Informativeness of Auditory Stimuli Does Not Affect EEG Signal Diversity

Brain signal diversity constitutes a robust neuronal marker of the global states of consciousness. It has been demonstrated that, in comparison to the resting wakefulness, signal diversity is lower during unconscious states, and higher during psychedelic states. A plausible interpretation of these findings is that the neuronal diversity corresponds to the diversity of subjective conscious experiences. Therefore, in the present study we varied an information rate processed by the subjects and hypothesized that greater information rate will be related to richer and more differentiated phenomenology and, consequently, to greater signal diversity. To test this hypothesis speech recordings (excerpts from an audio-book) were presented to subjects at five different speeds (65, 83, 100, 117, and 135% of the original speed). By increasing or decreasing speed of the recordings we were able to, respectively, increase or decrease the presented information rate. We also included a backward (unintelligible) speech presentation and a resting-state condition (no auditory stimulation). We tested 19 healthy subjects and analyzed the recorded EEG signal (64 channels) in terms of Lempel-Ziv diversity (LZs). We report the following findings. First, our main hypothesis was not confirmed, as Bayes Factor indicates evidence for no effect when comparing LZs among five presentation speeds. Second, we found that LZs during the resting-state was greater than during processing of both meaningful and unintelligible speech. Third, an additional analysis uncovered a gradual decrease of diversity over the time-course of the experiment, which might reflect a decrease in vigilance. We thus speculate that higher signal diversity during the unconstrained resting-state might be due to a greater variety of experiences, involving spontaneous attention switching and mind wandering

Analysis of treatment results in primary germ cell tumours with mediastinal location: own experience

Wstęp: Pierwotne nowotwory z komórek rozrodczych o lokalizacji śródpiersiowej stanowią 1–6% guzów śródpiersia oraz 2–5% wszystkich nowotworów z komórek rozrodczych występujących u dorosłych. Rozpoznawane są najczęściej w 3. dekadzie życia, w 90% u mężczyzn. Najczęstsze objawy to: duszność, bóle w klatce piersiowej, kaszel, stany podgorączkowe i utrata masy ciała. Celem pracy była ocena wyników leczenia pierwotnych nowotworów z komórek rozrodczych o lokalizacji śródpiersiowej i przegląd piśmiennictwa poświęconego tej tematyce.Materiał i metody: W okresie od 1999 do 2009 roku w Klinice Nowotworów Płuca i Klatki Piersiowej Centrum Onkologii-Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie w Warszawie leczono 5 chorych z nowotworem z komórek rozrodczych o pierwotnej lokalizacji śródpiersiowej, 4 mężczyzn i 1 kobietę. Średnia wieku wyniosła 27,8 roku (zakres 23–30).Wyniki: U wszystkich chorych zastosowano chemioterapię według schematu BEP. U wszystkich chorych uzyskano obiektywną odpowiedź na leczenie. Dwóch chorych zmarło z powodu progresji choroby pomimo stosowania chemioterapii II i III linii. Trzech chorych nadal pozostaje w obserwacji. Mediana czasu przeżycia wyniosła 55,8 miesiąca (zakres 8,0–120,0).Wnioski: Pierwotne nowotwory z komórek rozrodczych o lokalizacji śródpiersiowej są nowotworami o rokowaniu gorszym niż w lokalizacji gonadalnej. Na podstawie obserwacji własnych i przeglądu piśmiennictwa można stwierdzić, że wyniki leczenia pierwotnych nienasieniaków w lokalizacji śródpiersiowej pozostają niezadowalające. Szczególnie niekorzystne są wyniki leczenia chorych, u których dochodzi do wczesnej wznowy lub progresji w trakcie chemioterapii I linii. Określenie nowych standardów postępowania w nowotworach opornych na cisplatynę wymaga dalszych badań oceniających skuteczność cytostatyków nowych generacji.Introduction: Primary germ cell tumours with mediastinal location comprise 1–6% of mediastinal tumours and 2–5% of all germ cell tumours occurring in adults. They are identified mostly in the 3rd decade of life, in 90% of cases in men. The most common symptoms are dyspnea, chest pain, cough, fever and weight loss. The aim of the present study was the analysis of our own results of treatment of primary germ cell tumours with mediastinal location, and a review of the literature concerning this subject.Material and methods: Five patients (4 males, 1 female) median age 27.8 years (range 23–30 years) treated in the period from 1999 to 2009 in Maria Sklodowska-Curie Memorial Cancer Centre and Institute of Oncology, Department of Lung Cancer and Chest Tumours in Warsaw, due to germinal tumours with primary mediastinal location, entered the study.Results: All patients received chemotherapy according to the BEP regimen. All patients achieved an objective response to treatment. Two patients died due to disease progression in spite of II- and III-line treatment. Three patients are still in follow-up. The median survival time was 55.8 months (range 8.0–120.0 months).Conclusions: Primary mediastinal germ cell tumours have worse prognosis than do those with gonadal location. Based on our observations and review of the literature, it can be concluded that the results of treatment of non-seminoma type germ cell tumours with primary mediastinal location remain poor. Patients who develop early recurrence or progression during first-line chemotherapy are particularly at risk of unfavourable outcome. Identification of new standards of treatment in tumours resistant to cisplatin require further studies evaluating the effectiveness of new generation cytostatic drugs

The molecular basis of conformational instability of the ecdysone receptor DNA binding domain studied by in silico and in vitro experiments

The heterodimer of the ecdysone receptor (EcR) and ultraspiracle (Usp), members of the nuclear receptors superfamily, regulates gene expression associated with molting and metamorphosis in insects. The DNA binding domains (DBDs) of the Usp and EcR play an important role in their DNA-dependent heterodimerization. Analysis of the crystal structure of the UspDBD/EcRDBD heterocomplex from Drosophila melanogaster on the hsp27 gene response element, suggested an appreciable similarity between both DBDs. However, the chemical denaturation experiments showed a categorically lower stability for the EcRDBD in contrast to the UspDBD. The aim of our study was an elucidation of the molecular basis of this intriguing instability. Toward this end, we mapped the EcRDBD amino acid sequence positions which have an impact on the stability of the EcRDBD. The computational protein design and in vitro analyses of the EcRDBD mutants indicate that non-conserved residues within the α-helix 2, forming the EcRDBD hydrophobic core, represent a specific structural element that contributes to instability. In particular, the L58 appears to be a key residue which differentiates the hydrophobic cores of UspDBD and EcRDBD and is the main reason for the low stability of the EcRDBD. Our results might serve as a benchmark for further studies of the intricate nature of the EcR molecule

Intrinsically disordered N-terminal domain of the Helicoverpa armigera Ultraspiracle stabilizes the dimeric form via a scorpion-like structure

Nuclear receptors (NRs) are a family of ligand-dependent transcription factors activated by lipophilic compounds. NRs share a common structure comprising three domains: a variable N-terminal domain (NTD), a highly conserved globular DNA-binding domain and a ligand-binding domain. There are numerous papers describing the molecular details of the latter two globular domains. However, very little is known about the structure-function relationship of the NTD, especially as an intrinsically disordered fragment of NRs that may influence the molecular properties and, in turn, the function of globular domains. Here, we investigated whether and how an intrinsically disordered NTD consisting of 58 amino acid residues affects the functions of the globular domains of the Ultraspiracle protein from Helicoverpa armigera (HaUsp). The role of the NTD was examined for two well-known and easily testable NR functions, i.e., interactions with specific DNA sequences and dimerization. Electrophoretic mobility shift assays showed that the intrinsically disordered NTD influences the interaction of HaUsp with specific DNA sequences, apparently by destabilization of HaUsp-DNA complexes. On the other hand, multi-angle light scattering and sedimentation velocity analytical ultracentrifugation revealed that the NTD acts as a structural element that stabilizes HaUsp homodimers. Molecular models based on small-angle X-ray scattering indicate that the intrinsically disordered NTD may exert its effects on the tested HaUsp functions by forming an unexpected scorpion-like structure, in which the NTD bends towards the ligand-binding domain in each subunit of the HaUsp homodimer. This structure may be crucial for specific NTD-dependent regulation of the functions of globular domains in NR

Security theory and practice: Stablisation and reconstrution of post-conlict areas in the 21st century

Wprowadzenie: Cieszymy się, że możemy skierować do Państwa rąk kolejny numer periodyku „Bezpieczeństwo.Teoria i Praktyka”, tym razem poświęcony problematyce stabilizacji i odbudowy obszarów pokonfliktowych w XXI w. Podjęty temat jest niezwykle ważny, ponieważ żyjemy w czasach nieuporządkowanego świata, w którym liczba konfliktów zbrojnych o różnej skali i charakterze oraz wynikające z nich konsekwencje wpływają destrukcyjnie na ład międzynarodowy.Umiędzynarodowienie konfliktów wewnętrznych pełni często funkcję instrumentalną w grze, której stawką jest zajęcie przez dane państwo właściwego – z punktu widzenia jego decydentów – miejsca w nowym systemie ról międzynarodowych. Przykładem tego jest wojna domowa w Syrii, którą Jerzy Zdanowski w artykule rozpoczynającym tom traktuje jako „wojnę zastępczą”. Krótko przedstawia także istotę rekonstrukcji obszarów pokonfliktowych, czym jako badacz rozwija myśli pułkownika Piotra Gąstała, wieloletniego żołnierza i dowódcy Jednostki Wojskowej GROM, który podczas swojej służby przebywał w niejednym państwie dotkniętym konfliktem zbrojnym i wojną oraz ich skutkami. W udzielonym wywiadzie odnosi się on do zagadnienia stabilizacji ze swojej perspektywy – praktyka, któremu nie raz, na terenie prowadzenia działań wojskowych, przyszło mierzyć się z tym wszystkim, co kryje się pod tym pojęciem. Należy przy tym uwzględnić, że jako żołnierz jednostki specjalnej wykonywał tam specyficzne działania. O tym, jak podchodzą do nich nie tylko praktycy, ale i badacze, pisze Piotr Orłowski, analizując znaczenie sił specjalnych jako narzędzia stabilizacji na obszarach pokonfliktowych