45 research outputs found

    Analysis of virome by high-throughput sequencing disclosed multiple infection in a single grapevine plant.

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    Among phytosanitary problems of the grapevine, viruses stand out for their capacity of reducing the quality and yield of grapes. however, detecting and identifying viral infections in grapevines can be challenging. This study performed a high throughput sequencing (hTS) of the viral pathogens present in a vine showing virus-like symptoms to elucidate the etiology. hTS analysis reported in a hybrid grapevine with mild curling down of leaf edges, the presence of four viruses and viroids, which were probably implicated in the observed symptoms. The determined complete genomes showed high genetic identities with previously characterized isolates of homologous pathogens. Key words: diagnosis, symptoms, hTS, diversity, virus. Resumo: Dentre os problemas fitossanitários da videira, os vírus se destacam pela capacidade de reduzir a qualidade e o rendimento da uva. No entanto, detectar e identificar infecções virais em videiras pode ser um desafio. O objetivo do estudo foi realizar um sequenciamento de alto rendimento (hTS) para determinar os patógenos virais presentes em uma videira com sintomas de virose e elucidar a etiologia. com o hTS foi detectada, em uma videira híbrida com leve enrolamento dos bordos foliares, a presença de quatro vírus e viroides, os quais provavelmente estavam implicados com os sintomas observados. Os genomas completos determinados mostraram altas identidades genéticas com isolados previamente caracterizados de patógenos homólogos. Palavras-chave: diagnose, sintomas, hTS, diversidade, vírus

    Analysis of virome by high-throughput sequencing revealed multiple infection in a single grapevine plant.

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    Grapevines (Vitis sp.) can host up to 86 virus species, some of which affect plant vigor, production and fruit quality. In 2019, cv. BRS Bibiana, a hybrid vine showing mild leafroll symptoms, collected in an experimental field in Canoinhas-SC, Brazil, was investigated for viruses.Evento online

    RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo.

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    Sendo o trigo (Triticum aestivum) uma das principais commodities agrícolas do mundo, técnicas de melhoramento genético são empregadas na busca contínua de melhores características agronômicas, nutricionais e de resistência a estresses bióticos e abióticos
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