Impact of Discrepancies between the Abbott RealTime and Cobas TaqMan Assays for Quantification of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Group M Non-B Subtypes▿

Viral loads in 249 clinical samples from individual patients infected with human immunodeficiency virus type 1 non-B subtypes were determined with both the Abbott RealTime and Cobas TaqMan assays. The differences exceeded 0.5 log for about 20% of samples and 1 log for 3%, with higher values always from the Abbott assay in the latter cases

Pitfalls of HIV genotypic tropism testing after treatment interruption

Item does not contain fulltextOBJECTIVES: The genotypic method is reliable enough for the determination of tropism and largely preferred in Europe. However, careful interpretation is essential when assessing HIV genotypic resistance during treatment interruption (TI) due to the possible disappearance of resistant strains. The results of HIV genotypic tropism testing in such a context remain unknown. METHODS: First, we studied changes in tropism in patients included in a structured TI assay: the Reverse study. Second, we investigated the unexpected tropism switches from X4 to R5 recorded in our routine database. RESULTS: Tropism determination was possible in 21 patients of the Reverse study, 9 of whom had an X4 virus (43%) at baseline. Two patients displayed a change of tropism during TI, both switching from X4 to R5. Regarding the database investigation, 7 of the 222 patients with at least two plasma tropism determinations recorded in the database displayed a switch from X4 to R5. TI due to non-compliance at the time of the tropism change was reported for five of these seven patients. CONCLUSIONS: We have shown that the redistribution of the HIV population caused by TI could potentially result in X4 viruses becoming undetected and inappropriate prescription of a CCR5 receptor antagonist. Therefore, genotypic tropism results should be interpreted with caution in such a context

La gestion d'un lagon en mutation : acteurs, enjeux et recherche-action en Nouvelle-Calédonie (Pacifique Sud)

Cet article synthétise les résultats d'un programme de recherche interdisciplinaire effectué sur la côte nord-ouest de la province Nord de la Nouvelle-Calédonie (Pacifique sud) de 2008 à 2011. Cette région fait face aux rapides changements urbains et économiques induits par la création d'un important complexe métallurgique. Ce projet industriel, porteur de développement économique, est aussi un projet politique emblématique du processus original de décolonisation négociée dans lequel la Nouvelle-Calédonie est engagée. Une démarche scientifique adaptative a été mise en place pour améliorer la connaissance de l'écosociosystème côtier et mieux gérer les usages littoraux, et les petites pêcheries en particulier. Cette démarche combinait trois approches complémentaires : recherche-action (s'appuyant sur les points de vue et les logiques des parties prenantes locales), interdisciplinarité (sciences biologiques, sociales et juridiques) et partenariat entre plusieurs institutions de recherche et de développement. Les résultats montrent que les principaux défis de gestion des usages littoraux sont fortement imbriqués et renvoient à des questions environnementales, sociales, culturelles aussi bien qu'économiques et politiques. Toutes les conditions pour la réussite d'une gestion participative ne sont pas actuellement réunies à l'échelle de la zone d'étude. Cependant, notre étude ouvre des pistes pour la promotion d'initiatives de gouvernance partagée, en se fondant sur des dynamiques locales existantes ou émergentes pouvant être élargies à d'autres échelles. Des orientations de politiques publiques sont aussi suggérées, incluant la promotion d'approches territoriales pour le développement local. (Résumé d'auteur