The SWR1 Histone Replacement Complex Causes Genetic Instability and Genome-Wide Transcription Misregulation in the Absence of H2A.Z

The SWR1 complex replaces the canonical histone H2A with the variant H2A.Z (Htz1 in yeast) at specific chromatin regions. This dynamic alteration in nucleosome structure provides a molecular mechanism to regulate transcription, gene silencing, chromosome segregation and DNA repair. Here we show that genetic instability, sensitivity to drugs impairing different cellular processes and genome-wide transcriptional misregulation in htz1Δ can be partially or totally suppressed if SWR1 is not formed (swr1Δ), if it forms but cannot bind to chromatin (swc2Δ) or if it binds to chromatin but lacks histone replacement activity (swc5Δ and the ATPase-dead swr1-K727G). These results suggest that in htz1Δ the nucleosome remodelling activity of SWR1 affects chromatin integrity because of an attempt to replace H2A with Htz1 in the absence of the latter. This would impair transcription and, either directly or indirectly, other cellular processes. Specifically, we show that in htz1Δ, the SWR1 complex causes an accumulation of recombinogenic DNA damage by a mechanism dependent on phosphorylation of H2A at Ser129, a modification that occurs in response to DNA damage, suggesting that the SWR1 complex impairs the repair of spontaneous DNA damage in htz1Δ. In addition, SWR1 causes DSBs sensitivity in htz1Δ; consistently, in the absence of Htz1 the SWR1 complex bound near an endonuclease HO-induced DSB at the mating-type (MAT) locus impairs DSB-induced checkpoint activation. Our results support a stepwise mechanism for the replacement of H2A with Htz1 and demonstrate that a tight control of this mechanism is essential to regulate chromatin dynamics but also to prevent the deleterious consequences of an incomplete nucleosome remodelling

Predictions for the future of kallikrein-related peptidases in molecular diagnostics

Kallikrein-related peptidases (KLKs) form a cancer-related ensemble of serine proteases. This multigene family hosts the most widely used cancer biomarker that is PSA-KLK3, with millions of tests performed annually worldwide. The present report provides an overview of the biomarker potential of the extended KLK family (KLK1-KLK15) in various disease settings and envisages approaches that could lead to additional KLK-driven applications in future molecular diagnostics. Particular focus is given on the inclusion of KLKs into multifaceted cancer biomarker panels that provide enhanced diagnostic, prognostic and/or predictive accuracy in several human malignancies. Such panels have been described so far for prostate, ovarian, lung and colorectal cancers. The role of KLKs as biomarkers in non-malignant disease settings, such as Alzheimer’s disease and multiple sclerosis, is also commented upon. Predictions are given on the challenges and future directions regarding clinically oriented KLK research

SARS-CoV-2 viral load in nasopharyngeal swabs is not an independent predictor of unfavorable outcome

The aim was to assess the ability of nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load at first patient’s hospital evaluation to predict unfavorable outcomes. We conducted a prospective cohort study including 321 adult patients with confirmed COVID-19 through RT-PCR in nasopharyngeal swabs. Quantitative Synthetic SARS-CoV-2 RNA cycle threshold values were used to calculate the viral load in log10 copies/mL. Disease severity at the end of follow up was categorized into mild, moderate, and severe. Primary endpoint was a composite of intensive care unit (ICU) admission and/or death (n = 85, 26.4%). Univariable and multivariable logistic regression analyses were performed. Nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load over the second quartile (≥ 7.35 log10 copies/mL, p = 0.003) and second tertile (≥ 8.27 log10 copies/mL, p = 0.01) were associated to unfavorable outcome in the unadjusted logistic regression analysis. However, in the final multivariable analysis, viral load was not independently associated with an unfavorable outcome. Five predictors were independently associated with increased odds of ICU admission and/or death: age ≥ 70 years, SpO2, neutrophils > 7.5 × 103/µL, lactate dehydrogenase ≥ 300 U/L, and C-reactive protein ≥ 100 mg/L. In summary, nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load on admission is generally high in patients with COVID-19, regardless of illness severity, but it cannot be used as an independent predictor of unfavorable clinical outcome

I. Encuentro de la Red de Asentamientos Populares : aportes teórico-metodológicos para la reflexión sobre políticas públicas de acceso al hábitat

Contenidos Introducción / M. Cecilia Marengo, Ana Laura Elorza, Virginia Monayar ; Eje 1. Acceso al hábitat y urbanizaciones informales; Asentamientos (in)formales en pequeñas metrópolis del Cono Sur. Estado de situación y debate actual / Ricardo Apaolaza, Elizabeth Zenteno Torres, Marco Sumiza; Un análisis comparativo sobre la expansión de asentamientos populares en las ciudades patagónicas / Santiago Bachiller, Mariana Giaretto, Pablo Marigo, Natalia Usach ; Acceso al Hábitat para los ¨sin techo¨: la lucha por la tierra en la Ciudad de Posadas-Misiones / Myriam Elena Barone, Jonas Dumas, Mariela Dachary, Celia Draganchuk; El mercado informal de suelo y vivienda en resistencia. El caso del asentamiento en "La Rubita" Resistencia, Argentina / María Andrea Benitez, María Victoria Cazorla; Brazos Unidos un realojo en construcción colectiva / Borelli, Lily, Halich, Verónica; Transformaciones en el hábitat de asentamientos informales y políticas públicas sociales. El caso de barrio nuestro hogar III / Renzo Cáceres; Discursividad mediática sobre el acceso y producción del hábitat popular en el barrio Costanera / Debora Leticia Decima; Trayectorias residenciales y usos de la ciudad como clave de lectura de la lucha por el acceso a la ciudad / María Mercedes Di Virgilio, Natalia Cosacov, Denise Brikman, Mercedes Najman; Asentamientos en el borde metropolitano. Avances de investigación, reflexiones y preguntas / Lucas Jordán Dombroski; Repensando el acceso al hábitat en ciudades medias. La problemática habitacional de Tandil / Agustina Girado; Narrativas de un asentamiento de comienzos de siglo: más allá de la épica y la mafia / María Maneiro; Informalidad y periferia urbana. Derivas de la política habitacional / M. Cecilia Marengo, Virginia Monayar, Florencia Sosa; Sobre las ¿nuevas? ocupaciones de tierras. Notas para una periodización de las tomas en San Francisco Solano, 1981-2002 / Santiago Nardin Memorias villeras en disputa sobre las intervenciones estatales de erradicación en Villa 20 (1976-1983) / Julieta Oxman; El Centro para Erradicación de Villas de Emergencia. Planificación, censo y viviendas, Rosario (1964-1983) / Anahí G. Pagnoni; Ensayo de una cartografía de asentamientos informales en la Ciudad de Córdoba / German Gustavo Rebord, Andrea Karina Stiefkens; Urbanización y prácticas estatales en asentamientos populares en Comodoro Rivadavia. El caso del “Barrio las Américas” / Letizia Vázquez; Eje 2: Derecho a la ciudad: conflictos y disputas por el territorio urbano; La ciudad contra el barrio. El caso de los Barrios del Sur en San José de Costa Rica / Pablo Acuña Quiel; Procesos autogestionarios de hábitat popular y políticas urbanas en la ciudad de Ushuaia. Tierra del Fuego. Argentina / Alicia Delia Alcaráz; Conflictos y tensiones en la ocupación del suelo en Posadas. Misiones, Argentina: procesos de diferenciación / Lucia Mariana Andrujovich, Laura Josefa Krujoski,Myriam Elena Barone; Políticas públicas, exclusión y conformación de identidades colectivas / Sandra Raquel Ávalos; La reurbanización del Playón de Chacarita como problema público. Arenas, actores y políticas públicas / Joaquín Benítez; Relocalización, organización y derecho a la ciudad. El caso de Barrio Nuevo (La Plata) / María Sofía Bernat; Resistencias y disputas político-judiciales en casos de desalojos de asentamientos en Buenos Aires / María Cristina Cravino; Análisis de las herramientas territoriales de la organización ArqCom (LP) en el periodo 2012-2018 / Andrea Di Croce Garay, Nahir Meline Cantar, Ángeles Belén Carrizo Romero, Tamara Dileo; Planificación y urbanización del Barrio 31 y 31 bis / Rosana Karina Espejo; Mercado de suelo: tensiones y ambigüedades. El caso de la zona Norte de Resistencia, Chaco, Argentina / Sebastián Galvaliz, María del Rosario Olmedo; Marta Graciela Giró; Experiencias de urbanización y ciudadanización en La Carbonilla. Una propuesta de análisis en escalas / María Belén Garibotti, Luciana Boroccioni, María Florencia Girola ¿Integración? A la trama formal. De complejidades a desafíos / Carolain Izaguirre, Marion Tejera y Carolina Leiva; ¿Urbanizar o aniquilar? Disyuntivas ontológicas en los procesos de urbanización de las sierras de Córdoba / Denise Mattioli; Conflicto y construcción de resistencias en el asentamiento Barrio Flores / Emilia Elisa Molina; Conflictos territoriales y recualificación de la ribera. Los pescadores artesanales y los espacios públicos / Diego Roldán; El Bajo Belgrano: del Barrio de las Latas a la Villa 30 / Valeria Laura Snitcofsky; Líneas de fuga en un barrio de resistencia. Visualización de una lucha / Rafael Ramón Franco Spatuzza; Nuevas legalidades para la reurbanización de villas en CABA. Un desafío para los derechos / Agustín Territoriale, María Julia López; Los Vacíos Urbanos. Dinámicas Urbanas y Respuestas Innovadoras frente al Derecho a la Ciudad / Ezequiel Zeitune, Silvia A Politi, Natalia Czytajlo; Eje 3: Políticas públicas para atender la informalidad y de gestión en el hábitat popular; Tolerancia y precariedad. Advertencias de la política de regularización del Gran Resistencia al RENABAP / Miguel Ángel Barreto, Evelyn Roxana Abildgaard, María Laura Puntel; Adicciones y narcomenudeo, barreras (in) franqueables para los asentamientos informales en Tucumán, Argentina / Paula Boldrini; Políticas de relocalización de villas: ¿qué pasa después? La organización consorcial como práctica comunitaria / María Florencia Bruno, Belén Demoy, Natalia Fainburg, Romina Olejarczyk; La disputa por la participación y la noción de participación en disputa: una reflexión desde el proceso de urbanización de la Villa 31 (2015-2019) / Tomás Capalbo; Economía popular en asentamientos informales del Gran San Miguel de Tucumán / Corina María Cattáneo; La producción de territorialidades en el habitar un asentamiento: procesos de intervención estatal y disociaciones socio espaciales / Magali Chanampa; Estrategias de gestión territorial desde las políticas públicas: replicando el “modelo Medellín” con acento Cordobés / Ana Laura Elorza, Mónica Alvarado Rodríguez, Fani Balcazar, Ernesto Morillo, Mariana Gamboa; Discusiones sobre la conceptualización e identificación de asentamientos informales. Análisis de la realidad en Chubut / María Paula Ferrari, Sergio Andrés Kaminker, Roxana Yanina Velásquez; Barrios autoproducidos en ciudades intermedias. El caso de Río Grande, Tierra del Fuego AIAS / Nadia B. Finck; Luces y sombras del Programa Compra de Vivienda Usada / Elena Inés Gabriel Hernández; Programas de Inclusión Socio-Urbana: ¿Producto de última generación de la Nueva Agenda Urbana? / Fernando Murillo, Gabriel Artese, Andrés Mage; Los dispositivos de espera en las políticas habitacionales / Romina Olejarczyk; Tres debates recurrentes acerca de la vivienda para la población urbana de menores ingresos / Juan Santiago Palero; Nuevos asentamientos precarios: un desafío a la Política Habitacional y Urbana Chilena / Rubén Sepúlveda Ocampo, Felipe Núñez Orrego; Irrumpir con las recetas. Reflexiones en torno a desarrollo, políticas públicas y hábitat popular / Carla Eleonora Pedrazzani, María Inés Sesma.Esta publicación presenta los trabajos del I. Encuentro de la Red de Asentamientos Populares: aportes teórico -metodológicos para la reflexión sobre políticas públicas de acceso al hábitat, desarrollado los días 23 y 24 de mayo de 2019 en la Facultad de Arquitectura, Urbanismo y Diseño de la Universidad Nacional de Córdoba. En las últimas dos décadas, el INVIHAB (Instituto de Investigación de Vivienda y Hábitat) se ha conformado como un espacio de referencia en la investigación, transferencia y formación en temáticas relativas a las políticas de vivienda, territorio, informalidad urbana, ambiente y ciudadanía. Experiencia que ha llevado a la articulación con otros espacios académicos, organizaciones socio-territoriales, gobiernos locales, en el sentido de confluir en la comprensión, reflexión y formulación de propuestas para mitigar las desigualdades socioterritoriales. En este escenario, se viene construyendo una red de investigadores que estudian la informalidad urbana desde diversos enfoques -territoriales, físico-espaciales, sociales, urbanos, laborales, entre otros- tendientes a superar las miradas parciales y locales desde los abordajes teórico metodológicos y propiciar la comprensión del fenómeno desde una perspectiva que abarque la multiplicidad de campos y su complejidad.FIL: Marengo, María Cecilia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Arquitectura, Urbanismo y Diseño; Argentina.FIL: Elorza, Ana Laura. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Arquitectura, Urbanismo y Diseño; Argentina.FIL: Monayar, Virginia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Arquitectura, Urbanismo y Diseño; Argentina

Prevalence of Chagas disease in the Bolivian population of Majorca (Spain)

a b s t r a c t Objective: To establish the prevalence of Trypanosoma cruzi infection in Bolivian (Spain) participants. Methods: A cross sectional study was carried out in Majorca. Bolivian residents older than 18 years assigned to the family physicians of two primary care centers were randomly selected from the health card population database. Participants were invited to attend a serology test and an interview. T. cruzi infection was confirmed after two positive ELISA tests. If the result was positive or dubious, the serological test was sent to the National Microbiology Center for confirmation. Results: A total of 251 participants were included (response rate 36.3%). The overall seroprevalence of Chagas infection was 19.1% (95% CI: 14.06-24.19). Seroprevalence was higher in participants from highly endemic provinces, those from rural areas, those who had lived in mud houses, and in those whose mother or a family member had contracted this infection. Conclusion: This study demonstrates a high prevalence of T. cruzi in Bolivian residents, which was strongly associated with established risk factors

Prevalence of Chagas disease in the Bolivian population of Majorca (Spain)

Objective: To establish the prevalence of Trypanosoma cruzi infection in Bolivian (Spain) participants. Methods: A cross sectional study was carried out in Majorca. Bolivian residents older than 18 years assigned to the family physicians of two primary care centers were randomly selected from the health card population database. Participants were invited to attend a serology test and an interview. T. cruzi infection was confirmed after two positive ELISA tests. If the result was positive or dubious, the serological test was sent to the National Microbiology Center for confirmation. Results: A total of 251 participants were included (response rate 36.3%). The overall seroprevalence of Chagas infection was 19.1% (95% CI: 14.06-24.19). Seroprevalence was higher in participants from highly endemic provinces, those from rural areas, those who had lived in mud houses, and in those whose mother or a family member had contracted this infection. Conclusion: This study demonstrates a high prevalence of T. cruzi in Bolivian residents, which was strongly associated with established risk factors

Response to novel drugs before and after allogeneic stem cell transplantation in patients with relapsed multiple myeloma

Multiple myeloma (MM) remains as an incurable disease and, although allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (allo-HSCT) is a potentially curative approach, most patients ultimately relapse, and their treatment remains challenging. Because allo-HSCT can modify not only the biology of the disease, but also the immune system and the microenvironment, it can potentially enhance the response to rescue therapies. Information on the efficacy and safety of novel drugs in patients relapsing after allo-HSCT is lacking, however. The objectives of this study were to evaluate the efficacy and toxicity of rescue therapies in patients with MM who relapsed after allo-HSCT, as well as to compare their efficacy before and after allo-HSCT. This retrospective multicenter study included 126 consecutive patients with MM who underwent allo-HSCT between 2000 and 2013 at 8 Spanish centers. All patients engrafted. The incidence of grade II-IV acute graft-versus-host disease (GVHD) was 47%, and nonrelapse mortality within the first 100 days post-transplantation was 13%. After a median follow-up of 92 months, overall survival (OS) was 51% at 2 years and 43% at 5 years. The median progression-free survival after allo-HSCT was 7 months, whereas the median OS after relapse was 33 months. Patients relapsing in the first 6 months after transplantation had a dismal prognosis compared with those who relapsed later (median OS, 11 months versus 120 months; P < .001). The absence of chronic GVHD was associated with reduced OS after relapse (hazard ratio, 3.44; P < .001). Most patients responded to rescue therapies, including proteasome inhibitors (PIs; 62%) and immunomodulatory drugs (IMiDs; 77%), with a good toxicity profile. An in-depth evaluation, including the type and intensity of PI- and IMiD-based combinations used before and after allo-HSCT, showed that the overall response rate and duration of response after allo-HSCT were similar to those seen in the pretransplantation period. Patients with MM who relapse after allo-HSCT should be considered candidates for therapy with new drugs, which can achieve similar response rates with similar durability as seen in the pretransplantation period. This pattern does not follow the usual course of the disease outside the transplantation setting, where response rates and time to progression decreases with each consecutive line of treatment