Sendo o trigo (Triticum aestivum) uma das principais commodities agrícolas do mundo, técnicas de melhoramento genético são empregadas na busca contínua de melhores características agronômicas, nutricionais e de resistência a estresses bióticos e abióticos

BINNECK, E.

BUENO, P.

LAU, E. Y.

NHANI JUNIOR, A.

SCAGLIUSI, S. M. M.

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48 RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo  Paola Bueno(1), Elene Yamazaki Lau(2), Eliseu Binneck(3), Antonio Nhani Júnior(4) e Sandra Maria Mansur Scagliusi(5)  (1)Estudante de Biomedicina, Faculdade Especializada na Área da Saúde do Rio Grande do Sul-Fasurgs, Passo Fundo, RS. Estagiária de graduação. (2)Pesquisadora da Embrapa Trigo, orientadora, Passo Fundo, RS. (3)Pesquisador da Embrapa Soja, Londrina, PR. (4)Pesquisador da Embrapa Informática Agropecuária, Campinas, SP. (5)Pesquisadora da Embrapa Trigo, Passo Fundo, RS.   Resumo – Sendo o trigo (Triticum aestivum) uma das principais commodities agrícolas do mundo, técnicas de melhoramento genético são empregadas na busca contínua de melhores características agronômicas, nutricionais e de resistência a estresses bióticos e abióticos. A geração de plantas duplo haploides (DH) é uma das estratégias para acelerar o processo de melhoramento, reduzindo o tempo para alcançar a homozigose. A cultura de micrósporos isolados para gerar DHs é dificultada pela recalcitrância à embriogênese dependente do genótipo. Portanto, identificar genes relacionados à recalcitrância poderá auxiliar a visualizar novas possibilidades para superar esse obstáculo. Para isso, recentemente foi realizado o sequenciamento Illumina (RNA-Seq) de transcritos dos genótipos Fielder (responsivo) e Embrapa 27 (recalcitrante), antes e após tratamento de frio para induzir a embriogênese. Os genes com expressão diferencial foram identificados por análise de bioinformática. O objetivo desse trabalho é analisar o significado biológico dos dados, selecionar genes para verificar a expressão gênica em importantes estágios do processo da embriogênese e também para validar os dados do RNA-Seq. Para inferir o significado biológico, estão sendo analisados os dados de anotação e ontologia de genes (processo biológico, função molecular e componente celular), verificado o aumento/diminuição de níveis de expressão, e realizadas buscas em publicações existentes. Baseada nessa pesquisa, serão selecionados 30 genes e desenhados primers para a futura análise de expressão por RT-PCR. A análi-se preliminar dos dados indicou que, após o tratamento de frio, há uma significativa indução de genes relacionados a resposta a estresses e a componentes de membrana, especialmente em Fielder.  Termos para indexação: Triticum aestivum, sequenciamento, recalcitrância à embriogênese  Apoio: Embrapa   

RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo.

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/bitstream/doc/1132460/1/Bueno-p48-MIC-MPG-2020-completo.pdf

RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo.

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