Susceptibility of genetic variants and gene-gene and gene-environment factor interactions in the etiology of nonsyndromic oral clefts in the Brazilian population

Orientadores: Ricardo Della Coletta, Hercílio Martelli JuniorTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de PiracicabaResumo: A etiologia das fissuras orais não-sindrômicas (FONS) é complexa e fortemente influenciada pelos fatores genéticos e ambientais específicos de cada população. No Brasil, a elevada miscigenação é considerada uma característica que pode influenciar na suscetibilidade das FONS. Para melhor compreender os aspectos genéticos associados as FONS na população brasileira, este estudo compilou resultados de 4 estudos específicos. O primeiro estudo foi uma revisão sistemática e meta-análise de marcadores genéticos avaliados na população brasileira. Este estudo revelou possíveis associações dos polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) rs642961 (IRF6), rs987525 e rs1530300 (8q24), rs1801133 (MTHFR) e rs17563 (BMP4) com a etiologia das fissuras labiais com ou sem fissuras palatinas não-sindrômica (FL±PNS). Contudo, frente ao pequeno número de estudos que analisou cada um destes marcadores, mais estudos com amostras robustas e que levem em consideração a elevada miscigenação da população brasileira são necessários. O segundo estudo optou por validar 7 SNPs (rs7552 em 2q24.2, rs8049367 em 16p13.3, rs1880646, rs7406226 e rs9891446 em 17p13, rs1588366 em 17q23.2 e rs73039426 em 19q13.11), localizados em regiões associadas com FL±PNS em estudos de larga escala genômica, em 831 pacientes com FL±PNS e 866 controles. A análise de regressão logística levando em consideração as diferenças na ancestralidade genômica e no gênero entre os grupos revelou que o SNP rs7552 é um marcador de risco para o desenvolvimento das FL±PNS. Interações gene-gene (GxG) entre rs7552 com rs8049367, rs1880646, rs9891446, rs1588366 e rs73039426 foram também associadas com risco aumentado para o desenvolvimento das FL±PNS. Embora os SNPs rs1880646 e rs9891446 não foram individualmente associados com FL±PNS, o haplótipo AG (alelo A de rs1880646 e alelo G de rs9891446) foi mais frequente entre os pacientes com FL±PNS em comparação com os controles, exibindo um risco aumentado para o desenvolvimento da fissura. O terceiro estudo avaliou a influência de SNP em genes associados com a neutralização do estresse oxidativo (famílias de genes superóxido dismutase-SOD e paraoxinase-PON) no risco das FL±PNS na população brasileira, considerando interações GxG e gene-fatores ambientais (GxE). Os resultados demonstraram que o alelo C e o genótipo CT do SNP rs2237583 em PON1 evocam efeitos protetores para as FL±PNS, enquanto rs3917490 apresentou significância apenas com amostra composta por pacientes com alta ascendência africana. Várias interações GxG contendo os SNP rs2237583 em PON1 e rs17166879 em PON2 atingiram significância após o ajuste para múltiplos testes. Por fim, o quarto estudo utilizou a estratégia de tag-SNP para verificar a participação de variantes (rs1169, rs7153, rs9968051, rs9819530 e rs6794341) em GOLGB1 na patogênese das fissuras palatinas isoladas não-sindrômicas (FPNS). Neste estudo contendo 270 pacientes com FPNS e 284 controles, nenhuma associação significante foi observada entre as variantes em GOLGB1 e as FPNS. Em conclusão, este estudo revela alguns potenciais marcadores genéticos associados ao desenvolvimento das FONS na população brasileira e reforça a importância de considerar interações GxG na patogênese desta malformação congênitaAbstract: The nonsyndromic oral cleft (NOC) etiology is complex and strongly influenced by specific genetic and environmental factors within each population. In Brazil, the high miscegenation is considered a characteristic that may influence NOC susceptibility. To improve our understanding in the genetic aspects associated with NOC in the Brazilian population, this study compiled results from 4 specific studies. The first study was a systematic review and meta-analysis of genetic markers evaluated in the Brazilian population. This study revealed possible associations of single nucleotide polymorphisms (SNP) rs642961 (IRF6), rs987525 and rs1530300 (8q24), rs1801133 (MTHFR) and rs17563 (BMP4) with the etiology of nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL±P). However, in the view of the small number of studies that analyzed each of these markers, more studies with robust samples taking into account the high miscegenation of the Brazilian population are necessary. The second study opted to validate 7 SNP (rs7552 in 2q24.2, rs8049367 in 16p13.3, rs1880646, rs7406226 and rs9891446 in 17p13, rs1588366 in 17q23.2 and rs73039426 in 19q13.11), located in regions associated with NSCL±P in large-scale genomic studies, in 831 patients with NSCL±P and 866 controls. Logistic regression analysis adjusted to differences in the genomic ancestry and gender of the groups revealed that the SNP rs7552 is a marker of risk for the development of NSCL±P. Gene-gene (GxG) interactions between rs7552 with rs8049367, rs1880646, rs9891446, rs1588366 and rs73039426 were also associated with increased risk for the development of NSCL±P. Although rs1880646 and rs9891446 were not individually associated with NSCL±P, the A-G haplotype (A allele of rs1880646 and G allele of rs9891446) was more frequent among NSCL±P patients as compared to controls, exhibiting an increased risk to NSCL±P. The third study evaluated the influence of SNP in genes associated with neutralization of stress oxidative (superoxide dismutase-SOD and paraoxonase-PON gene families) in the risk of NSCL±P in the Brazilian population, considering GxG and gene-environment factor (GxE) interactions. The results showed that the C allele and the CC genotype of PON1 rs2237583 evoke significant protective effects against NSCL±P, while rs3917490 showed a significant association only in the sample composed of patients displaying high African ancestry. Some GxG interactions containing PON1 rs2237583 and PON2 rs17166879 reached significance after adjustment for multiple tests. Finally, the fourth study used the tag-SNP strategy to verify the participation of variants (rs1169, rs7153, rs9968051, rs9819530 and rs6794341) in GOLGB1 in the pathogenesis of nonsyndromic cleft palate only (NSCPO). In this study containing 270 patients with NSCPO and 284 controls, no significant associations were observed between variants in GOLGB1 and NSCPO. In conclusion, this study reveals some potential genetic markers associated with the development of NOC in the Brazilian population, and reinforces the importance of considering GxG interactions in the pathogenesis of this congenital malformationDoutoradoPatologiaDoutor em Estomatopatologia2016/02667-0CAPESFAPES

Simultaneous left colectomy and standard hepatectomy reformed by laparoscopy

As abordagens laparoscópicas têm sido cada vez mais utilizadas em pacientes com câncer colorretal ou hepático. Colectomia e hepatectomia simultâneas são consideradas técnicas seguras e apresentam resultados oncológicos semelhantes independente da localização do tumor primário quando associada à ressecções hepáticas com menos de quatro metástases, uma vez que não existe aumento da morbimortalidade nem prejuízo na sobrevida. O desenvolvimento de técnicas e materiais laparoscópicos tornou a ressecção combinada do cólon e do fígado uma opção bastante atraente. O objetivo do presente estudo é demonstrar a ressecção de um tumor sincrônico de sigmoide e metástase hepática única tratada por colectomia e setorectomia lateral esquerda puramente laparoscópicaLaparoscopic approaches have been increasingly used in patients with colorectal or liver cancer. Simultaneous colectomy and hepatectomy are considered safe techniques and present similar oncological results regardless of the location of the primary tumor when there are fewer than four liver metastases, since there is no increase in morbidity or decrease in survival. The development of laparoscopic techniques and materials has made the combined resection of the colon and liver a very attractive option. The aim of this study is to demonstrate the synchronous resection of the sigmoid tumor and single liver metastasis treated by purely laparoscopic colectomy and liver left lateral sectorectomy

Epidemiological Features Of Patients With Nonsyndromic Cleft Lip And/or Palate In Western Parana

Aim: : To describe the clinical, demographic and environmental features associated with NSCL/P (nonsyndromic cleft lip and/or palate) patients born in western Parana state, Brazil. Methods: This cross-sectional, observational, retrospective study included 188 patients attended at the Association of Carriers of Cleft Lip and Palate - APOFILAB, Cascavel-Parana, between 2012 and 2014. Information on demographic characteristics, medical and dental histories and life style factors were obtained from records and personal interviews. Results: Among the 188 patients, cleft lip and palate (CLP) was the most frequent subtype (55.8%), followed by cleft lip only (CLO, 25.0%) and cleft palate only (CPO, 19.2%). Caucasian males were the most affected, although no differences among types of cleft were observed. The otorhinolaryngologic and respiratory alterations were the most frequent systemic alterations in NSCL/P patients, and more than 80% of the NSCL/P mothers reported no vitamin supplements during the first trimester of pregnancy. Conclusions: This study revealed that the prevalence of nonsyndromic oral cleft types in this cohort was quite similar to previously reported prevalence rates. Systemic alterations were identified among 23.4% of the patients and patients with CLP were the most affected. History of maternal exposition to environmental factors related to nonsyndromic oral clefts was frequent and most mothers reported no vitamin supplements during the pregnancy. This study highlights the importance of identifying systemic alterations and risk factors associated with NSCL/P in the Brazilian population for planning comprehensive strategies and integrated actions for the development of preventive programs and treatment.15139-4

Validação de um método para medir a digestibilidade de nutrientes e avaliação de rações comerciais para catfish

O catfish americano, espécie aquícola importante nos Estados Unidos, também é produzido no sul do Brasil. Entretanto, a digestibilidade dos nutrientes das rações disponíveis no Brazil não é conhecida. Nesse estudo otimizou-se a coleta de fezes e a determinação do coeficiente de digestibilidade aparente (CDA) para a espécie. Ensaios pilotos foram conduzidos para determinação do tempo de passagem do alimento no trato digestório, densidade dos peixes e intervalo entre coletas de fezes. O tempo de passagem variou de 11h30 a 10h30 em peixes com peso médio de 100 e 172 g, respectivamente. O peso médio (base seca) das fezes produzidas por peixes (peso médio 99 g), em seis dias, foi 0.54 g, independentemente de a densidade ser 10, 15 ou 20 peixes por gaiola (p >; 0.05). Com esta metodologia foi possível coletar 10.80 g de fezes (base seca) por tanque em três dias. A digestibilidade da proteína aumentou com intervalos de coleta de fezes de 1, 6 e 12 h, indicando aumento na lixiviação deste nutriente à medida que aumentou o tempo de exposição das fezes à água. A coleta de fezes foi otimizada com 20 peixes por tanque e com 6 h de intervalo entre as coletas. Também foi avaliado o CDA para proteína, energia e matéria seca de rações comerciais para catfish, utilizando-se o método indireto com a adição de 0.5% de Cr2O3 como marcador inerte nas dietas. Os conteúdos de proteína bruta das rações comerciais foram similares às especificações dos fabricantes, mas as rações não forneceram 28% de proteína digestível, necessária para o crescimento adequado da espécie. A proteína digestível nas rações comerciais variou de 23.3% a 25.6% e a energia digestível, de 1177 a 1249 kJ 100 g-1 de ração. Ressalta-se assim a importância da determinação da digestibilidade dos nutrientes na avaliação de rações comerciais.Channel catfish, a major freshwater aquaculture species in the US, is also farmed in Southern Brazil. However, apparent digestibility coefficients (ADC) of nutrients in commercial feeds available in Brazil for the species are not known. This study aimed at optimizing a methodology for fecal collection and determination of apparent nutrient digestibility for catfish. Pilot trials were carried out to establish gastrointestinal transit, fish density, and time interval between fecal collections. Gastrointestinal transit of dry feed for catfish varied from 11h30 to 10h30 for 100 and 172-g fish, respectively. Average dry weight of feces produced along a six day period by 99-g fish was 0.54 g, regardless of stocking density (10, 15 or 20 fish per 98-L cage; p >; 0.05). Described methodology allowed the collection of average 10.80 g feces per tank (dry weight) in three days. Feces collected at 1, 6 or 12 h had increased protein digestibility from 1 to 12 h, that is, there was increased protein leaching as the time of feces exposure to water increased. Fecal collection was optimized at 20 fish per tank and 6 h interval between collections. ADC of protein, energy, and dry matter of four commercial feeds for catfish using the indirect method with the addition of 0.5% of Cr2O3 as an inert maker was also evaluated. Crude protein contents of commercial feeds matched manufacturer's specifications but did not yielded the 28% digestible protein required for adequate channel catfish growth. The digestible protein of commercial feeds ranged from 23.3% to 25.6% and digestible energy ranged from 1177 to 1249 kJ 100 g-1 feed. It is instrumental measuring nutrient digestibility when evaluating commercial feeds

Determination and uncertainty propagation of sensitivity coefficients in rockwell hardness measurements

In the field of hardness measurements, a problem arises when trying to understand how different measurement parameters (speed of the indenter, force, thermal drift, etc.) affect the outcome of the measurement itself. Because the mathematical model defining hardness scales do not consider such factors, the simplest way to include additional influence parameters in the mathematical model is to introduce them linearly via sensitivity coefficients, which are obtained experimentally and thus characterized by uncertainties. Uncertainties of the sensitivity coefficients are in general not considered in the evaluation of the combined standard uncertainty of the hardness measurements. In this paper a general procedure is presented and applied to HRA and HRC measurements

Late prematurity: a systematic review

AbstractObjectivethis study aimed to review the literature regarding late preterm births (34 weeks to 36 weeks and 6 days of gestation) in its several aspects.Sourcesthe MEDLINE, LILACS, and Cochrane Library databases were searched, and the references of the articles retrieved were also used, with no limit of time.Data synthesisnumerous studies showed a recent increase in late preterm births. In all series, late preterm comprised the majority of preterm births. Studies including millions of births showed a strong association between late preterm birth and neonatal mortality. A higher mortality in childhood and among young adults was also observed. Many studies found an association with several neonatal complications, and also with long-term disorders and sequelae: breast-feeding problems, cerebral palsy, asthma in childhood, poor school performance, schizophrenia, and young adult diabetes. Some authors propose strategies to reduce late preterm birth, or to improve neonatal outcome: use of antenatal corticosteroids, changes in some of the guidelines for early delivery in high-risk pregnancies, and changes in neonatal care for this group.Conclusionsnumerous studies show greater mortality and morbidity in late preterm infants compared with term infants, in addition to long-term disorders. More recent studies evaluated strategies to improve the outcomes of these neonates. Further studies on these strategies are needed

Determination and Uncertainty Propagation of Sensitivity Coefficients in Rockwell Hardness Measurements

In the field of hardness measurements, a problem arises when trying to understand how different measurement parameters (such as speed of the indenter, force, maximum displacement, thermal drift, etc.) affect the outcome of the measurement itself. Because the mathematical model defining hardness scales do not consider such factors, the simplest way to include additional influence parameters in the mathematical model is to introduce them linearly via sensitivity coefficients, which are obtained experimentally and thus characterized by uncertainties. However, uncertainties of the sensitivity coefficients are in general not considered in the evaluation of the combined standard uncertainty of the hardness measurements. In this paper a general procedure is presented and applied to practical case-studies on HRA and HRC hardness measurements. In this field, the international definitions (standards) state each sensitivity coefficient for influence parameters about specific reference values: additional (generally neglected) uncertainty contributions reflect how much the measurements fail to be performed at exactly the prescribed reference values. Indeed, in the second case-study presented in this paper, we have found that the expanded uncertainty obtained via the proposed method is about 50 % larger than the one reported in the example of the international guidelines. This result highlights the importance of considering the uncertainties of the sensitivity coefficients when evaluating the combined standard uncertainty of any measurement

Códigos de dispersão linear e comunicação cooperativa em canais de comunicações sem fio com realimentação limitada

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica.Nesta tese, dois tipos de sistemas de comunicação sem fio com múltiplas antenas (MIMO - multiple-input multiple-output) e realimentação limitada de canal são considerados. No primeiro tipo, as múltiplas antenas transmissoras estão instaladas em um único transmissor (caso MIMO convencional). Neste caso, propõem-se códigos de dispersão linear (LDCs). O esquema proposto seleciona o LDC, de um conjunto de vários LDCs, que minimiza a probabilidade de erro instantânea baseado nas condições instantâneas do canal. A determinação do melhor conjunto de LDCs, ou seja, aquele que minimiza a probabilidade de erro média, é descrita como um problema de otimização. No segundo tipo, as múltiplas antenas transmissoras estão localizadas em diferentes nós de uma rede sem fio, cada nó sendo equipado com uma única antena (caso MIMO distribuído). Assim, propõe-se um esquema de diversidade cooperativa para um sistema de comunicação que consiste em NT nós cooperadores que recebem ?log2(NT)? bits de realimentação do nó destino com informação sobre o estado do canal. Esta informação é usada apropriadamente para se obter ganhos de diversidade cooperativa e de razão sinal-ruído. Um receptor linear simples e um receptor com cancelamento de interferência são propostos. Mostra-se que seus desempenhos de erro são muito próximos do desempenho do receptor de máxima verossimilhança. Um limitante superior para a probabilidade de erro média de bit para a modulação BPSK em canais com desvanecimento é derivado. Para ambos os tipos de sistemas de comunicação sem fio, os esquemas propostos apresentam melhor desempenho de erro do que esquemas já existentes na literatura