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Analysis of virome by high-throughput sequencing disclosed multiple infection in a single grapevine plant.
Among phytosanitary problems of the grapevine, viruses stand out for their capacity of reducing the quality and yield of grapes. however, detecting and identifying viral infections in grapevines can be challenging. This study performed a high throughput sequencing (hTS) of the viral pathogens present in a vine showing virus-like symptoms to elucidate the etiology. hTS analysis reported in a hybrid grapevine with mild curling down of leaf edges, the presence of four viruses and viroids, which were probably implicated in the observed symptoms. The determined complete genomes showed high genetic identities with previously characterized isolates of homologous pathogens. Key words: diagnosis, symptoms, hTS, diversity, virus. Resumo: Dentre os problemas fitossanitários da videira, os vírus se destacam pela capacidade de reduzir a qualidade e o rendimento da uva. No entanto, detectar e identificar infecções virais em videiras pode ser um desafio. O objetivo do estudo foi realizar um sequenciamento de alto rendimento (hTS) para determinar os patógenos virais presentes em uma videira com sintomas de virose e elucidar a etiologia. com o hTS foi detectada, em uma videira híbrida com leve enrolamento dos bordos foliares, a presença de quatro vírus e viroides, os quais provavelmente estavam implicados com os sintomas observados. Os genomas completos determinados mostraram altas identidades genéticas com isolados previamente caracterizados de patógenos homólogos. Palavras-chave: diagnose, sintomas, hTS, diversidade, vírus
Analysis of virome by high-throughput sequencing revealed multiple infection in a single grapevine plant.
Grapevines (Vitis sp.) can host up to 86 virus species, some of which affect plant vigor, production and fruit quality. In 2019, cv. BRS Bibiana, a hybrid vine showing mild leafroll symptoms, collected in an experimental field in Canoinhas-SC, Brazil, was investigated for viruses.Evento online
Wheat transcriptome analysis targeting leaf rust resistance-related genes.
ISCB-Latin America 2014. Pôster D03
Caracterização molecular de isolados do vírus do nanismo amarelo do Rio Grande do Sul.
Área: Fitopatologia
RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo.
Sendo o trigo (Triticum aestivum) uma das principais commodities agrícolas do mundo, técnicas de melhoramento genético são empregadas na busca contínua de melhores características agronômicas, nutricionais e de resistência a estresses bióticos e abióticos
Genética da resistência de planta adulta à ferrugem da folha em trigo - cultivar Toropi.
Orientadora: Sandra Patussi Brammer
Differential gene expression in the cattle tick Rhipicephalus microplus fed on resistant and susceptible cattle.
Na publicação: Jacqueline Cavalcanti Barros, Renato Andreotti. PAG 2019. PE0246