Current issues of teaching general surgery.

Analysis of the results of teaching general surgery in a credit-modular system showed that there are issues that need to be solved at different levels. They concern educational and methodological and logistical support of education, the proper methodology of teaching practical skills, the distribution of modular control of mastering level of practical and theoretical knowledge as well as the increase of academic hours a on the discipline in the total and restructuring clinical practice

Current issues of teaching general surgery.

Analysis of the results of teaching general surgery in a credit-modular system showed that there are issues that need to be solved at different levels. They concern educational and methodological and logistical support of education, the proper methodology of teaching practical skills, the distribution of modular control of mastering level of practical and theoretical knowledge as well as the increase of academic hours a on the discipline in the total and restructuring clinical practice

Combination of Endobronchial Ultrasound and Modern Cytological Diagnosis in Patients With Intrathoracic Lesions

Objective: To evaluate the effectiveness of endobronchial (EBUS) and endoscopic ultrasound (EUS) in cytomorphological verification of a malignant process using the transbronchial needle aspiration (TBNA) of the lymph nodes and mediastinal organs.Materials and methods: In 2017–2019 we analyzed the cytological samples (standard and cell block) of 172 patients (115 males and 57 females) with an average age of 61 years (25–82 years) in the clinical diagnostic laboratory of Scientific Research Institute – Ochapovsky Regional Clinical Hospital No. 1 (Krasnodar, Russian Federation). Of them 111 were used for immunocytochemical analysis. The majority of the studies (77) were performed in patients with lung cancer in order to identify the stage of the disease. We used combined bronchoscopy under general anesthesia in the operating room with high-frequency ventilation and a rapid on-site evaluation (ROSE).Results: We found the lymph node and mediastinal invasion in 140 (81%) patients who underwent EBUS-EUS TBNA. The non-diagnostic results were obtained in 32 (19%) patients. The combination of EUS and EBUS with TBNA showed the highest effectiveness in the mentioned clinical cases. The sensitivity, specificity, and accuracy of the cytologic analysis during EBUS and EUS with TBNA and no ROSE were 89%, 100%, and 90%, respectively. ROSE reduced the rate of non-diagnostic results and increased the sensitivity (96%), specificity (100%), and accuracy (97%) of the cytologic evaluation.Conclusions: According to the obtained results, we recommend using EBUS-EUS TBNA modalities for morphological verification of the mediastinal lymph nodes as a routine invasive diagnosis component of the preoperative evaluation in patients with lung cancer

Biology of archaea from a novel family Cuniculiplasmataceae (Thermoplasmata) ubiquitous in hyperacidic environments

The order Thermoplasmatales (Euryarchaeota) is represented by the most acidophilic organisms known so far that are poorly amenable to cultivation. Earlier culture-independent studies in Iron Mountain (California) pointed at an abundant archaeal group, dubbed 'G-plasma'. We examined the genomes and physiology of two cultured representatives of a Family Cuniculiplasmataceae, recently isolated from acidic (pH 1-1.5) sites in Spain and UK that are 16S rRNA gene sequence-identical with 'G-plasma'. Organisms had largest genomes among Thermoplasmatales (1.87-1.94 Mbp), that shared 98.7-98.8% average nucleotide identities between themselves and 'G-plasma' and exhibited a high genome conservation even within their genomic islands, despite their remote geographical localisations. Facultatively anaerobic heterotrophs, they possess an ancestral form of A-type terminal oxygen reductase from a distinct parental clade. The lack of complete pathways for biosynthesis of histidine, valine, leucine, isoleucine, lysine and proline pre-determines the reliance on external sources of amino acids and hence the lifestyle of these organisms as scavengers of proteinaceous compounds from surrounding microbial community members. In contrast to earlier metagenomics-based assumptions, isolates were S-layer-deficient, non-motile, non-methylotrophic and devoid of iron-oxidation despite the abundance of methylotrophy substrates and ferrous iron in situ, which underlines the essentiality of experimental validation of bioinformatic predictions

Оптимізація лікування хворих із синдромом гострої кровотечі в просвіт Травного каналу

the aim of the work: is to improve the results of treating patients with acute bleeding syndrome into the lumen of the upper gastrointestinal canal with ulcer genesis by improving the methods of local endoscopic hemostasis. Materials and Methods. Patients with manifestations of acute bleeding syndrome into the lumen of the upper section of the digestive canal with ulcerative genesis were included in a randomized, prospective study which was carried out in the surgical clinic of Dnipropetrovsk Medical Academy on the basis of Surgical Department No. 2 where advanced therapeutic endoscopic manipulations and surgeries to improve local endoscopic hemostasis have been actively implemented. According to the obtained data, peptic duodenal ulcer was among the diseases that caused acute bleeding into the lumen of the upper part of the digestive canal. In case of acute bleeding syndrome into the lumen of the upper digestive canal with ulcerative genesis, the structure of the nosological units can be represented as follows: peptic duodenal ulcer – 67.8 %, gastric ulcer – 32.2 %. Results and Discussion. As a result of the carried out analysis of the distribution of local hemostasis states according to Forrest, it was found that the first class of danger (Forrest I) was determined in 39.5 % of cases and the second class of danger (Forrest II) in 60.5 % of cases. Based on the analysis of the clinical and experimental study we have created an integrated scale to determine the risk of recurrent bleeding. High risk of bleeding was evaluated by an integral score of 20 to 30 points, medium risk – from 13 to 20 points, low risk – up to 12 points respectively. In the period 2016–2017 with the active use of local endoscopic hemostasis and endoscopic monitoring in the complex of conservative therapy in patients with acute bleeding syndrome into the lumen of the upper gastrointestinal canal with ulcer genesis, we managed to significantly reduce the number specific of surgeries from 13.1 % to 8.2 % cases. For the purpose of early detection of stigmas of recurrent bleeding and measures to prevent its occurrence, endoscopic monitoring is indicated to all patients with acute bleeding syndrome into the lumen of the upper gastrointestinal canal of the ulcerative genesis. In order to temporarily stop bleeding and prepare the patient for the delayed surgery in case of extremely high risk of surgical intervention in patients with acute bleeding syndrome, it is reasonable to apply once again local endoscopic hemostasis methods. In the complex of conservative therapy of patients with acute bleeding syndrome into the lumen of the upper division of the digestive canal with ulcer genesis we managed to reduce significantly the number of surgical interventions by 2.5 times due to the widespread introduction of methods of local endoscopic hemostasis, endoscopic prophylactic prophylaxis.Цель работы: улучшить результаты лечения больных с синдромом острого кровотечения в просвет верхнего отдела пищеварительного канала язвенного генеза за счет совершенствования методов местного эндоскопического гемостаза. Материалы и методы. В рандомизавонное, проспективное исследование были включины больные с проявлениями синдрома острого кровотечения в просвет верхнего отдела пищеварительного канала язвенного генеза, где в хирургической клинике ГУ ГМА МЗ Украины наряду с диагностическим эзофагогастордуоденоскопическим исследованием внедряли усовершенствованные лечебные эндоскопические манипуляции и операции с целью создания устойчивого местного эндоскопического гемостаза. По полученным нами данным язвенная болезнь двенадцатиперстной кишки занимала первое место среди заболеваний, вызвавших острое кровотечение в просвет верхнего отдела пищеварительного тракта. При синдроме острого кровотечения в просвет верхнего отдела пищеварительного канала язвенного генеза структуру нозологических единиц можно представить в следующем виде: язвенная болезнь двенадцатиперстной кишки – 67,8 %, язва желудка – 32,2 %. Результаты исследований и их обсуждение. В результате проведенного нами анализа распределения состояний местного гемостаза по Forrest было установлено, что I класс опасности (Forrest I) был обнаружен в 39,5 % случаев, а II класс опасности (Forrest II) в 60,5 % случаев. На основе анализа проведенного исследования нами была создана интегральная шкала определения риска возникновения рецидива кровотечения. Высокий риск возникновения кровотечения устанавливали по интегральной оценке от 20 до 30 баллов, средний риск – от 13 до 20 баллов, низкий риск – до 12 баллов. В период 2016–2017 гг. при активном применения методов местного эндоскопического гемостаза и эндоскопического мониторинга в комплексе консервативной терапии у больных с синдромом острого кровотечения в просвет верхнего отдела пищеварительного канала язвенного генеза удалось существенно снизить удельный вес оперативных вмешательств с 13,1 до 8,2 % случаев. С целью раннего выявления стигматов возникновения рецидивного кровотечения и проведения мероприятий по профилактике ее возникновения проведения эндоскопического мониторинга показано всем больным с синдромом острого кровотечения в просвет верхнего отдела пищеварительного канала язвенного генеза. С целью временной остановки кровотечения и подготовки больного к проведению отсроченной операции в случае чрезвычайно высокого риска оперативного вмешательства у больных с синдромом острого кровотечения в просвет верхнего отдела пищеварительного канала язвенного генеза целесообразно повторное применение методов местного эндоскопического гемостаза. Применение комплекса консервативной терапии у больных с синдромом острого кровотечения в просвет верхнего отдела пищеварительного канала язвенного генеза позволило снизить количество оперативных вмешательств в 2,5 раза благодаря широкому внедрению методов местного эндоскопического гемостаза, эндоскопической профилактике возникновения рецидивного кровотечения и эндоскопическому мониторингу.Мета роботи: покращити результати лікування хворих із синдромом гострої кровотечі в просвіт верхнього відділу травного каналу виразкового генезу за рахунок вдосконалення методів місцевого ендоскопічного гемостазу. Матеріали і методи. До рандомізавоного, проспективного дослідження були залучені хворі з проявами синдрому гострої кровотечі в просвіт верхнього відділу травного каналу виразкового генезу, де в хірургічній клініці ДЗ ДМА МОЗ України поряд з діагностичним езофагогастордуоденоскопічним дослідженням впроваджували удосконалені лікувальні ендоскопічні маніпуляції та операції з метою створення стійкого місцевого ендоскопічного гемостазу. За отриманими нами даними виразкова хвороба дванадцятипалої кишки посідала перше місце серед захворювань, що спричиняли гостру кровотечу в просвіт верхнього відділу травного каналу. При синдромі гострої кровотечі в просвіт верхнього відділу травного каналу виразкового генезу структуру нозологічних одиниць можна представити так: виразкова хвороба дванадцятипалої кишки – 67,8 %, виразка шлунка – 32,2 %. Результати досліджень та їх обговорення. В результаті проведеного аналізу розподілу станів місцевого гемостазу за Forrest І клас небезпеки (Forrest І) встановлено в 39,5 % випадків, а ІІ клас небезпеки (Forrest ІІ) – у 60,5 % випадків. На основі аналізу проведеного дослідження створено інтегральну шкалу визначення ризику виникнення рецидиву кровотечі. Високий ризик виникнення кровотечі встановлювали при інтегральній оцінці від 20 до 30 балів, середній ризик – від 13 до 20 балів, низький ризик – до 12 балів. У період 2016–2017 рр. при активному застосування методів місцевого ендоскопічного гемостазу та ендоскопічного моніторингу в комплексі консервативної терапії у хворих із синдромом гострої кровотечі в просвіт верхнього відділу травного каналу виразкового генезу вдалося істотно знизити питому вагу операційних втручань з 13,1 до 8,2 % випадків. З метою раннього виявлення стигматів виникнення рецидивної кровотечі і проведення заходів щодо профілактики її виникнення проведення ендоскопічного моніторингу показано всім хворим із синдромом гострої кровотечі в просвіт верхнього відділу травного каналу виразкового генезу. З метою тимчасової зупинки кровотечі і підготовки хворого до проведення відстроченої операції в разі надзвичайно високого ризику операційного втручання у хворих із синдромом гострої кровотечі в просвіт верхнього відділу травного каналу виразкового генезу доцільне повторне застосування методів місцевого ендоскопічного гемостазу. Застосування комплексу консервативної терапії у хворих із синдромом гострої кровотечі в просвіт верхнього відділу травного каналу виразкового генезу дозволило знизити кількість операційних втручань в 2,5 раза завдяки широкому впровадженню методів місцевого ендоскопічного гемостазу, ендоскопічної профілактики виникнення рецидивної кровотечі та ендоскопічному моніторингу

A Temperate <i>Sinorhizobium</i> Phage, AP-16-3, Closely Related to Phage 16-3: Mosaic Genome and Prophage Analysis

Soil Sinorhizobium phage AP-16-3, a strain phylogenetically close to Rhizobium phage 16-3, was isolated in a mountainous region of Dagestan, belonging to the origin of cultivated plants in the Caucasus, according to Vavilov N.I. The genome of phage AP-16-3 is 61 kbp in size and contains 62 ORFs, of which 42 ORFs have homologues in the genome of Rhizobium phage 16-3, which was studied in the 1960s–1980s. A search for Rhizobium phage 16-3-related sequences was performed in the genomes of modern strains of root nodule bacteria belonging to different species, genera, and families. A total of 43 prophages of interest were identified out of 437 prophages found in the genomes of 42 strains, of which 31 belonged to Sinorhizobium meliloti species. However, almost all of the mentioned prophages contained single ORFs, and only two prophages contained 51 and 39 ORFs homologous to phages related to 16-3. These prophages were detected in S. meliloti NV1.1.1 and Rh. leguminosarum OyaliB strains belonging to different genera; however, the similarity level of these two prophages did not exceed 14.7%. Analysis of the orphan genes in these prophages showed that they encoded predominantly virion structural elements, but also enzymes and an extensive group of hypothetical proteins belonging to the L, S, and E regions of viral genes of phage 16-3. The data obtained indicate that temperate phages related to 16-3 had high infectivity against nodule bacteria and participated in intragenomic recombination events involving other phages, and in horizontal gene transfer between rhizobia of different genera. According to the data obtained, it is assumed that the repetitive lysogenic cycle of temperate bacteriophages promotes the dissolution of the phage genetic material in the host bacterial genome, and radical updating of phage and host bacterial genomes takes place