Associations of myostatin gene polymorphisms with performance and mortality traits in broiler chickens

Myostatin is a negative regulator of skeletal muscle growth. We evaluated effects of myostatin polymorphisms in three elite commercial broiler chicken lines on mortality, growth, feed conversion efficiency, ultrasound breast depth, breast percentage, eviscerated carcass weight, leg defects, blood oxygen level, and hen antibody titer to infectious bursal disease virus vaccine. Progeny mean data adjusted for fixed and mate effects and DNA from 100 sires per line were used. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the myostatin gene segregating in these lines were identified by designing specific primers, amplifying individual DNA in each line by polymerase chain reaction, cloning, sequencing and aligning the corresponding products. Individual sires were genotyped for five identified SNPs which contributed to eight haplotypes. Frequencies of SNP alleles and haplotypes differed between lines. Using the allele substitution effect model, the myostatin SNPs were found to have significant (P < 0.031) associations with growth, mortality, blood oxygen and hen antibody titer to infectious bursal disease virus vaccine, although the associations were not often consistent across lines. These results suggest that the myostatin gene has pleiotropic effects on broiler performance

Diet formulation on swine performance, carcass quality, production and composition of swine manure

A eficiência de utilização dos alimentos pelos animais pode ser influenciada pela maneira como as informações de composição e digestibilidade dos nutrientes são utilizadas. A formulação de rações para suínos baseada no conceito de proteína bruta pode apresentar níveis de aminoácidos desbalanceados ocasionando a desaminação dos aminoácidos em excesso. O nitrogênio disponível pode ser utilizado na síntese de outros compostos ou simplesmente excretado, o que significa perda de eficiência no processo e aumento da capacidade poluente dos dejetos produzidos. Assim, foram realizados dois experimentos para estudar os efeitos do uso de formulação de dietas para suínos em crescimento e terminação. As dietas foram: 1) formulação baseada nas exigências de proteína bruta e aminoácidos totais do NRC; 2) formulação com níveis de lisina (Lys) total 15% superiores ao da dieta 1; 3) formulação com teor de proteína semelhante ao da dieta 2 mas atendendo a proteína ideal; 4) formulação atendendo a proteína ideal proposta por Baker (1997), com 15% mais Lys digestível mantendo-se o mesmo teor de proteína. Os animais que receberam as dietas 2 e 4 apresentaram maior ganho de peso diário. Para espessura de toucinho, profundidade de lombo e porcentagem de carne não houve efeito de tratamento. As dietas com níveis de proteína mais elevados proporcionaram maior excreção de fezes. Os animais que receberam as dietas formuladas com 15% mais Lys (dietas 2 e 4) apresentaram menor excreção de nitrogênio nas fezes, sem afetar a excreção deste na urina.The efficiency with which animals utilize each ingredient in the diet is related to the way by which information on nutrient composition and digestibility is used. Swine feed formulation based on crude protein may result in an imbalance of aminoacids, which in turn results in the deamination of aminoacids. Nitrogen may be used in the synthesis of new compounds or just excreted through urine, becoming a loss in efficiency and increasing pollution potential. Two studies were carried out to evaluate the effects of types of feed formulation in growing and finishing swine. Growing and finishing diets were: 1) Formulation based on crude protein and total aminoacids, according to NRC; 2) Total lysine (Lys) levels 15% above those of diet 1; 3) Protein levels similar to diet 2, but meeting the ideal protein level; 4) Similar to diet 3 with 15% more digestible Lys. Swine fed diets 2 and 4 showed higher daily weight gain. Backfat, longissimus dorsi area and lean tissue were not affected by treatments. Animals fed diets with higher protein levels showed higher fecal excretion. Animals fed diets with 15% more Lys (diets 2 and 4) showed lower fecal nitrogen excretion without any effect on the excretion of this element through urine

Investigação do gene da Leptina em linhagens de aves de corte e postura

A leptina, hormônio polipeptídico secretado principalmente pelo tecido adiposo, tem um papel importante na regulação da ingestão de alimentos, metabolismo de energia e reprodução em mamíferos. A função do gene da leptina tem sido intensamente estudada em mamíferos, porém, em aves, ainda é pouco conhecida. O cDNA deste gene foi identificado em galinhas, e a alta expressão hepática e os níveis de leptina no plasma foram associados à alta deposição de gordura presente em linhagens de aves selecionadas. Entretanto, permanecem controvérsias sobre o gene da leptina em galinhas, pois diversos autores não conseguiram amplificar este gene a partir de DNA genômico ou cDNA. Tendo em vista essas controvérsias e a importância desse gene, o presente trabalho teve como objetivo amplificar o gene da leptina numa população de aves desenvolvida pela Embrapa Suínos e Aves (Brasil). Primeiramente, as seqüências do gene da leptina de Gallus gallus (GenBank AF012727) e Mus musculus (GenBank NM_008493) foram alinhadas com o objetivo de desenhar os primers em regiões conservadas nas duas espécies, pois como descrito na literatura, esses genes apresentam 94,6% de similaridade. Para os quatro pares de primers desenhados, foram realizados diversos testes de amplificação utilizando DNA e cDNA, mas não foi obtido um fragmento único ou a banda esperada. A seqüência do gene da leptina depositada no GenBank não representa a seqüência do gene da leptina de galinhas.Leptin, a polypeptide hormone secreted mainly by adipose tissue, plays an important role in feed intake regulation, energy metabolism and reproduction in several species. Its function has been intensively studied in mammals; however, in birds limited information is available. The cDNA sequence for chicken leptin has been reported, and high hepatic expression levels of leptin were associated with fat deposition in selected bird lines. However, controversies still remain concerning to the chicken leptin gene and several authors failed to amplify this gene from genomic DNA or cDNA. In view of this controversy and the importance of this gene, the present study aimed to investigate the leptin gene in a population of birds developed by Embrapa Swine and Poultry Research Center (Brazil). First of all, the sequences of Gallus gallus leptin gene (GenBank AF012727) and Mus musculus (GenBank NM_008493) were aligned with the objective of designing primers in conserved regions among the two species, since 94.6% of similarity is described in the literature in those species. For all four pairs of primers designed, several amplification tests were performed with both DNA and cDNA, but neither unique fragment nor expected band size was ever achieved. The leptin sequence in GenBank does not represent the sequence of the chicken leptin gene

Investigação do gene da Leptina em linhagens de aves de corte e postura

A leptina, hormônio polipeptídico secretado principalmente pelo tecido adiposo, tem um papel importante na regulação da ingestão de alimentos, metabolismo de energia e reprodução em mamíferos. A função do gene da leptina tem sido intensamente estudada em mamíferos, porém, em aves, ainda é pouco conhecida. O cDNA deste gene foi identificado em galinhas, e a alta expressão hepática e os níveis de leptina no plasma foram associados à alta deposição de gordura presente em linhagens de aves selecionadas. Entretanto, permanecem controvérsias sobre o gene da leptina em galinhas, pois diversos autores não conseguiram amplificar este gene a partir de DNA genômico ou cDNA. Tendo em vista essas controvérsias e a importância desse gene, o presente trabalho teve como objetivo amplificar o gene da leptina numa população de aves desenvolvida pela Embrapa Suínos e Aves (Brasil). Primeiramente, as seqüências do gene da leptina de Gallus gallus (GenBank AF012727) e Mus musculus (GenBank NM_008493) foram alinhadas com o objetivo de desenhar os primers em regiões conservadas nas duas espécies, pois como descrito na literatura, esses genes apresentam 94,6% de similaridade. Para os quatro pares de primers desenhados, foram realizados diversos testes de amplificação utilizando DNA e cDNA, mas não foi obtido um fragmento único ou a banda esperada. A seqüência do gene da leptina depositada no GenBank não representa a seqüência do gene da leptina de galinhas.Leptin, a polypeptide hormone secreted mainly by adipose tissue, plays an important role in feed intake regulation, energy metabolism and reproduction in several species. Its function has been intensively studied in mammals; however, in birds limited information is available. The cDNA sequence for chicken leptin has been reported, and high hepatic expression levels of leptin were associated with fat deposition in selected bird lines. However, controversies still remain concerning to the chicken leptin gene and several authors failed to amplify this gene from genomic DNA or cDNA. In view of this controversy and the importance of this gene, the present study aimed to investigate the leptin gene in a population of birds developed by Embrapa Swine and Poultry Research Center (Brazil). First of all, the sequences of Gallus gallus leptin gene (GenBank AF012727) and Mus musculus (GenBank NM_008493) were aligned with the objective of designing primers in conserved regions among the two species, since 94.6% of similarity is described in the literature in those species. For all four pairs of primers designed, several amplification tests were performed with both DNA and cDNA, but neither unique fragment nor expected band size was ever achieved. The leptin sequence in GenBank does not represent the sequence of the chicken leptin gene

Seleção estratégica de marcadores para detecção de locos para características quantitativas em aves

ABSTRACT: Selective genotyping for a certain trait in individuals with extreme phenotypes contributes sufficient information to determine linkage between molecular markers and quantitative trait loci (QTL). In this experiment an F2 population, developed by crossing males from a broiler line with females from a layer line, was employed to detect QTL on chromosomes 3 and 5. Twenty-eight performance and carcass traits were measured in F2 offspring, and phenotypic correlations between traits were calculated. Body weight at 42 days (BW42) presented the greatest positive correlations with most other traits, with correlation between body weights at 35 and 41 days, weight gain between birth and 35, 41 and 42 days, as well as weights of carcass and some body parts superior to 0.8. One hundred-and-seventy F2 offspring, representing the top (4.5%) and the bottom (4.5%) of a normal distribution curve of BW42, were selected with equal proportions of males and females, and within dam family. Samples were genotyped for 19 informative markers on chromosome 3, and 11 markers on chromosome 5. Marker allelic frequencies of phenotypic groups with high and low BW42 were compared with a chi-square test. Four regions on chromosome 3 and three regions on chromosome 5 had markers that were suggestively associated with BW42 (P < 0.10), confirming and expanding previous studies. ___________________________________________________________________________________ RESUMOA genotipagem seletiva de indivíduos com fenótipos extremos para uma determinada característica contribui com informação suficiente para determinar a ligação entre marcadores moleculares e locos para características quantitativas (QTL). Neste estudo uma população F2, formada a partir do cruzamento de uma linha parental de aves para corte com uma linha de postura foi empregada para obtenção de medidas fenotípicas e genotipagem por marcadores microssatélites, posicionados nos cromossomos 3 e 5. Foram medidas 28 características de desempenho e carcaça e determinada a correlação fenotípica entre elas. A característica peso vivo aos 42 dias (BW42) apresentou maior correlação positiva com a maioria das características, com correlação entre pesos vivos aos 35, 41 dias, ganhos de peso do nascimento aos 35, 41 e 42 dias, e pesos de carcaça e partes superiores a 0,8. Cento e setenta aves F2, representando 4,5% das aves mais leves e 4,5% das mais pesadas para BW42 foram selecionadas dentro de famílias, na mesma proporção de machos e fêmeas e genotipadas para 19 marcadores informativos no cromossomo 3 e 11 no cromossomo 5. As freqüências alélicas dos marcadores nos grupos fenotípicos de alto e baixo BW42 foram comparadas empregando teste de qui-quadrado. Foram identificadas quatro regiões no cromossomo 3 e três regiões no cromossomo 5 sugestivamente ligadas a QTL para BW42 (P < 0,10), confirmando e expandindo estudos anteriores de mapeamento de QTL em aves

Mapas de ligação dos cromossomos 6, 7, 8, 11 e 13 de uma população brasileira de galinha

A linkage map is essential not only for quantitative trait loci (QTL) mapping, but also for the organization and location of genes along the chromosomes. The present study is part of a project whose major objective is, besides from construction the linkage maps, the whole genome scan for mapping QTL for performance traits in the Brazilian experimental chicken population. Linkage maps of chicken chromosomes 6 to 8, 11 and 13 were constructed based on this population. The population was developed from two generations of crossbreeding between a broiler and a layer line. Fifty-one microsatellite markers were tested, from which 28 were informative: 4, 8, 7, 4 and 5 for chromosomes 6, 7, 8, 11 and 13, respectively. A SNP located in the leptin receptor gene was included for chromosome 8. Ten parental, 8 F1 and 459 F2 chickens from five full-sib families were genotyped with these markers. The number of total informative meioses per locus varied from 232 to 862, and the number of phase-known informative meioses from 0 to 764. Marker orders in the chromosomes coincided with those of the chicken consensus map, except for markers ADL0147 and MCW0213, on chromosome 13, which were inverted. The reduced number of phase-known informative meioses for ADL0147 (150) may be pointed out as a possible cause for this inversion, apart from the relative short distance between the two markers involved in the inversion (10.5 cM).O mapa de ligação além de ser fundamental no mapeamento de locos de características quantitativas (QTLs) é importante na organização e localização de genes distribuídos ao longo dos cromossomos. O presente estudo é parte de um trabalho cujo objetivo maior, é a análise de mapeamento de QTLs para características de desempenho no genoma de uma população experimental desenvolvida no Brasil. Com base nesta população foram construídos os mapas de ligação dos cromossomos 6 a 8, 11 e 13 da galinha. A população foi desenvolvida a partir de duas gerações de cruzamentos entre uma linhagem de corte e uma de postura. Foram testados 51 marcadores microssatélites, dos quais 28 foram informativos: 4, 8, 7, 4 e 5 dos cromossomos 6, 7, 8, 11 e 13, respectivamente. Um SNP localizado no gene do receptor da leptina foi incluído no cromossomo 8. Os 10 parentais, 8 F1 e um total de 459 aves F2 de cinco famílias de irmãos completos foram genotipados com estes marcadores. O número de meioses informativas totais por loco variou de 232 a 862 e o de meioses informativas de fase conhecida de 0 a 764. A ordem dos marcadores nos cromossomos coincidiu com a do mapa consenso da galinha, com exceção dos marcadores ADL0147 e MCW0213 do cromossomo 13 que tiveram sua ordem invertida. O número reduzido de meioses informativas de fase conhecida para o marcador ADL0147 (150) pode ser apontado como uma possível causa para a inversão, além da relativa proximidade entre os dois marcadores envolvidos na inversão (10,5 cM)

Genetic parameters for body weight, carcass chemical composition and yield in a broiler-layer cross developed for QTL mapping

The objective of this study was to estimate genetic and phenotypic correlations of body weight at 6 weeks of age (BW6), as well as final carcass yield, and moisture, protein, fat and ash contents, using data from 3,422 F2 chickens originated from reciprocal cross between a broiler and a layer line. Variance components were estimated by the REML method, using animal models for evaluating random additive genetic and fixed contemporary group (sex, hatch and genetic group) effects. The heritability estimates (h2) for BW6, carcass yield and percentage of carcass moisture were 0.31 ± 0.07, 0.20 ± 0.05 and 0.33 ± 0.07, respectively. The h2 for the percentages of protein, fat and ash on a dry matter basis were 0.48 ± 0.09, 0.55 ± 0.10 and 0.36 ± 0.08, respectively. BW6 had a positive genetic correlation with fat percentage in the carcass, but a negative one with protein and ash contents. Carcass yield, thus, appears to have only low genetic association with carcass composition traits. The genetic correlations observed between traits, measured on a dry matter basis, indicated that selection for carcass protein content may favor higher ash content and a lower percentage of carcass fat

Mapping QTLS on chicken chromosome 1 affecting performance and carcass traits.

Uma população experimental F2 foi desenvolvida a partir do cruzamento de uma linhagem macho de frangos de corte com uma linhagem de postura, com o objetivo de mapear QTLs (locos controladores de características quantitativas) para características de desempenho e carcaça. Um total de 2.063 animais F2 em 21 famílias de irmãos completos obtidas em 17 incubações. As aves foram criadas como frangos de corte e abatidas a 6 semanas de idade, foram avaliadas 19 características de desempenho e carcaça. A genotipagem foi realizada em 3 fases: 1) Um total de 80 marcadores microssatélites do cromossomo 1 foram testados nos indivíduos parentais e F1 para identificar marcadores informativos. 2) Genotipagem seletiva dos indivíduos F2 que representam os extremos fenotípicos para peso vivo aos 42 dias de idade (P42), para identificar regiões potencialmente associadas (P < 0,10) com esta característica. 3) Sete famílias de irmãos completos (649 F2) foram genotipados para 12 marcadores associados na fase 2 e para 14 marcadores flanqueadores. Mapeamento por intervalo utilizando regressão foi aplicado para dois modelos genéticos (F2 e meio-irmãos) para detectar QTLs Foram encontradas fortes evidências de QTLs afetando peso vivo, consumo de ração, conversão alimentar e peso de asas, coxas e sobrecoxas, peito, gordura abdominal, fígado, pulmão e coração no cromossomo 1.An F2 chicken population was developed by crossing a broiler sire line and a layer line, with the objective of mapping Quantitative Trait Loci (QTL) for performance and carcass traits. A total of 2,063 F2 chicks in 21 full-sib families from 17 hatches were reared as broilers and slaughtered at 6 weeks of age. Nineteen performance and carcass quality traits were measured. The genotyping was done in three phases: 1) A total of 80 microsatellite markers from chromosome 1 were tested in the parental and F1 individuals to identify informative markers. 2) Selective genotyping of F2 individuals, representing extreme phenotypes for body weight at 42 days of age (BW42), to identify regions potentially associated (P < 0,10) with this trait. 3) Seven full-sib families (649 F2 chicks) were genotyped for 12 markers associated in phase 2 and for additional 14 flanking markers. Interval mapping using regression methods was applied to two different genetic models: 1) Line-cross; 2) Half-sib analyses for mapping QTL. Strong evidences for QTL affecting body weight, feed intake, feed conversion and weights of drums and thighs, breast, abdominal fat, liver, lung and heart were found on chromosome 1

Nutricao e alimentacao de suinos

Trabalho de Conclusão de Curso - Universidade Federal de Santa Catarina. Curso de Agronomia

A regionalização do discurso de João Guimarães Rosa: a linguagem e a caracterização do homem do sertão

This study intends to analyze the regional influences for the language and the characterization of characters of the environment João Guimarães Rosa, stressing the important of language as cultural heritage. The study is based on the concepts of Culture and defended by Region of Cultural Geography, Language as an asset by Iphan, interviews and works of Rosa, and publications related to Rosa's works. Having the definition of place as a center of meaning constructed by experience (Tuan, 1983), and that the region is now seen based on the set of perceptions and lived down from seizures, evaluations, decisions and behaviors collectives (Bezzi, 2004), qualitative research provides grounds of the discussion it’s importance of communication and the same transcript. Through the study of language, characters and actions of the author's own notes to create the environment for the study of behavior, lived and / or imagined in the stories. Based on the literature review has set itself the aim of the study of the language coupled with the behavior of certain individuals of the same group have a cultural identity is recognized and valued as historic and cultural heritageO presente trabalho busca analisar as influências regionais através da linguagem e da caracterização das personagens de João Guimarães Rosa no ambiente do Sertão Mineiro, salientando a importância da língua como patrimônio cultural. O estudo se baseia nas concepções de Cultura e Região defendidas pela Geografia Cultural, da Língua como patrimônio pelo IPHAN, em entrevistas e obras de Guimarães Rosa, além de publicações relacionadas às obras rosianas. Tendo a definição de lugar como “um centro de significados construído pela experiência” (TUAN, 1983), e de que a região passa a ser vista “com base no conjunto das percepções vividas e estabelecidas a partir de apreensões, valorações, decisões e comportamentos coletivos” (BEZZI, 2004), a pesquisa qualitativa apresenta fundamentos para a discussão da importância da comunicação e da transcrição da mesma. Através do estudo da linguagem, ações das personagens e do próprio autor, observa-se a criação do ambiente de estudo do comportamento, vivido e/ou imaginado na narrativa ficcional. Com base na análise bibliográfica têm-se como objetivo configurar o estudo de que a língua aliada ao comportamento de determinados indivíduos de um mesmo grupo apresentam uma identidade cultural sendo reconhecida e valorizada como patrimônio histórico-cultura