Caracterização de isolados de Mycosphaerella fijiensis de diferentes regiões do Brasil por meio de VNTR.

A sigatoka-negra da bananeira (Musa spp.) é causada pelo fungo Mycosphaerela fijiensis Morelet, que destrói a área foliar inibindo a capacidade fotossintética da planta, acarretando em baixa produção de frutos, tornando-se assim a mais importante doença da banana no mundo. Para auxiliar na seleção de plantas resistentes é de fundamental importância o conhecimento da diversidade do patógeno, que por sua vez podem ser avaliados com o auxilio de marcadores moleculares. Marcadores baseados em locos hipervariáveis de minisatélites ou Variable Number of Tandem Repeat (VNTR) possui um caráter altamente polimórfico e tem sido amplamente empregado no melhoramento de plantas e analises de diversidade de microrganismos. Deste modo o objetivo deste estudo foi caracterizar indivíduos de M. fijiensis de diferentes regiões do Brasil utilizando o marcador VNTR. Foram analisados 184 isolados de sete estados (AM, SP, MT, PA, RR, RO, AC) por meio de seis locis de VNTR desenvolvidos para M. fijiensis: 3959, 3831-2, 3786, 1333, 0705, 0252. Cada reação de PCR foi realizada em volume final de 20μL, contendo 50ng de DNA genômico, 5 μM de cada primer, tampão 1X, 1,5 mM de MgCl2, 0,2 mM de dNTP e 0,2 U de Taq Polymerase. As reações foram realizadas utilizando o seguinte programa: Desnaturação inicial de 94ºC por 1 min, 30 ciclos de 94ºC por 30 s, 65ºC por 30 s, 72ºC por 30 s, seguidos de um alongamento final de 10 min a 72ºC e os produtos da PCR foram separados por eletroforese em gel de agarose 1,5%. Foi obtido um total de 16 alelos com padrões de bandas que variavam de 100 a 500 pares de base. Os minissatélites 1333, 3786, 3831-2 e 3959 apresentaram 3, 4, 4 e 3 alelos respectivamente. Entretanto os loci 0252 e 0705 não apresentaram polimorfismo na população em estudo. Os valores da similaridade genética estimados pelo coeficiente de Jaccard variaram de 0,36 a 1. O dendrograma obtido pelo método UPGMA distribuiu os isolados em cinco grupos sem discriminação por região. Baseados nestes dados, não existem padrões óbvios da distribuição geográfica dos isolados, assim como o alto nível de similaridade entre os isolados de diferentes Estados do país corrobora a hipótese de sua disseminação partir da região norte do Brasil

Modelos não lineares de crescimento da tilápia-do-nilo (Oreochromis niloticus) na linhagem Chitralada.

Objetivou-se com este estudo avaliar e comparar diferentes modelos de crescimentos ajustados para descrever a relação peso corporal/idade da tilápia-do-nilo (Oreachromis niloticus) da linhagem Chitralada criadas em tanques-rede. O presente estudo foi conduzido pela CODEVASF / Embrapa Semiárido - CPATSA, em uma piscicultura comercial localizada na cidade de Juazeiro - BA. O banco de dados utilizado foi composto pelo peso corporal oriundo de sete biometrias realizadas em cada tanque-rede do inicio da criação ao abate dos peixes. As biometrias foram realizadas nos tempos 30, 60, 90, 150, 180, 240 e 270 dias, sendo cada biometria composta por 81 pesagens, totalizando em 567 medidas. Para o peso corporal foram ajustados os modelos de crescimento de Brody, Von Bertalanffy, Gompertz, Logistics e Richards em função do tempo. A escolha do modelo que melhor descrevesse a curva de crescimento da tilápia-do-nilo foi realizada pelo critério do coeficiente de determinação ajustado (R2Aj), o desvio padrão residual (DPR), o critério de informação de Akaike (AIC) e o critério bayesiano de Schwarz (BIC). Dentre os modelos avaliados, apenas o modelo de Brody não apresentou convergência para o peso corporal da tilápia-do-nilo. Os demais modelos ajustados apresentaram R2Aj semelhantes, apontando alteração apenas na terceira casa decimal. Comportamento semelhante foi observado ao DPR, mostrando que os resíduos destes modelos comportam de forma semelhante. Entretanto, para o AIC e BIC o modelo de Von Bertalanffy apresentou os melhores valores. O modelo de Von Bertalanffy apresentou-se como o mais adequado para a descrição da relação peso corporal/idade da tilápia-do-nilo, linhagem Chitraladacriadas em tanques-rede, fornecendo parâmetros com interpretações e valores que condizem com a realidade

On the Analysis of Trajectory-Based Search Algorithms: When is it Beneficial to Reject Improvements?

We investigate popular trajectory-based algorithms inspired by biology and physics to answer a question of general significance: when is it beneficial to reject improvements? A distinguishing factor of SSWM (strong selection weak mutation), a popular model from population genetics, compared to the Metropolis algorithm (MA), is that the former can reject improvements, while the latter always accepts them. We investigate when one strategy outperforms the other. Since we prove that both algorithms converge to the same stationary distribution, we concentrate on identifying a class of functions inducing large mixing times, where the algorithms will outperform each other over a long period of time. The outcome of the analysis is the definition of a function where SSWM is efficient, while Metropolis requires at least exponential time. The identified function favours algorithms that prefer high quality improvements over smaller ones, revealing similarities in the optimisation strategies of SSWM and Metropolis respectively with best-improvement (BILS) and first-improvement (FILS) local search. We conclude the paper with a comparison of the performance of these algorithms and a (1, λ ) RLS on the identified function. The algorithm favours the steepest gradient with a probability that increases with the size of its offspring population. The results confirm that BILS excels and that the (1, λ ) RLS is efficient only for large enough population sizes

Polyphenol profile and quantitative assessment of the flavonoid kaempferitrin in wild and cultivated Brazilian Amazonian Uncaria guianensis (Rubiaceae).

The Amazonian Rubiaceae species Uncaria guianensis (UG) is locally used as antiinflammatory, antitumor, antidiabetic, anti-ulcers, and others. The phenolic content of its leaves is characterized by the great predominance of the flavonoid kaempferol-3,7-O-(alpha)-L-dirhamnoside (kaempferitrin). The present study quantitatively evaluates the kaempferitrin content in the leaves and branches of cultivated and wild UG specimens collected in different locations of the Brazilian Amazon rainforest by employing high-performance liquid chromatography coupled to a diode array detector (HPLC-DAD). Besides, the understanding of the polyphenol profile performed by electron spray ionization is deepened by tandem mass spectrometry analysis (ESI-MS/MS), using a previously approached leaf UG extract, and the flavonoid quercetin-3,7-O-(alpha)-L-dirhamnoside was first isolated from UG. All samples showed quite similar qualitative polyphenol profiles. Kaempferitrin in UG ranged from 1.1 to 1.9 mg 100 mg-1 for dry leaves of adult wild plants, 0.3 to 0.7 mg 100 mg-1 for dry leaves of cultivated young plants and 0.00 to 0.04 mg 100 mg-1 for dry branches of adult wild plants. Besides suggesting the distribution of kaempferitrin in the species, these results reinforce this flavonol as a suitable chemical marker for UG leaves and the products derived from them.This work was supported by Fundacao Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ) (No. E-26/170.742/2002), and in part by the Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior - International Cooperation Program (CAPES-PrInt) (No. 88881.312008/2018-1). DP thanks the Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico (CNPq) for his fellowship. The authors thank Dr Peter May and N.G.O. Pro-Natura (Brazil) and Dr Jose A. Cabral from CBA-Amazonas for the kind donation of part of the plant material used. Thanks to Dr Helida B. N. Borges of the Central Herbarium of the UFMT, Brazil and Mr Jorginaldo W. de Oliveira of the Herbarium of the UFRJ, Brazil for their cooperation. The authors are grateful to Mr Ricardo Coelho for his support

Peletização da torta de mamona para reduzir a volatilização de NH3 e o potencial de alergenicidade

Este trabalho teve como objetivo peletizar o farelo de mamona para eliminar a poeira e revestir o pellets para reduzir a perda de nitrogênio por volatilização de amônia (NH3). Os resultados demonstram que a peletização da torta de mamona reduz a volatilização de amônia (NH3), em até 40%, durante os primeiros 10 dias após a aplicação do adubo no solo. Contudo, ao final do período de estudo, a perda acumulada total é superior ao obtido no material não peletizado; o uso de biomassa de gliricídia em pó, com ou sem aditivo, não reduz a volatilização de amônia; a peletização da torta de mamona elimina as partículas mais finas (pó), que entram facilmente em suspensão no ar, contribuindo para menores riscos à saúde humana com o manuseio do adubo

Edaphoclimatic and genetic influence on soil water availability factor for different sugarcane varieties.

Sugarcane is grown in all Brazilian states; however, water stress is the main limiting factor of crop productivity in most farming environments (FEN). Thus, the objective was to verify the water availability factor in the soil (factor f) between FEN and sugarcane varieties. The assay was conducted in the Central and Southern Regions of Goiano, in Red Latosol with distinct physical-water attributes among the FEN

Tolerance of sugarcane varieties to different levels of water depletion on soil.

Sugarcane is one of the most important crops for Brazilian agribusiness, despite water stress being one of the main limiting factors of growth and productivity. Thus, the objective was to verify if there is variation in the tolerance to water deficit among sugarcane varieties in the soil and climate conditions of Quirinópolis-GO (State of Goiás)

Post-Weaning Protein Malnutrition Increases Blood Pressure and Induces Endothelial Dysfunctions in Rats

Malnutrition during critical periods in early life may increase the subsequent risk of hypertension and metabolic diseases in adulthood, but the underlying mechanisms are still unclear. We aimed to evaluate the effects of post-weaning protein malnutrition on blood pressure and vascular reactivity in aortic rings (conductance artery) and isolated-perfused tail arteries (resistance artery) from control (fed with Labina®) and post-weaning protein malnutrition rats (offspring that received a diet with low protein content for three months). Systolic and diastolic blood pressure and heart rate increased in the post-weaning protein malnutrition rats. In the aortic rings, reactivity to phenylephrine (10−10–3.10−4 M) was similar in both groups. Endothelium removal or L-NAME (10−4 M) incubation increased the response to phenylephrine, but the L-NAME effect was greater in the aortic rings from the post-weaning protein malnutrition rats. The protein expression of the endothelial nitric oxide isoform increased in the aortic rings from the post-weaning protein malnutrition rats. Incubation with apocynin (0.3 mM) reduced the response to phenylephrine in both groups, but this effect was higher in the post-weaning protein malnutrition rats, suggesting an increase of superoxide anion release. In the tail artery of the post-weaning protein malnutrition rats, the vascular reactivity to phenylephrine (0.001–300 µg) and the relaxation to acetylcholine (10−10–10−3 M) were increased. Post-weaning protein malnutrition increases blood pressure and induces vascular dysfunction. Although the vascular reactivity in the aortic rings did not change, an increase in superoxide anion and nitric oxide was observed in the post-weaning protein malnutrition rats. However, in the resistance arteries, the increased vascular reactivity may be a potential mechanism underlying the increased blood pressure observed in this model