Fabricación y caracterización estructural de láminas delgadas de Cu-Al-Ni con memoria de forma

Esta tesis se centra en el estudio de l´aminas delgadas de aleaciones Cu-Al-Ni con memoria de forma crecidas por pulverizaci´on cat´odica. Estas poseen potenciales apli- ´ caciones en dispositivos micro electromec´anicos. La transformaci´on martens´ıtica del material, que da origen al efecto memoria de forma, es sensible a la microestructura y al espesor de las l´aminas delgadas. La microestructura, a su vez, depende de las condiciones de fabricaci´on. Con el objetivo de determinar cu´ales son las mejores condiciones para obtener l´aminas delgadas de aleaciones Cu-Al-Ni con efecto memoria de forma, se crecieron l´aminas a diferentes temperaturas del sustrato (TS). Esta temperatura, la cual se vari´o entre temperatura ambiente y 823 K, afecta la microestructura y las caracter´ısticas de la transformaci´on martens´ıtica en las l´aminas. Sobre las l´aminas que presentaron transformaci´on martens´ıtica, se probaron diferentes m´etodos para lograr que el material deforme de manera controlada. Estos m´etodos consistieron en modificar una de las superficies de las l´aminas, ya sea por litograf´ıa con posterior comido i´onico o implantaci´on de iones de O o Al. La microestructura de las l´aminas delgadas fue analizada mediante difracci´on de rayos X y microscop´ıa electr´onica de transmisi´on. La transformaci´on martens´ıtica fue caracterizada a partir de mediciones de resistencia el´ectrica en funci´on de la temperatura. Los resultados muestran que la transformaci´on martens´ıtica es fuertemente afectada por la microestructura, lo cual se evidencia por incrementos en el rango de temperatura de transformaci´on e hist´eresis mayores respecto a muestras masivas. Se crecieron l´aminas delgadas de tama˜nos de grano comprendidos entre 30 nm y varios micr´ometros, las cuales presentan transformaci´on martens´ıtica. Al aumentar el tama˜no de grano se encontr´o que tanto la hist´eresis como el rango de temperaturas de transformaci´on disminuyen mientras que el salto de resistencia el´ectrica aumenta. Esto es producto de la disminuci´on en la densidad de bordes de grano, lo cual disminuye la barrera energ´etica para la transformaci´on martens´ıtica. Analizando l´aminas delgadas policristalinas de espesores entre 0,10 y 2,25 µm se encontr´o que al reducir el espesor se estabiliza la fase austen´ıtica, dificultando la transformaci´on martens´ıtica hasta el punto de ser suprimida por completo. El efecto memoria de forma se analiz´o deformando las l´aminas a baja temperatura en fase martens´ıtica y observando si se recuperaba la forma al calentar por encima de la temperatura de transformaci´on, en fase austen´ıtica. Este efecto se encontr´o presente en muestras con tama˜nos de grano por encima de 100 nm. Se busc´o inducir el efecto doble memoria de forma, el cual es la propiedad de los materiales de alternar entre las formas de tanto la fase martens´ıtica como de la fase austen´ıtica. Se hall´o que la implantaci´on de iones de Al en l´aminas con tama˜no de grano microm´etrico dio los mejores resultados.This thesis focuses on the study of shape memory Cu-Al-Ni thin films based growth by sputtering. These films have potential applications in microelectromechanical systems (MEMS). We found that the martensitic transformation, which originates the shape memory effect, depends on the film thickness and the microstructure. Considering that the microstructure depends on the fabrication conditions and with the objective of determining the optimal growth parameters in Cu-Al-Ni thin films, we modifying the substrate temperature (TS) between room temperature and 823 K. The changes in the microstructure produced by TS affect the characteristic features of the martensitic transformation. For the cases where martensitic transformation is observed, we tried to induce controlled shape memory. The methods consisted of superficial modification with geometrical patterns using optical lithography and ion milling, and damage profiles using implantation of ions such as O and Al. The microstructure of the thin films was analyzed by X-ray diffraction and transmission electron microscopy. The martensitic transformation was characterized from resistance versus temperature measurements. The results show that, in comparison with bulk, the changes in the microstructure modify the martensitic transformation temperature, the temperature range of transformation and the hysteresis. We observe martensitic transformation for Cu-Al-Ni thin films with grain size average between 30 nm and several microns. The increment in the grain size average reduces the temperature range of transformation and the hysteresis, which could be related to the influence of the grain boundary density on the energy barriers. The analysis of the martensitic transformation for samples with thicknesses between 0.1 and 2.25 µm shows that the austenitic phase stabilizes as the thickness decreases. The martensitic transformation is completely suppressed for 0.15 µm. We analyze the shape of the memory effect comparing the changes between samples deformed in the martensitic phase (low temperatures) and the austenite phase (room temperature). We found that samples with grain size average above 100 nm recover the original shape. Moreover, we work on producing thin films that have the two-way memory effect. The best results are obtained for ion implantation with Al.Fil: Morán, Mauricio Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Area de Investigación y Aplicaciones No Nucleares. Gerencia de Física (Centro Atómico Bariloche); Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Energía Nuclear. Instituto Balseiro; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo; Argentin

Martensitic transformation in free-standing Cu-Al-Ni thin films with micrometric grain size

The martensitic transformation of polycrystalline thin films based on shape memory alloys is usually affected by the average grain size and by the thickness. We have carried out a study of the temperature driven martensitic transformation in micrometric grain size Cu-Al-Ni films with 18R structure. Thin films with a thickness of 6 μm were grown by sputtering on highly oriented pyrolytic graphite HOPG (0001) substrate at 873 K. After that, the samples were peeled-off from the substrate and annealed at 1123 K for 30 min. The observed microstructure shows an average grain size of 3.7 (± 0.2) μm. The martensitic start temperature (M s) for different films ranges from 170 K to 370 K due to small changes in the chemical concentration. The influence of surface oxides and changes in the atomic order produced by post-quench aging treatments is analyzed. The results show that while surface passivation has a weak influence, changes in the atomic order increase M s without impacting significantly on the hysteresis. Comparison with previous results of nanometric and micrometric grain size samples reveals that the barriers for the transformation are mainly given by plastic deformation at grain boundaries.Fil: Morán, Mauricio Javier. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Investigación y Aplicaciones No Nucleares. Gerencia de Física (Centro Atómico Bariloche); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; ArgentinaFil: Condo, Adriana Maria. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Investigación y Aplicaciones No Nucleares. Gerencia de Física (Centro Atómico Bariloche); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; ArgentinaFil: Bengió, Silvina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Investigación y Aplicaciones No Nucleares. Gerencia de Física (Centro Atómico Bariloche); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; ArgentinaFil: Soldera, Flavio Andres. Universitat Saarland; AlemaniaFil: Sirena, Martin. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Investigación y Aplicaciones No Nucleares. Gerencia de Física (Centro Atómico Bariloche); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; ArgentinaFil: Haberkorn, Nestor Fabian. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Investigación y Aplicaciones No Nucleares. Gerencia de Física (Centro Atómico Bariloche); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentin

Stress-induced pseudoelasticity in freestanding Cu–Al–Ni thin film by AFM-assisted nanoindentation

Freestanding thin films of Cu–Al–Ni shape memory alloys (SMAs) have attracted interests in recent years for the development of next generation micro-scaled sensors and actuators in MEMS. Thin films’ capacity to recover stress-induced strain is critical to assess their potential for applications in these technologies. In this work, we report for the first time a quantitative study of this capacity in a freestanding Cu–Al–Ni thin film by Atomic Force Microscopy (AFM)-assisted nanoindentation. Stress-induced pseudoelastic (or superelastic) effects were successfully observed by this technique for relatively high strains up to a relative indentation depth of 30% concerning the film thickness. This effect highlights a clear shape memory effect, suggesting a sample's high mechanical performance for potential applications in the design of micro actuators for MEMS technologies. Results enable to set new perspectives of the use of this technique as an efficient methodology for future study of pseudoelasticity in micro/nanostructured SMAs.Fil: Roa Díaz, Simón Andre. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnologia. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnologia - Nodo Bariloche | Comision Nacional de Energia Atomica. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnologia. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnologia - Nodo Bariloche.; ArgentinaFil: Sirena, Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnologia. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnologia - Nodo Bariloche | Comision Nacional de Energia Atomica. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnologia. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnologia - Nodo Bariloche.; ArgentinaFil: Morán, Mauricio Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Recrystallization and martensitic transformation in nanometric grain size Cu-Al-Ni thin films grown by DC sputtering at room temperature

We report the recrystallization of metastable hexagonal and body centered cubic BCC phase in free-standing 6 μm thick Cu-Al-Ni films grown by DC sputtering at room temperature. The results show that the BCC phase recrystallizes to L2_1 at around 533 K together with precipitation of γ2-phase. Annealing temperatures (533 K-623 K) at short times (0-30 min) produce systematic increment of the fraction of γ2-phase. Films with phase coexistence of hexagonal, γ2 and L2_1 structure display temperature driven martensitic transformation. This transformation is observed for samples with austenite grain size of around 30 nm. In all cases, the martensitic transformation temperature (MS) notoriously decreases (compared to bulk) and systematically increases with the annealing temperatures and annealing time. In addition, the films display extended transformation and retransformation ranges along with asymmetric hysteresis, which may be associated to restitutive forces due to elastic deformations at martensite - martensite and martensite - austenite interfaces. Annealing temperatures above 623 K produce fast precipitation to equilibrium α- and γ2-phases. The austenitic phase can be recovered after annealing over 1000 K and fast quenching in ice-water.Fil: Morán, Mauricio Javier. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Energía Nuclear. Instituto Balseiro; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Condó, Sergio Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Energía Nuclear. Instituto Balseiro; ArgentinaFil: Haberkorn, Nestor Fabian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Energía Nuclear. Instituto Balseiro; Argentin

Dislocation density evolution in cold-rolled Zr-2.5%Nb pressure tubes under thermal treatments by high energy XRD and neutron TOF diffraction peak profile analysis

Diffraction line profile analysis was done to characterize the change in the dislocation density at different stages of the processing route of a Zr-2.5%Nb pressure tube. Two diffraction experiments were carried out: High Energy X-Ray Diffraction (HE-XRD) and Neutron Time of Flight Diffraction (TOF-ND). On samples in the extruded, cold-rolled and post-annealed conditions, the HE-XRD experiment in transmission geometry allows a detailed characterization of the dependence of the line shape on the direction of the scattering vector. Important variations of the FWHM (Full Width at Half Maximum) were observed, which was interpreted as the non-uniform distribution of dislocations among grains with different orientations. Average values of the dislocation density and subgrain size were obtained after applying the Warren-Averbach method. The effect of post deformation annealing for soaking temperatures from 400° to 450°C was studied using TOF-ND. Peak profile analysis was performed on in-situ neutron time-of-flight diffractograms to obtain peak positions and widths to calculate residual stresses and dislocation densities. The results show that the dislocation density decreases largely at early times and it is followed by a slow diminution over time. Dislocation density decreases from ∼8 × 1014 m−2 for the cold-rolled sample to values close or under 2 × 1014 m−2. A remnant dislocation density after long annealing times was detected, with a value that decreases as the soaking temperature increases. Dislocation type was also characterized. It was found that dislocations with 〈a〉 Burgers vectors represent approximately 90% of the population, while the other 10% are 〈c+a〉. An empirical recovery kinetics model was proposed where dislocation mobility is assumed as a thermally activated mechanism. This model can be used as a processing tool to estimate the dislocation density expected for different soaking temperatures and times. The effect of residual stresses on peak broadening was also discussed. It was estimated that this contribution represents around 10–20% to the observed physical line broadening.Fil: Morán, Mauricio Javier. Comisión Nacional de Energía Atómica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Álvarez, M. Vicente. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica; ArgentinaFil: Vizcaino, Pablo. Comisión Nacional de Energía Atómica. Centro Atómico Ezeiza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Brown, D.W.. Los Alamos National High Magnetic Field Laboratory; Estados UnidosFil: Santisteban, Javier Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica; Argentin

Características de las crisis hipertensivas en los pacientes atendidos en el área de emergencia del Hospital Vicente Corral Moscoso de la ciudad de Cuenca, en los años 2005 - 2006

Es un Estudio Epidemiológico de Carácter Descriptivo; Retrospectivo, que busca conocer las características de las crisis hipertensivas en los pacientes atendidos en el área de emergencia en los años 2005 - 2006. La información fue recogida de los libros de registro de la Emergencia del hospital correspondiente a las áreas de Medicina Interna, Gineco obstetricia y Cirugía, esta información fue ingresada a una base de datos en los programas de Epi Info y Microsoft. Excel. Resultados: De un total de 52277 archivos se obtuvo que 1086 pacientes presentaron crisis hipertensivas en la emergencia del HVCM, equivalente al 2.07de todas las causas de emergencias. El tipo de C H que más se atiende son las Urgencias Hipertensivas con el 82.12frente a las Emergencias Hipertensiva con el 18.88. La Emergencia hipertensiva que mayormente se presenta son los ECV con el 90.73de presentación. La edad de presentación de estas Crisis corresponde a la 5ta y 6ta década de vida, excluyendo al grupo de Gineco obstetricia donde la presentación de C H es diferente por su estado gestacional. El sexo que mayormente se ve afectado es el femenino con el 71.11frente el masculino con el 28.83. El 58.47de los pacientes con crisis hipertensiva ya tenían un diagnóstico previo de hta frente al 41.53que no poseía este diagnóstico. La familia farmacológica más utilizada son los IECA con el 71de elección en las Áreas de Clínica y Cirugía mientras que en Gineco Obstetricia son los Vasodilatadores Directos como la Hidralazina con el 30.11, sin embargo la norma que más se presenta en este servicio es la hospitalización con el 42.14de las pacientes maternas. Este estudio provee información nueva e importante sobre las características de los pacientes con hta atendidos en el HVCM y el manejo médico que reciben en dicha instituciónMédicoCuenc

Crystallographic Texture Study of Nano-SiC-Doped MgB2 Wires

In this work, we present the characterization of Ti sheathed MgB2 wires prepared by PIT with two different cross-sections: circular and hexagonal. We determined the crystallographic texture of both the Ti sheath and the MgB 2 core by X-ray diffraction (XRD) pole figures. We evaluated the critical current density (Jc) of the wires in two different directions using a SQUID magnetometer, in order to determine the anisotropic factor of the current density (Jaf). We found that J af is larger than one and it is field independent for both wires, consistently with the increased probability to encounter the basal planes perpendicular to the axial direction (AD) obtained in the crystallographic texture.Fil: Melone, Mauro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; ArgentinaFil: Morán, Mauricio Javier. Comisión Nacional de Energía Atómica. Centro Atómico Bariloche; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; ArgentinaFil: Malamud, Florencia. Comisión Nacional de Energía Atómica. Centro Atómico Bariloche; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; ArgentinaFil: Malachevsky, Maria Teresa. Comisión Nacional de Energía Atómica. Centro Atómico Bariloche; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; ArgentinaFil: Serquis, Adriana Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnología. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnología - Nodo Bariloche | Comisión Nacional de Energía Atómica. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnología. Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnología - Nodo Bariloche; Argentin

Martensitic transformation in freestanding and supported Cu–Al–Ni thin films obtained at low deposition temperatures

In order to use the shape memory alloy Cu-Al-Ni in micro-actuators, freestanding thin films with martensitic transformation are required. Here we show that freestanding Cu-Al-Ni thin films with L21 structure, martensitic transformation and shape memory effect can be obtained using iron as a sacrificial layer. The Cu-Al-Ni films with best performance are obtained at deposition temperatures between 533 K and 563 K. The Fe layer can afterwards be removed selectively by electrochemical etching.Fil: Morán, Mauricio Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Energía Nuclear. Instituto Balseiro; ArgentinaFil: Condo, Adriana Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Energía Nuclear. Instituto Balseiro; ArgentinaFil: Soldera, Flavio. Universitat Saarland; AlemaniaFil: Sirena, Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Energía Nuclear. Instituto Balseiro; ArgentinaFil: Haberkorn, Nestor Fabian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia del Área de Energía Nuclear. Instituto Balseiro; Argentin

The Transcriptomic Portrait of Locally Advanced Breast Cancer and Its Prognostic Value in a Multi-Country Cohort of Latin American Patients

Purposes: Most molecular-based published studies on breast cancer do not adequately represent the unique and diverse genetic admixture of the Latin American population. Searching for similarities and differences in molecular pathways associated with these tumors and evaluating its impact on prognosis may help to select better therapeutic approaches. Patients and Methods: We collected clinical, pathological, and transcriptomic data of a multi-country Latin American cohort of 1,071 stage II-III breast cancer patients of the Molecular Profile of Breast Cancer Study (MPBCS) cohort. The 5-year prognostic ability of intrinsic (transcriptomic-based) PAM50 and immunohistochemical classifications, both at the cancer-specific (OSC) and disease-free survival (DFS) stages, was compared. Pathway analyses (GSEA, GSVA and MetaCore) were performed to explore differences among intrinsic subtypes. Results: PAM50 classification of the MPBCS cohort defined 42·6% of tumors as LumA, 21·3% as LumB, 13·3% as HER2E and 16·6% as Basal. Both OSC and DFS for LumA tumors were significantly better than for other subtypes, while Basal tumors had the worst prognosis. While the prognostic power of traditional subtypes calculated with hormone receptors (HR), HER2 and Ki67 determinations showed an acceptable performance, PAM50-derived risk of recurrence best discriminated low, intermediate and high-risk groups. Transcriptomic pathway analysis showed high proliferation (i.e. cell cycle control and DNA damage repair) associated with LumB, HER2E and Basal tumors, and a strong dependency on the estrogen pathway for LumA. Terms related to both innate and adaptive immune responses were seen predominantly upregulated in Basal tumors, and, to a lesser extent, in HER2E, with respect to LumA and B tumors. Conclusions: This is the first study that assesses molecular features at the transcriptomic level in a multicountry Latin American breast cancer patient cohort. Hormone-related and proliferation pathways that predominate in PAM50 and other breast cancer molecular classifications are also the main tumor-driving mechanisms in this cohort and have prognostic power. The immune-related features seen in the most aggressive subtypes may pave the way for therapeutic approaches not yet disseminated in Latin America. Clinical Trial Registration: ClinicalTrials.gov (Identifier: NCT02326857). Copyright © 2022 Llera, Abdelhay, Artagaveytia, Daneri-Navarro, Müller, Velazquez, Alcoba, Alonso, Alves da Quinta, Binato, Bravo, Camejo, Carraro, Castro, Castro-Cervantes, Cataldi, Cayota, Cerda, Colombo, Crocamo, Del Toro-Arreola, Delgadillo-Cisterna, Delgado, Dreyer-Breitenbach, Fejerman, Fernández, Fernández, Fernández, Franco-Topete, Gabay, Gaete, Garibay-Escobar, Gómez, Greif, Gross, Guerrero, Henderson, Lopez-Muñoz, Lopez-Vazquez, Maldonado, Morán-Mendoza, Nagai, Oceguera-Villanueva, Ortiz-Martínez, Quintero, Quintero-Ramos, Reis, Retamales, Rivera-Claisse, Rocha, Rodríguez, Rosales, Salas-González, Sanchotena, Segovia, Sendoya, Silva-García, Trinchero, Valenzuela, Vedham, Zagame, United States-Latin American Cancer Research Network (US-LACRN) and Podhajcer.Fil: Llera, Andrea Sabina. Fundación Instituto Leloir-CONICET. Molecular and Cellular Therapy Laboratory; ArgentinaFil: Abdelhay, Eliana Saul Furquim Werneck. Instituto Nacional de Câncer. Bone Marrow Transplantation Unit; BrasilFil: Artagaveytia, Nora. Universidad de la República. Hospital de Clínicas Manuel Quintela; UruguayFil: Daneri-Navarro, Adrián. Universidad de Guadalajara; MéxicoFil: Müller, Bettina. Instituto Nacional del Cáncer; ChileFil: Velazquez, Carlos. Universidad de Sonora; MéxicoFil: Alcoba, Elsa B. Hospital Municipal de Oncología María Curie; ArgentinaFil: Alonso, Isabel. Centro Hospitalario Pereira Rossell; UruguayFil: Alves da Quinta, Daniela B. Fundación Instituto Leloir-CONICET. Molecular and Cellular Therapy Laboratory; ArgentinaFil: Alves da Quinta, Daniela B. Universidad Argentina de la Empresa (UADE). Instituto de Tecnología (INTEC); ArgentinaFil: Binato, Renata. Instituto Nacional de Câncer. Bone Marrow Transplantation Unit; BrasilFil: Bravo, Alicia Inés. Hospital Regional de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Camejo, Natalia. Universidad de la República. Hospital de Clínicas Manuel Quintela; UruguayFil: Carraro, Dirce Maria. AC Camargo Cancer Center. Centro Internacional de Pesquisa (CIPE). Laboratory of Genomics and Molecular Biology; BrasilFil: Castro, Mónica. Instituto de Oncología Angel Roffo; ArgentinaFil: Castro-Cervantes, Juan M. Hospital de Especialidades CMNO-IMSS; MéxicoFil: Cataldi, Sandra. Instituto Nacional del Cáncer; UruguayFil: Cayota, Alfonso. Institut Pasteur de Montevideo; UruguayFil: Cerda, Mauricio. Universidad de Chile. Instituto de Neurociencias Biomédicas. Facultad de Medicina. Centro de Informática Médica y Telemedicina. Instituto de Ciencias Biomédicas (ICBM). Integrative Biology Program; ChileFil: Colombo, Alicia. Universidad de Chile. Facultad de Medicina y Hospital Clínico. Department of Pathology; ChileFil: Crocamo, Susanne. Instituto Nacional de Câncer. Oncology Department; BrasilFil: Del Toro-Arreola, Alicia. Universidad de Guadalajara; MéxicoFil: Delgadillo-Cisterna, Raúl. Hospital de Especialidades CMNO-IMSS; MéxicoFil: Delgado, Lucía. Universidad de la República. Hospital de Clínicas Manuel Quintela; UruguayFil: Dreyer-Breitenbach, Marisa. Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcantara Gomes; BrasilFil: Fejerman, Laura. University of California Davis. Department of Public Health Sciences and Comprehensive Cancer Center; Estados UnidosFil: Fernández, Elmer A. Universidad Católica de Córdoba. CONICET. Centro de Investigación y Desarrollo en Inmunología y Enfermedades Infecciosas [Centro de Investigación y Desarrollo en Inmunología y Enfermedades Infecciosas (CIDIE); ArgentinaFil: Fernández, Elmer A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; ArgentinaFil: Fernández, Wanda. Hospital San Borja Arriarán; ChileFil: Franco-Topete, Ramón A. Universidad de Guadalajara. Hospital Civil de Guadalajara. Organismo Público Descentralizado (OPD); MéxicoFil: Gabay, Carolina. Instituto de Oncología Angel Roffo; ArgentinaFil: Gaete, Fancy. Hospital Luis Tisne; ChileFil: Garibay-Escobar, Adriana. Universidad de Sonora; MéxicoFil: Gómez, Jorge. Texas A&M University; Estados UnidosFil: Greif, Gonzalo. Institut Pasteur de Montevideo; UruguayFil: Gross, Thomas G. Center for Global Health, National Cancer Institute; Estados UnidosFil: Guerrero, Marisol. Hospital San José; ChileFil: Henderson, Marianne K. Center for Global Health, National Cancer Institute; Estados UnidosFil: Lopez-Muñoz, Miguel E. Universidad de Sonora; MéxicoFil: Lopez-Vazquez, Alejandra. Universidad de Sonora; MéxicoFil: Maldonado, Silvina. Hospital Regional de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Morán-Mendoza, Andrés J. Hospital de Gineco-Obstetricia CMNO-IMSS; MéxicoFil: Nagai, Maria Aparecida. Sao Paulo University Medical School. Cancer Institute of São Paulo (ICESP). Center for Translational Research in Oncology; BrasilFil: Oceguera-Villanueva, Antonio. Instituto Jalisciense de Cancerologia; MéxicoFil: Ortiz-Martínez, Miguel A. Hospital General Regional No. 1. IMSS; MéxicoFil: Quintero, Jael. Universidad de Sonora; MéxicoFil: Quintero-Ramos, Antonio. Universidad de Guadalajara; MéxicoFil: Reis, Rui M. Hospital de Câncer de Barretos. Molecular Oncology Research Center; BrasilFil: Retamales, Javier. Grupo Oncológico Cooperativo Chileno de Investigación; ChileFil: Rivera-Claisse, Ernesto. Centro Estatal de Oncologia; MéxicoFil: Rocha, Darío. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; ArgentinaFil: Rodríguez, Robinson. Hospital Central de las Fuerzas Armadas; UruguayFil: Rosales, Cristina. Hospital Municipal de Oncología María Curie; ArgentinaFil: Salas-González, Efrain. Hospital de Gineco-Obstetricia CMNO-IMSS; MéxicoFil: Sanchotena, Verónica. Hospital Municipal de Oncología María Curie; ArgentinaFil: Segovia, Laura. Hospital Barros Luco Trudeau; ChileFil: Sendoya, Juan Martín. Fundación Instituto Leloir-CONICET. Molecular and Cellular Therapy Laboratory; ArgentinaFil: Silva-García, Aida A. Universidad de Guadalajara. Hospital Civil de Guadalajara. Organismo Público Descentralizado (OPD); MéxicoFil: Trinchero, Alejandra. Hospital Regional de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Valenzuela, Olivia. Universidad de Sonora; MéxicoFil: Vedham, Vidya. National Cancer Institute. Center for Global Health; Estados Unido

The Transcriptomic Portrait of Locally Advanced Breast Cancer and Its Prognostic Value in a Multi-Country Cohort of Latin American Patients.

PurposesMost molecular-based published studies on breast cancer do not adequately represent the unique and diverse genetic admixture of the Latin American population. Searching for similarities and differences in molecular pathways associated with these tumors and evaluating its impact on prognosis may help to select better therapeutic approaches.Patients and methodsWe collected clinical, pathological, and transcriptomic data of a multi-country Latin American cohort of 1,071 stage II-III breast cancer patients of the Molecular Profile of Breast Cancer Study (MPBCS) cohort. The 5-year prognostic ability of intrinsic (transcriptomic-based) PAM50 and immunohistochemical classifications, both at the cancer-specific (OSC) and disease-free survival (DFS) stages, was compared. Pathway analyses (GSEA, GSVA and MetaCore) were performed to explore differences among intrinsic subtypes.ResultsPAM50 classification of the MPBCS cohort defined 42·6% of tumors as LumA, 21·3% as LumB, 13·3% as HER2E and 16·6% as Basal. Both OSC and DFS for LumA tumors were significantly better than for other subtypes, while Basal tumors had the worst prognosis. While the prognostic power of traditional subtypes calculated with hormone receptors (HR), HER2 and Ki67 determinations showed an acceptable performance, PAM50-derived risk of recurrence best discriminated low, intermediate and high-risk groups. Transcriptomic pathway analysis showed high proliferation (i.e. cell cycle control and DNA damage repair) associated with LumB, HER2E and Basal tumors, and a strong dependency on the estrogen pathway for LumA. Terms related to both innate and adaptive immune responses were seen predominantly upregulated in Basal tumors, and, to a lesser extent, in HER2E, with respect to LumA and B tumors.ConclusionsThis is the first study that assesses molecular features at the transcriptomic level in a multicountry Latin American breast cancer patient cohort. Hormone-related and proliferation pathways that predominate in PAM50 and other breast cancer molecular classifications are also the main tumor-driving mechanisms in this cohort and have prognostic power. The immune-related features seen in the most aggressive subtypes may pave the way for therapeutic approaches not yet disseminated in Latin America.Clinical trial registrationClinicalTrials.gov (Identifier: NCT02326857)