Identification of fast and slow growing rhizobia nodulating soybean (Glycine max [L.] Merr) by a multiplex PCR reaction

Two DNA fragments, a 730-bp and a 900-bp fragment, one homologous to host cultivar specificity genes nolBT of Sinorhizobium fredii and the other one homologous to RSα, an insertion-like sequence present in Bradyrhizobium japonicum, were generated by polymerase chain reaction (PCR) with two pairs of primers. The amount of each fragment generated by the multiplex PCR was proportional to the amount of template DNA present. The amplification of the 900-bp RSα fragment was more sensitive, since it was amplified from a smaller amount of template DNA than the 730-bp nolBT fragment. By running the multiplex reaction in the presence of template DNA isolated from different sources, we confirmed that the reaction can discriminate between S. fredii, Bradyrhizobium japonicum and Sinorhizobium xinjiangensis.Facultad de Ciencias Agrarias y ForestalesInstituto de Fisiología Vegeta

Identification of fast and slow growing rhizobia nodulating soybean (Glycine max [L.] Merr) by a multiplex PCR reaction

Two DNA fragments, a 730-bp and a 900-bp fragment, one homologous to host cultivar specificity genes nolBT of Sinorhizobium fredii and the other one homologous to RSα, an insertion-like sequence present in Bradyrhizobium japonicum, were generated by polymerase chain reaction (PCR) with two pairs of primers. The amount of each fragment generated by the multiplex PCR was proportional to the amount of template DNA present. The amplification of the 900-bp RSα fragment was more sensitive, since it was amplified from a smaller amount of template DNA than the 730-bp nolBT fragment. By running the multiplex reaction in the presence of template DNA isolated from different sources, we confirmed that the reaction can discriminate between S. fredii, Bradyrhizobium japonicum and Sinorhizobium xinjiangensis.Facultad de Ciencias Agrarias y ForestalesInstituto de Fisiología Vegeta

Ensifer (Sinorhizobium) fredii Interacted More Efficiently than Bradyrhizobium japonicum with Soybean

Aims: The purpose of this work was to compare the efficiency of Bradyrhizobium japonicum and Ensifer fredii to infect and develop nodules on soybean. Furthermore we also evaluated the competitive ability of both species and how this was altered by the plant genotype and the soil pH. Study Design: The design of the experiments was completely at random and the number of replicates was different on each of the different experiments tested. Place and Duration of Study: The place of the studies was the Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales Universidad Nacional de La Plata and the duration of the study was a year and a half. Methodology: Roots of inoculated soybean plants were fixed and the number of infection initiation sites was evaluated by means of microscopic observation. The number of nodules developed by inoculated plants was also evaluated. Results: Bacteria were equally effective at developing infection initiation sites on soybean however, E. fredii induced more nodules than B. japonicum, probably due to the fact that E. fredii is more efficient than B. japonicum at nodulating soybean. However, Bradyrhizobium was more competitive than E. fredii which was unrelated to the soybean genotype but altered by the soil pH. Under the conditions described E. fredii was less competitive than B. japonicum probably due to the high cultivar-rhizobia specificity. Conclusion: E. fredii was as efficient as B. japonicum at nodulating soybeans. However Bradyrhizobium was a better competitor though this is affected by the plant genotype and the soil pH. The selection and use of fast growing rhizobia in inoculant production seems to depend on broadening the genetic base of soybean or in selecting cultivars with specificity for fast growing rhizobia.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Fungal mitogenomes: Relevant features to planning plant disease management

Mitochondrial genomes (mt-genomes) are characterized by a distinct codon usage and their autonomous replication. Mt-genomes encode highly conserved genes (mt-genes), like proteins involved in electron transport and oxidative phosphorylation but they also carry highly variable regions that are in part responsible for their high plasticity. The degree of conservation of their genes is such that they allow the establishment of phylogenetic relationships even across distantly related species. Here, we describe the mechanisms that generate changes along mt-genomes, which play key roles at enlarging the ability of fungi to adapt to changing environments. Within mt-genomes of fungal pathogens, there are dispensable as well as indispensable genes for survival, virulence and/or pathogenicity. We also describe the different complexes or mechanisms targeted by fungicides, thus addressing a relevant issue regarding disease management.Despite the controversial origin and evolution of fungal mt-genomes, the intrinsic mechanisms and molecular biology involved in their evolution will help to understand, at the molecular level, the strategies for fungal disease management.Fil: Medina, Rocio. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; ArgentinaFil: Franco, Mario Emilio Ernesto. University of Arizona; Estados Unidos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; ArgentinaFil: Bartel, Laura Cecilia. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología; ArgentinaFil: Martínez Alcántara, Virginia. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales; ArgentinaFil: Saparrat, Mario Carlos Nazareno. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Fisiología Vegetal. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo. Instituto de Fisiología Vegetal; ArgentinaFil: Balatti, Pedro Alberto. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones de Fitopatología; Argentin

Ensifer (Sinorhizobium) fredii Interacted More Efficiently than Bradyrhizobium japonicum with Soybean

Aims: The purpose of this work was to compare the efficiency of Bradyrhizobium japonicum and Ensifer fredii to infect and develop nodules on soybean. Furthermore we also evaluated the competitive ability of both species and how this was altered by the plant genotype and the soil pH. Study Design: The design of the experiments was completely at random and the number of replicates was different on each of the different experiments tested. Place and Duration of Study: The place of the studies was the Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales Universidad Nacional de La Plata and the duration of the study was a year and a half. Methodology: Roots of inoculated soybean plants were fixed and the number of infection initiation sites was evaluated by means of microscopic observation. The number of nodules developed by inoculated plants was also evaluated. Results: Bacteria were equally effective at developing infection initiation sites on soybean however, E. fredii induced more nodules than B. japonicum, probably due to the fact that E. fredii is more efficient than B. japonicum at nodulating soybean. However, Bradyrhizobium was more competitive than E. fredii which was unrelated to the soybean genotype but altered by the soil pH. Under the conditions described E. fredii was less competitive than B. japonicum probably due to the high cultivar-rhizobia specificity. Conclusion: E. fredii was as efficient as B. japonicum at nodulating soybeans. However Bradyrhizobium was a better competitor though this is affected by the plant genotype and the soil pH. The selection and use of fast growing rhizobia in inoculant production seems to depend on broadening the genetic base of soybean or in selecting cultivars with specificity for fast growing rhizobia.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Los rizobios que nodulan la soja en sitios con ambientes nativos y cultivados de la Argentina

La soja es una leguminosa que establece simbiosis con diez especies distintas de Rizobios entre las que se encuentran bacterias de crecimiento rápido y lento. La interacción es el resultado de la expresión de un conjunto de genes en la planta y en la bacteria. En este trabajo se describe que los cultivares de soja de la Argentina presentan variabilidad en su capacidad de nodulación y que se han encontrado dos satélites asociados a este carácter. Por otro lado el análisis de la diversidad en los suelos sin historia del cultivo de soja demostró que los rizobios nativos de esas áreas podrían aportar genes para la evolución de los rizobios simbiontes de la soja. Es más, la diversidad de los suelos y ambientes en los que se cultiva la soja es probable conduzca a la evolución de aislamientos con capacidades simbióticas contrastantes.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Los rizobios que nodulan la soja en sitios con ambientes nativos y cultivados de la Argentina

La soja es una leguminosa que establece simbiosis con diez especies distintas de Rizobios entre las que se encuentran bacterias de crecimiento rápido y lento. La interacción es el resultado de la expresión de un conjunto de genes en la planta y en la bacteria. En este trabajo se describe que los cultivares de soja de la Argentina presentan variabilidad en su capacidad de nodulación y que se han encontrado dos satélites asociados a este carácter. Por otro lado el análisis de la diversidad en los suelos sin historia del cultivo de soja demostró que los rizobios nativos de esas áreas podrían aportar genes para la evolución de los rizobios simbiontes de la soja. Es más, la diversidad de los suelos y ambientes en los que se cultiva la soja es probable conduzca a la evolución de aislamientos con capacidades simbióticas contrastantes.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Los rizobios que nodulan la soja en sitios con ambientes nativos y cultivados de la Argentina

La soja es una leguminosa que establece simbiosis con diez especies distintas de Rizobios entre las que se encuentran bacterias de crecimiento rápido y lento. La interacción es el resultado de la expresión de un conjunto de genes en la planta y en la bacteria. En este trabajo se describe que los cultivares de soja de la Argentina presentan variabilidad en su capacidad de nodulación y que se han encontrado dos satélites asociados a este carácter. Por otro lado el análisis de la diversidad en los suelos sin historia del cultivo de soja demostró que los rizobios nativos de esas áreas podrían aportar genes para la evolución de los rizobios simbiontes de la soja. Es más, la diversidad de los suelos y ambientes en los que se cultiva la soja es probable conduzca a la evolución de aislamientos con capacidades simbióticas contrastantes

Los rizobios que nodulan la soja en sitios con ambientes nativos y cultivados de la Argentina

La soja es una leguminosa que establece simbiosis con diez especies distintas de Rizobios entre las que se encuentran bacterias de crecimiento rápido y lento. La interacción es el resultado de la expresión de un conjunto de genes en la planta y en la bacteria. En este trabajo se describe que los cultivares de soja de la Argentina presentan variabilidad en su capacidad de nodulación y que se han encontrado dos satélites asociados a este carácter. Por otro lado el análisis de la diversidad en los suelos sin historia del cultivo de soja demostró que los rizobios nativos de esas áreas podrían aportar genes para la evolución de los rizobios simbiontes de la soja. Es más, la diversidad de los suelos y ambientes en los que se cultiva la soja es probable conduzca a la evolución de aislamientos con capacidades simbióticas contrastantes.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Tomate (Solanum lycopersicum) en la Argentina, el uso de bioinsumos y su evaluación.

La producción mundial de tomate fresco aumentó de 119.479.993 a 163.963.770 toneladas en 10 años y la de tomate industria se mantuvo más o menos estable en 5.538.000 toneladas. El 90 % de la producción mundial se concentra en diez países, siendo el líder Estados Unidos, seguido por China, Italia, y Turquía. La Argentina ocupa el puesto número 13 y participa con el 1% de la producción mundial. Las principales provincias productoras de tomate fresco son: Buenos Aires, Salta, Jujuy, Tucumán, Corrientes y Santa Fe. Mendoza es la principal productora de tomate industria con un aporte del 44 % de la producción del país, le sigue San Juan (28 %), Río Negro (11,5 %) y el 16,5 % restante proviene del noroeste argentino: Santiago del Estero, La Rioja, Catamarca, Salta y Jujuy. El rendimiento promedio de tomate industria en el país es de 55 toneladas por hectárea. En Argentina se consumen 550 millones de kilogramos de tomate por año. En la última temporada (2014/2015) se produjeron 535.000 toneladas en 7.790 hectáreas. En la provincia de Buenos Aires y particularmente en el cinturón hortícola del Gran La Plata la producción de tomate bajo cubierta ha crecido y esto fue acompañado por la aparición de patologías y plagas que se controlan con productos de síntesis química. Estos generan riesgo para los operadores y por otro lado un tomate con residuos que podrían poner en riesgo la calidad alimentaria.El sector hortícola está incorporando tecnologías destinadas no solo a aumentar la producción sino también a generar un producto de mayor calidad. Se utilizan híbridos de tomate con agregado genético y plantas injertadas y algunos productos biológicos. En este contexto es evidente que los trabajos deben orientarse al control de los patógenos de suelo, al control de insectos y la detección de fuentes de inóculo en semillas o plantas introducidas. Existen los insumos biológicos para reemplazar los agroquímicos? Tenemos las herramientas para evaluar el uso de estos productos? Estamos utilizando el sistema inmune de la planta? Evaluamos el impacto de los biológicos sobre la producción