44 research outputs found

    Non-Standard Errors

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    In statistics, samples are drawn from a population in a data-generating process (DGP). Standard errors measure the uncertainty in estimates of population parameters. In science, evidence is generated to test hypotheses in an evidence-generating process (EGP). We claim that EGP variation across researchers adds uncertainty: Non-standard errors (NSEs). We study NSEs by letting 164 teams test the same hypotheses on the same data. NSEs turn out to be sizable, but smaller for better reproducible or higher rated research. Adding peer-review stages reduces NSEs. We further find that this type of uncertainty is underestimated by participants

    Multiorgan MRI findings after hospitalisation with COVID-19 in the UK (C-MORE): a prospective, multicentre, observational cohort study

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    Introduction: The multiorgan impact of moderate to severe coronavirus infections in the post-acute phase is still poorly understood. We aimed to evaluate the excess burden of multiorgan abnormalities after hospitalisation with COVID-19, evaluate their determinants, and explore associations with patient-related outcome measures. Methods: In a prospective, UK-wide, multicentre MRI follow-up study (C-MORE), adults (aged ≥18 years) discharged from hospital following COVID-19 who were included in Tier 2 of the Post-hospitalisation COVID-19 study (PHOSP-COVID) and contemporary controls with no evidence of previous COVID-19 (SARS-CoV-2 nucleocapsid antibody negative) underwent multiorgan MRI (lungs, heart, brain, liver, and kidneys) with quantitative and qualitative assessment of images and clinical adjudication when relevant. Individuals with end-stage renal failure or contraindications to MRI were excluded. Participants also underwent detailed recording of symptoms, and physiological and biochemical tests. The primary outcome was the excess burden of multiorgan abnormalities (two or more organs) relative to controls, with further adjustments for potential confounders. The C-MORE study is ongoing and is registered with ClinicalTrials.gov, NCT04510025. Findings: Of 2710 participants in Tier 2 of PHOSP-COVID, 531 were recruited across 13 UK-wide C-MORE sites. After exclusions, 259 C-MORE patients (mean age 57 years [SD 12]; 158 [61%] male and 101 [39%] female) who were discharged from hospital with PCR-confirmed or clinically diagnosed COVID-19 between March 1, 2020, and Nov 1, 2021, and 52 non-COVID-19 controls from the community (mean age 49 years [SD 14]; 30 [58%] male and 22 [42%] female) were included in the analysis. Patients were assessed at a median of 5·0 months (IQR 4·2–6·3) after hospital discharge. Compared with non-COVID-19 controls, patients were older, living with more obesity, and had more comorbidities. Multiorgan abnormalities on MRI were more frequent in patients than in controls (157 [61%] of 259 vs 14 [27%] of 52; p<0·0001) and independently associated with COVID-19 status (odds ratio [OR] 2·9 [95% CI 1·5–5·8]; padjusted=0·0023) after adjusting for relevant confounders. Compared with controls, patients were more likely to have MRI evidence of lung abnormalities (p=0·0001; parenchymal abnormalities), brain abnormalities (p<0·0001; more white matter hyperintensities and regional brain volume reduction), and kidney abnormalities (p=0·014; lower medullary T1 and loss of corticomedullary differentiation), whereas cardiac and liver MRI abnormalities were similar between patients and controls. Patients with multiorgan abnormalities were older (difference in mean age 7 years [95% CI 4–10]; mean age of 59·8 years [SD 11·7] with multiorgan abnormalities vs mean age of 52·8 years [11·9] without multiorgan abnormalities; p<0·0001), more likely to have three or more comorbidities (OR 2·47 [1·32–4·82]; padjusted=0·0059), and more likely to have a more severe acute infection (acute CRP >5mg/L, OR 3·55 [1·23–11·88]; padjusted=0·025) than those without multiorgan abnormalities. Presence of lung MRI abnormalities was associated with a two-fold higher risk of chest tightness, and multiorgan MRI abnormalities were associated with severe and very severe persistent physical and mental health impairment (PHOSP-COVID symptom clusters) after hospitalisation. Interpretation: After hospitalisation for COVID-19, people are at risk of multiorgan abnormalities in the medium term. Our findings emphasise the need for proactive multidisciplinary care pathways, with the potential for imaging to guide surveillance frequency and therapeutic stratification

    A mixed grape and blueberry extract is safe for dogs to consume

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    Background: Grape and blueberry extracts are known to protect against age-related cognitive decline. However, beneficial effects achieved by mixing grape and blueberry extracts have yet to be evaluated in dogs, or their bioavailability assessed. Of concern to us were cases of acute renal failure in dogs, after their ingestion of grapes or raisins. The European Pet Food Industry Federation (2013) considers only the grape or raisin itself to be potentially dangerous; grape-seed extracts per-se, are not considered to be a threat. Our aim was therefore to evaluate the renal and hepatic safety, and measure plasma derivatives of a polyphenol-rich extract from grape and blueberry (PEGB; from the Neurophenols Consortium) in dogs. Polyphenol expression was analyzed by UHPLC-MS/MS over 8 hours, for dogs given PEGB at 4 mg/kg. Safety was evaluated using four groups of 6 dogs. These groups received capsules containing no PEGB (control), or PEGB at 4, 20, or 40 mg/kg BW/d, for 24 weeks. Blood and urine samples were taken the week prior to study commencement, then at the end of the 24-wk study period. Routine markers of renal and liver damage, including creatinine (Creat), blood urea nitrogen, albumin, minerals, alkaline phosphatase (ALP), and alanine transaminase (ALT) were measured. Biomarkers for early renal damage were also evaluated in plasma (cystatin C (CysC), and neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL)), and urine (CysC, clusterin (Clu), and NGAL). Ratios of urinary biomarkers to Creat were calculated, and compared with acceptable maximal values obtained for healthy dogs, as reported in the literature. Results: While several PEGB-specific polyphenols and metabolites were detected in dog plasma, at the end of the PEGB consumption period, our biomarker analyses presented no evidence of either renal or liver damage (Creat, BUN, ionogram, albumin and ALT, ALP). Similarly, no indication of early renal damage could be detected. Plasma CysC, urinary CysC/Creat, Clu/Creat, and NGAL/Creat ratios were all beneath reported benchmarked maximums, with no evidence of PEGB toxicity. Conclusions: Long-term consumption of a pet specific blend of a polyphenol-rich extract from grape and blueberry (PEGB; from the Neurophenols Consortium), was not associated with renal or hepatic injury, and can therefore be considered safe

    Cercottes (45), Le pont de la Chicane. Un tronçon d'un axe de circulation du haut-Empire et des occupations de l'Antiquité tardive à l'Époque contemporaine dans le cadran sud-est du passage de la Retrève

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    Les fouilles menées au lieu-dit Pont de la Chicane sur la commune de Cercottes (45) ont permis de documenter une occupation rurale liée à un espace de circulation daté du Haut-Empire. Cette occupation se situe à la marge d’un établissement domestique détecté à moins de 30 mètres. L’essentiel des structures est daté du Haut-Empire (de la période augustéenne au IIIe s. ap. J.-C.), à l’exception des fosses localisées dans la partie nord de l’emprise prescrite. D’autres vestiges remontent à l’Antiquité tardive et aux époques médiévales, modernes et contemporaines. Ces vestiges sont en grande majorité des structures en creux. Un réseau de fossés parallèles, assez bien marqué et relativement figé dans le temps, est constitué de nombreux tronçons de fossés orientés à 45°par rapport aux points cardinaux. La reprise et le curage des fossés, combinés au mobilier archéologique (céramique, faune et mobilier métallique) reflètent la présence d’un occupation domestique environnante ainsi qu’un entretien relativement régulier des fossés. Ces fossés enserrent un espace large de 32 m occupé par des empreintes d’ornières qui prennent la même direction. À l’exception du réseau fossoyé, la plupart des vestiges sont très arasés et leurs comblements relativement stériles (comblements sableux oranges peu organiques et peu différents du substrat superficiel). L’Antiquité tardive est représentée par un alignement de quatre fosses d’inhumations de chiens, dont les datations radiocarbone effectuées sur ossements donnent une fourchette chronologique entre la deuxième moitié du IIe et la deuxième moitié du VIe s. ap. J.-C. Ces fosses ont livré des squelettes incomplets ou quasiment complets. Si les ossements sont assez altérés, ces dépôts ont livré des informations assez intéressantes. Deux des fosses présentent des creusements successifs pour l’installation des canidés et l’un d’eux est accompagné d’un coq. Par ailleurs, une autre fosse montre un chien reposant sur un vase céramique qui a probablement été intentionnellement découpé. Parallèlement à ce premier ensemble, trois fosses alignées présentaient chacune le dépôt d’un vase appartenant au répertoire culinaire classique daté entre le IIe et le IIIe s. ap. J.-C. Les datations sur charbons donnent une fourchette chronologique allant de la deuxième moitié du IIIe au début du Ve s., voire le début du VIe s ap. J.-C. La partie nord de l’emprise fouillée est occupée par des fosses d’Époque moderne, parmi lesquelles se démarque tout particulièrement une grande nappe de plan informe. Celle-ci est liée à l’extraction de matériaux carbonatés dans le cadre d’une pratique de marnage. Sur l'ensemble de la phase terrain, toutes les entités archéologiques ont été testées et fouillées, soit intégralement (fossés, trous de poteau, fosses), soit par moitié (fosses) ou par sondages (fossés, vastes nappes en cuvette). L'ensemble du site a fait l'objet d'une prospection au détecteur de métaux au terme du décapage mécanique

    Cercottes (45), Le pont de la Chicane. Un tronçon d'un axe de circulation du haut-Empire et des occupations de l'Antiquité tardive à l'Époque contemporaine dans le cadran sud-est du passage de la Retrève

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    Les fouilles menées au lieu-dit Pont de la Chicane sur la commune de Cercottes (45) ont permis de documenter une occupation rurale liée à un espace de circulation daté du Haut-Empire. Cette occupation se situe à la marge d’un établissement domestique détecté à moins de 30 mètres. L’essentiel des structures est daté du Haut-Empire (de la période augustéenne au IIIe s. ap. J.-C.), à l’exception des fosses localisées dans la partie nord de l’emprise prescrite. D’autres vestiges remontent à l’Antiquité tardive et aux époques médiévales, modernes et contemporaines. Ces vestiges sont en grande majorité des structures en creux. Un réseau de fossés parallèles, assez bien marqué et relativement figé dans le temps, est constitué de nombreux tronçons de fossés orientés à 45°par rapport aux points cardinaux. La reprise et le curage des fossés, combinés au mobilier archéologique (céramique, faune et mobilier métallique) reflètent la présence d’un occupation domestique environnante ainsi qu’un entretien relativement régulier des fossés. Ces fossés enserrent un espace large de 32 m occupé par des empreintes d’ornières qui prennent la même direction. À l’exception du réseau fossoyé, la plupart des vestiges sont très arasés et leurs comblements relativement stériles (comblements sableux oranges peu organiques et peu différents du substrat superficiel). L’Antiquité tardive est représentée par un alignement de quatre fosses d’inhumations de chiens, dont les datations radiocarbone effectuées sur ossements donnent une fourchette chronologique entre la deuxième moitié du IIe et la deuxième moitié du VIe s. ap. J.-C. Ces fosses ont livré des squelettes incomplets ou quasiment complets. Si les ossements sont assez altérés, ces dépôts ont livré des informations assez intéressantes. Deux des fosses présentent des creusements successifs pour l’installation des canidés et l’un d’eux est accompagné d’un coq. Par ailleurs, une autre fosse montre un chien reposant sur un vase céramique qui a probablement été intentionnellement découpé. Parallèlement à ce premier ensemble, trois fosses alignées présentaient chacune le dépôt d’un vase appartenant au répertoire culinaire classique daté entre le IIe et le IIIe s. ap. J.-C. Les datations sur charbons donnent une fourchette chronologique allant de la deuxième moitié du IIIe au début du Ve s., voire le début du VIe s ap. J.-C. La partie nord de l’emprise fouillée est occupée par des fosses d’Époque moderne, parmi lesquelles se démarque tout particulièrement une grande nappe de plan informe. Celle-ci est liée à l’extraction de matériaux carbonatés dans le cadre d’une pratique de marnage. Sur l'ensemble de la phase terrain, toutes les entités archéologiques ont été testées et fouillées, soit intégralement (fossés, trous de poteau, fosses), soit par moitié (fosses) ou par sondages (fossés, vastes nappes en cuvette). L'ensemble du site a fait l'objet d'une prospection au détecteur de métaux au terme du décapage mécanique

    Cercottes (45), Le pont de la Chicane. Un tronçon d'un axe de circulation du haut-Empire et des occupations de l'Antiquité tardive à l'Époque contemporaine dans le cadran sud-est du passage de la Retrève

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    Les fouilles menées au lieu-dit Pont de la Chicane sur la commune de Cercottes (45) ont permis de documenter une occupation rurale liée à un espace de circulation daté du Haut-Empire. Cette occupation se situe à la marge d’un établissement domestique détecté à moins de 30 mètres. L’essentiel des structures est daté du Haut-Empire (de la période augustéenne au IIIe s. ap. J.-C.), à l’exception des fosses localisées dans la partie nord de l’emprise prescrite. D’autres vestiges remontent à l’Antiquité tardive et aux époques médiévales, modernes et contemporaines. Ces vestiges sont en grande majorité des structures en creux. Un réseau de fossés parallèles, assez bien marqué et relativement figé dans le temps, est constitué de nombreux tronçons de fossés orientés à 45°par rapport aux points cardinaux. La reprise et le curage des fossés, combinés au mobilier archéologique (céramique, faune et mobilier métallique) reflètent la présence d’un occupation domestique environnante ainsi qu’un entretien relativement régulier des fossés. Ces fossés enserrent un espace large de 32 m occupé par des empreintes d’ornières qui prennent la même direction. À l’exception du réseau fossoyé, la plupart des vestiges sont très arasés et leurs comblements relativement stériles (comblements sableux oranges peu organiques et peu différents du substrat superficiel). L’Antiquité tardive est représentée par un alignement de quatre fosses d’inhumations de chiens, dont les datations radiocarbone effectuées sur ossements donnent une fourchette chronologique entre la deuxième moitié du IIe et la deuxième moitié du VIe s. ap. J.-C. Ces fosses ont livré des squelettes incomplets ou quasiment complets. Si les ossements sont assez altérés, ces dépôts ont livré des informations assez intéressantes. Deux des fosses présentent des creusements successifs pour l’installation des canidés et l’un d’eux est accompagné d’un coq. Par ailleurs, une autre fosse montre un chien reposant sur un vase céramique qui a probablement été intentionnellement découpé. Parallèlement à ce premier ensemble, trois fosses alignées présentaient chacune le dépôt d’un vase appartenant au répertoire culinaire classique daté entre le IIe et le IIIe s. ap. J.-C. Les datations sur charbons donnent une fourchette chronologique allant de la deuxième moitié du IIIe au début du Ve s., voire le début du VIe s ap. J.-C. La partie nord de l’emprise fouillée est occupée par des fosses d’Époque moderne, parmi lesquelles se démarque tout particulièrement une grande nappe de plan informe. Celle-ci est liée à l’extraction de matériaux carbonatés dans le cadre d’une pratique de marnage. Sur l'ensemble de la phase terrain, toutes les entités archéologiques ont été testées et fouillées, soit intégralement (fossés, trous de poteau, fosses), soit par moitié (fosses) ou par sondages (fossés, vastes nappes en cuvette). L'ensemble du site a fait l'objet d'une prospection au détecteur de métaux au terme du décapage mécanique

    Cercottes (45), Le pont de la Chicane. Un tronçon d'un axe de circulation du haut-Empire et des occupations de l'Antiquité tardive à l'Époque contemporaine dans le cadran sud-est du passage de la Retrève

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    Les fouilles menées au lieu-dit Pont de la Chicane sur la commune de Cercottes (45) ont permis de documenter une occupation rurale liée à un espace de circulation daté du Haut-Empire. Cette occupation se situe à la marge d’un établissement domestique détecté à moins de 30 mètres. L’essentiel des structures est daté du Haut-Empire (de la période augustéenne au IIIe s. ap. J.-C.), à l’exception des fosses localisées dans la partie nord de l’emprise prescrite. D’autres vestiges remontent à l’Antiquité tardive et aux époques médiévales, modernes et contemporaines. Ces vestiges sont en grande majorité des structures en creux. Un réseau de fossés parallèles, assez bien marqué et relativement figé dans le temps, est constitué de nombreux tronçons de fossés orientés à 45°par rapport aux points cardinaux. La reprise et le curage des fossés, combinés au mobilier archéologique (céramique, faune et mobilier métallique) reflètent la présence d’un occupation domestique environnante ainsi qu’un entretien relativement régulier des fossés. Ces fossés enserrent un espace large de 32 m occupé par des empreintes d’ornières qui prennent la même direction. À l’exception du réseau fossoyé, la plupart des vestiges sont très arasés et leurs comblements relativement stériles (comblements sableux oranges peu organiques et peu différents du substrat superficiel). L’Antiquité tardive est représentée par un alignement de quatre fosses d’inhumations de chiens, dont les datations radiocarbone effectuées sur ossements donnent une fourchette chronologique entre la deuxième moitié du IIe et la deuxième moitié du VIe s. ap. J.-C. Ces fosses ont livré des squelettes incomplets ou quasiment complets. Si les ossements sont assez altérés, ces dépôts ont livré des informations assez intéressantes. Deux des fosses présentent des creusements successifs pour l’installation des canidés et l’un d’eux est accompagné d’un coq. Par ailleurs, une autre fosse montre un chien reposant sur un vase céramique qui a probablement été intentionnellement découpé. Parallèlement à ce premier ensemble, trois fosses alignées présentaient chacune le dépôt d’un vase appartenant au répertoire culinaire classique daté entre le IIe et le IIIe s. ap. J.-C. Les datations sur charbons donnent une fourchette chronologique allant de la deuxième moitié du IIIe au début du Ve s., voire le début du VIe s ap. J.-C. La partie nord de l’emprise fouillée est occupée par des fosses d’Époque moderne, parmi lesquelles se démarque tout particulièrement une grande nappe de plan informe. Celle-ci est liée à l’extraction de matériaux carbonatés dans le cadre d’une pratique de marnage. Sur l'ensemble de la phase terrain, toutes les entités archéologiques ont été testées et fouillées, soit intégralement (fossés, trous de poteau, fosses), soit par moitié (fosses) ou par sondages (fossés, vastes nappes en cuvette). L'ensemble du site a fait l'objet d'une prospection au détecteur de métaux au terme du décapage mécanique

    Cercottes (45), Le pont de la Chicane. Un tronçon d'un axe de circulation du haut-Empire et des occupations de l'Antiquité tardive à l'Époque contemporaine dans le cadran sud-est du passage de la Retrève

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    Les fouilles menées au lieu-dit Pont de la Chicane sur la commune de Cercottes (45) ont permis de documenter une occupation rurale liée à un espace de circulation daté du Haut-Empire. Cette occupation se situe à la marge d’un établissement domestique détecté à moins de 30 mètres. L’essentiel des structures est daté du Haut-Empire (de la période augustéenne au IIIe s. ap. J.-C.), à l’exception des fosses localisées dans la partie nord de l’emprise prescrite. D’autres vestiges remontent à l’Antiquité tardive et aux époques médiévales, modernes et contemporaines. Ces vestiges sont en grande majorité des structures en creux. Un réseau de fossés parallèles, assez bien marqué et relativement figé dans le temps, est constitué de nombreux tronçons de fossés orientés à 45°par rapport aux points cardinaux. La reprise et le curage des fossés, combinés au mobilier archéologique (céramique, faune et mobilier métallique) reflètent la présence d’un occupation domestique environnante ainsi qu’un entretien relativement régulier des fossés. Ces fossés enserrent un espace large de 32 m occupé par des empreintes d’ornières qui prennent la même direction. À l’exception du réseau fossoyé, la plupart des vestiges sont très arasés et leurs comblements relativement stériles (comblements sableux oranges peu organiques et peu différents du substrat superficiel). L’Antiquité tardive est représentée par un alignement de quatre fosses d’inhumations de chiens, dont les datations radiocarbone effectuées sur ossements donnent une fourchette chronologique entre la deuxième moitié du IIe et la deuxième moitié du VIe s. ap. J.-C. Ces fosses ont livré des squelettes incomplets ou quasiment complets. Si les ossements sont assez altérés, ces dépôts ont livré des informations assez intéressantes. Deux des fosses présentent des creusements successifs pour l’installation des canidés et l’un d’eux est accompagné d’un coq. Par ailleurs, une autre fosse montre un chien reposant sur un vase céramique qui a probablement été intentionnellement découpé. Parallèlement à ce premier ensemble, trois fosses alignées présentaient chacune le dépôt d’un vase appartenant au répertoire culinaire classique daté entre le IIe et le IIIe s. ap. J.-C. Les datations sur charbons donnent une fourchette chronologique allant de la deuxième moitié du IIIe au début du Ve s., voire le début du VIe s ap. J.-C. La partie nord de l’emprise fouillée est occupée par des fosses d’Époque moderne, parmi lesquelles se démarque tout particulièrement une grande nappe de plan informe. Celle-ci est liée à l’extraction de matériaux carbonatés dans le cadre d’une pratique de marnage. Sur l'ensemble de la phase terrain, toutes les entités archéologiques ont été testées et fouillées, soit intégralement (fossés, trous de poteau, fosses), soit par moitié (fosses) ou par sondages (fossés, vastes nappes en cuvette). L'ensemble du site a fait l'objet d'une prospection au détecteur de métaux au terme du décapage mécanique
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