24 research outputs found
A novel high-content immunofluorescence assay as a tool to identify at the single cell level γ-globin inducing compounds
The identification of drugs capable of reactivating γ-globin to ameliorate β-thalassemia and Sickle Cell anemia is still a challenge, as available γ-globin inducers still have limited clinical indications. High-throughput screenings (HTS) aimed to identify new potentially therapeutic drugs require suitable first-step-screening methods combining the possibility to detect variation in the γ/β globin ratio with the robustness of a cell line. We took advantage of a K562 cell line variant expressing β-globin (β-K562) to set up a new multiplexed high-content immunofluorescence assay for the quantification of γ-and β-globin content at single-cell level. The assay was validated by using the known globin inducers hemin, hydroxyurea and butyric acid and further tested in a pilot screening that confirmed HDACs as targets for γ-globin induction (as proved by siRNA-mediated HDAC3 knockdown and by treatment with HDACs inhibitors entinostat and dacinostat) and identified Heme-oxygenases as novel candidate targets for γ-globin induction. Indeed, Heme-oxygenase2 siRNA knockdown as well as its inhibition by Tin protoporphyrin-IX (TinPPIX) greatly increased γ-globin expression. This result is particularly interesting as several metalloporphyrins have already been developed for clinical uses and could be tested (alone or in combination with other drugs) to improve pharmacological γ-globin reactivation for the treatment of β-hemoglobinopathie
Mortality from gastrointestinal congenital anomalies at 264 hospitals in 74 low-income, middle-income, and high-income countries: a multicentre, international, prospective cohort study
Background: Congenital anomalies are the fifth leading cause of mortality in children younger than 5 years globally. Many gastrointestinal congenital anomalies are fatal without timely access to neonatal surgical care, but few studies have been done on these conditions in low-income and middle-income countries (LMICs). We compared outcomes of the seven most common gastrointestinal congenital anomalies in low-income, middle-income, and high-income countries globally, and identified factors associated with mortality. // Methods: We did a multicentre, international prospective cohort study of patients younger than 16 years, presenting to hospital for the first time with oesophageal atresia, congenital diaphragmatic hernia, intestinal atresia, gastroschisis, exomphalos, anorectal malformation, and Hirschsprung's disease. Recruitment was of consecutive patients for a minimum of 1 month between October, 2018, and April, 2019. We collected data on patient demographics, clinical status, interventions, and outcomes using the REDCap platform. Patients were followed up for 30 days after primary intervention, or 30 days after admission if they did not receive an intervention. The primary outcome was all-cause, in-hospital mortality for all conditions combined and each condition individually, stratified by country income status. We did a complete case analysis. // Findings: We included 3849 patients with 3975 study conditions (560 with oesophageal atresia, 448 with congenital diaphragmatic hernia, 681 with intestinal atresia, 453 with gastroschisis, 325 with exomphalos, 991 with anorectal malformation, and 517 with Hirschsprung's disease) from 264 hospitals (89 in high-income countries, 166 in middle-income countries, and nine in low-income countries) in 74 countries. Of the 3849 patients, 2231 (58·0%) were male. Median gestational age at birth was 38 weeks (IQR 36–39) and median bodyweight at presentation was 2·8 kg (2·3–3·3). Mortality among all patients was 37 (39·8%) of 93 in low-income countries, 583 (20·4%) of 2860 in middle-income countries, and 50 (5·6%) of 896 in high-income countries (p<0·0001 between all country income groups). Gastroschisis had the greatest difference in mortality between country income strata (nine [90·0%] of ten in low-income countries, 97 [31·9%] of 304 in middle-income countries, and two [1·4%] of 139 in high-income countries; p≤0·0001 between all country income groups). Factors significantly associated with higher mortality for all patients combined included country income status (low-income vs high-income countries, risk ratio 2·78 [95% CI 1·88–4·11], p<0·0001; middle-income vs high-income countries, 2·11 [1·59–2·79], p<0·0001), sepsis at presentation (1·20 [1·04–1·40], p=0·016), higher American Society of Anesthesiologists (ASA) score at primary intervention (ASA 4–5 vs ASA 1–2, 1·82 [1·40–2·35], p<0·0001; ASA 3 vs ASA 1–2, 1·58, [1·30–1·92], p<0·0001]), surgical safety checklist not used (1·39 [1·02–1·90], p=0·035), and ventilation or parenteral nutrition unavailable when needed (ventilation 1·96, [1·41–2·71], p=0·0001; parenteral nutrition 1·35, [1·05–1·74], p=0·018). Administration of parenteral nutrition (0·61, [0·47–0·79], p=0·0002) and use of a peripherally inserted central catheter (0·65 [0·50–0·86], p=0·0024) or percutaneous central line (0·69 [0·48–1·00], p=0·049) were associated with lower mortality. // Interpretation: Unacceptable differences in mortality exist for gastrointestinal congenital anomalies between low-income, middle-income, and high-income countries. Improving access to quality neonatal surgical care in LMICs will be vital to achieve Sustainable Development Goal 3.2 of ending preventable deaths in neonates and children younger than 5 years by 2030
AVALIAÇÃO DA QUALIDADE DE PINTINHOS DE UM DIA EM INCUBATÓRIO DE AVÓS (MEDICINA VETERINÁRIA)
O acompanhamento e a avaliação dos processos que podem interferir na qualidade dos pintinhos são imprescindíveis para evitar mortalidade e perda de qualidade dos pintinhos gerando consequentemente, perda econômica para o produtor. O objetivo deste trabalho é relatar e quantificar as maiores causas de descarte e de mortalidade de pintinhos em um incubatório de avós. A pesquisa foi realizada em um incubatório industrial localizado no estado de Goiás, onde foi acompanhado a incubação de um lote de 36.595 ovos durante o período de 23 dias. A idade do lote era de 62 semanas. Foram obtidos 18.764 pintinhos de qualidade do incubatório, sendo 14.196 da linha fêmea e 4.568 da linha macho. Dos pintinhos descartados da linha fêmea, a maioria estava sujo de gema; da linha macho, a maior parte estava com abdômen distendido. Neste estudo, foi possível observar a qualidade de pintinhos de um dia de vida, e foi possível quantificar as maiores causas de descarte em um incubatório de avós.Palavras-Chave: pintinhos; incubatório; qualidade; descarte
UTILIZAÇÃO DE COMPOSTO ORGÂNICO NA RECUPERAÇÃO DE PASTAGENS DEGRADADAS (MEDICINA VETERINÁRIA)
A degradação das pastagens representa como um dos maiores problema nas atividades da pecuária brasileira, afetando diretamente a sustentabilidade do sistema produtivo. Estas pastagens, quando bem manejadas e utilizadas respeitando suas características fisiológicas, exigências climáticas e de fertilidade do solo, mantêm-se produtivas por muito tempo. Essa degradação é decorrente de vários fatores que atuam isoladamente ou em conjunto direta ou indiretamente na cadeia produtiva do sistema agropecuário brasileiro, desde a espécie forrageira, como exemplo da Brachiaria brizantha, sua implantação e o manejo. Assim, faz-se necessário a utilização de técnicas para a recuperação de pastagens, alinhadas as premissas sustentáveis, adubação orgânica, que é uma forma de aperfeiçoar e aproveitar potencialidades dos compostosorgânicas de bovino e frango na adubação da Brachiaria brizantha em degradação. O presente trabalho, e seus experimentos foram conduzidos no campo experimental Riacho Fundo II DF, (CAUB). Tendo como objetivo identificar os benefícios da adubação orgânica na recuperação de pastagem, Brachiaria brizantha, degradada. Os tratamentos foram feitos através de dosagens para cada tipo de composto orgânico, cama frango é composto bovino, com delineamento utilizado foi o de blocos ao acaso, com parcelas divididas. A área experimental de 25,20m2, foi dividida em 1 blocos com 3 canteiros, cada canteiro medindo 2,80m x 3,00m. A adubação utilizando compostos orgânicos de bovinos e cama de frango na Brachiaria brizantha, mostrou eficiência pouco significativa para o quantitativo de compostos utilizado no experimento, para o solo do cerrado o composto bovino demostrou melhor eficiência em ralação à cama de frango.Palavras chave: degradação, pastagens; recuperação de pasto; adubação orgânica
INFLUÊNCIA DO ENRIQUECIMENTO AMBIENTAL NO BEM-ESTAR DOS CÃES HOSPEDADOS EM HÓTEIS (MEDICINA VETERINÁRIA)
O enriquecimento ambiental proporciona uma qualidade de vida para os animais, sendo classificado em cinco categorias: sociais, nutricional, sensorial, físico e cognitivo. Esses enriquecimentos proporcionam ao animal expressar seu comportamento natural, desenvolvimento físico e psicológico. A pesquisa foi realizada em duas etapas, análise comportamental dos cães, e percepção do conhecimento das pessoas em relação ao enriquecimento ambiental. Para avaliação do comportamento, utilizou-se o método de varredura, onde foram selecionados cinco indivíduos hospedados de forma coletiva. Também foi distribuído, em redes sociais, um questionário sobre a percepção das pessoas em relação ao enriquecimento ambiental, utilizando o aplicativo Google Forms como ferramenta para coleta de respostas.. 254 pessoas participaram da pesquisa. 77,2% afirmam que seus pets têm espaço para se exercitar, 52,8% sabem o que é enriquecimento ambiental e 90,4% reconhecem que o ambiente do pet pode melhorar o bem-estar e a vida dele. Esse reconhecimento dos tutores pode reduzir o comportamento estereotipado dos animais, o estrese,a agressão e automutilação. Com essa pesquisa foi observado que os tutores dos animais procuram melhoria na qualidade de vida do seu animal, como melhoria no local onde vive, a alimentação, exercícios físicos.Palavras-Chave: Enriquecimento ambiental, hotel, interação alimentar, enriquecimento nutricional,hospedagem
Rinmaker: a fast, versatile and reliable tool to determine residue interaction networks in proteins
Abstract Background Residue Interaction Networks (RINs) map the crystallographic description of a protein into a graph, where amino acids are represented as nodes and non-covalent bonds as edges. Determination and visualization of a protein as a RIN provides insights on the topological properties (and hence their related biological functions) of large proteins without dealing with the full complexity of the three-dimensional description, and hence it represents an invaluable tool of modern bioinformatics. Results We present RINmaker, a fast, flexible, and powerful tool for determining and visualizing RINs that include all standard non-covalent interactions. RINmaker is offered as a cross-platform and open source software that can be used either as a command-line tool or through a web application or a web API service. We benchmark its efficiency against the main alternatives and provide explicit tests to show its performance and its correctness. Conclusions RINmaker is designed to be fully customizable, from a simple and handy support for experimental research to a sophisticated computational tool that can be embedded into a large computational pipeline. Hence, it paves the way to bridge the gap between data-driven/machine learning approaches and numerical simulations of simple, physically motivated, models
Carcass Characteristics and Qualitative Attributes of Pork from Immunocastrated Animals
An investigation was carried out to assess the carcass characteristics and meat quality aspects of immunocastrated male pigs of medium genetic potential for lean meat deposition in carcass (53 to 55%). When the crossbred Large White x Landrace pigs (n = 45) were 70 days old, they were distributed in a totally randomized design in three treatments (castrated males, females and immunocastrated males) with three replicates of five animals. The pigs were slaughtered when they were 140 days old. Carcass temperature and pH were recorded twice, at 45 min and 24 h after slaughter. The carcasses were evaluated for hot and cold carcass yield, commercial cuts yield, length and depth, back fat thickness, loin eye area and lean meat percentage. The Longissimus dorsi muscle was extracted for analysis of color (L*, a*, b*), exudate loss, cooking loss and centesimal and sensorial analysis of the meat. There were no significant differences for the evaluated parameters between castrated males, immunocastrated males and females, except for backfat thickness between the 7th and 8th thoracic vertebra and the point P2 (lower for immunocastrated males) and carcass temperature at 45 min post slaughter (higher in immunocastrated males), however, this did not interfer with the rate of pH decrease post mortem and the meat quality. The results from this research did not indicate a benefit of immunocastration on carcass characteristics of pigs of medium genetic potential for lean meat deposition in carcass, when compared to surgical castration
Hydrochoerus hydrochaeris: ECOLOGIA E POTENCIAL DA ESPÉCIE PARA PRODUÇÃO - UMA REVISÃO/ Hydrochoerus hydrochaeris: ECOLOGY AND THE SPECIES POTENTIAL FOR PRODUCTION- A REVIEW
A capivara (Hydrochoerus hydrochaeris), maior roedor existente, é considerado um animal silvestre de interesse econômico. Entretanto, no Brasil, restrições legais impedem o desenvolvimento de sistemas de manejo das populações silvestres livres. Fora do Brasil, há o exemplo da Venezuela, onde é praticada a exploração sustentável das populações silvestres de capivaras, por meio da caça controlada, que é uma opção viável para o controle deste roedor e uma nova fonte de renda para a população. Essa revisão foi redigida com o objetivo de discutir sobre a ecologia da espécie, a sua importância para a produção animal, padrões de consumo da carne e mercado consumidor.Palavras-chave: danos, mercado consumidor, sistema de uso sustentável</p