R Package OBsMD for Follow-Up Designs in an Objective Bayesian Framework

Fractional factorial experiments often produce ambiguous results due to confounding among the factors; as a consequence more than one model is consistent with the data. Thus, the practical problem is how to choose additional runs in order to discriminate among the rival models and to identify the active factors. The R package OBsMD solves this problem by implementing the objective Bayesian methodology proposed by Consonni and Deldossi (2016). The main feature of this approach is that the follow-up designs are obtained through the use of just two functions, OBsProb() and OMD() without requiring any prior specifications, being fully automatic. Thus OBsMD provides a simple tool for conducting a design of experiments to solve real world problems

Hemojuvelin N-terminal mutants reach the plasma membrane but do not activate the hepcidin response

Background Hemojuvelin is a glycosylphosphatidylinositol-anchored protein, expressed in liver, skeletal muscle and heart. As a co-receptor of bone morphogenetic protein, membrane hemojuvelin positively modulates the iron regulator hepcidin. Mutations of the gene encoding for hemojuvelin cause juvenile hemochromatosis, characterized by hepcidin deficiency and severe iron overload. We have previously shown that several hemojuvelin variants do not efficiently reach the plasma membrane, whereas a few N-terminal mutants localize to the plasma membrane. Design and Methods We studied hemojuvelin mutants of N-terminus (C80R, S85P, G99V, ΔRGD) and GDPH-consensus site for autoproteolysis (A168D, F170S, D172E) transiently expressed in HeLa cells, using electron microscopy, morphometric analysis and binding assays at different time points. Hepcidin activation by wild-type and mutant forms of hemojuvelin was assessed in Hep3B cells transfected with a hepcidin-promoter luciferase-reporter construct. Results S85P, G99V and ΔRGD were localized to plasma membrane 36 hours after transfection, but less efficiently exported than the wild-type protein at earlier (24–30 hours) times. Morphometric analysis clearly documented delayed export and endoplasmic reticulum retention of G99V. C80R was exported without delay. GDPH variants were partially retained in the endoplasmic reticulum and Golgi apparatus, but showed impaired plasma membrane localization. In the hepcidin promoter assay only wild type hemojuvelin was able to activate hepcidin. Conclusions The delayed export and retention in the endoplasmic reticulum of some N-terminal mutants could contribute to the pathogenesis of juvenile hemochromatosis, reducing a prompt response of bone morphogenetic protein. However, independently of their plasma membrane export, all hemojuvelin mutants tested showed no or minimal hepcidin activation

LA INTEGRACIÓN REGIONAL COMO ELEMENTO DINAMIZADOR DEL DESARROLLO ECONÓMICO EN EL ESTADO DE HIDALGO

El concepto integración implica diferentes características, específicamente en el patrón del comercio internacional, donde las economías nacionales logran otro nivel en su interrelación y, al mismo tiempo, obtienen beneficios en el comercio, mayor competitividad y, en general, mejores niveles de bienestar social. Por lo tanto, el objetivo de una integración es la intensificación de las relaciones comerciales y de tránsito entre los integrantes, en la generación de ganancias, interrelación y estandarización de los sistemas jurídicos y administrativos de carácter público. El presente documento aborda el análisis sobre el proceso de integración regional sus diferentes variables en población y territorio. Por lo que se plantea que existe una importancia fundamental del territorio, la geografía y la población en los procesos socioeconómicos a nivel mundial, donde estas variables se convierten en factores circunstanciales del crecimiento económico. Por lo tanto, se abordarán los diferentes paradigmas que las explican como elementos esenciales de los procesos de desarrollo. En este sentido se pretende conocer los procesos de la integración regional; que principalmente tienen que ver, con el ordenamiento del territorio, la interacción con los sistemas productivos locales y como la sociedad ha sido participe de este proceso en un escenario de globalización actual. Por tanto, en este trabajo se plantea que el desarrollo económico y la integración regional son hechos relacionados, ya que diferentes experiencias a nivel mundial así lo han comprobado. Por lo que se analizarán los mecanismos teóricos a través de los cuales el comercio, el tránsito de la población, la homologación de sistemas jurídicos y administrativos estimula el crecimiento, reducen la pobreza y aumentan los ingresos de los más desfavorecidos

EL DESARROLLO ECONÓMICO Y LA INTEGRACIÓN DEL CAPITAL SOCIAL EN HIDALGO

El desarrollo económico no está distribuido uniformemente en la mayor parte del mundo, cada vez observamos a una sociedad con desigualdad en ingreso y oportunidades, así mismo el individualismo y la polarización social generalmente están presentes en los territorios más deprimidos. En la era industrial, el capital humano, se reconoció como un determinante adicional, después de la ruptura de la economía del conocimiento, las relaciones entre los agentes económicos y otros agentes de la sociedad, es decir, el capital social, que se ha convertido en un nuevo factor determinante del desarrollo económico. Dado lo anterior, el capital social se ha estudiado en diferentes contextos para explicar por qué algunos individuos y comunidades están mejor que otros; por qué algunas instituciones, como el mercado, el estado o las organizaciones cívicas, funcionan de manera más efectiva que otras; cómo se crean estas instituciones y cómo las personas se unen para establecer objetivos colectivos. En realidad, el desarrollo económico bajo el concepto de capital social no es nuevo, ya que representa preguntas que la humanidad ha estado reflexionando desde que comenzó a explorar su entorno natural. Para Adam Smith, un filósofo moral y padre de la economía política clásica, las redes y asociaciones comerciales son los canales principales para la transmisión de una reputación de confiabilidad, mientras que los principios de compasión y autodisciplina siguen siendo cruciales en el funcionamiento de las economías y sociedades (Smith, 1958). En general, se considera que la fortaleza del capital social radica en su capacidad para construir los tipos de vínculos de red y las relaciones de confianza entre los actores en las esferas pública y privada que se necesitan para reunir recursos materiales y no materiales; producir bienes públicos y asignar sus beneficios en las premisas de eficiencia y equidad. Por lo anterior los objetivos son: 1.- Determinar el papel que desempeña el capital social en la transformación o refuerzo de las relaciones sociales y económicas. Y 2.-Analizár como el capital social afecta el bienestar público y las decisiones de la política social y si estas se encuentran vinculadas con el desarrollo económico. Conclusiones Preliminares Se infiere que en el desarrollo económico existe influencia de la cultura en el alcance de la actividad colectiva y por lo tanto, del capital social, la cultura da forma al comportamiento social (Kilian & Turner, 1972) y la densidad de la interacción social determina la prudencia de las personas para actuar colectivamente (Park & Ernest, 1924) donde la cultura es homogénea, es más probable que la actividad institucional tenga legitimidad comunitaria, sea coherente y tenga éxito (Cornell & Kalt, 1991), las instituciones que crea una comunidad determinarán, en gran medida, hasta qué punto las personas pueden movilizarse colectivamente para ejercer control sobre el desarrollo de sus comunidades; y un la acción colectiva permanecerá mucho después de que las circunstancias que lo inspiraron hayan cambiado

LA INTEGRACIÓN REGIONAL COMO ELEMENTO DINAMIZADOR DEL DESARROLLO ECONÓMICO EN EL ESTADO DE HIDALGO.

El concepto integración implica diferentes características, específicamente en el patrón del comercio internacional, donde las economías nacionales logran otro nivel en su interrelación y, al mismo tiempo, obtienen beneficios en el comercio, mayor competitividad y, en general, mejores niveles de bienestar social. Por lo tanto, el objetivo de una integración es la intensificación de las relaciones comerciales y de tránsito entre los integrantes, en la generación de ganancias, interrelación y estandarización de los sistemas jurídicos y administrativos de carácter público. El presente documento aborda el análisis sobre el proceso de integración regional sus diferentes variables en población y territorio. Por lo que se plantea que existe una importancia fundamental del territorio, la geografía y la población en los procesos socioeconómicos a nivel mundial, donde estas variables se convierten en factores circunstanciales del crecimiento económico. Por lo tanto se abordaran los diferentes paradigmas que las explican como elementos esenciales de los procesos de desarrollo. En este sentido se pretende conocer los procesos de la integración regional; que principalmente tienen que ver, con el ordenamiento del territorio, la interacción con los sistemas productivos locales y como la sociedad ha sido participe de este proceso en un escenario de globalización actual. Por tanto en este trabajo se plantea que el desarrollo económico y la integración regional son hechos relacionados, ya que diferentes experiencias a nivel mundial así lo han comprobado. Por lo que se analizarán los mecanismos teóricos a través de los cuales el comercio, el tránsito de la población, la homologación de sistemas jurídicos y administrativos estimula el crecimiento, reducen la pobreza y aumentan los ingresos de los más desfavorecidos

MiR-155 modulates the inflammatory phenotype of intestinal myofibroblasts by targeting SOCS1 in ulcerative colitis

Abnormal levels of microRNA (miR)-155, which regulate inflammation and immune responses, have been demonstrated in the colonic mucosa of patients with inflammatory bowel diseases (IBD), although its role in disease pathophysiology is unknown. We investigated the role of miR-155 in the acquisition and maintenance of an activated phenotype by intestinal myofibroblasts (IMF), a key cell population contributing to mucosal damage in IBD. IMF were isolated from colonic biopsies of healthy controls, ulcerative colitis (UC) and Crohn's disease (CD) patients. MiR-155 in IMF was quantified by quantitative reverse transcription-PCR in basal condition and following exposure to TNF-alpha, interleukin (IL)-1 beta, lipopolysaccharide (LPS) or TGF-beta 1. The effects of miR-155 mimic or inhibitor transfection on cytokine release and suppressor of cytokine signaling 1 (SOCS1) expression were assessed by enzyme-linked immunosorbent assay and western blot, respectively. Regulation of the target gene SOCS1 expression by miR-155 was assessed using luciferase reporter construct. We found that miR-155 was significantly upregulated in UC as compared with control-and CD-derived IMF. Moreover, TNF-alpha and LPS, but not TGF-beta 1 and IL-1 beta, significantly increased miR-155 expression in IMF. Ectopic expression of miR-155 in control IMF augmented cytokines release, whereas it downregulated SOCS1 expression. MiR-155 knockdown in UC-IMF reduced cytokine production and enhanced SOCS1 expression. Luciferase reporter assay demonstrated that miR-155 directly targets SOCS1. Moreover, silencing of SOCS1 in control IMF significantly increased IL-6 and IL-8 release. In all, our data suggest that inflammatory mediators induce miR-155 expression in IMF of patients with UC. By downregulating the expression of SOCS1, miR-155 wires IMF inflammatory phenotype

Nuclear expression of Rac1 in cervical premalignant lesions and cervical cancer cells

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Abnormal expression of Rho-GTPases has been reported in several human cancers. However, the expression of these proteins in cervical cancer has been poorly investigated. In this study we analyzed the expression of the GTPases Rac1, RhoA, Cdc42, and the Rho-GEFs, Tiam1 and beta-Pix, in cervical pre-malignant lesions and cervical cancer cell lines.</p> <p>Methods</p> <p>Protein expression was analyzed by immunochemistry on 102 cervical paraffin-embedded biopsies: 20 without Squamous Intraepithelial Lesions (SIL), 51 Low- grade SIL, and 31 High-grade SIL; and in cervical cancer cell lines C33A and SiHa, and non-tumorigenic HaCat cells. Nuclear localization of Rac1 in HaCat, C33A and SiHa cells was assessed by cellular fractionation and Western blotting, in the presence or not of a chemical Rac1 inhibitor (NSC23766).</p> <p>Results</p> <p>Immunoreacivity for Rac1, RhoA, Tiam1 and beta-Pix was stronger in L-SIL and H-SIL, compared to samples without SIL, and it was significantly associated with the histological diagnosis. Nuclear expression of Rac1 was observed in 52.9% L-SIL and 48.4% H-SIL, but not in samples without SIL. Rac1 was found in the nucleus of C33A and SiHa cells but not in HaCat cells. Chemical inhibition of Rac1 resulted in reduced cell proliferation in HaCat, C33A and SiHa cells.</p> <p>Conclusion</p> <p>Rac1 is expressed in the nucleus of epithelial cells in SILs and cervical cancer cell lines, and chemical inhibition of Rac1 reduces cellular proliferation. Further studies are needed to better understand the role of Rho-GTPases in cervical cancer progression.</p

Ruolo della via di segnale di Wnt5a nel fenotipo dei miofibroblasti sub-epiteliali intestinali in corso di Colite Ulcerosa

ABSTRACT Background: Wnts are a highly conserved family of secreted glicoproteins involved in several physiological and pathological processes. Intestinal subepithelial myofibroblasts (ISEMFs), a cellular population releasing growth factors and cytokines involved in tissue remodelling, have been recently identified as a source of Wnts ligands. Since Wnt5a, the main ligand of the non-canonical pathway, plays a pivotal role in intestinal epithelial repair and is up-regulated in chronic inflammatory disorders such as rheumatoid arthritis, the aim of our study was to evaluate, in ISEMFs derived from normal subjects and ulcerative colitis (UC) patients, the expression of Wnt5a and its receptors and determine its autocrine role on ISEMFs. Methods: ISEMFs were isolated from colonic mucosa of healthy subjects (n=6) or from patients with UC (n=10). Wnt5a and Frzd1, 2, 4, 5 expressions was evaluated by quantitative RT-Time PCR and Western Blot. To determine the autocrine effect of Wnt5a, we performed functional studies using Wnt5a KO by shRNA or exposing ISEMFs to human recombinant Wnt5a. Following 96 hours culture, cell proliferation was quantitated by 3H-tymidine incorporation and cell cycle analysis. To evaluate anti-apoptotic role of Wnt5a, we performed functional studies exposing ISEMFs to human recombinant Wnt5a and staurosporin. Following 24 hours culture Annexin V and caspase-3 assay was estimated. To identify pathway induced by Wnt5a signal, functional studies using β-catenin KO by shRNA or exposing ISEMFs to Ca2+ inhibitors was performed and CamKII protein levels was measured by Western blot. Results: UC-derived ISEMFs showed a significantly higher Wnt5a expression at mRNA and protein level (p<0.05) in basal condition as compared to controls. Furthermore, as compared to controls UC-derived ISEMFs produced significantly higher amounts of Wnt5a following exposure to LPS or TGFβ (p<0.05). ISEMFs derived both normal and UC patients showed a similar pattern of Wnts receptors. Wnt5a silencing in UC-derived ISEMFs and in control ISEMFs, caused a significant reduction in cell proliferation (p<0.05). Indeed, rWnt5a supplementation stimulated cell proliferation and resistance to staurosporin induced-apoptosis. Wnt5a signal is β-catenin independent because supplementation of rWnt5a in KO β-catenin ISEMFs led to a significative increase of cell proliferation (p<0.05). On the contrary,Wnt5a signal seems to be mediated by CamKII, promoting an increase of its phosphorilation. Conclusions: ISEMFs from UC patients produce an excess of Wnt5a that is able to stimulate cellular proliferation, resistance to apoptosis and that acts by CamKII activation. We speculate that Wnt5a plays a key role to expand the ISEMFs population in UC patients and might contribute to tissue damage and remodeling during chronic inflammation.Wnt5a rappresenta il ligando prototipo della via non canonica di Wnt, via di segnale coinvolta nei processi di embriogenesi, riparazione tissutale e carcinogenesi dell’epitelio intestinale. Fisiologicamente, Wnt5a agisce sulla migrazione e proliferazione di tipi cellulari diversi coinvolti nel mantenimento dell’omeostasi epiteliale, fungendo da mediatore nel dialogo tra epitelio e mesenchima. Numerosi dati sperimentali suggeriscono inoltre che l’aumento di Wnt5a possa essere un meccanismo comune dell’infiammazione cronica in quanto è sovra-espresso nell’artrite reumatoide, nell’aterosclerosi e nella psoriasi. Abbiamo pertanto iniziato ad esaminare il ruolo di Wnt5a nell’infiammazione cronica intestinale. Il modello preso in esame è rappresentato da miofibroblasti subepiteliali intestinali (ISEMFs) da Rettocolite Ulcerosa (RCU). Le ISEMFs sono cellule coinvolte nell’omeostasi intestinale: nell’intestino rappresentato il maggior sito di produzione del collagene e di altre proteine della matrice extracellulare, promuovendo dunque il rimodellamento tessutale. Inoltre interagiscono con le cellule epiteliali, le staminali e i macrofagi promuovendo e la restituzione epiteliale e la secrezione di citochine e chemochine. Si è osservato che nella mucosa dei pazienti affetti da IBD, il numero di queste cellule è significativamente aumentato rispetto a quello della mucosa sana, e che un’alterazione della loro funzionalità è coinvolto nella fisiopatologia delle IBD. L’aumentata espressione di Wnt5a a livello trascrizionale e proteico è stata verificata in soggetti affetti da RCU, con correlazione diretta con il grado di attività di malattia. Studi di immunoistochimica hanno permesso, mediante co-localizzazione con α-SMA, di osservare la distribuzione di Wnt5a nel tessuto e la sua preponderante espressione in miofibroblasti sub epiteliali. La caratterizzazione di Wnt5a è stata dunque effettuata su miofibroblasti primari estratti da mucosa di Rettocolite Ulcerosa e tessuto controllo. Cellule derivate da tessuto infiammato hanno mostrato maggiori livelli di espressione proteica di Wnt5a. Dosaggi del trascritto e western blotting hanno permesso di osservare che il TGFβ e LPS sono in grado promuovere una sovra-espressione di Wnt5a nei miofibroblasti intestinali. Abbiamo quindi condotto dei saggi per verificare se Wnt5a regolasse caratteristiche fisiologiche e fenotipiche nelle ISEMFs stesse. A tal fine,dopo aver verificato la presenza dei recettori per Wnt5a, abbiamo iniziato degli studi di tipo funzionale mediante RNA interference (RNAi) per lo spegnimento genico (loss of function); perciò abbiamo messo a punto la metodica per il Knockdown di Wnt5a in colture primarie di ISEMFs con vettori adenovirali codificanti shRNA. Viceversa sono stati condotti degli studi di gain of function supplementando al terreno di coltura cellulare la proteina purificata rWnt5a. Sono stati effettuati dei saggi proliferazione rilevata mediante il metodo dell’incorporazione della timidina triziata da cui emerso che nelle ISEMFs Wnt5a promuove la proliferazione. Inoltre sono stati effettuati dei saggi sul ciclo cellulare mediante colorazione di ioduro di propidio e di resistenza all’apoptosi mediante anessina V e test di attivazione della caspasi-3, da cui emerge che questa glicoproteina promuove la sopravvivenza cellulare. Complessivamente questi dati sembrano indicare che Wnt5a ha il ruolo di promuovere l’espansione e il mantenimento di questo tipo cellulare e quindi di perpetuare il danno tissutale e l’infiammazione cronica intestinale in RCU