Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

Actas del V Congreso ISUF-H Costa Rica 2021: Ciudades espontáneas versus ciudades planificadas: distintos retos, distintas realidades

En el año 2021 celebramos en Costa Rica la V edición del Congreso ISUF-H, los días 1, 2 y 3 de diciembre, con la Escuela de Arquitectura de la Universidad de Costa Rica como anfitriona del evento. El congreso “Ciudades espontáneas versus ciudades planificadas: distintos retos, distintas realidades” propuso como eje central una reflexión crítica sobre los procesos de urbanización planificada y urbanización espontánea, en el cual se fomente un abordaje de las ciudades como expresión de organización social, económica, ambiental y cultural, enfatizando el carácter ideológico de la urbanización y subrayando su continua construcción como resultado de construcciones complejas. La celebración de un nuevo congreso en América Latina, permitió reforzar la tradición crítica en el abordaje de las ciudades, y reforzar también la necesidad de plantear una perspectiva latinoamericana de los estudios urbanos, y por consiguiente de una teoría urbana latinoamericana. En esta ocasión el congreso se centró en ahondar en la temática de la forma urbana, desde perspectivas transversales que involucren las amplias disciplinas que asumen como objeto de discusión las problemáticas de la ciudad contemporánea y cuestionan la dicotomía planteada entre lo espontáneo y lo planificado. Para la Escuela de Arquitectura de la Universidad de Costa Rica y su Laboratorio de Ciudad y Territorio es un honor haber podido llevar a cabo esta nueva edición del congreso de la Asociación ISUF-H como segunda sede en un país latinoamericano. Relevante para fortalecer la temática de la forma urbana en la región, reforzando alianzas y estableciendo nuevas redes que permitan compartir conocimientos a partir de las experiencias de esas diversidades urbanas. Auspiciar el debate en torno a la morfología urbana y las diferencias entre esas ciudades espontáneas y las planificadas, fue una oportunidad para reunir a expertos de las distintas latitudes hispánicas.UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ingeniería::Facultad de Ingeniería::Escuela de Arquitectur

La plasticidad del hepatocito y su relevancia en la fisiología y la patología hepática

The liver is one of the most important organs that contribute to maintain metabolic homeostasis in vertebrates, with a high regenerative capacity. Liver is constituted by diverse cellular types, which work together to accomplish the organ function. Hepatocytes are the main cellular type responsible for most of hepatic functions; they are a heterogeneous population with specialized metabolic functions. Several signaling pathways such as TGF-β/Smads, Hippo/YAP-TAZ and Wnt/ β-catenin, among others, regulate hepatocytes phenotype. These cells are normally in a quiescent state but they exhibit plasticity in response to liver damage; thus, they can proliferate or change their phenotype through process such as transdifferentiation or transformation in order to contribute to the maintenance of liver homeostasis or during the development of diverse pathologies.El hígado es uno de los principales órganos encargados de mantener la homeostasis en vertebrados,  además de poseer una gran capacidad regenerativa. El hígado está constituido por diversos tipos celulares que de forma coordinada contribuyen para que el órgano funcione eficientemente. Los hepatocitos representan el tipo celular principal de este órgano y llevan a cabo la mayoría de sus actividades; además, constituyen una población heterogénea de células epiteliales con funciones especializadas en el metabolismo. El fenotipo de los hepatocitos está controlado por diferentes vías de señalización, como la vía del TGFβ/Smads, la ruta Hippo/YAP-TAZ y la vía Wnt/β-catenina, entre otras. Los hepatocitos son células que se encuentran normalmente en un estado quiescente, aunque cuentan con una plasticidad intrínseca que se manifiesta en respuesta a diversos daños en el hígado; así, estas células reactivan su capacidad proliferativa o cambian su fenotipo a través de procesos celulares como la transdiferenciación o la transformación, para contribuir a mantener la homeostasis del órgano en condiciones saludables o desarrollar diversas  patologías

Identification of genes modulated by interferon gamma in breast cancer cells

Interferon gamma (IFNγ) plays a context-dependent dual tumor-suppressor and pro-tumorigenic roles in cancer. IFNγ induces morphological changes in breast cancer (BC) cells with or without estrogen receptor alpha (ERα) expression. However, IFNγ-regulated genes in BC cells remain unexplored. Here, we performed a cDNA microarray analysis of MCF-7 (ERα+) and MDA-MB-231 (HER2-/PR-/ERα-) cells with and without IFNγ treatment. We identified specific IFNγ−modulated genes in each cell type, and a small group of genes regulated by IFNγ common in both cell types. IFNγ treatment for an extended time mainly repressed gene expression shared by both cell types. Nonetheless, some of these IFNγ-repressed genes were seemingly deregulated in human mammary tumor samples, along with decreased IFNGR1 (an IFNγ receptor) expression. Thus, IFNγ signaling-elicited anti-tumor activities may be mediated by the downregulation of main IFNγ target genes in BC; however, it may be deregulated by the tumor microenvironment in a tumor stage-dependent manner

Prevalencia de efectos adversos y eficacia de la terapia anticoagulante con Dabigatrán frente a Warfarina en pacientes con fibrilación auricular no valvular: Prevalence of adverse effects and efficacy of anticoagulant therapy with Dabigatran versus Warfarin in patients with non-valvular atrial fibrillation in the cardiology

Introducción: La fibrilación auricular (FA), es la arritmia cardíaca más frecuente, afectando aproximadamente al 2% de la población general y su prevalencia va aumentando conforme avanza la edad y la presencia de factores de riesgo; además, puede estar asociada a diferentes comorbilidades como: HTA, DM, IC, IAM, entre otras. Objetivo: Determinar la prevalencia de efectos adversos y eficacia de la terapia anticoagulante con Dabigatrán frente a Warfarina en pacientes con fibrilación auricular no valvular en el HTMC, durante el período de enero de 2014 a enero de 2018. Materiales y métodos: Es un estudio retrospectivo, analítico y descriptivo; el universo estaba formado por 500 pacientes del HTMC con diagnóstico de fibrilación auricular. El instrumento de recolección de datos fue por medio del sistema AS400 del IESS, en el cual se recolectó la información a partir de las historias clínicas de los pacientes y almacenada en Microsoft Excel. Se obtuvo una muestra, según los criterios de inclusión, dando un total de 209 pacientes, divididos en dos grupos, el primero de 106 pacientes medicados con Warfarina y el segundo de 103 pacientes que fueron medicados con Dabigatrán. Resultados: Se obtuvo los resultados de la valoración del riesgo tromboembólico y hemorrágico, a partir de las escalas CHADS2VASC y HAS BLED, respectivamente. Los pacientes presentaron las mismas comorbilidades, no hubo diferencia estadísticamente significativa entre los diferentes grupos de edad y género, tampoco para tabaco y obesidad; al contrario, si existió una diferencia estadísticamente significativa para alcoholismo, probablemente existe mayor exposición a este factor de riesgo cardiovascular en uno de los grupos; para insuficiencia cardiaca, esto indicaría mayor presencia de insuficiencia cardiaca en uno de los grupos. Conclusión: Se concluyó, que ambos grupos presentaban la misma probabilidad de presentar eventos hemorrágicos por medio del score HAS BLED; sin embargo, los valores P estadísticamente significativos para los diferentes tipos de sangrados, demuestran que hay una mayor prevalencia de sangrado en un grupo que en otro. Se determinó, que los pacientes medicados con Warfarina presentaron mayor prevalencia de sangrados durante los 4 años del estudio, a diferencia del grupo de pacientes medicados con Dabigatrán

TGF-β y células cebadas: reguladores del desarrollo del tumor

The transforming growth factor (TGF-β) is a pleiotropic cytokine implicated in various pathological conditions, such as autoimmune disorders, allergies and, in recent years, cancer. This cytokine exerts tumor suppressive effects that cancer cells must evade for tumor progression. Paradoxically, TGF-β also modulates inflammatory processes that favor tumor progression, such as the recruitment of cells from the immune system, like mast cells (MCs).This cell type participates in the regulation of tumor progression through secretion of diverse mediators: pro-angiogenic, pro-inflammatory and growth factors. Here, we review advances in understanding the role of TGF-β in mast cells regulation, as well as their contribution in tumor development. The understanding of TGF-β and MCs interplay during cancer development is essential for the design of new therapies to inhibit tumor progression.El Factor de crecimiento transformante β (TGF-β) es una citocina pleiotrópica implicada en distintas condiciones patológicas, como desórdenes autoinmunes, alergias y en los últimos años, en el cáncer. Esta citocina ejerce efectos supresores de tumores que las células cancerosas deben evadir para lograr la progresión del tumor. Sin embargo, paradójicamente, el TGF-β también modula procesos inflamatorios que favorecen la progresión del tumor, como el reclutamiento de células del sistema inmune al sitio del mismo; entre estas células se encuentran las células cebadas (CCs), las cuales, a su vez también participan en la regulación del tumor, a través de la secreción de distintos mediadores proinflamatorios, proangiogénicos y factores de crecimiento. En esta revisión se describen algunos avances en la comprensión del papel del TGF-β en la regulación de las CCs y la contribución de éstas en el desarrollo y la metástasis de tumores sólidos. El entendimiento de la función del TGF-β y de las células cebadas durante el desarrollo del cáncer es fundamental para el diseño de nuevas terapias que inhiban la progresión del tumor

Mecanismos básicos en la modulación de la expresión génica: algunas implicaciones en el envejecimiento del cerebro

Epigenetic and transcriptional regulation are two interconnected processes regulating the activation and deactivation of all genes. This controlled modulation of gene expression determines the phenotype of different cell types, including their morphology, functionality, and ability to respond to diverse conditions. Regulation of epigenetics does not involve changes in the DNA sequence; however, it alters the formation of several protein complexes that are capable of modifying the chromatin structure to modulate the expression of genes. Epigenetic modifications are highly regulated by several factors such as diet, environment, and physical activity. Furthermore, under a disease condition or particular health state, and during aging, changes have been reported in a cell’s epigenome. Notably, aging is considered as a direct risk factor for the development of neurodegenerative diseases. This review presents a general overview of transcriptional regulation and epigenetic mechanisms, and their relationship with the aging process. Alterations in epigenetic mechanisms are evident during aging, which may impact the development of neurodegenerative diseases. La regulación transcripcional y epigenética son dos procesos interconectados, responsables del encendido y apagado de la expresión de todos los genes. Esta fina modulación de la expresión génica determina el fenotipo de los diferentes tipos celulares, su morfología, su funcionalidad y su habilidad de responder ante diversas condiciones. La regulación epigenética no implica cambios en la secuencia del DNA, pero sí en la generación de numerosos complejos proteicos capaces de modificar la estructura de la cromatina y así modular la expresión génica. La epigenética en los organismos es altamente regulada por varios factores que incluyen la dieta, el ambiente y la actividad física, entre otros. Además, bajo una condición de enfermedad o un estado saludable, así como durante el envejecimiento, se reportan diferencias entre los epigenomas de las células. De manera importante, el envejecimiento es un factor de riesgo directo para el desarrollo de enfermedades neurodegenerativas. En esta revisión presentamos brevemente un panorama general del proceso de regulación transcripcional y de los mecanismos epigenéticos, así como su relación con el proceso del envejecimiento. Alteraciones en los mecanismos epigéneticos son evidentes durante el avance de la edad, los cuales podrían tener alguna influencia en el desarrollo de enfermedades neurodegenerativas

Fabrication of low-cost micropatterned polydimethyl-siloxane scaffolds to organise cells in a variety of two-dimensioanl biomimetic arrangements for lab-on-chip culture platforms

We present the rapid-prototyping of type I collagen micropatterns on poly-dimethylsiloxane substrates for the biomimetic confinement of cells using the combination of a surface oxidation treatment and 3-aminopropyl triethoxysilane silanisation followed by glutaraldehyde crosslinking. The aim of surface treatment is to stabilise microcontact printing transfer of this natural extracellular matrix protein that usually wears out easily from poly-dimethylsiloxane, which is not suitable for biomimetic cell culture platforms and lab-on-chip applications. A low-cost CD-DVD laser was used to etch biomimetic micropatterns into acrylic sheets that were in turn replicated to poly-dimethylsiloxane slabs with the desired features. These stamps were finally inked with type I collagen for microcontact printing transfer on the culture substrates in a simple manner. Human hepatoma cells (HepG2) and rat primary hepatocytes, which do not adhere to bare poly-dimethylsiloxane, were successfully seeded and showed optimal adhesion and survival on simple protein micropatterns with a hepatic cord geometry in order to validate our technique. HepG2 cells also proliferated on the stamps. Soft and stiff poly-dimethylsiloxane layers were also tested to demonstrate that our cost-effective process is compatible with biomimetic organ-on-chip technology integrating tunable stiffness with a potential application to drug testing probes development where such cells are commonly used

Lysophosphatidylinositol Promotes Chemotaxis and Cytokine Synthesis in Mast Cells with Differential Participation of GPR55 and CB2 Receptors

Mast cells (MCs) are the main participants in the control of immune reactions associated with inflammation, allergies, defense against pathogens, and tumor growth. Bioactive lipids are lipophilic compounds able to modulate MC activation. Here, we explored some of the effects of the bioactive lipid lysophosphatidylinositol (LPI) on MCs. Utilizing murine bone marrow-derived mast cells (BMMCs), we found that LPI did not cause degranulation, but slightly increased FcεRI-dependent β-hexosaminidase release. However, LPI induced strong chemotaxis together with changes in LIM kinase (LIMK) and cofilin phosphorylation. LPI also promoted modifications to actin cytoskeleton dynamics that were detected by an increase in cell size and interruptions in the continuity of the cortical actin ring. The chemotaxis and cortical actin ring changes were dependent on GPR55 receptor activation, since the specific agonist O1602 mimicked the effects of LPI and the selective antagonist ML193 prevented them. The LPI and O1602-dependent stimulation of BMMC also led to VEGF, TNF, IL-1α, and IL-1β mRNA accumulation, but, in contrast with chemotaxis-related processes, the effects on cytokine transcription were dependent on GPR55 and cannabinoid (CB) 2 receptors, since they were sensitive to ML193 and to the specific CB2 receptor antagonist AM630. Remarkably, GPR55-dependent BMMC chemotaxis was observed towards conditioned media from distinct mouse and human cancer cells. Our data suggest that LPI induces the chemotaxis of MCs and leads to cytokine production in MC in vitro with the differential participation of GPR55 and CB2 receptors. These effects could play a significant role in the recruitment of MCs to tumors and the production of MC-derived pro-angiogenic factors in the tumor microenvironment