Genomic sequencing capacity, data retention, and personal access to raw data in Europe

Whole genome/exome sequencing (WGS/WES) has become widely adopted in research and, more recently, in clinical settings. Many hope that the information obtained from the interpretation of these data will have medical benefits for patients and—in some cases—also their biological relatives. Because of the manifold possibilities to reuse genomic data, enabling sequenced individuals to access their own raw (uninterpreted) genomic data is a highly debated issue. This paper reports some of the first empirical findings on personal genome access policies and practices. We interviewed 39 respondents, working at 33 institutions in 21 countries across Europe. These sequencing institutions generate massive amounts of WGS/WES data and represent varying organisational structures and operational models. Taken together, in total, these institutions have sequenced ∼317,259 genomes and exomes to date. Most of the sequencing institutions reported that they are able to store raw genomic data in compliance with various national regulations, although there was a lack of standardisation of storage formats. Interviewees from 12 of the 33 institutions included in our study reported that they had received requests for personal access to raw genomic data from sequenced individuals. In the absence of policies on how to process such requests, these were decided on an ad hoc basis; in the end, at least 28 requests were granted, while there were no reports of requests being rejected. Given the rights, interests, and liabilities at stake, it is essential that sequencing institutions adopt clear policies and processes for raw genomic data retention and personal access

Аналіз стійкості різних стратегій оптимізації аналогових кіл

The problem of designing of analog circuits is presented in the generalized formulation. Generalization consists in possibility of refusal of performance of laws of Kirchhoff during designing process at their unconditional performance in its final point. Thus there is a possibility to redistribute an expense of computer time between the block of the analysis of a circuit and the block of parametrical optimization. Basic element of this redistribution is specially entered vector of control. In such a case the process of designing of a circuit will be formulated in terms of the theory of control as controlled dynamic system. For the analysis of properties of such system it is offered to use the concept of function of Lyapunov of dynamic system. Various forms of function of Lyapunov are offered. The analysis of behavior of func-tion of Lyapunov and its derivative has allowed establishing considerable correlation be-tween properties of this function and processor time of designing of a circuit.Задача проектирования аналоговых цепей представлена в обобщенной формулировке. Обобщение состоит в возможности отказа от выполнения законов Кирхгофа в течение процесса проектирования при безусловном их выполнении в его конечной точке. При этом возникает возможность перераспределять затраты компьютерного времени между блоком анализа цепи и блоком параметрической оптимизации. Основным элементом этого перераспределения является специально введенный управляющий вектор. В таком случае процесс проектирования цепи сформулируется в терминах теории управления как управляемая динамическая система. Для анализа свойств такой системы предложено использовать концепцию функции Ляпунова динамической системы. Предложены различные формы функции Ляпунова. Анализ поведения функции Ляпунова и ее производной позволил установить значительную корреляцию между свойствами этой функции и процессорным временем проектирования цепи.Задача проектування аналогових кіл представлена в узагальненому формулюванні. Узагальнення полягає в можливості відмови від виконання законів Кірхгофа протягом процесу проектування при безумовному їх виконанні в його кінцевій точці. При цьому виникає можливість перерозподіляти витрати комп’ютерного часу між блоком аналізу кола й блоком параметричної оптимізації. Основним елементом цього перерозподілу є спеціально введений керуючий вектор. У такому випадку процес проектування кола сформулюється в термінах теорії управління як керована динамічна система. Для аналізу властивостей такої системи запропоновано використовувати концепцію функції Ляпунова динамічної системи. Запропоновані різні форми функції Ляпунова. Аналіз поведінки функції Ляпунова і її похідній дозволив установити значну кореляцію між властивостями цієї функції і процесорним часом проектування кола

Ефект прискорення при оптимізації електронних кіл

An additional acceleration effect has been analyzed for the electronic circuit optimization process. This effect has been appeared due to the different behavior of the design trajectories whenever the vector of the control functions was changed. Effect was obtained for all analyzed circuits and it can reduce the computer time to some powersПроанализирован эффект дополнительного ускорения процесса оптимизацииэлектронной цепи. Этот эффект возникает вследствие различного поведения траекторий проектирования при изменении вектора управляющих функций. Эффект проявляется для всех анализируемых цепей и позволяет дополнительно сократить затраты машинного времени на несколько порядковПроаналізовано ефект додаткового прискорення процесу оптимізації електронного кола. Цей ефект виникає внаслідок різної поведінки траєкторій проектування при зміні вектора керуючих функцій. Ефект проявляється для всіх кіл, що аналізуються, и дозволяє додатково скоротить витрати машинного часу на кілька порядкі