Genótipos do vírus da hepatite C em pacientes em hemodiálise no Distrito Federal, Brasil

Hepatitis C virus (HCV) genotypes and subtypes were determined in hemodialysis patients in the Federal District, Brazil, by sequencing of the 5' noncoding (NC) and nonstructural 5B (NS5B) regions. From 761 patients, 66 anti-HCV-positive samples were tested for HCV RNA. All 51 HCV RNA-positive samples by PCR of the 5' NC region were genotyped as genotypes 1 (90.2%) and 3 (9.8%). Subtype 1a (82.3%) was the most prevalent, followed by subtypes 3a (9.8%), 1b (5.9%) and 1a/1b (2.0%). Forty-two samples could be amplified and genotyped in the NS5B region: 38 (90.5%) as genotype 1, subtypes 1a, and 8 (9.5%) as genotype 3, subtype 3a. For the 42 samples sequenced in both regions, the genotypes and subtypes determined were concordant in 100% and 95.2% of cases, respectively. Two samples presented discrepant results, with the 5' NC region not distinguishing correctly the subtypes 1a and 1b. These findings indicate that the HCV genotype 1, subtype 1a, is the most prevalent among hemodialysis patients in the Federal District, Brazil.Os genótipos e subtipos do vírus da hepatite C (HCV) foram determinados em pacientes em hemodiálise no Distrito Federal, Brasil, pelo sequenciamento das regiões 5' não codificante (NC) e não estrutural 5B (NS5B). De 761 pacientes, 66 amostras anti-HCV positivas foram testadas para RNA-HCV. Todas as 51 amostras RNA-HCV positivas por PCR para a região 5' NC foram genotipadas como dos genótipos 1 (90,2%) e 3 (9,8%). O subtipo 1a (82,3%) foi o mais prevalente, seguido pelos subtipos 3a (9,8%), 1b (5,9%) e 1a/1b (2,0%). Quarenta e duas amostras puderam ser amplificadas e genotipadas na região NS5B: 38 (90,5%) como genótipo 1, subtipo 1a, e 8 (9,5%) como genótipo 3, subtipo 3a. Para as 42 amostras sequenciadas nas duas regiões, os genótipos e subtipos determinados foram concordantes em 100% e 95,2% dos casos, respectivamente. Duas amostras apresentaram resultados discrepantes, sendo que a região 5' NC não diferenciou corretamente os subtipos 1a e 1b. Estes achados indicam que o genótipo 1, subtipo 1a, do HCV é o mais prevalente em pacientes em hemodiálise no Distrito Federal, Brasil

Distribution of hepatitis C virus genotypes among blood donors from mid-west region of Brazil

In order to investigate the hepatitis C virus (HCV) genotypes in mid-west region of Brazil, 250 anti-HCV positive blood donors were studied. Among them, the anti-HCV serological status was confirmed in 205 (82%). HCV RNA was detected in 165 samples, which were genotyped. HCV types 1, 2 and 3 were found in 67.9%, 3% and 29.1% of the donors, respectively. In Goiás state, subtype 1a (50%) was the most prevalent, followed by subtypes 3a (30.9%) and 1b (16.7%). In Mato Grosso state, subtype 1a was also predominant (41%), followed by subtypes 1b (29.5%) and 3a (25%). In Mato Grosso do Sul state, subtypes 1a and 1b were detected equally (36.8%), followed by 3a (21.1%). Subtype 2b was rare (2.4%, 4.5% and 5.3%, respectively). In Distrito Federal, subtype 3a (39%) was more frequent than 1a (31.7%) and the remaining (29.3%) belonged to subtype 1b.Com objetivo de determinar os genótipos do vírus da hepatite C (HCV) circulantes na Região Centro-Oeste do Brasil, 250 doadores de sangue anti-HCV positivos foram estudados. Dentre eles, a positividade para anti-HCV foi confirmada em 205 (82%). O RNA-HCV foi detectado em 165 amostras, as quais foram genotipadas. Os tipos 1, 2 e 3 do HCV foram encontrados em 67,9%, 3% e 29,1% dos doadores, respectivamente. No Estado de Goiás, o subtipo 1a (50%) foi o mais prevalente, seguido pelos subtipos 3a (30,9%) e 1b (16,7%). No Estado de Mato Grosso, o subtipo 1a (41%) foi também predominante, seguido pelos subtipos 1b (29,5%) e 3a (25%). No Estado de Mato Grosso do Sul, os subtipos 1a e 1b foram igualmente detectados (36,8%), seguidos por 3a (21,1%). O subtipo 2b foi raro (2,4%, 4,5% e 5,3%, respectivamente). No Distrito Federal, o subtipo 3a (39%) foi mais freqüente que 1a (31,7%), sendo o restante (29,3%) identificado como subtipo 1b

Variabilidade do gene da proteína capsidial do Grapevine leafroll-associated virus 3 no Brasil

Leafroll is an economically important disease affecting grapevines (Vitis spp.). Nine serologically distinct viruses, Grapevine leafroll-associated virus-1 through 9, are associated with this disease. The present study describes the coat protein gene sequence of four GLRaV-3 isolates occurring in the São Francisco River basin, Northeastern Brazil. The viral RNA was extracted from GLRaV-3 ELISA-positive plants and the complete coat protein gene was amplified by RT-PCR. Sequences were generated automatically and compared to the complete coat protein sequence from North American (NY1) and Chinese (Dawanhong Nº2 and SL10) GLRaV-3 isolates. The four studied isolates, named Pet-1 through 4, showed deduced amino acid identities of 98-100% (Pet-1 through 3) and 95% (Pet-4) with North American and Chinese isolates. A total of seventeen amino acid substitutions was detected among the four characterized isolates in comparison to the NY1, Dawanhong No.2 and SL10 sequences. The results indicated the existence of natural variation among GLRaV-3 isolates from grapevines, also demonstrating a lack of correlation between sequence data and geographic origin. This variability should be considered when selecting regions of the viral genome targeted for reliable and consistent virus molecular detection.O enrolamento da folha é uma doença economicamente importante que afeta videiras (Vitis spp.). Nove vírus sorologicamente distintos, Grapevine leafroll-associated virus-1 a -9, estão associados à doença. Este estudo descreve a seqüência do gene da proteína capsidial de quatro isolados do GLRaV-3 encontrados no Vale do Rio São Francisco, Nordeste do Brasil. O RNA viral foi extraído de plantas positivas em ELISA para o GLRaV-3 e o gene da proteína capsidial completo foi amplificado por RT-PCR. As seqüências foram geradas automaticamente e comparadas a seqüências completas do gene da proteína capsidial de isolados Norte-Americano (NY1) e Chineses (Dawanhong Nº;2 e SL10) de GLRaV-3. Os quatro isolados estudados, denominados Pet-1 a 4, exibiram identidades de aminoácidos deduzidos de 98-100% (Pet-1 a 3) e 95% (Pet-4) com os isolados Norte-Americano e Chineses. Um total de dezessete substituições de aminoácidos foi detectado entre os quatro isolados caracterizados em comparação com as seqüências do NY1, Dawanhong No.2 e SL10. Os resultados indicaram a existência de variação natural entre os isolados de GLRaV-3 de videiras, demonstrando também a falta de correlação entre dados de sequência e origem geográfica. Esta variabilidade deve ser considerada quando se selecionam regiões do genoma viral para uma detecção molecular confiável e consistente

Distribuição dos genótipos do vírus da hepatite C em doadores de sangue na Região Centro-Oeste do Brasil

In order to investigate the hepatitis C virus (HCV) genotypes in mid-west region of Brazil, 250 anti-HCV positive blood donors were studied. Among them, the anti-HCV serological status was confirmed in 205 (82%). HCV RNA was detected in 165 samples, which were genotyped. HCV types 1, 2 and 3 were found in 67.9%, 3% and 29.1% of the donors, respectively. In Goiás state, subtype 1a (50%) was the most prevalent, followed by subtypes 3a (30.9%) and 1b (16.7%). In Mato Grosso state, subtype 1a was also predominant (41%), followed by subtypes 1b (29.5%) and 3a (25%). In Mato Grosso do Sul state, subtypes 1a and 1b were detected equally (36.8%), followed by 3a (21.1%). Subtype 2b was rare (2.4%, 4.5% and 5.3%, respectively). In Distrito Federal, subtype 3a (39%) was more frequent than 1a (31.7%) and the remaining (29.3%) belonged to subtype 1b.Com objetivo de determinar os genótipos do vírus da hepatite C (HCV) circulantes na Região Centro-Oeste do Brasil, 250 doadores de sangue anti-HCV positivos foram estudados. Dentre eles, a positividade para anti-HCV foi confirmada em 205 (82%). O RNA-HCV foi detectado em 165 amostras, as quais foram genotipadas. Os tipos 1, 2 e 3 do HCV foram encontrados em 67,9%, 3% e 29,1% dos doadores, respectivamente. No Estado de Goiás, o subtipo 1a (50%) foi o mais prevalente, seguido pelos subtipos 3a (30,9%) e 1b (16,7%). No Estado de Mato Grosso, o subtipo 1a (41%) foi também predominante, seguido pelos subtipos 1b (29,5%) e 3a (25%). No Estado de Mato Grosso do Sul, os subtipos 1a e 1b foram igualmente detectados (36,8%), seguidos por 3a (21,1%). O subtipo 2b foi raro (2,4%, 4,5% e 5,3%, respectivamente). No Distrito Federal, o subtipo 3a (39%) foi mais freqüente que 1a (31,7%), sendo o restante (29,3%) identificado como subtipo 1b

O desenvolvimento dos "Diagnosis Related Groups"- DRGs. Metodologia de classificação de pacientes hospitalares The development of "Diagnosis Related Groups" - DRGs, a methodology for classifying hospital patients

É descrito o processo de desenvolvimento do sistema de classificação de pacientes internados em hospitais que atendem casos agudos, denominada Diagnosis Relatd Group - DRGs, desenvolvido e difundido por pesquisadores da Universidade de Yale, USA. Esse sistema vem a ser um instrumento que permite a mensuração do produto hospitalar, principalmente sob o ponto de vista gerencial. São apresentadas considerações acerca do que é entendido como produto hospitalar, seguindo nos meandros do desenvolvimento dos primeiros DRGs, até a mais recente revisão do sistema. É descrita sua utilização em alguns países e diversos usos potenciais desse sistema, que abrangem desde o uso para pagamento a instrumento de controle de qualidade.<br>The history of Diagnosis Related Groups (DRG's), a system for classifying patients in acute care hospitals, developed by researchers at Yale University, USA, is reviewed. DRGs are an instrument for measuring the hospital product, primarily from a management viewpoint. Starting with a review of the definitions of hospital product, the article follows the course from the first DRGs through the most recent revision, providing a summary of potential and current applications of the system in several countries, which range from payment mechanism to uses in quality control