Analyses phosphoprotéomiques des cellules hématopoïétiques en réponse à une nouvelle classe d'analogues de sphingolipides ayant des propriétés anti-oncogéniques: travail de bachelor : diplôme 2016

La cinétique de phosphorylation des protéines dans des cellules hématopoïétiques est étudiée. Ces dernières sont traitées avec de la SH-BC-893 et de la C2-ceramide. La détection se fait par HPLC couplé à de la spectrométrie de masse

Peptide antiviral strategies as an alternative to treat lower respiratory viral infections

Lower respiratory infection caused by human pathogens such as influenza and respiratory syncytial virus (RSV) is a significant healthcare burden that must be addressed. The preferred options to achieve this goal are usually to develop vaccines for prophylaxis and to develop antiviral small molecules to treat infected patients with convenient, orally administrable drugs. However, developing a vaccine against RSV poses special challenges with the diminished immune system of infants and the elderly, and finding a universal flu vaccine is difficult because the product must target a large array of viral strains. On the other hand, the use of small-molecule antivirals can result in the emergence of resistant viruses as it has well-been reported for HIV, influenza, and hepatitis C virus (HCV). This paper reviews peptide antiviral strategies as an alternative to address these challenges. The discovery of influenza and RSV peptidic fusion inhibitors will be discussed and compared to small molecules in view of escape mutations. The importance of constraining peptides into macrocycles to improve both their inhibitory activity and pharmacological properties will be highlighted

Peptide Technologies at Energypolis

The new Energypolis campus brings together the skills of EPFL Valais-Wallis, HES-SO Valais-Wallis, and the Ark Foundation's services. Together these partners respond to today's major concerns in the domains of energy, health, and the environment cutting-edge technology. The spirit of this new campus is to foster innovation in these disciplines and emulate the creation of start-up companies. The HES-SO hosts the School of Engineering (HEI) at this campus, which includes the following degree programmes: Life Technologies, Systems Engineering and Energy and Environmental Engineering, as well as their corresponding applied research institutes. Peptide technologies belong to the many activities that are carrying out in the Institute of Life Technologies. The present review summarizes the peptide technologies that are currently under development, that is, the regioselective labeling of therapeutic antibodies for cancer imaging, the development of peptide antivirals and antimicrobials for the treatment of infectious diseases, targeting of drugs conjugated to peptidic scaffolds as well as engineering of biomaterials

Origenes, Homiliae, interpretibus Rufino et Hieronymo

Numérisation effectuée à partir d'un document de substitutionNumérisation effectuée à partir d'un document originalAppartient à l'ensemble documentaire : PlnskyFAAppartient à l'ensemble documentaire : PlnskyFA03Mécénat : Ce manuscrit a été numérisé dans le cadre de « France-Angleterre, 700-1200 : manuscrits médiévaux de la Bibliothèque nationale de France et de la British Library, un programme de la Fondation Polonsky ».F. 1ra-35rb : Origenes, In Genesim homiliae I-XVI, interprete Rufino ; inc. « In principio fecit Deus celum et terram. Quod est principium nisi Dominus noster et salvator … », expl. « … semper que Dei sunt cogitare, que Dei sunt querere, et Deus erit semper nobiscum, per Iesum Christum ... » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1920, vol. VI, p. 1-144).F. 35rb-38vb : Origenes (?), In Genesim homilia XVII, incompl. ; inc. « Incipit explanatio de bendictionibus patriarcharum. Omilia I. /f. 35va/ Sciendum primo est quod in singulis quibusque … », expl. « …filios patris sui quasi in morali loco posuimus » (P.G. 12, 253-262).F. 38vb-80rb : Origenes, In Exodum homiliae, interprete Rufino ; inc. « Videtur mihi unusquisque sermo scrip-/f. 39ra/-ture divine similis esse … », expl. « … proferre in tempore et aptare possimus et componere atque ex his adornare tabernaculum Deo Iacob, per Christum Dominum ... » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1920, vol. VI, p. 145-279).F. 80rb-150vb : Origenes, In Leviticum homiliae, interprete Rufino ; inc. « Sicut in novissimis diebus Verbum Dei ex Maria carne vestitum … », expl. « … iugum fidei et karitatis et spei ac totius sanctitatis imposuit. Ipsi gloria in eternum ... » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1920, vol. VI, p. 280-507).F. 150vb-151ra : Rufinus Aquileiensis, Prologus in Origenis homilias ; inc. « Incipit expositio in Iesu nave omelie numero viginti et sex. In divinis voluminibus refertus quod ad constructionem… », expl. « … eruditis deberet iniungi expetis ab indoctis » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1921, vol. VII, p. 286-287).F. 151ra-193rb : Origenes, In Iesu Nave librum homiliae, interprete Rufino ; inc. « Donavit Deus nomen quod est super omne nomen, Domino et salvatori nostro Iesu Christo. Est autem nomen quod est super … », expl. « … ecclesia Dei viventis et ubi est verus Israel in Christo Iesu Domino nostro, per quem ... Explicit omelia XXVI in Iesu Nave » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1921, vol. VII, p. 287-463).F. 193rb-206rb : Origenes, In Iudicum librum homiliae, interprete Rufino, avec lacune de VIII, 5 à IX, 2 ; inc. « Incipit de eo quod scriptum est in libro Iudicum : et servivit populus Domino omnibus diebus Iesu qui viderunt omnia opera Domini magna que fecit cum Israel. Lector quidem presentis lectionis … », expl. « …ut ab ipso victoriam consequi mereamur in Christo Iesu Domino nostro, cui est ... Explicit omelia octava Iudicum » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1921, vol. VII, p. 465-514, 519-522).F. 206rb-213rb : Origenes, In Regnorum librum homiliae ; inc. « Incipit nona in Regnorum, de Helcana et Fenenna et Anna et Samuel[e] et Heli et Ofni et Finees. Non tunc tantummodo Deus plantavit paradisum sed donec stat vita mortalium … », expl. « … ut in novitate vite ambulem in Christo Iesu Domino nostro cui est ... Explicit omelia prima in Regnorum » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, 1-25).F. 213rb-222vb : Origenes, In Canticum Canticorum homiliae, interprete Hieronymo ; inc. « Incipit cantica canticorum in exordium canticorum /f. 213va/ usque ad eum locum in quo ait : quoadusque rex veniat in recubito suo. Quomodo didicimus per Moysem esse quedam non solum sancta sanctorum … », expl. « …ut digni efficiamur sponsi sermone sapientia Iesu, cui est ... Finit in canticis canticorum omelia secunda » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, p. 27-60).F. 222vb-238rb : Origenes, In Isaiam homiliae, interprete Hieronymo ; inc. « Incipit in Ysaia propheta omelia prima. Quamdiu Ozias rex vixit videre non potuit visionem … », expl. « … a domino per singulos intellectus per singula opera et efficeris filius Dei in Christo Iesu, cui est ... Finierunt omelie in Esaya novem feliciter » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, p. 242-289, incompl. + P.L., XXIV, col. 935D-936D). F. 238rb-242vb : Origenes (?), In Ieremiam homiliae, I ; inc. « Incipit in Ieremia omelia prima. Deus ad benefaciendum promtus est et ad puniendum autem eos qui pena digni sunt dissimulatur … », expl. « … sed plantatio paradisi ubi templum Dei sit in Christo Iesu, cui est ... » (P.L. 25, 586-598).242vb-250rb : Origenes, In Ieremiam homiliae, II-III ; inc. « In eo quod scriptum est : fugite de medio Babylonis usque ad eum locum in quo continetur adproximavit usque ad celum iudicii et elevavit usque ad sidera. Quomodo corpus nostrum in aliquo terre loco consistit … », expl. « … mundatus Ierusalem transgredi civitate Dei in Christo Iesu, cui est ... Finit omelia tertia » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, p. 290-317).F. 250rb-278ra : Origenes (?), In Ieremiam homiliae, IV-XIV ; inc. « Incipit omelia quarta. Clamavit perdix congregavit que non peperit faciens divitias suas non cum iudicio. In medio dierum eius derelinquent eum. In novissimis eius erit insipiens thronus glorie exaltatus. /f. 250va/ Ab initio locus sanctificatio nostra sustentatio … », expl. « …fiet unus grex et unus pastor docens in commune populum suum magnificare omnipotentem Deum cum Christo Iesu, cui est ... Finit omelia XIIII » (P.L. 25, 615-692).F. 278ra-rb : Hieronymus Stridonius, Prologus in Origenis homilia ; inc. « Incipit omelia XV. Magnum est quidem amice quod postulas ut Origenem faciam latinum … », expl. « … ea lege, qua tibi sepe constitui, ut ego vocem prebeam, tu notarium » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, p. 318).F. 278rb-279vb : Origenes, In Ezechielem homilia I, interprete Hieronymo, 1-3 incompl. « Non omnis qui captivus est propter peccata sustinet captivitatem … », expl. « … quis est ignis iste sic sapiens ut custodiat aurum meum aut argen/ » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, p. 318-324).Le ms. semble originaire de l’abbaye de Saint-Denis (Île de France) et produit au milieu du XIIe siècle, sous l’abbatiat de Suger, par plusieurs copistes. Deux cotes de cette abbaye sont encore lisibles au f. 1r : « OR + » (XIIIe siècle) ; « XIIII. IIIC. IIIIXX. XIIII » (XVe siècle). Cf. Delisle, Cab. des mss., I, p. 201 et 203. D’après la notice de Lauer (Cat. mss latins, Paris, 1940, vol. II, p. 97), le ms. passa au Collège de Clermont avant d’entrer dans la collection de Colbert. Néanmoins, aucune trace de ce passage n'est conservée dans le ms., ni dans l’inventaire des manuscrits ayant appartenu audit collège et entrés ensuite dans la collection de Jean-Baptiste Colbert par l’intermédiaire d’Etienne Baluze. Comme l’a montré Nebbiai (La bibliothèque de l’abbaye de Saint-Denis en France…, p. 130-134), le ms. faisait partie de ceux rentrés dans la collection de l’humaniste Nicolas Le Fèvre (1544-1612), précepteur de Louis XIII, suite aux premiers pillages subis par l’abbaye de Saint-Denis et ayant eu lieu au milieu du XVIe siècle. Il est possible que Nicolas Le Fèvre lui-même ait ajouté le titre figurant dans la marge supérieure du f. 1r : « Origenis homiliae » et quelques annotations marginales comparant le texte du ms. aux éditions imprimées.Après la mort de Le Fèvre, le ms. rentra dans la collection du président Jacques-Auguste de Thou (1553-1617). Son ex-libris aux f. 1r et 279v : « Jac. Aug. Thuani ». Dans le catalogue de sa bibliothèque rédigé par Dupuy (cf. ms. BnF, Dupuy 653, f. 4v), le manuscrit est enregistré : « 25. Origenis homiliae lat. fol. ».Le ms rentra ensuite dans la bibliothèque de Jean-Baptiste Colbert (1619-1683), avec les autres manuscrits du président de Thou acquis par Baluze en 1679. Sa cote au f. 1r : « Cod. Colb. 799 ».Enfin, le ms. rentra dans la Bibliothèque royale avec d’autres manuscrits de la collection Colbert en 1732, en recevant la cote « Regius 3731.7 » (f. 1r).Le ms. a été restauré en 1955 (cf. l’annotation au f. 2r).Lieu de copie : France (Sens ou Saint-Denis

Origenes, Homiliae in Vetus Testamentum, interpretibus Hieronymo et Rufino.

Numérisation effectuée à partir d'un document de substitution.Numérisation effectuée à partir d'un document originalAppartient à l'ensemble documentaire : PlnskyFAAppartient à l'ensemble documentaire : PlnskyFA03Mécénat : Ce manuscrit a été numérisé dans le cadre de « France-Angleterre, 700-1200 : manuscrits médiévaux de la Bibliothèque nationale de France et de la British Library, un programme de la Fondation Polonsky ».F. 1va, 1vb : Recettes diverses ; inc. « Curatio vesice. … Ad scabiem vel impetiginem … Probatio sanguinis … Ad vocem emendandam … ». F. 1va-vb : Gualo, Versus contra symoniachos ; « Sacrilegis monachis emptoribus ecclesiarum / composui satiram carmen per secula clarum / quam quia vir magnus corrobrat Hugo Diensis / noster amicus eam legat Otto Suessionensis … ».F. 1vb : De Rome porticu ; inc. « Porticus est Rome qua dum spatiando fero me … », expl. « … prospera nulla dies sit ».F. 2ra-rb : Liber miraculorum sancti Quintini, c. 17 (excerptum) ; inc. « /suffragiis in porticum prefati templi deportaretur … », expl. « ... deauratis involutum honorifice sepelivit » (AA.SS. Oct. XIII, p. 801-812, passim).F. 2rb : Prognostica ; inc. « Kalenda ianuarii si fuerint in prima feria, hiemps bonus erit … », expl. « … homines egrotabuntur ». F. 3ra-va : Capitula Origenis homiliarum in Genesi, Exodo, Levitico, in libro Iesu Nave, in Iudicum libro, in Isaia, in Hieremia. F. 3vb-40rb : Origenes, In Genesim homiliae I-XVI, interprete Rufino ; inc. « Quod est principium nisi Dominus noster et salvator omnium … », expl. « … semper que Dei sunt cogitare, que Dei sunt querere, et Deus erit semper nobiscum, per Iesum Christum … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1920, vol. VI, p. 1-144). F. 40rb-44ra : Origenes (?), In Genesim homilia XVII, incomplet ; inc. « Incipit explanatio de bendictionibus patriarcharum. Sciendum primo est quod in singulis quibusque locis … », expl. « … filios patris sui quasi in morali loco posuimus » (P.G., XII, col. 253-262). F. 44ra-81ra : Origenes, In Exodum homiliae, interprete Rufino ; inc. « Videtur mihi unusquisque sermo scripture divine similis esse … », expl. « … componere atque ex his adornare tabernaculum Deo Iacob, per Christum Iesum … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1920, vol. VI, p. 145-279). F. 81rb-138rb : Origenes, In Leviticum homiliae, interprete Rufino ; inc. « Sicut in novissimis diebus verbum Dei ex Maria ... », expl. « ... iugum fidei et caritatis et spei ac totius sanctitatis imposuit, ipsi gloria … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1920, vol. VI, p. 280-507). F. 138va-vb : Rufinus Aquileiensis, Prologus in Origenis homilias ; inc. « (rubrique au f. 138rb : Incipit expositio in Iesu Nave homelie numero viginti et sex) In divinis voluminibus refertur quod ad constructionem tabernaculi ... », expl. « ... quia opus quod eruditis deberet iniungi expetis ab indoctis » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1921, vol. VII, p. 286-287.). F. 138vb-180rb : Origenes, In Iesu Nave librum homiliae, interprete Rufino ; inc. « Donavit Deus nomen quod est super omne nomen, Domino et salvatori nostro Iesu Christo. Est autem nomen quod est super … », expl. « … ecclesia Dei viventis et ubi est verus Israel in Christo Iesu Domino nostro, per quem … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1921, vol. VII, p. 287-463). F. 180rb-194va : Origenes, In Iudicum librum homiliae, interprete Rufino ; inc. « Lector quidem presentis lectionis … », expl. « … ut ab ipso victoriam consequi mereamur in Christo Iesu Domino nostro, cui est … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1921, vol. VII, p. 465-514, 519-522). F. 194va-201va : Origenes, In Regnorum librum homilia ; inc. « Non tunc tantummodo Deus plantavit paradisum sed donec stat vita mortalium … », expl. « … ut in novitate vite ambulem in Christo Iesu Domino nostro cui … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, 1-25). F. 201va-210ra : Origenes, In Canticum Canticorum homiliae, interprete Hieronymo ; inc. « Quomodo dicimus per Moysen esse quedam non solum sancta ... », expl. « … ut digni efficiamur sponsi sermone sapientia Iesu, cui est … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, p. 27-60). F. 210ra-223va : Origenes, In Isaiam homiliae, interprete Hieronymo ; inc. « Quamdiu Ozias rex vixit videre non potuit visionem … », expl. « … a domino per singulos intellectus per singula opera et efficeris filius Dei in Christo Iesu, cui … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, p. 242-289, incompl. + P.L., XXIV, col. 935D-936D). F. 223va-227rb : Origenes (?), In Ieremiam homilia I ; inc. « Deus qui ad benefaciendum promtus est ad puniendos autem eos qui pena digni sunt dissimulator … », expl. « … sed plantatio paradisi ubi templum Dei sit in Christo Iesu, cui honor … » (P.L., XXV, col. 586-598). F. 227va-232vb : Origenes, In Ieremiam homiliae II-III ; inc. « Quomodo corpus nostrum in aliquot terre loco consistit … », expl. « … mundatus Ierusalem transgredi civitate Dei in Christo Iesu, cui est … » (Origenes Werke, éd. W. A. Baehrens, Leipzig, 1925, vol. VIII, p. 290-317). F. 232vb-252vb : Origenes (?), In Ieremiam homiliae IV-XIV ; inc. « Clamavit perdix congregavit que non peperit faciens divinitas suas non cum iuditio. In medio dierum eius derelinquet eum, et in novissimis suis erit insipiens thronus glorie exaltatus. Ab initio locus sanctificatio nostra sustentatio … », expl. « … fiet unus grex et unus pastor docens in commune populum suum magnificare omnipotentem Deum cum Christo Iesu, cui est … » (P.L., XXV, col. 615-692).Le ms. a été copié par Edmundus, moine de l’abbaye de Saint-Germain-des-Prés, où il resta jusqu’à la Révolution. Au f. 252v, anathème : « Quicumque librum istum defraudaverit vel scienter male tractaverit vel literas deleverit per malitiam suam sit anathema maranatha, idest dampnatus et a consortio Dei separatus donec Dominus redeat ad iudicium. Amen ». Au f. 1v, ex-libris (XVIIIe s.) : « Sancti Germani a Pratis ». Il entra ensuite à la Bibliothèque nationale entre 1795 et 1796, avec d’autres manuscrits de Saint-Germain.Lieu de copie : France (Saint-Germain-des-Prés

Targeting the RSV N0/P complex with constrained alpha-helical peptides

Each year, the infection of infants with RSV is the cause of a large number of hospitalizations and deathsworldwide. The current standard of care, Synagis, is used as a preventive medicine for premature children only, and there is no drug available to treat the patients who are suffering from this infection. Targeting the polymerase replication complex is a strategy that has been used successfully to develop drugs against other viruses such as HIV, HCV and HBV. In this project, we wish to inhibit the replication complex by disrupting the N0/P interaction. N0 is the nucleoprotein species that is bound as a complex to the phosphoprotein prior to nucleic acid encapsidation. Recently, the N-terminal region (1-29) of the RSV P protein has been identified as sufficient to bind to N0, and the importance of each P residues has been assessed through alanine scanning mutagenesis experiments. Additionally, NMR studies have provided evidence that P (13-25) has a propensity to fold into an alpha helix in solution. We used these data to design stabilized alpha-helical peptides, with the aim to screen for dominant negative inhibitors of the RSV N0/P interaction. The peptideswere stabilized as macrocyclic peptides using the stapled peptide technology, because this technique can improve their potency, proteolytic stability and cellular permeability. The putative P alpha-helix was plotted onto an alpha-helical wheel, and the amino-acids located on the non-interacting site of the helix were selected for modification with the non-natural amino-acids required for stapling. We will present the results of this stapled peptide scan by reporting i) the conformational analysis by circular dichroism, ii) the biological activity in a novel N0-P fluorescence polarization assay, a viral replication assay and a cytotoxicity assay and iii) the in vivo proof of concept by intranasal administration of a hit peptide, HEVS 124, to BALB/c mice inoculated with a Luc-encoding RSV