essentiellement des résultats d’observations, notre exercice consistera, in fine, à tenter de reconstituer les protocoles possibles mis en œuvre par les observateurs ou Aristote lui-même pour l’obtention de ces observations. Au-delà de la pertinence des descriptions comportementales des animaux par les humains pendant l’antiquité, cette étude ciblée permettra, à partir des inférences proposées sur les actions mobilisées pour connaître les comportements animaux et des écarts entre les rapports d’observation de l’antiquité et d’aujourd’hui, de réfléchir sur les aspects généralisables et la souplesse ou flexibilité des comportements

Observer le comportement animal au temps de l’Antiquité – induction des protocoles au regard des pratiques actuelles en éthologie.

International audienceLes historiens de la pensée interprètent souvent les discours antiques, y compris dans le domaine naturaliste, comme déterminés par des postures idéologiques. En réaction contre ce parti pris intellectuel, nous pensons utile de faire le pari de l’expérience et d’envisager l’histoire naturelle antique comme une tradition majoritairement fondée sur des données d’expérience et une observation cumulée. Pour mettre à l’épreuve cette approche, qui suppose une autre genèse des savoirs naturalistes, nous examinerons le dossier des descriptions de comportements proposées par Aristote principalement dans les livres 8 et 9 de l’Histoire des Animaux. Notre objectif est donc d’aborder les textes antiques, par un travail conjoint impliquant la philologie, l’histoire, la biologie et l’éco-éthologie contemporaine en faisant l’hypothèse, a priori, d’une objectivité des observateurs lors de leur description des comportements. Aristote circonscrit les comportements des animaux aux fonctions d’accouplement et de soins aux petits et à la recherche de nourriture, toutes forces vitales qui contribuent à la persistance des populations —les principaux éléments influant sur ces comportements étant les changements de saison et les variations de températures, par ailleurs deux facteurs dépendants (HA 596a20-23). Observateur et médiateur de récits et de données qu’il généralise, Aristote propose des descriptions particulièrement détaillées de comportements et de leurs contextes. Nous centrerons notre étude sur le thème des soins aux petits qui fournit un riche éventail de textes sur des espèces variées (oiseaux, mammifères, poissons) de milieux terrestres ou aquatiques. Notre démarche consistera dans un premier temps, à confronter les descriptions des textes d’Aristote pour quelques espèces cibles avec les connaissances actuelles concernant les comportements de ces espèces. Il s’agira d’apprécier dans quelle mesure l’analyse des comportements animaux pendant l’antiquité s’accorde ou non avec celle issue de nos observations contemporaines. Cela nous permettra également de discuter de l’existence éventuelle des biais d’observations liés à l’une ou l’autre époque. Comme les textes antiques nous donnent essentiellement des résultats d’observations, notre exercice consistera, in fine, à tenter de reconstituer les protocoles possibles mis en œuvre par les observateurs ou Aristote lui-même pour l’obtention de ces observations. Au-delà de la pertinence des descriptions comportementales des animaux par les humains pendant l’antiquité, cette étude ciblée permettra, à partir des inférences proposées sur les actions mobilisées pour connaître les comportements animaux et des écarts entre les rapports d’observation de l’antiquité et d’aujourd’hui, de réfléchir sur les aspects généralisables et la souplesse ou flexibilité des comportements

La flexibilité comportementale face aux perturbations de l’Anthropocène. Ce que le spatial nous apprend du temporel.

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La flexibilité comportementale face aux perturbations de l’Anthropocène. Ce que le spatial nous apprend du temporel.

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Spatial heterogeneity of recapture probability in substantial in most species and has consequences for survival estimates

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Etude de l’impact de l’épidémie Ebola sur la variabilité adaptative des gorilles de plaines de l’Ouest, via une méthode alternative au séquençage à haut débit

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