Staphylococcus aureus infective endocarditis versus bacteremia strains: Subtle genetic differences at stake

AbstractInfective endocarditis (IE)(1) is a severe condition complicating 10–25% of Staphylococcus aureus bacteremia. Although host-related IE risk factors have been identified, the involvement of bacterial features in IE complication is still unclear. We characterized strictly defined IE and bacteremia isolates and searched for discriminant features. S. aureus isolates causing community-acquired, definite native-valve IE (n=72) and bacteremia (n=54) were collected prospectively as part of a French multicenter cohort. Phenotypic traits previously reported or hypothesized to be involved in staphylococcal IE pathogenesis were tested. In parallel, the genotypic profiles of all isolates, obtained by microarray, were analyzed by discriminant analysis of principal components (DAPC)(2). No significant difference was observed between IE and bacteremia strains, regarding either phenotypic or genotypic univariate analyses. However, the multivariate statistical tool DAPC, applied on microarray data, segregated IE and bacteremia isolates: IE isolates were correctly reassigned as such in 80.6% of the cases (C-statistic 0.83, P<0.001). The performance of this model was confirmed with an independent French collection IE and bacteremia isolates (78.8% reassignment, C-statistic 0.65, P<0.01). Finally, a simple linear discriminant function based on a subset of 8 genetic markers retained valuable performance both in study collection (86.1%, P<0.001) and in the independent validation collection (81.8%, P<0.01). We here show that community-acquired IE and bacteremia S. aureus isolates are genetically distinct based on subtle combinations of genetic markers. This finding provides the proof of concept that bacterial characteristics may contribute to the occurrence of IE in patients with S. aureus bacteremia

La surexpression de p53 est un facteur prédictif de progression de la dysplasie de bas grade dans l'endobrachyœsophage

Cette étude longitudinale cas témoin cherchait à déterminer la valeur de p53 pour identifier les patients atteints d'endobrachyœsophage avec dysplasie de bas grade (DBG) ayant un risque élevé de transformation carcinomateuse. Un groupe de patients atteints de DBG ayant évolué vers un cancer, et un groupe de patients atteints de DBG sans évolution connue ont été comparés. La surexpression de p53 en immunohistochimie, mais pas les mutations du gène TP53, était significativement plus fréquente dans la DBG du groupe d'étude. La valeur prédictive de progression de la surexpression de p53 était supérieure à celle des mutations de TP53. La surexpression de p53 concordait rarement avec la mutation de TP53. Cette étude suggère que la progression néoplasique de l'endobrachyœsophage implique d'autres mécanismes d'inactivation de p53 que la mutation.NANTES-BU Médecine pharmacie (441092101) / SudocSudocFranceF

Mécanismes cellulaires et moléculaires des perturbations du renouvellement de l'épithelium intestinal et de l'oncogenèse au cours des maladies inflammatoires chroniques de l'intestin

L'homéostasie de la barrière intestinale peut-être rompue au cours de 2 processus physiopathologiques : 1) la prolifération incontrôlée des cellules épithéliales au cours d'un processus de régénération cicatricielle pouvant initier un processus d'oncogenèse, et 2) une perte cellulaire accélérée suite à une réponse inflammatoire de la muqueuse. Ce travail de thèse est divisé en 2 parties. L'une, clinico-pathologique et biologique, est fondée sur l'exploitation d'une population de patients atteints de maladie inflammatoire chronique de l intestin (MICI) et ayant développé des lésions coliques selon la séquence inflammation / régénération / dysplasie / cancer. Cette approche a permis de valider des marqueurs phénotypiques et génotypiques susceptibles d'être associés à chacune des étapes du processus d oncogenèse. L'autre, fondamentale, est fondée sur l'exploitation d'un nouveau modèle de culture d'explants de muqueuse colique humaine normale et a permis de recréer ex vivo l initiation d une réponse inflammatoire de type Th1. Ces 2 approches ont apporté des éléments nouveaux : - Le remodelage épithélial au cours des MICI est associé à la voie des tumeurs festonnées, voie de carcinogenèse récemment décrite dans les cancers du colon sporadiques, définie par une signature morphologique et oncogénétique originale (mutation de BRAF et statut MSI de la tumeur) (article 1). - La régénération épithéliale au cours des MICI coïncide avec l'expression du récepteur de la neurotensine, NTS1. Cette expression est régulée soit par son propre ligand, la neurotensine, soit par la b caténine (article 2).- L intégrité de la barrière épithéliale intestinale chez l'homme est dépendante de 2 cytokines dites cytokines du mutualisme , l IL10 et le TGFb, produites par les cellules résidentes de la muqueuse. En l'absence d IL10, le LPS endogène déclenche une réponse immunitaire de type Th1 à l origine de la rupture de la barrière épithéliale (article 3). En conclusion, les approches que nous avons développées, à l origine de résultats originaux, serviront à mieux définir les rapports entre l inflammation intestinale et l oncogenèse colorectaleThe intestinal mucosa homeostasis can be disturbed during two related physiopathological process: 1) an uncontrolled proliferation of epithelial cells during inflammatory repair leading to oncogenesis, and 2) an accelerated cellular loss during intestinal inflammatory response. This work is divided into 2 parts. The first approach is based a cohort of patients suffering from inflammatory bowel disease (IBD) with lesions evolving towards cancer through the inflammation / regeneration / dysplasia / cancer sequence. This approach led us to validate several phenotypic and genotypic markers likely to be associated with the stepwise process of oncogenesis. The other approach is based on the exploitation of a new explant culture model of human normal colonic mucosa that led us to recreate ex vivo the initiation of a Th1 inflammatory response. New findings resulting from these 2 approaches are as follows: - Epithelial remodelling during IBD is associated with the serrated pathway of oncogenesis, first described in sporadic colon cancer. This pathway is defined by a morphological and oncogenetic signature (BRAF mutation and MSI status of the tumor) (article 1). - Epithelial regeneration during IBD is associated with the expression of the neurotensin receptor, NTS1. NTS1 expression is regulated by its ligand, neurotensin or by b catenin (article 2). - Finally, the human intestinal epithelial barrier integrity depends on 2 immunoregulatory cytokines, IL10 and TGFb, produced by mucosal resident cells. After IL10 depletion, endogenous LPS triggers a Th1 immune response leading to epithelial barrier disruption (article 3). In conclusion, the approaches developed led to new findings which will help define the mechanistic link between intestinal inflammation and oncogenesis.NANTES-BU Médecine pharmacie (441092101) / SudocSudocFranceF

Hétérogénéité histopathologique et moléculaire des tumeurs villeuses recto-sigmoïdiennes

Les tumeurs villeuses, définies macroscopiquement, sont des lésions étendues, sessiles, d'aspect villeux, siégeant préférentiellement dans le sigmoïde et le rectum. Ces tumeurs ont été assimilées aux adénomes villeux après la publication de la classification de l'OMS en 1976. La littérature a depuis négligé ces lésions, et leurs caractéristiques morphologiques et moléculaires sont peu connues. Cette étude a évalué cliniquement, histologiquement, immunohistochimiquement et génétiquement, toutes les lésions décrites en endoscopie comme des nappes ou polypes villeux du sigmoïde et du rectum sur ces dix dernières années. L'évaluation a été faite sur la base des données récentes de la littérature des polypes coliques, incluant les polypes festonnés. Nous avons étudié le statut mutationnel des gènes BRAF et KRAS, le statut d'instabilité microsatellitaire, l'expression des protéines MLH1, MGMT et p16INK4A, l'expression nucléaire de la protéine ß-caténine, et l'expression du gène suppresseur de tumeur TP53 dans une série de tumeurs villeuses (n=22). Les tumeurs villeuses du rectum et du sigmoïde étaient rares (0,3%). Isolées à partir d'une population homogène macroscopiquement, les tumeurs villeuses se révélaient hétérogènes histologiquement et génétiquement. Les tumeurs villeuses étaient divisées en 4 groupes: adénomes villeux (n=9), adénomes tubulo-villeux (n=6), adénomes festonnés traditionnels filiformes (n=3) et polypes mixtes adénomateux et hyperplasiques (n=4). Ces groupes étaient souvent associés à des caractéristiques cliniques et moléculaires spécifiques. Toutes les tumeurs villeuses, quelque soit leur histologie, étaient stables pour les microsatellites. Les adénomes villeux étaient fréquemment mutés pour le gène KRAS alors que tous les adénomes festonnés traditionnels étaient mutés pour le gène BRAF et présentaient souvent des arguments pour un phénotype CIMP. Les polypes mixtes adénomateux et hyperplasiques étaient tantôt KRAS, tantôt BRAF mutés. La transformation carcinomateuse des tumeurs villeuses était fréquente et avait les mêmes caractéristiques histologiques et moléculaires que la tumeur villeuse précessive. En conclusion, l'aspect endoscopique villeux ne garantit pas le diagnostic d'adénome villeux, l'aspect histologique des tumeurs villeuses recto-sigmoïdiennes, subordonné à un profil génétique particulier, doit être soigneusement étudié, car il a un impact clinique, évolutif et thérapeutique.NANTES-BU Médecine pharmacie (441092101) / SudocSudocFranceF

Rôle des mitochondries dans les stéatoses et les stéatohépatites non alcooliques

Le syndrome anatomo-clinique dysmétabolique désigné par l'acronyme anglo-saxon NAFLD pour " Non Alcoholic Fatty Liver Disease" inclut les lésions de stéatose et de stéatohépatite non alcoolique (SHNA). La complication majeure de la NAFLD est la cirrhose. La pathogénie de la NAFLD est mal connue. L'hypothèse d'une évolution en 2 phases a été proposée avec une première phase de surcharge et une deuxième phase liée au stress oxydatif responsable de l'activité nécrotico-inflammatoire. La mitochondrie joue un rôle important dans ces 2 phases. Le but de ce travail était de comparer in situ les variations d'expression des mitochondries et du stress oxydatif, par une technique d'immunohistochimie, avec l'activité nécrotico-inflammatoires et l'extension de la fibrose des NAFLD. Entre octobre 2002 et novembre 2003, 15 patients atteints de NAFLD ont été inclus. Les données cliniques et biologiques étaient colligées. Les biopsies hépatiques de ces patients ont été examinées après colorations standards et immunohistochimiques. Les anticorps utilisés étaient dirigés contre les macrophages et les cellules de Kupffer (CD68 et myeloperoxydase), contre les cellules stellaires activées (actine musculaire lisse), contre une protéine mitochondriale (113-1) et contre les nitrotyrosines. Une évaluation de l'activité nécrotico-inflammatoire et de la fibrose a été réalisée. L'intensité de ces lésions a été comparée aux résultats obtenus avec les différents anticorps. Parmi les 15 patients, 1 présentait une stéatose, 5 une stéatose associée à une surcharge ferrique, 5 une stéatohépatite et 4 une stéatohépatite associée à une surcharge ferrique. Les cellules marquées par le CD68 et l'actine musculaire lisse étaient significativement augmentées par rapport au foie normal. Dans tous les cas, il était observé une diminution de l'expression de 113-1 de distribution centrolobulaire et une augmentation diffuse de la nitration. Cette étude suggère, grâce à des outils morphologiques simples, la présence d'une nitration excessive dans la NAFLD dès le stade de stéatose. Elle est associée à une perte fonctionnelle mitochondriale et pourrait jouer un rôle dans l'évolution de la fibrose.NANTES-BU Médecine pharmacie (441092101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

The double stranded RNA analog poly-IC elicits both robust IFN-λ production and oncolytic activity in human gastrointestinal cancer cells

International audienceCopyright: Bou-Hanna et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License 3.0 (CC BY 3.0), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited. ABSTRACT Purpose: Type III IFN (IFN-λ) is the dominant frontline response over type I IFN in human normal intestinal epithelial cells upon viral infection, this response being mimicked by the dsRNA analog poly-IC. Poly-IC also induces cell death in murine intestinal crypts ex vivo. Here we examined whether these innate defense functions of normal intestinal epithelial cells are recapitulated in gastrointestinal carcinoma cells so that they could be harnessed to exert both immunoadjuvant and oncolytic functions, an unknown issue yet. Experimental design: Four human gastrointestinal carcinoma cell lines versus the Jurkat lymphoma cell line were used to assess the effects of intracellular poly-IC on i) IFN-λ secretion and cell proliferation and ii) role of NFκB signaling using the NFκB inhibitory peptide SN50 as a screening probe and a siRNA approach. Results: Poly-IC induced in all cell lines except Jurkat both a robust IFN-λ secretion and a cytoreductive effect on adherent cells, restricted to proliferating cells and associated with cellular shedding and reduced clonogenicity of the shed cells. Collectively these findings demonstrate the oncolytic activity of poly-IC. Inhibiting NFκB in T84 cells using a siRNA approach decreased IFN-λ production without protecting the cells from the poly-IC oncolytic effects. In line with these findings IFN-λ, that upregulated the anti-viral protein MxA, was unable per se to alter T84 cell proliferation. Conclusion: Our demonstration that poly-IC-induced concomitant recapitulation of two innate functions of normal intestine, i.e. IFN-λ production and cell death, by human gastrointestinal cancer cells opens new perspectives in gastrointestinal cancer treatment

The double stranded RNA analog poly-IC elicits both robust IFN-λ production and oncolytic activity in human gastrointestinal cancer cells

International audienceCopyright: Bou-Hanna et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License 3.0 (CC BY 3.0), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited. ABSTRACT Purpose: Type III IFN (IFN-λ) is the dominant frontline response over type I IFN in human normal intestinal epithelial cells upon viral infection, this response being mimicked by the dsRNA analog poly-IC. Poly-IC also induces cell death in murine intestinal crypts ex vivo. Here we examined whether these innate defense functions of normal intestinal epithelial cells are recapitulated in gastrointestinal carcinoma cells so that they could be harnessed to exert both immunoadjuvant and oncolytic functions, an unknown issue yet. Experimental design: Four human gastrointestinal carcinoma cell lines versus the Jurkat lymphoma cell line were used to assess the effects of intracellular poly-IC on i) IFN-λ secretion and cell proliferation and ii) role of NFκB signaling using the NFκB inhibitory peptide SN50 as a screening probe and a siRNA approach. Results: Poly-IC induced in all cell lines except Jurkat both a robust IFN-λ secretion and a cytoreductive effect on adherent cells, restricted to proliferating cells and associated with cellular shedding and reduced clonogenicity of the shed cells. Collectively these findings demonstrate the oncolytic activity of poly-IC. Inhibiting NFκB in T84 cells using a siRNA approach decreased IFN-λ production without protecting the cells from the poly-IC oncolytic effects. In line with these findings IFN-λ, that upregulated the anti-viral protein MxA, was unable per se to alter T84 cell proliferation. Conclusion: Our demonstration that poly-IC-induced concomitant recapitulation of two innate functions of normal intestine, i.e. IFN-λ production and cell death, by human gastrointestinal cancer cells opens new perspectives in gastrointestinal cancer treatment

Hépatite chronique liée au virus C et stéatose hépatique

Objectifs : Préciser les causes de stéatose hépatique et évaluer son retentissement, chez des patients atteints d'une hépatite chronique liée au VHC, afin de définir une CAT de la prise en charge de la stéatose au cours de l'hépatite chronique liée au VHC. Méthode : 46 patients consécutifs ont été inclus de façon rétrospective, tous porteurs d'une hépatite chronique liée au VHC avec stéatose. Les patients étaient successivement séparés en deux groupes : suivant qu'ils avaient ou non des causes de stéatose ; une consommation excessive d'alcool, un génotype 3 du VHC. Un groupe témoin était constitué de 46 patients atteints d'une hépatite chronique liée au VHC sans stéatose. Résultats : 72 % des patients présentaient une ou plusieurs causes non virologiques de stéatose, souvent métaboliques. Le taux moyen des TGP, l'activité de l'hépatite, le % de stéatose n'étaient pas différents qu'ils aient ou non des causes de stéatose. Le taux moyen des TGP, l'activité de l'hépatite, le degré de fibrose n'étaient pas différents qu'ils aient ou non le génotype 3. Le VHC de génotype 3 était plus fréquent dans la population de l'étude avec stéatose, comparée au groupe témoin sans stéatose. Le % moyen de stéatose était plus élevé chez les patients présentant un VHC de génotype 3, il n'y avait pas de différence du taux de stéatose lorsqu'on comparait les patients avec et sans cause de stéatose. La vitesse d'évolution de la fibrose était la même qu'il existe ou non des causes de stéatose, La vitesse d'évolution de la fibrose était la même qu'il existe ou non des causes de stéatose, une consommation excessive d'alcool. Or les études ont montré que l'apparition de la cirrhose était plus rapide chez les sujets présentant une hépatite chronique liée au VHC avec consommation d'alcool. Ceci suggère que la stéatose qu'elle qu'en soit sa cause intervient dans la fibrogenèse. Conclusion : La stéatose hépatique au cours de l'hépatite chronique liée au VHC est multifactorielle. Il faut rechercher ces causes et les prendre en charge, car la stéatose intervient dans la constitution de la cirrhose.ST ETIENNE-BU Médecine (422182102) / SudocSudocFranceF

Comparaison des aspects histologiques et tomodensitométriques des méningiomes microkystiques

Les meningiomes microkystiques sont des meningiomes particuliers par la presence de larges vacuoles dans le cytoplasme des cellules tumorales. Apres l'examen d'un meningiome microkystique dont l'aspect TDM etait trompeur, nous avons voulu determiner les aspects TDM des meningiomes microkystiques. Methodes : nous avons isole 7 meningiomes microkystiques intracraniens parmi les 204 meningiomes analyses dans le service d'Anatomie Pathologique entre 1994 et 2000. Les cliches tomodensitometriques preoperatoires de ces 7 meningiomes ont ete reexamines. Resultats : Trois meningiomes etaient purement microkystiques. Deux etaient homogenes, hypo ou isodenses en TDM. Le troisieme etait heterogene en raison de la presence de sang. Les 4 autres meningiomes associaient des contingents histologiques fibreux ou meningotheliaux au contingent microkystique. Ils etaient heterogenes en TDM. Les 7 tumeurs etaient appendues a la dure-mere. Les cliches apres injection etaient disponibles pour 6 tumeurs : 3 d'entre elles etaient heterogenes. Dans ces 3 cas, le diagnostic tomodensitometrique propose etait astrocytome. Conclusion : La presence d'un contingent microkystique dans un meningiome rend son diagnostic tomodensitometrique difficile : l'heterogeneite de ce type particulier de meningiome apres injection de produit de contraste est souvent responsable d'un diagnostic tomodensitometrique errone d'astrocytome.ST ETIENNE-BU Médecine (422182102) / SudocSudocFranceF