Understanding mechanisms of enzyme co-operativity: The importance of not being at equilibrium

AbstractThe discovery at the end of the 1950s and the beginning of the 1960s that there were enzymes like threonine deaminase and aspartate transcarbamoylase that failed to follow the expected hyperbolic behaviour predicted by the Michaelis–Menten equation, raised several questions and induced the development of mechanisms to explain this peculiar behaviour. At that time it was already known that the binding of oxygen to haemoglobin did not follow a hyperbolic curve, but a sigmoidal one, and it was thought that a similar situation probably existed for enzymes with sigmoidal kinetics. In other words, the observed kinetic behaviour was a consequence of co-operativity in the substrate binding. Two main models were postulated: those of Monod, Wyman and Changeux in 1965 and of Koshland, Némethy and Filmer in 1966. Both consider that the different conformations are in equilibrium and that there is a rapid equilibrium in the binding, which implies that co-operativity could only exist if there is more than one substrate binding site per enzyme molecule, that is, if the enzyme is an oligomer. What about monomeric enzymes, could they show kinetic co-operativity? Yes, but only through mechanisms that imply the existence of enzyme conformations that are not in equilibrium, and have different kinetic parameters. There are, in fact, very few examples of monomeric enzymes showing kinetic co-operativity with a natural substrate. The case of “glucokinase” (hexokinase D or hexokinase IV), a monomeric enzyme with co-operativity with respect to glucose, will be discussed

A Simple Self-Maintaining Metabolic System: Robustness, Autocatalysis, Bistability

International audienceA living organism must not only organize itself from within; it must also maintain its organization in the face of changes in its environment and degradation of its components. We show here that a simple (M,R)-system consisting of three interlocking catalytic cycles, with every catalyst produced by the system itself, can both establish a non-trivial steady state and maintain this despite continuous loss of the catalysts by irreversible degradation. As long as at least one catalyst is present at a sufficient concentration in the initial state, the others can be produced and maintained. The system shows bistability, because if the amount of catalyst in the initial state is insufficient to reach the non-trivial steady state the system collapses to a trivial steady state in which all fluxes are zero. It is also robust, because if one catalyst is catastrophically lost when the system is in steady state it can recreate the same state. There are three elementary flux modes, but none of them is an enzyme-maintaining mode, the entire network being necessary to maintain the two catalysts

Devolución de impuestos en la DIAN y Secretaría de Hacienda de Santiago de Cali en el año 2008: análisis normativo y procesal

La factibilidad que poseen los contribuyentes al momento de solicitar la devolución y/o compensación de saldos que resulten a favor de sus operaciones gira en torno al estricto cumplimiento de la normatividad que regula tanto el trámite para el fisco como para el trámite interno de la Administración de impuestos ya que estas determinan el positivo o negativo desarrollo del proceso. Para determinar la viabilidad de la solicitud se tomo como herramienta de investigación una previa visita a la División de Devoluciones Tributarias de la DIAN de donde se pudieron conocer datos estadísticos y apreciaciones particulares sobre el proceso de devolución; además de conocer más a fondo los motivos por los cuales se generan los saldos a favor y la normatividad que regula tanto el tramite. En igual sentido se hizo una visita a la Secretaria de Hacienda Municipal de Santiago de Cali, Subdirección Administrativa de Impuestos y Rentas Municipales para los mismos fines. Finalmente se obtuvo como resultado que aunque el trámite puede llegar a ser dispendioso debido a que algunas normas se quedan cortas ante algunas situaciones presentadas por las empresas, existe una alta probabilidad de que el proceso de devolución sea resuelto a favor del contribuyenteTrabajo de grado (Contador Público)-- Universidad Autónoma de Occidente, 2009PregradoContador(a) Público(a

Modelo de probabilidad de ocurrencia del caracol gigante africano (Achatina fulica) para Boyacá, Colombia

The invasive capacity and the natural history of the Achatina fulica (Linnaeus, 1758) has positioned it as one of the 100 most dangerous invasive species worldwide. Its study has transcended the limits of biological research and has been complemented with predictive analysis of ecological behaviors and the study of its social and economic influence factors. The objective of this research was to generate a probability of occurrence model for the giant African snail, at a spatial and temporal scale. Records of the appearance of the species were collected through secondary information from the department of Boyacá. Bioclimatic information was obtained from the Worldclim platform, and the social and economic indicators of each locality were extracted from the Terridata-DNP database. The information was analyzed using the R Studio statistical software, with ENMTML and ISLR packages. For the modeling, the maximum entropy algorithm (Maxent) was used; model validation was performed using the AUC, TSS, Kappa, Sorensen, and Jaccard metrics. The bioclimatic variables that most influenced the probability of occurrence model were temperature, precipitation and humidity. It was also determined that the variables aqueduct coverage and deforested area were statistically related in the municipalities where the invasive species has been reported in the department. Under current conditions, the giant African snail could establish itself in approximately 11,209.74 km, that is, in 47.54% of the Boyacá territory. Under the socioeconomic conditions of the future prediction, in the SSP1 126 scenario the species could increase its presence to 63.25% and in the SSP4 585 scenario to 50.42%. In the latter, the most chaotic scenario, it was found that although the occupation may be less than the first scenario, the probability of occurrence is higher.La capacidad invasora y la historia natural de Achatina fulica (Linnaeus, 1758) posiciona esta especie como una de las 100 especies invasoras más peligrosas a nivel mundial.  Su estudio ha trascendido los límites de la investigación biológica para complementarse con análisis de predicción de los comportamientos ecológicos y la influencia de los factores sociales y económicos. El objetivo de la investigacion fue generar un modelo de probabilidad de ocurrencia para el caracol gigante africano, a escala espacial y temporal. Se recopilaron registros de presencia de la especie mediante información secundaria para el departamento de Boyacá; la información bioclimática se obtuvo a partir de la plataforma Worldclim, los indicadores sociales y económicos de cada localidad se extrajeron de la base de datos Terridata-dnp. La información se analizó por medio de software estadístico R Studio, mediante los paquetes ENMTML y ISLR.  Para el modelamiento se utilizó el algoritmo de máxima entropía (Maxent); la validación del modelo se realizó con las métricas AUC, TSS, Kappa, Sorensen y Jaccard. Las variables bioclimáticas que más influyeron en el modelo de probabilidad de ocurrencia fueron temperatura, precipitación y humedad; así mismo, se determinó que las variables cobertura de acueducto y área deforestada están relacionadas estadísticamente en los municipios en donde se ha reportado la especie invasora en el departamento. En las condiciones actuales el caracol gigante africano, podría establecerse en aproximadamente 11.209,74 km; es decir, en el 47,54% del territorio boyacense; bajo las condiciones socioeconómicas de la predicción futura, en el escenario ssp1 126 la especie podría ampliar su presencia hasta el 63.25% y en el escenario ssp4 585 al 50,42%, siendo este último el más caótico se encontró que la ocupación puede ser menor al primer escenario, pero la probabilidad de ocurrencia es más alta

Nociones de matemáticas financieras

Esta obra es una introducción a la variada problemática de la Matemática Financiera, el cual servirá de ayuda a todo público interesado en dicha disciplina. En el enfoque dado, se encuentran los fundamentos precisos para abordar con propiedad la resolución práctica de problemas de las operaciones financieras, estando al alcance de todos los estudiantes con conocimientos básicos de matemáticas, ya que dichos desarrollos se exponen en un lenguaje sencillo y de fácil comprensión

Percepción de competencias investigativas, innovación y emprendimiento en estudiantes universitarios

This research aims to analyze the perception of development the research, innovation, and entrepreneurship competencies of students and teachers at the Universidad Mariana, Colombia, to create research training programs and strategies for the academic community.Analizar la percepción del desarrollo de competencias investigativas, de innovación y emprendimiento de estudiantes de una universidad privada de la ciudad de Pasto, Colombia, para generar programas y estrategias en formación investigativa en la comunidad académica

Percepción de competencias investigativas, innovación y emprendimiento en estudiantes universitarios

Analizar la percepción del desarrollo de competencias investigativas, de innovación y emprendimiento de estudiantes de una universidad privada de la ciudad de Pasto, Colombia, para generar programas y estrategias en formación investigativa en la comunidad académica

Identificación de las fases del análisis de riesgo, para fortalecer la inocuidad de los canelones de verdura.

Se procede a investigar la posible fuente de contaminación en un caso donde denunciaron un presunto brote de una enfermedad trasmitida por alimentos Los canelones de verdura son alimentos perecederos susceptibles de ser atacados por estafilococos aureus, es por esto que se presume que la contaminación se pudo ocasionar por varias fallas en las aplicaciones de la preparación del alimento, cómo la falta de implementación del SGC, el cual por medio de ellos se tiene el mejoramiento continuo, soportado en la estandarización de los procesos y procedimientos, evitando contaminación en los productos, también la falta de un análisis de riesgo donde en su proceso de reconocimiento nos dictamine una situación de peligro existente y definición de sus características Las enfermedades de transmisión alimentaria ETA, se ha convertido en el mundo en un problema de salud pública, se ha hecho indispensable los estudios científicos acerca de los peligros que siempre están presentes y evitar el riesgo a lo máximo, La intoxicación alimentaria por Staphylococcus aureus se produce por la ingestión de alimentos contaminados con toxinas que producen diarrea y vómitos. El riesgo de que se produzca un brote en alto grado, depende también de la manipulación de alimentos ya sea por la falta de buenas prácticas de manufactura, por falta de cocimiento, por no tener buena conservación en los alimentos. A pesar de la contaminación, muchos alimentos tienen un sabor y olor normales. (Thomas G. Boyce) La realización de un análisis de riesgo se hace necesaria para contar con el soporte técnico y científico que permita plantear estrategias para el control en la producción de alimentos y de esta manera disminuir la probabilidad de enfermedades por esta causa, al igual que generar estrategias de comunicación dirigidas a la población.We proceed to investigate the possible source of contamination in a case where they reported an alleged outbreak of a disease transmitted by food. Vegetable cannelloni are perishable foods susceptible to attack by Staphylococcus aureus, which is why it is presumed that contamination could be caused by several failures in the applications of food preparation, such as the lack of implementation of the QMS, which half of them we have continuous improvement, supported in the standardization of processes and procedures, avoiding contamination in products, also the lack of a risk analysis where in the process of recognition we determine an existing danger situation and definition of their characteristics. The foodborne diseases ETA, has become a public health problem in the world, scientific studies have become indispensable about the dangers that are always present and avoid the risk to the maximum, food poisoning by Staphylococcus aureus produced by the ingestion of food contaminated with toxins that produce diarrhea and vomiting. The risk of a high-level outbreak also depends on the handling of food due to the lack of good manufacturing practices, lack of cooking, and not having good food preservation. Despite contamination, many foods have a normal taste and smell. (Thomas G. Boyce) The realization of a risk analysis is necessary to have the technical and scientific support to propose strategies for the control of food production and thus reduce the likelihood of diseases due to this cause, as well as generate communication strategies directed to the population

Plan de mejoramiento en procesos de salud ocupacional con énfasis en la gestión del conocimiento para el Banco Agrario " Málaga Santander"

El presente trabajo; fue realizado como requisito para obtener el título de administradoras de empresas, basadas en lo solicitado en el curso del Diplomado de Profundización en Gerencia del Talento Humano. La investigación realizada fue de tipo cualitativo y su desarrollo se describe en cinco capítulos: En un primer capítulo se planteó el problema con base a la Salud Ocupacional para la empresa BANCO AGRARIO DE MALAGA SANTANDER DONDE , el segundo capítulo contiene las teorías relacionadas con la temática; literatura que sirvió de base para la argumentación y descripción del trabajo, en el capítulo tres, se establecieron los procedimientos utilizados para la indagación de los datos necesarios en el estudio, en consecuencia: En el capítulo cuarto se presentan los resultados obtenidos mediante el instrumento utilizado en la recolección de la información donde se evidencio grandes falencias y finaliza con el capítulo cinco, en el que se hacen las recomendaciones del caso frente a los hallazgos encontrados, luego se plantea la propuesta basada en la gestión del conocimiento y el Modelo de Nonaka y Takeuchi. Por último se entregan las conclusiones a que se llegó producto de la presente investigación.The present work; It was made as a requirement to obtain the title of business administrator, based on what was requested in the course of the Diploma in Human Resource Management. The research carried out was of a qualitative nature and its development is described in five chapters: In a first chapter the problem was raised based on Occupational Health for the company BANCO AGRARIO DE MALAGA SANTANDER DONDE, the second chapter contains the theories related to the subject; Literature that served as the basis for the argumentation and description of the work, in chapter three, the procedures used for the investigation of the necessary data in the study were established, consequently: In the fourth chapter the results obtained by the instrument used are presented in the collection of information where large deficiencies were evidenced and ends with chapter five, in which the recommendations of the case are made in relation to the findings found, then the proposal based on knowledge management and the Nonaka Model and Takeuchi. Finally, the conclusions reached are the product of the present investigation